root/galaxy-central/test-data/1.sam

リビジョン 2, 3.4 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central
行番号 
1@QNAME  FLAG    RNAME   POS     MAPQ    CIGAR   MRNM    MPOS    ISIZE   SEQ     QUAL    OPT
21378_11_329     69      *       0       0       *       *       0       0       AGACCGGGCGGGGTGGCGTTCGGT        %##+'#######%###$#$##$(#
31378_11_329     133     *       0       0       *       *       0       0       GTTCGTGGCCGGTGGGTGTTTGGG        ###$$#$#$&#####$'$#$###$
41378_17_1788    69      *       0       0       *       *       0       0       TGCCGTGTCTTGCTAACGCCGATT        #'#$$#$###%%##$$$$######
51378_17_1788    133     *       0       0       *       *       0       0       TGGGTGGATGTGTTGTCGTTCATG        #$#$###$#$#######$#$####
61378_25_2035    69      *       0       0       *       *       0       0       CTGCGTGTTGGTGTCTACTGGGGT        #%#'##$#$##&%#%$$$%#%#'#
71378_25_2035    133     *       0       0       *       *       0       0       GTGCGTCGGGGAGGGTGCTGTCGG        ######%#$%#$$###($###&&%
81378_28_770     89      chr11.nib:1-134452384   72131356        37      17M1I5M =       72131356        0       CACACTGTGACAGACAGCGCAGC 00/02!!0//1200210!!44/1 XT:A:U  CM:i:2  SM:i:37 AM:i:0  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:22
91378_28_770     181     chr11.nib:1-134452384   72131356        0       24M     =       72131356        0       TTGGTGCGCGCGGTTGAGGGTTGG        $$(#%%#$%#%####$%%##$###
101378_33_1945    113     chr2.nib:1-242951149    181247988       0       23M     chr12.nib:1-132349534   41710908        0       GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG PQRVUMNXYRPUXYXWXSOSZ]M XT:A:R  CM:i:0  SM:i:0  AM:i:0  X0:i:163148     XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
111378_33_1945    177     chr12.nib:1-132349534   41710908        0       23M     chr2.nib:1-242951149    181247988       0       AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA SQQWZYURVYWX]]YXTSY]]ZM XT:A:R  CM:i:0  SM:i:0  AM:i:0  X0:i:163148     XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
121378_34_789     69      *       0       0       *       *       0       0       ATGGTGGCTGACGCGTTTGACTGT        #$##%#$##$&$#%##$##$###$
131378_34_789     133     *       0       0       *       *       0       0       GGGCTTGCGTTAGTGAGAGGTTGT        ###%$%$%%###$####$###$#&
141378_35_263     115     chr16.nib:1-88827254    19671878        0       23M     =       19671877        -1      AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTCT 77543:<55#"4!&=964518A> XT:A:R  CM:i:2  SM:i:0  AM:i:0  X0:i:4  X1:i:137        XM:i:2  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
151378_35_263     179     chr16.nib:1-88827254    19671877        0       23M     =       19671878        1       GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTC LE7402DD34FL:27AKE>;432 XT:A:R  CM:i:0  SM:i:0  AM:i:0  X0:i:265        XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
161378_43_186     69      *       0       0       *       *       0       0       ATACTAGTTGGGACGCGTTGTGCT        #$(4%$########$#$###$$$#
171378_43_186     133     *       0       0       *       *       0       0       GCTAGGGTTTGGGTTTGCGGTGGG        $%#$########%##%#$###'#'
181378_51_1671    117     chr2.nib:1-242951149    190342418       0       24M     =       190342418       0       CTGGCGTTCTCGGCGTGGATGGGT        #####$$##$#%#%%###%$#$##
191378_51_1671    153     chr2.nib:1-242951149    190342418       37      16M1I6M =       190342418       0       TCTAACTTAGCCTCATAATAGCT /<<!"0///////00/!!0121/ XT:A:U  CM:i:2  SM:i:37 AM:i:0  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:22
201378_56_324     117     chr2.nib:1-242951149    80324999        0       24M     =       80324999        0       TCCAGTCGCGTTGTTAGGTTCGGA        #$#$$$#####%##%%###**#+/
211378_56_324     153     chr2.nib:1-242951149    80324999        37      8M1I14M =       80324999        0       TTTAGCCCGAAATGCCTAGAGCA 4;6//11!"11100110////00 XT:A:U  CM:i:2  SM:i:37 AM:i:0  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:22
221378_56_773     69      *       0       0       *       *       0       0       TGTCGTGAGGTCACTTATCCCCAT        &%#%##%%#####&#$%##$%##$
231378_56_773     133     *       0       0       *       *       0       0       TCTGGTCGGTTTCGGGGAGTGGAA        ##%%#&$###$#$##%$####%%$
241378_62_2027    69      *       0       0       *       *       0       0       CTTCCACGATCTGCTCGCTGTGGT        (#&&$##$$#$%#%$$$#$###'#
251378_62_2027    133     *       0       0       *       *       0       0       GTTGGCCTGGCCTGCCGTGCTGCG        *##),/%##$)#%##1$#'%.#&#
261378_62_2029    69      *       0       0       *       *       0       0       TCTGGGCTGTCTTCGGGTCGGTGT        $%$$####$##$$#)##%%#$###
271378_62_2029    133     *       0       0       *       *       0       0       GGCGGTGTGTGGTGCGGCTGTGCG        /$$$=(####%####)$$%$-&%#
281378_67_1795    81      chr16.nib:1-88827254    26739130        0       23M     chrY.nib:1-57772954     57401793        0       TGGCATTCCTGTAGGCAGAGAGG AZWWZS]!"QNXZ]VQ]]]/2]] XT:A:R  CM:i:2  SM:i:0  AM:i:0  X0:i:3  X1:i:0  XM:i:2  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
291378_67_1795    161     chrY.nib:1-57772954     57401793        37      23M     chr16.nib:1-88827254    26739130        0       GATCACCCAGGTGATGTAACTCC ]WV]]]]WW]]]]]]]]]]PU]] XT:A:U  CM:i:0  SM:i:37 AM:i:0  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。