root/galaxy-central/test-data/emboss_cusp_out.cusp

リビジョン 2, 2.4 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central

行番号 
1#CdsCount: 10
2
3#Coding GC 36.36%
4#1st letter GC 34.22%
5#2nd letter GC 35.29%
6#3rd letter GC 39.57%
7
8#Codon AA Fraction Frequency Number
9GCA    A     0.200     5.348      1
10GCC    A     0.400    10.695      2
11GCG    A     0.400    10.695      2
12GCT    A     0.000     0.000      0
13TGC    C     0.500    21.390      4
14TGT    C     0.500    21.390      4
15GAC    D     0.667    10.695      2
16GAT    D     0.333     5.348      1
17GAA    E     0.500     5.348      1
18GAG    E     0.500     5.348      1
19TTC    F     0.316    32.086      6
20TTT    F     0.684    69.519     13
21GGA    G     0.000     0.000      0
22GGC    G     0.200     5.348      1
23GGG    G     0.200     5.348      1
24GGT    G     0.600    16.043      3
25CAC    H     0.667    10.695      2
26CAT    H     0.333     5.348      1
27ATA    I     0.429    16.043      3
28ATC    I     0.143     5.348      1
29ATT    I     0.429    16.043      3
30AAA    K     0.600    32.086      6
31AAG    K     0.400    21.390      4
32CTA    L     0.152    26.738      5
33CTC    L     0.061    10.695      2
34CTG    L     0.152    26.738      5
35CTT    L     0.273    48.128      9
36TTA    L     0.182    32.086      6
37TTG    L     0.182    32.086      6
38ATG    M     1.000    16.043      3
39AAC    N     0.286    10.695      2
40AAT    N     0.714    26.738      5
41CCA    P     0.250     5.348      1
42CCC    P     0.500    10.695      2
43CCG    P     0.250     5.348      1
44CCT    P     0.000     0.000      0
45CAA    Q     0.333     5.348      1
46CAG    Q     0.667    10.695      2
47AGA    R     0.143     5.348      1
48AGG    R     0.143     5.348      1
49CGA    R     0.143     5.348      1
50CGC    R     0.000     0.000      0
51CGG    R     0.143     5.348      1
52CGT    R     0.429    16.043      3
53AGC    S     0.136    16.043      3
54AGT    S     0.227    26.738      5
55TCA    S     0.136    16.043      3
56TCC    S     0.227    26.738      5
57TCG    S     0.000     0.000      0
58TCT    S     0.273    32.086      6
59ACA    T     0.400    21.390      4
60ACC    T     0.100     5.348      1
61ACG    T     0.200    10.695      2
62ACT    T     0.300    16.043      3
63GTA    V     0.231    16.043      3
64GTC    V     0.000     0.000      0
65GTG    V     0.000     0.000      0
66GTT    V     0.769    53.476     10
67TGG    W     1.000    21.390      4
68TAC    Y     0.444    21.390      4
69TAT    Y     0.556    26.738      5
70TAA    *     0.500    26.738      5
71TAG    *     0.400    21.390      4
72TGA    *     0.100     5.348      1
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。