root/galaxy-central/test-data/gtf2bedgraph_in.gtf

リビジョン 2, 20.4 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central

行番号 
1chr1    Cufflinks       exon    36425950        36426026        1000    -       .       gene_id "uc007aqa.1"; transcript_id "uc007aqa.1"; exon_number "21"; FPKM "4.8386844109"; frac "0.515875"; conf_lo "0.000000"; conf_hi "9.779040"; cov "0.274837";
2chr1    Cufflinks       exon    46891972        46892996        1000    -       .       gene_id "uc007axc.1"; transcript_id "uc007axc.1"; exon_number "9"; FPKM "8.4688567539"; frac "1.000000"; conf_lo "6.667227"; conf_hi "10.270487"; cov "0.481031";
3chr1    Cufflinks       exon    71654478        71654594        1000    -       .       gene_id "uc007bkb.1"; transcript_id "uc007bkb.1"; exon_number "4"; FPKM "0.4686878995"; frac "0.186704"; conf_lo "0.300747"; conf_hi "0.636629"; cov "0.026621";
4chr1    Cufflinks       transcript      72629845        72679706        1000    +       .       gene_id "uc007bks.1"; transcript_id "uc007bks.1"; FPKM "4.0695297327"; frac "1.000000"; conf_lo "2.473329"; conf_hi "5.665731"; cov "0.231149";
5chr1    Cufflinks       exon    75531753        75532000        1000    +       .       gene_id "uc007bpt.1"; transcript_id "uc007bpt.1"; exon_number "24"; FPKM "3.6392661141"; frac "1.000000"; conf_lo "2.391008"; conf_hi "4.887524"; cov "0.206710";
6chr1    Cufflinks       exon    123389482       123389564       1000    +       .       gene_id "uc007cju.1"; transcript_id "uc007cju.1"; exon_number "20"; FPKM "0.9948773061"; frac "1.000000"; conf_lo "0.105032"; conf_hi "1.884723"; cov "0.056509";
7chr1    Cufflinks       exon    129625990       129626119       1000    +       .       gene_id "uc007ckv.1"; transcript_id "uc007ckv.1"; exon_number "1"; FPKM "0.0003267777"; frac "0.004692"; conf_lo "0.000000"; conf_hi "0.000915"; cov "0.000019";
8chr1    Cufflinks       exon    132059397       132059512       1000    +       .       gene_id "uc007clw.1"; transcript_id "uc007clw.1"; exon_number "7"; FPKM "0.2051423010"; frac "0.886787"; conf_lo "0.000000"; conf_hi "0.509199"; cov "0.011652";
9chr1    Cufflinks       exon    175865141       175865308       1000    -       .       gene_id "uc007dsf.1"; transcript_id "uc007dsf.1"; exon_number "5"; FPKM "0.6544444010"; frac "1.000000"; conf_lo "0.068952"; conf_hi "1.239936"; cov "0.037172";
10chr10   Cufflinks       transcript      7399380 7400956 1000    -       .       gene_id "uc007eie.1"; transcript_id "uc007eie.1"; FPKM "2.1099978681"; frac "1.000000"; conf_lo "0.514989"; conf_hi "3.705006"; cov "0.119848";
11chr10   Cufflinks       exon    79784826        79784954        1000    -       .       gene_id "uc007gcr.1"; transcript_id "uc007gcr.1"; exon_number "2"; FPKM "1.2054582676"; frac "1.000000"; conf_lo "0.000000"; conf_hi "2.597402"; cov "0.068470";
12chr10   Cufflinks       exon    79820729        79820836        1000    +       .       gene_id "uc007gcy.1"; transcript_id "uc007gcy.1"; exon_number "2"; FPKM "1.8177911161"; frac "1.000000"; conf_lo "0.532419"; conf_hi "3.103164"; cov "0.103250";
13chr10   Cufflinks       transcript      105907395       106369573       1000    +       .       gene_id "uc007gyr.1"; transcript_id "uc007gyr.1"; FPKM "4.2493607936"; frac "0.247216"; conf_lo "3.727223"; conf_hi "4.771499"; cov "0.241364";
14chr10   Cufflinks       exon    119487061       119487172       1000    +       .       gene_id "uc007hep.1"; transcript_id "uc007hep.1"; exon_number "10"; FPKM "4.3105966126"; frac "0.341843"; conf_lo "3.127417"; conf_hi "5.493776"; cov "0.244842";
15chr11   Cufflinks       exon    29097093        29097209        1000    +       .       gene_id "uc007igs.1"; transcript_id "uc007igs.1"; exon_number "7"; FPKM "4.2530782301"; frac "1.000000"; conf_lo "2.700074"; conf_hi "5.806083"; cov "0.241575";
16chr11   Cufflinks       exon    69404158        69404264        1000    +       .       gene_id "uc007jqm.1"; transcript_id "uc007jqm.1"; exon_number "10"; FPKM "18.7450971965"; frac "0.685277"; conf_lo "11.773851"; conf_hi "25.716343"; cov "1.064721";
17chr11   Cufflinks       transcript      98249986        98261804        1000    -       .       gene_id "uc007lgh.1"; transcript_id "uc007lgh.1"; FPKM "2.1571271227"; frac "1.000000"; conf_lo "0.856331"; conf_hi "3.457924"; cov "0.122525";
18chr11   Cufflinks       exon    102210141       102211681       1000    -       .       gene_id "uc007lrp.1"; transcript_id "uc007lrp.1"; exon_number "1"; FPKM "0.8688186006"; frac "1.000000"; conf_lo "0.254471"; conf_hi "1.483166"; cov "0.049349";
19chr11   Cufflinks       transcript      105926400       105927243       1000    -       .       gene_id "uc007lya.1"; transcript_id "uc007lya.1"; FPKM "3.6706747247"; frac "1.000000"; conf_lo "0.000000"; conf_hi "8.861793"; cov "0.208494";
20chr11   Cufflinks       exon    106633966       106634066       1000    -       .       gene_id "uc007lzm.1"; transcript_id "uc007lzm.1"; exon_number "2"; FPKM "2.4729108195"; frac "0.689555"; conf_lo "0.805433"; conf_hi "4.140389"; cov "0.140461";
21chr11   Cufflinks       exon    120472427       120472492       1000    -       .       gene_id "uc007mtq.1"; transcript_id "uc007mtq.1"; exon_number "3"; FPKM "10.2380258574"; frac "0.356865"; conf_lo "4.499395"; conf_hi "15.976656"; cov "0.581520";
22chr12   Cufflinks       exon    100112717       100112852       1000    -       .       gene_id "uc007orn.1"; transcript_id "uc007orn.1"; exon_number "39"; FPKM "1.8669402513"; frac "0.154118"; conf_lo "1.707295"; conf_hi "2.026586"; cov "0.106042";
23chr13   Cufflinks       exon    8889564 8891614 1000    +       .       gene_id "uc007pkn.1"; transcript_id "uc007pkn.1"; exon_number "5"; FPKM "9.4402522582"; frac "1.000000"; conf_lo "6.745038"; conf_hi "12.135466"; cov "0.536206";
24chr13   Cufflinks       exon    13756207        13756380        1000    +       .       gene_id "uc007pmj.1"; transcript_id "uc007pmj.1"; exon_number "18"; FPKM "0.0574771218"; frac "0.793101"; conf_lo "0.000000"; conf_hi "0.140705"; cov "0.003265";
25chr13   Cufflinks       exon    93243918        93244083        1000    -       .       gene_id "uc007rkp.1"; transcript_id "uc007rkp.1"; exon_number "4"; FPKM "6.9802111138"; frac "1.000000"; conf_lo "3.858566"; conf_hi "10.101856"; cov "0.396476";
26chr14   Cufflinks       exon    13130096        13130170        1000    +       .       gene_id "uc007sfq.1"; transcript_id "uc007sfq.1"; exon_number "4"; FPKM "4.0381928600"; frac "1.000000"; conf_lo "2.254366"; conf_hi "5.822020"; cov "0.229369";
27chr14   Cufflinks       exon    32036106        32036250        1000    +       .       gene_id "uc007sxe.1"; transcript_id "uc007sxe.1"; exon_number "10"; FPKM "0.1289615781"; frac "1.000000"; conf_lo "0.000000"; conf_hi "0.386885"; cov "0.007325";
28chr14   Cufflinks       exon    56517080        56517223        1000    -       .       gene_id "uc007ubd.1"; transcript_id "uc007ubd.1"; exon_number "2"; FPKM "15.7683764379"; frac "0.548796"; conf_lo "8.949920"; conf_hi "22.586833"; cov "0.895643";
29chr14   Cufflinks       exon    62950942        62951013        1000    +       .       gene_id "uc007ugl.1"; transcript_id "uc007ugl.1"; exon_number "1"; FPKM "10.1138803585"; frac "1.000000"; conf_lo "6.480867"; conf_hi "13.746893"; cov "0.574468";
30chr14   Cufflinks       exon    66479007        66479052        1000    +       .       gene_id "uc007ujq.1"; transcript_id "uc007ujq.1"; exon_number "8"; FPKM "14.3011267395"; frac "1.000000"; conf_lo "10.806805"; conf_hi "17.795448"; cov "0.812304";
31chr14   Cufflinks       exon    70961619        70961783        1000    +       .       gene_id "uc007uoj.1"; transcript_id "uc007uoj.1"; exon_number "7"; FPKM "2.0814553995"; frac "1.000000"; conf_lo "1.231705"; conf_hi "2.931206"; cov "0.118227";
32chr14   Cufflinks       exon    96679222        96679434        1000    -       .       gene_id "uc007uuq.1"; transcript_id "uc007uuq.1"; exon_number "7"; FPKM "1.7614342028"; frac "1.000000"; conf_lo "0.851833"; conf_hi "2.671035"; cov "0.100049";
33chr14   Cufflinks       exon    99504388        99504488        1000    +       .       gene_id "uc007uvc.1"; transcript_id "uc007uvc.1"; exon_number "3"; FPKM "3.1573312214"; frac "0.277705"; conf_lo "2.620155"; conf_hi "3.694508"; cov "0.179336";
34chr15   Cufflinks       exon    12777808        12777962        1000    +       .       gene_id "uc007vic.1"; transcript_id "uc007vic.1"; exon_number "6"; FPKM "12.7118803258"; frac "0.653301"; conf_lo "7.807708"; conf_hi "17.616053"; cov "0.722034";
35chr15   Cufflinks       exon    28200049        28200282        1000    +       .       gene_id "uc007vjy.1"; transcript_id "uc007vjy.1"; exon_number "19"; FPKM "0.0608801712"; frac "1.000000"; conf_lo "0.000000"; conf_hi "0.146978"; cov "0.003458";
36chr15   Cufflinks       exon    34434714        34434889        1000    +       .       gene_id "uc007vlv.1"; transcript_id "uc007vlv.1"; exon_number "4"; FPKM "2.1698982510"; frac "1.000000"; conf_lo "1.049368"; conf_hi "3.290429"; cov "0.123250";
37chr15   Cufflinks       transcript      51709056        51716160        1000    +       .       gene_id "uc007vrc.1"; transcript_id "uc007vrc.1"; FPKM "5.0213279245"; frac "1.000000"; conf_lo "3.187798"; conf_hi "6.854858"; cov "0.285211";
38chr15   Cufflinks       exon    54880182        54880296        1000    -       .       gene_id "uc007vrt.1"; transcript_id "uc007vrt.1"; exon_number "14"; FPKM "9.7267082384"; frac "1.000000"; conf_lo "7.809774"; conf_hi "11.643643"; cov "0.552477";
39chr15   Cufflinks       exon    59176893        59177072        1000    -       .       gene_id "uc007vxs.1"; transcript_id "uc007vxs.1"; exon_number "11"; FPKM "4.5392702144"; frac "1.000000"; conf_lo "2.723562"; conf_hi "6.354978"; cov "0.257830";
40chr15   Cufflinks       exon    76426650        76426779        1000    -       .       gene_id "uc007wla.1"; transcript_id "uc007wla.1"; exon_number "3"; FPKM "3.5730073595"; frac "0.230550"; conf_lo "2.576136"; conf_hi "4.569879"; cov "0.202947";
41chr15   Cufflinks       exon    76533504        76533613        1000    +       .       gene_id "uc007wlt.1"; transcript_id "uc007wlt.1"; exon_number "4"; FPKM "3.3395072810"; frac "0.491112"; conf_lo "2.499197"; conf_hi "4.179818"; cov "0.189684";
42chr15   Cufflinks       exon    88963183        88963261        1000    -       .       gene_id "uc007xfl.1"; transcript_id "uc007xfl.1"; exon_number "3"; FPKM "1.5871531781"; frac "1.000000"; conf_lo "0.291248"; conf_hi "2.883058"; cov "0.090150";
43chr15   Cufflinks       exon    102455470       102455519       1000    -       .       gene_id "uc007xwk.1"; transcript_id "uc007xwk.1"; exon_number "13"; FPKM "0.2873090379"; frac "0.161741"; conf_lo "0.099159"; conf_hi "0.475459"; cov "0.016319";
44chr16   Cufflinks       transcript      3979123 3982204 1000    -       .       gene_id "uc007xzf.1"; transcript_id "uc007xzf.1"; FPKM "4.1992546925"; frac "0.467884"; conf_lo "2.835257"; conf_hi "5.563252"; cov "0.238518";
45chr15   Cufflinks       exon    102313591       102313719       1000    +       .       gene_id "uc007xvy.2"; transcript_id "uc007xvy.2"; exon_number "7"; FPKM "37.5792165910"; frac "0.297738"; conf_lo "34.688492"; conf_hi "40.469941"; cov "2.134498";
46chr16   Cufflinks       exon    4608598 4608818 1000    +       .       gene_id "uc007xzw.1"; transcript_id "uc007xzw.1"; exon_number "2"; FPKM "5.7793602049"; frac "1.000000"; conf_lo "4.036818"; conf_hi "7.521903"; cov "0.328267";
47chr16   Cufflinks       exon    20541820        20541939        1000    +       .       gene_id "uc007ypy.1"; transcript_id "uc007ypy.1"; exon_number "7"; FPKM "68.0268643583"; frac "1.000000"; conf_lo "60.085498"; conf_hi "75.968231"; cov "3.863924";
48chr17   Cufflinks       transcript      24857054        24858867        1000    +       .       gene_id "uc008axy.1"; transcript_id "uc008axy.1"; FPKM "22.0141466642"; frac "1.000000"; conf_lo "15.369306"; conf_hi "28.658988"; cov "1.250403";
49chr17   Cufflinks       exon    25379604        25380686        1000    -       .       gene_id "uc008bah.1"; transcript_id "uc008bah.1"; exon_number "1"; FPKM "1.7458387165"; frac "0.226783"; conf_lo "1.488719"; conf_hi "2.002959"; cov "0.099164";
50chr17   Cufflinks       exon    27159196        27159462        1000    +       .       gene_id "uc008bfe.1"; transcript_id "uc008bfe.1"; exon_number "2"; FPKM "1.7334774900"; frac "0.118977"; conf_lo "1.272113"; conf_hi "2.194842"; cov "0.098461";
51chr18   Cufflinks       exon    34787707        34787836        1000    +       .       gene_id "uc008ela.1"; transcript_id "uc008ela.1"; exon_number "7"; FPKM "5.0638001964"; frac "0.237331"; conf_lo "4.342098"; conf_hi "5.785503"; cov "0.287624";
52chr18   Cufflinks       exon    61371052        61371250        1000    -       .       gene_id "uc008fbu.1"; transcript_id "uc008fbu.1"; exon_number "4"; FPKM "0.1230526474"; frac "1.000000"; conf_lo "0.000000"; conf_hi "0.369158"; cov "0.006989";
53chr18   Cufflinks       exon    61167370        61167501        1000    -       .       gene_id "uc008fbi.1"; transcript_id "uc008fbi.1"; exon_number "12"; FPKM "2.4172869897"; frac "1.000000"; conf_lo "1.244731"; conf_hi "3.589843"; cov "0.137302";
54chr18   Cufflinks       exon    86630592        86630719        1000    +       .       gene_id "uc008fuz.1"; transcript_id "uc008fuz.1"; exon_number "6"; FPKM "2.2892787327"; frac "1.000000"; conf_lo "1.065608"; conf_hi "3.512950"; cov "0.130031";
55chr19   Cufflinks       exon    5603634 5603715 1000    -       .       gene_id "uc008gea.1"; transcript_id "uc008gea.1"; exon_number "2"; FPKM "2.1837193523"; frac "0.163446"; conf_lo "1.715120"; conf_hi "2.652319"; cov "0.124035";
56chr2    Cufflinks       exon    28404475        28404676        1000    +       .       gene_id "uc008iyn.1"; transcript_id "uc008iyn.1"; exon_number "15"; FPKM "10.9087431164"; frac "0.368384"; conf_lo "4.356515"; conf_hi "17.460972"; cov "0.619616";
57chr2    Cufflinks       exon    29770254        29770439        1000    +       .       gene_id "uc008jal.1"; transcript_id "uc008jal.1"; exon_number "12"; FPKM "7.2973656902"; frac "0.685974"; conf_lo "5.778526"; conf_hi "8.816206"; cov "0.414490";
58chr2    Cufflinks       exon    30002172        30002382        1000    +       .       gene_id "uc008jbj.1"; transcript_id "uc008jbj.1"; exon_number "8"; FPKM "12.8769808138"; frac "1.000000"; conf_lo "10.220662"; conf_hi "15.533299"; cov "0.731412";
59chr2    Cufflinks       exon    32076600        32076704        1000    +       .       gene_id "uc008jeo.1"; transcript_id "uc008jeo.1"; exon_number "21"; FPKM "43.8860660433"; frac "0.911093"; conf_lo "40.407190"; conf_hi "47.364942"; cov "2.492727";
60chr2    Cufflinks       exon    32546710        32546774        1000    -       .       gene_id "uc008jgm.1"; transcript_id "uc008jgm.1"; exon_number "12"; FPKM "8.1366623064"; frac "1.000000"; conf_lo "5.496780"; conf_hi "10.776544"; cov "0.462162";
61chr2    Cufflinks       exon    35574280        35574458        1000    +       .       gene_id "uc008jkv.1"; transcript_id "uc008jkv.1"; exon_number "6"; FPKM "2.0012109810"; frac "0.141121"; conf_lo "1.688896"; conf_hi "2.313526"; cov "0.113669";
62chr2    Cufflinks       exon    117127697       117127757       1000    -       .       gene_id "uc008lrl.1"; transcript_id "uc008lrl.1"; exon_number "14"; FPKM "1.6760710643"; frac "0.685093"; conf_lo "1.109659"; conf_hi "2.242483"; cov "0.095201";
63chr2    Cufflinks       exon    122435405       122435623       1000    -       .       gene_id "uc008maw.1"; transcript_id "uc008maw.1"; exon_number "8"; FPKM "10.5679023498"; frac "1.000000"; conf_lo "7.636894"; conf_hi "13.498911"; cov "0.600257";
64chr2    Cufflinks       exon    130265172       130265261       1000    +       .       gene_id "uc008mja.1"; transcript_id "uc008mja.1"; exon_number "9"; FPKM "3.6318426438"; frac "0.287992"; conf_lo "2.815837"; conf_hi "4.447848"; cov "0.206289";
65chr2    Cufflinks       exon    152702303       152702428       1000    +       .       gene_id "uc008ngq.1"; transcript_id "uc008ngq.1"; exon_number "7"; FPKM "2.5312142816"; frac "0.526901"; conf_lo "1.108909"; conf_hi "3.953519"; cov "0.143773";
66chr2    Cufflinks       exon    158262739       158262887       1000    +       .       gene_id "uc008nqh.1"; transcript_id "uc008nqh.1"; exon_number "8"; FPKM "5.0001206267"; frac "1.000000"; conf_lo "3.934091"; conf_hi "6.066150"; cov "0.284007";
67chr2    Cufflinks       exon    178152211       178152296       1000    +       .       gene_id "uc008ohq.1"; transcript_id "uc008ohq.1"; exon_number "3"; FPKM "1.6796903776"; frac "1.000000"; conf_lo "0.491970"; conf_hi "2.867411"; cov "0.095406";
68chr3    Cufflinks       exon    97500913        97501137        1000    -       .       gene_id "uc008qpe.1"; transcript_id "uc008qpe.1"; exon_number "7"; FPKM "4.1738869883"; frac "0.398377"; conf_lo "3.671923"; conf_hi "4.675851"; cov "0.237077";
69chr3    Cufflinks       exon    101987874       101987902       1000    -       .       gene_id "uc008qrt.1"; transcript_id "uc008qrt.1"; exon_number "4"; FPKM "0.6428024028"; frac "1.000000"; conf_lo "0.000000"; conf_hi "1.551862"; cov "0.036511";
70chr3    Cufflinks       exon    127258214       127258303       1000    +       .       gene_id "uc008rhf.1"; transcript_id "uc008rhf.1"; exon_number "2"; FPKM "0.4060755145"; frac "0.353557"; conf_lo "0.120085"; conf_hi "0.692066"; cov "0.023065";
71chr3    Cufflinks       exon    144790795       144790854       1000    +       .       gene_id "uc008rqi.1"; transcript_id "uc008rqi.1"; exon_number "5"; FPKM "1.1258808773"; frac "0.289434"; conf_lo "0.699104"; conf_hi "1.552658"; cov "0.063950";
72chr4    Cufflinks       exon    17978869        17981846        1000    +       .       gene_id "uc008sbv.1"; transcript_id "uc008sbv.1"; exon_number "5"; FPKM "0.6623587694"; frac "0.585087"; conf_lo "0.270053"; conf_hi "1.054665"; cov "0.037622";
73chr4    Cufflinks       exon    21711840        21711940        1000    +       .       gene_id "uc008scz.1"; transcript_id "uc008scz.1"; exon_number "5"; FPKM "0.9584930367"; frac "0.150841"; conf_lo "0.742054"; conf_hi "1.174932"; cov "0.054442";
74chr4    Cufflinks       exon    108353507       108353731       1000    -       .       gene_id "uc008ubn.1"; transcript_id "uc008ubn.1"; exon_number "9"; FPKM "2.6286767383"; frac "1.000000"; conf_lo "1.111010"; conf_hi "4.146344"; cov "0.149309";
75chr4    Cufflinks       exon    131325668       131325803       1000    -       .       gene_id "uc008vab.1"; transcript_id "uc008vab.1"; exon_number "2"; FPKM "4.0813960015"; frac "1.000000"; conf_lo "2.890730"; conf_hi "5.272062"; cov "0.231823";
76chr4    Cufflinks       exon    153530641       153530927       1000    +       .       gene_id "uc008wbi.1"; transcript_id "uc008wbi.1"; exon_number "12"; FPKM "21.2412511761"; frac "1.000000"; conf_lo "16.217040"; conf_hi "26.265462"; cov "1.206502";
77chr5    Cufflinks       exon    3631589 3631765 1000    +       .       gene_id "uc008whf.1"; transcript_id "uc008whf.1"; exon_number "19"; FPKM "4.6386616700"; frac "0.517324"; conf_lo "3.723563"; conf_hi "5.553760"; cov "0.263476";
78chr5    Cufflinks       exon    3992046 3992138 1000    +       .       gene_id "uc008wid.1"; transcript_id "uc008wid.1"; exon_number "15"; FPKM "23.3742995121"; frac "0.874843"; conf_lo "21.278988"; conf_hi "25.469611"; cov "1.327659";
79chr5    Cufflinks       exon    34223636        34223836        1000    +       .       gene_id "uc008xbk.1"; transcript_id "uc008xbk.1"; exon_number "12"; FPKM "4.1101744570"; frac "0.642098"; conf_lo "2.270677"; conf_hi "5.949672"; cov "0.233458";
80chr5    Cufflinks       exon    115734400       115734621       1000    +       .       gene_id "uc008zdo.1"; transcript_id "uc008zdo.1"; exon_number "3"; FPKM "15.3221708908"; frac "1.000000"; conf_lo "11.506469"; conf_hi "19.137873"; cov "0.870299";
81chr5    Cufflinks       exon    137807769       137808016       1000    +       .       gene_id "uc009aci.1"; transcript_id "uc009aci.1"; exon_number "12"; FPKM "0.7189248975"; frac "0.533440"; conf_lo "0.000000"; conf_hi "1.543846"; cov "0.040835";
82chr6    Cufflinks       transcript      17015149        17055825        1000    +       .       gene_id "uc009azi.1"; transcript_id "uc009azi.1"; FPKM "12.3429992456"; frac "1.000000"; conf_lo "9.242902"; conf_hi "15.443097"; cov "0.701082";
83chr6    Cufflinks       exon    15361026        15361102        1000    +       .       gene_id "uc009ayz.1"; transcript_id "uc009ayz.1"; exon_number "14"; FPKM "4.1692596952"; frac "0.281345"; conf_lo "2.894471"; conf_hi "5.444049"; cov "0.236814";
84chr6    Cufflinks       exon    115576309       115576426       1000    -       .       gene_id "uc009dix.1"; transcript_id "uc009dix.1"; exon_number "8"; FPKM "34.7320589881"; frac "0.628311"; conf_lo "31.195284"; conf_hi "38.268834"; cov "1.972780";
85chr6    Cufflinks       exon    117820274       117822784       1000    +       .       gene_id "uc009dld.1"; transcript_id "uc009dld.1"; exon_number "3"; FPKM "8.2141924772"; frac "1.000000"; conf_lo "5.778655"; conf_hi "10.649730"; cov "0.466566";
86chr6    Cufflinks       exon    121331667       121331759       1000    -       .       gene_id "uc009don.1"; transcript_id "uc009don.1"; exon_number "4"; FPKM "0.9373248338"; frac "0.255959"; conf_lo "0.597786"; conf_hi "1.276864"; cov "0.053240";
87chr6    Cufflinks       exon    134837648       134837803       1000    -       .       gene_id "uc009ekw.1"; transcript_id "uc009ekw.1"; exon_number "2"; FPKM "3.4342255434"; frac "0.337007"; conf_lo "2.099159"; conf_hi "4.769292"; cov "0.195064";
88chr7    Cufflinks       exon    19628774        19628924        1000    +       .       gene_id "uc009fkg.1"; transcript_id "uc009fkg.1"; exon_number "14"; FPKM "3.4380795645"; frac "0.240903"; conf_lo "2.901335"; conf_hi "3.974824"; cov "0.195283";
89chr7    Cufflinks       transcript      51739887        51740783        1000    +       .       gene_id "uc009gpo.1"; transcript_id "uc009gpo.1"; FPKM "3.5875651083"; frac "1.000000"; conf_lo "0.658330"; conf_hi "6.516800"; cov "0.203774";
90chr7    Cufflinks       exon    53085965        53086159        1000    -       .       gene_id "uc009gxj.1"; transcript_id "uc009gxj.1"; exon_number "6"; FPKM "6.4200658663"; frac "0.543693"; conf_lo "4.666748"; conf_hi "8.173383"; cov "0.364660";
91chr7    Cufflinks       exon    77546982        77547077        1000    +       .       gene_id "uc009hnk.1"; transcript_id "uc009hnk.1"; exon_number "7"; FPKM "0.4622078998"; frac "0.405823"; conf_lo "0.077413"; conf_hi "0.847003"; cov "0.026253";
92chr7    Cufflinks       exon    82788205        82788350        1000    +       .       gene_id "uc009hwu.1"; transcript_id "uc009hwu.1"; exon_number "1"; FPKM "0.6859341657"; frac "0.576962"; conf_lo "0.055268"; conf_hi "1.316600"; cov "0.038961";
93chr7    Cufflinks       exon    85984891        85985078        1000    -       .       gene_id "uc009hxo.1"; transcript_id "uc009hxo.1"; exon_number "3"; FPKM "3.0017741434"; frac "1.000000"; conf_lo "1.397258"; conf_hi "4.606290"; cov "0.170501";
94chr7    Cufflinks       exon    148509981       148510078       1000    -       .       gene_id "uc009kkn.1"; transcript_id "uc009kkn.1"; exon_number "11"; FPKM "32.9197864125"; frac "1.000000"; conf_lo "27.375094"; conf_hi "38.464479"; cov "1.869843";
95chr9    Cufflinks       exon    15330072        15330148        1000    +       .       gene_id "uc009ogc.1"; transcript_id "uc009ogc.1"; exon_number "2"; FPKM "1.0060367764"; frac "1.000000"; conf_lo "0.000000"; conf_hi "2.428788"; cov "0.057143";
96chr9    Cufflinks       transcript      21069743        21078812        1000    +       .       gene_id "uc009okt.1"; transcript_id "uc009okt.1"; FPKM "7.9134805855"; frac "0.623402"; conf_lo "5.930640"; conf_hi "9.896321"; cov "0.449485";
97chr9    Cufflinks       exon    57867100        57867303        1000    +       .       gene_id "uc009pwa.1"; transcript_id "uc009pwa.1"; exon_number "4"; FPKM "0.5359102332"; frac "1.000000"; conf_lo "0.000000"; conf_hi "1.293802"; cov "0.030440";
98chr9    Cufflinks       exon    49314958        49315758        1000    -       .       gene_id "uc009pje.1"; transcript_id "uc009pje.1"; exon_number "2"; FPKM "156.0206032233"; frac "0.793945"; conf_lo "147.369898"; conf_hi "164.671308"; cov "8.861965";
99chr9    Cufflinks       exon    106815438       106815604       1000    -       .       gene_id "uc009rkv.1"; transcript_id "uc009rkv.1"; exon_number "12"; FPKM "5.4023275754"; frac "1.000000"; conf_lo "4.337713"; conf_hi "6.466942"; cov "0.306852";
100chr9    Cufflinks       exon    119703054       119703292       1000    -       .       gene_id "uc009sbk.1"; transcript_id "uc009sbk.1"; exon_number "15"; FPKM "0.0814657030"; frac "1.000000"; conf_lo "0.000000"; conf_hi "0.244397"; cov "0.004627";
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。