Context Navigation

indel_analysis_in2.sam @ 2

リビジョン 2, 3.0 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年前)
import galaxy-central

Rev	行番号
[2]	1	r327 16 chrM 11 37 8M1D10M * 0 0 CTTACCAGATAGTCATCA -+<2;?@BA@?-,.+4=4 XT:A:U NM:i:1 X0:i:1 X1:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 MD:Z:41^C35
	2	r457 0 chr1 14 37 14M * 0 0 ACCTGACAGATATC =/DF;?@1A@?-,. XT:A:U NM:i:0 X0:i:1 X1:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 MD:Z:76
	3	r501 16 chrM 6 23 7M1I13M * 0 0 TCTGTGCCTACCAGACATTCA +=$2;?@BA@?-,.+4=4=4A XT:A:U NM:i:3 X0:i:1 X1:i:1 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 MD:Z:28C36G9 XA:Z:chr5,+134263658,14M1I61M,4;
	4	r764 4 * 0 0 * * 0 0 TTAAGGGGAACGTGTGGGCTATTTAGGCTTTATG BBB=?BBA?>;?=B=AA=;A@B>=;;>:A=?:?9
	5	r1288 16 chrM 8 37 11M1I7M * 0 0 TCACTTACCTGTACACACA /*F2;?@%A@?-,.+4=4= XT:A:U NM:i:4 X0:i:1 X1:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 MD:Z:2T0T1A69
	6	r1902 0 chr1 4 37 7M2D18M * 0 0 AGTCTCTTACCTGACGGTTATGA <2;?@BA@?-,.+4=4=4AA663 XT:A:U NM:i:3 X0:i:1 X1:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 MD:Z:17^CA58A0
	7	r2204 16 chrM 9 0 19M * 0 0 CTGGTACCTGACAGGTATC 2;?@BA@?-,.+4=4=4AA XT:A:R NM:i:1 X0:i:2 X1:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 MD:Z:0T75 XA:Z:chr1,-564927,76M,1;
	8	r2314 16 chrM 6 37 10M2D6M * 0 0 TCACTCTTACGTCTGA <2;?@BA@?-,.+4=4 XT:A:U NM:i:3 X0:i:1 X1:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 MD:Z:25A5^CA45
	9	r3001 0 chrM 13 37 3M1D5M2I7M * 0 0 TACAGTCACCCTCATCA <2;?@BA/(@?-,$& XT:A:U NM:i:3 X0:i:1 X1:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 MD:Z:17^CA58A0
	10	r3218 0 chr1 13 37 8M1D7M * 0 0 TACAGTCACTCATCA <2;?@BA/(@?-,$& XT:A:U NM:i:3 X0:i:1 X1:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 MD:Z:17^CA58A0
	11	r3760 4 * 0 0 * * 0 0 CCTGTGATCCATCGTGATGTCTTATTTAAGG BABCBCBBBABBACBCABCAACBBCBBB=?B
	12	r4767 16 chr2 3 37 15M2I7M * 0 0 CAGACTCTCTTACCAAAGACAGAC <2;?@BA/(@?-,.+4=4=4AA66 XT:A:U NM:i:4 X0:i:1 X1:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 MD:Z:2T1A4T65
	13	r5333 0 chrM 5 37 17M1D8M * 0 0 GTCTCTCATACCAGACAACGGCAT FB3$@BA/(@?-,.+4=4=4AA66 XT:A:U NM:i:4 X0:i:1 X1:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 MD:Z:45C10^C0C5C13
	14	r6121 4 * 0 0 * * 0 0 GTTAATAGGGTGATAGA AB/BC==CC%ACBC/CB
	15	r6690 16 chrM 7 23 20M * 0 0 CTCTCTTACCAGACAGACAT 2;?@BA/(@?-,.+4=4=4A XT:A:U NM:i:0 X0:i:1 X1:i:1 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 MD:Z:76 XA:Z:chr1,-568532,76M,1;
	16	r7211 0 chrM 7 37 24M * 0 0 CGACAGAGACAAAATAACATTTAA //<2;?@BA@?-,.+4=442;;6: XT:A:U NM:i:3 X0:i:1 X1:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 MD:Z:73G0G0
	17	r8122 4 * 0 0 * * 0 0 GACCTGTGATCCATCGTGATGT CBBAB/$3BB<AB/,CBCABCA
	18	r9922 16 chrM 4 0 7M3I9M * 0 0 CCAGACATTTGAAATCAGG F/D4=44^D++26632;;6 XT:A:U NM:i:0 X0:i:1 X1:i:1 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 MD:Z:76
	19	r9987 16 chrM 4 0 9M1I18M * 0 0 AGGTTCTCATTACCTGACACTCATCTTG G/AD6"/+4=4426632;;6:<2;?@BA XT:A:U NM:i:0 X0:i:1 X1:i:1 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 MD:Z:76
	20	r10145 16 chr1 16 0 5M2D7M * 0 0 CACATTGTTGTA G//+4=44=4AA XT:A:U NM:i:0 X0:i:1 X1:i:1 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 MD:Z:76
	21	r10324 16 chrM 15 0 6M1D5M * 0 0 CCGTTCTACTTG A@??8.G//+4= XT:A:U NM:i:0 X0:i:1 X1:i:1 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 MD:Z:76
	22	r11324 4 * 0 0 * * 0 0 AATAGGGTGATAGACCTG //CCCC#ACB;;C3BA5C
	23	r12331 16 chrM 17 0 4M2I6M * 0 0 AGTCGAATACGTG 632;;6:<2;?@B XT:A:U NM:i:0 X0:i:1 X1:i:1 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 MD:Z:76
	24	r12914 16 chr2 24 0 4M3I3M * 0 0 ACTACCCCAA G//+4=42,. XT:A:U NM:i:0 X0:i:1 X1:i:1 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 MD:Z:76

Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。

Context Navigation

root/galaxy-central/test-data/indel_analysis_in2.sam @ 2

異なるフォーマットでダウンロード: