root/galaxy-central/test-data/mutation_data1.txt @ 3

リビジョン 2, 11.3 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central
行番号 
1chrM    72      73      G       26394   4       49      0       26447   26398   1       23389   3       45      0       23437   23392   1       3133    0       5       0       3138    3133    1       4087    0       6       0       4093    4087    1       9544    0       18      0       9562    9544    1       14437   1       22      1       14461   14439   1       11325   0       3       1       11329   11326   1       3595    0       9       1       3605    3596    1       12029   0       14      0       12043   12029   1       10441   0       21      0       10462   10441   1 chrM    149     150     T       11      50422   2       96      50531   50435   1       4       45417   1       65      45487   45422   1       0       4050    0       2       4052    4050    1       0       4488    0       4       4492    4488    1       3       18713   0       22      18738   18716   1       7       26855   0       33      26895   26862   1       1       13677   1       6       13685   13679   1       0       4635    0       13      4648    4635    1       4       26401   3       44      26452   26408   1       5       19462   0       18      19485   19467   1 chrM    194     195     C       0       102     2       58672   58776   58674   1       1       191     0       52080   52272   52081   1       3       8       0       3709    3720    3712    1       3       7       1       4600    4611    4604    1       1       35      1       21266   21303   21268   1       4       73      1       30175   30253   30180   1       6       14      0       13695   13715   13701   1       1       7       0       4786    4794    4787    1       2       31      1       31363   31397   31366   1       1       29      3       21865   21898   21869   1 chrM    299     300     A       18619   88      12      0       18719   100     0       18153   84      5       0       18242   89      0       568     32      0       0       623     32      2       774     31      0       0       828     31      2       6658    22      1       0       6681    23      0       10589   37      5       0       10631   42      0       2288    85      1       0       2455    86      2       637     30      0       0       696     30      2       8133    41      2       0       8176    43      0       7327    26      5       0       7358    31      0 chrM    309     310     C       6       11340   0       1433    12779   1439    2       3       11229   0       1336    12568   1339    2       1       778     0       4       783     5       0       0       1065    0       3       1069    3       0       0       4297    0       464     4761    464     2       1       6162    1       765     6929    767     2       0       3075    0       6       3083    6       0       0       875     0       1       876     1       0       1       5064    0       644     5709    645     2       2       4468    0       582     5052    584     2 chrM    310     311     T       1       1362    0       3775    5138    1363    2       1       1389    1       4222    5613    1391    2       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       1       448     0       1636    2085    449     2       0       795     0       2176    2971    795     2       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       567     0       2128    2695    567     2       0       558     0       1397    1955    558     2 chrM    409     410     A       2       3       1       30151   30157   30155   1       2       13      3       30355   30373   30371   1       1       0       0       2752    2754    2752    1       1       1       0       2996    2998    2997    1       1       2       0       12262   12265   12264   1       4       8       1       16960   16973   16969   1       3       8       0       8837    8853    8845    1       0       0       0       2942    2942    2942    1       0       3       1       16259   16263   16263   1       1       3       0       11363   11367   11366   1 chrM    2353    2354    C       3       34      3       63620   63660   63626   1       4       15      1       58084   58104   58089   1       1       0       0       2981    2982    2982    1       0       3       0       4267    4271    4267    1       0       7       0       23235   23242   23235   1       5       12      0       35778   35795   35783   1       5       3       0       12254   12264   12259   1       3       1       0       3923    3928    3926    1       4       7       2       32378   32391   32384   1       2       6       0       24366   24374   24368   1 chrM    2484    2485    C       0       20      0       27765   27785   27765   1       2       29      0       24596   24627   24598   1       0       1       0       698     699     698     1       0       5       0       879     884     879     1       0       8       1       10159   10168   10160   1       2       23      1       16036   16062   16039   1       2       5       0       2555    2562    2557    1       0       3       0       761     764     761     1       0       4       2       12896   12902   12898   1       0       14      0       10916   10930   10916   1 chrM    2707    2708    g       27267   1       48      1       27317   27269   1       25550   1       42      1       25594   25552   1       2662    1       4       0       2667    2663    1       3230    0       1       0       3231    3230    1       10833   0       5       1       10839   10834   1       16605   0       24      2       16631   16607   1       9785    0       3       1       9791    9786    1       3116    0       6       1       3123    3117    1       13825   1       33      0       13859   13826   1       10957   0       14      0       10971   10957   1 chrM    3011    3012    G       75871   4       113     2       75990   75877   1       53124   4       84      4       53216   53132   1       8422    0       67      1       8491    8423    1       6613    2       7       0       6622    6615    1       22042   1       37      2       22082   22045   1       28451   4       43      4       28502   28459   1       18438   2       12      12      18464   18452   1       9704    1       10      2       9718    9707    1       37763   2       132     2       37899   37767   1       33885   3       62      3       33953   33891   1 chrM    3434    3435    A       38932   0       22      0       38954   22      0       28983   0       13      0       28996   13      0       1994    0       37      0       2031    37      2       1889    0       5       0       1894    5       0       10426   0       4       0       10430   4       0       10332   0       8       0       10340   8       0       5307    1       4       0       5312    5       0       1790    0       2       1       1793    3       0       25278   0       103     0       25381   103     0       14218   0       17      0       14235   17      0 chrM    3480    3481    A       22066   0       45      1       22112   46      0       17217   1       20      0       17238   21      0       1704    0       37      0       1741    37      2       1732    0       3       0       1735    3       0       6049    2       6       1       6058    9       0       5498    1       6       0       5505    7       0       4669    0       7       0       4676    7       0       1589    0       0       0       1589    0       0       14664   0       95      0       14759   95      0       8272    0       21      1       8294    22      0 chrM    5063    5064    T       3       91      5       79483   79582   99      0       4       59      3       59163   59229   66      0       0       45      0       2293    2338    45      2       1       46      0       2247    2294    47      2       0       16      1       20733   20750   17      0       0       22      0       20220   20242   22      0       2       4       0       5222    5228    6       0       0       5       0       2068    2073    5       0       4       31      2       49253   49290   37      0       2       37      2       28632   28673   41      0 chrM    5580    5581    C       2       13      1       12180   12196   12183   1       0       10      0       8677    8687    8677    1       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       1       3       0       3115    3119    3116    1       0       1       0       2806    2807    2806    1       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       6       0       5995    6001    5995    1       0       6       0       3799    3805    3799    1 chrM    7028    7029    T       8       5269    1       105     5383    5278    2       4       3685    2       55      3746    3691    1       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       1       1562    0       51      1614    1563    2       1       1396    0       47      1444    1397    2       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       3       3503    0       341     3847    3506    2       2       1928    0       67      1997    1930    2 chrM    8701    8702    G       65164   7       68      1       65240   65172   1       51607   3       70      1       51681   51611   1       3206    0       2       0       3208    3206    1       3036    0       8       0       3045    3036    1       18911   0       22      0       18933   18911   1       17348   1       21      1       17371   17350   1       7376    0       7       0       7384    7376    1       2752    0       6       0       2758    2752    1       44676   5       36      1       44718   44682   1       24266   1       33      3       24303   24270   1 chrM    8992    8993    C       6       32924   2       16918   49850   16926   2       9       20572   2       16675   37258   16686   2       0       1292    0       587     1879    587     2       0       1324    0       607     1931    607     2       1       9979    0       5030    15010   5031    2       2       9001    3       4879    13885   4884    2       1       2413    0       2171    4585    2172    2       1       828     0       604     1433    605     2       8       22642   1       10798   33449   10807   2       6       12485   0       5968    18459   5974    2 chrM    9377    9378    G       29155   4       68      3       29230   29162   1       22590   1       52      1       22644   22592   1       1311    0       5       0       1316    1311    1       1413    1       4       0       1418    1414    1       8996    0       18      0       9014    8996    1       8356    2       21      0       8379    8358    1       3699    0       5       0       3704    3699    1       1000    0       8       0       1008    1000    1       20883   0       37      1       20921   20884   1       10550   2       27      0       10579   10552   1 chrM    9540    9541    C       4       8       4       28819   28835   28827   1       0       9       1       22950   22960   22951   1       0       1       0       2325    2327    2325    1       0       3       0       2325    2328    2325    1       0       1       2       7816    7819    7818    1       0       2       0       7913    7915    7913    1       0       2       0       5783    5786    5783    1       0       0       0       2036    2036    2036    1       0       5       1       16604   16610   16605   1       0       4       1       11200   11205   11201   1 chrM    10398   10399   G       66134   2       150     8       66294   66144   1       48839   0       93      2       48934   48841   1       2035    0       43      0       2078    2035    2       2565    0       11      0       2576    2565    1       17496   0       24      2       17522   17498   1       16169   1       27      0       16197   16170   1       5940    0       4       1       5945    5941    1       2232    0       5       1       2238    2233    1       36668   4       232     2       36906   36674   1       22711   1       66      0       22778   22712   1 chrM    10550   10551   A       74049   6       63      2       74120   71      0       56316   0       47      0       56363   47      0       3414    0       62      0       3476    62      2       3268    0       3       0       3271    3       0       20413   0       20      1       20434   21      0       20500   1       23      0       20524   24      0       8413    0       4       3       8420    7       0       2905    1       0       0       2906    1       0       49435   3       246     1       49685   250     0       26154   0       39      0       26193   39      0 chrM    10819   10820   G       102048  8       109     0       102165  102056  1       98352   15      73      1       98441   98368   1       11816   1       8       1       11849   11818   1       17967   2       17      1       18020   17970   1       34660   5       38      0       34703   34665   1       45769   5       42      1       45817   45775   1       45832   2       18      6       45917   45840   1       21529   2       17      2       21603   21533   1       55823   7       41      1       55872   55831   1       41514   1       39      1       41555   41516   1 chrM    10873   10874   C       4       334     8       101706  102052  101718  1       6       306     5       110569  110886  110580  1       0       7       0       3345    3352    3345    1       0       8       1       3306    3315    3307    1       1       128     1       41600   41730   41602   1       3       130     3       51874   52010   51880   1       2       16      0       8571    8589    8573    1       0       11      0       3417    3428    3417    1       3       176     4       67437   67620   67444   1       2       92      1       39849   39944   39852   1 chrM    11017   11018   C       2       107     2       56456   56567   56460   1       0       81      1       47605   47687   47606   1       3       14      0       4468    4485    4471    1       5       28      0       8816    8849    8821    1       1       24      0       18568   18593   18569   1       0       28      2       21379   21409   21381   1       8       44      2       28099   28154   28109   1       2       40      5       12017   12064   12024   1       1       36      3       33901   33941   33905   1       1       39      0       20246   20286   20247   1 chrM    11299   11300   T       10      336     9       110226  110581  355     0       11      245     5       88175   88436   261     0       1       105     1       6018    6125    107     2       0       26      0       6381    6407    26      0       3       90      3       34717   34813   96      0       5       122     0       43156   43283   127     0       2       55      0       16730   16787   57      0       1       31      0       8903    8935    32      0       8       365     7       62861   63241   380     0       5       134     6       39079   39224   145     0 chrM    11719   11720   A       99      2       39249   3       39353   39254   1       62      4       34101   8       34175   34113   1       1       0       1332    0       1333    1332    1       1       0       1821    1       1823    1822    1       26      0       14441   0       14467   14441   1       33      0       20179   2       20214   20181   1       4       0       5059    1       5064    5060    1       2       0       1607    0       1609    1607    1       58      3       17478   1       17540   17482   1       30      0       15111   1       15142   15112   1 chrM    11722   11723   C       1       35      0       41858   41894   41859   1       1       29      0       36410   36440   36411   1       0       3       0       1385    1388    1385    1       0       2       0       1935    1937    1935    1       0       6       0       15395   15401   15395   1       0       15      0       21603   21618   21603   1       0       6       2       5159    5167    5161    1       1       2       1       1664    1668    1666    1       0       7       0       18965   18972   18965   1       0       13      1       16136   16150   16137   1 chrM    12705   12706   T       10      75459   0       22      75491   75469   1       10      65631   1       17      65659   65642   1       0       3062    1       0       3063    3063    1       1       4062    0       1       4065    4063    1       3       25753   0       7       25763   25756   1       5       37515   0       12      37532   37520   1       0       11340   0       9       11349   11340   1       0       4052    0       1       4053    4052    1       8       34266   0       3       34277   34274   1       8       27100   0       7       27115   27108   1 chrM    12850   12851   G       46567   1       36      1       46605   46569   1       40398   2       31      0       40431   40400   1       1317    0       0       0       1317    1317    1       1893    0       3       0       1896    1893    1       16848   2       4       0       16854   16850   1       24019   1       20      0       24040   24020   1       4794    0       7       0       4801    4794    1       1550    0       1       0       1551    1550    1       21752   0       13      0       21765   21752   1       17627   0       18      0       17645   17627   1 chrM    14053   14054   A       26124   15      101     4       26244   120     0       26956   4       63      3       27026   70      0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       8438    5       15      3       8461    23      0       13898   4       45      3       13950   52      0       687     1       9       2       699     12      1       0       0       0       0       0       0       0       9397    4       23      0       9424    27      0       9886    4       25      0       9915    29      0 chrM    14212   14213   C       2       41      1       56177   56221   56180   1       1       28      1       51914   51944   51916   1       1       2       0       1716    1719    1717    1       0       2       0       2198    2200    2198    1       0       2       2       19614   19618   19616   1       1       23      1       29488   29513   29490   1       1       3       0       6082    6087    6083    1       0       0       0       2066    2066    2066    1       0       9       0       28450   28459   28450   1       0       17      0       21138   21155   21138   1 chrM    14580   14581   G       45013   2       25      1       45041   45016   1       41510   2       24      0       41536   41512   1       2618    0       0       0       2618    2618    1       3842    0       2       2       3846    3844    1       15738   1       8       0       15747   15739   1       23187   1       22      1       23211   23189   1       9996    0       4       1       10001   9997    1       4043    0       1       0       4044    4043    1       19632   1       3       0       19636   19633   1       16565   0       16      0       16581   16565   1 chrM    14766   14767   T       6       46856   3       61      46926   46865   1       6       43558   2       35      43601   43566   1       0       2111    0       2       2113    2111    1       0       3170    0       1       3171    3170    1       2       17178   1       17      17198   17181   1       4       23031   1       30      23066   23036   1       3       8510    0       7       8520    8513    1       1       3048    0       6       3055    3049    1       1       20274   0       51      20326   20275   1       2       17619   0       37      17658   17621   1 chrM    14905   14906   A       15      1       39481   7       39504   39489   1       10      0       35463   9       35482   35472   1       1       0       2479    0       2480    2479    1       0       0       3393    0       3393    3393    1       5       1       15201   0       15207   15202   1       5       1       22237   5       22248   22243   1       1       1       9729    2       9733    9732    1       2       0       3152    0       3154    3152    1       9       0       19057   3       19069   19060   1       4       0       14805   2       14811   14807   1 chrM    15301   15302   A       19      3       46253   2       46277   46258   1       15      0       40199   2       40216   40201   1       0       0       3325    0       3325    3325    1       0       0       4466    0       4466    4466    1       7       1       16415   1       16424   16417   1       6       0       22924   3       22933   22927   1       8       0       12264   5       12277   12269   1       0       0       4301    1       4302    4302    1       5       1       22130   2       22138   22133   1       7       0       18198   0       18205   18198   1 chrM    15932   15933   C       6       15      3       59133   59157   59142   1       0       20      2       54009   54031   54011   1       0       0       0       3323    3323    3323    1       0       6       0       5061    5067    5061    1       0       8       0       21128   21136   21128   1       1       24      0       32868   32893   32869   1       2       3       0       13485   13492   13487   1       0       3       1       5238    5242    5239    1       2       3       0       20445   20450   20447   1       1       14      0       20645   20660   20646   1 chrM    16172   16173   C       4       26      0       10165   10195   10169   1       2       8       0       9289    9299    9291    1       0       15      0       1380    1395    1380    1       0       5       0       1429    1434    1429    1       0       0       1       3986    3987    3987    1       0       2       1       5510    5513    5511    1       0       8       0       4092    4100    4092    1       0       3       0       1404    1407    1404    1       0       3       0       4706    4709    4706    1       0       10      0       3883    3893    3883    1 chrM    16183   16184   C       2687    5       2       0       2694    2689    1       2563    4       1       0       2568    2564    1       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       1174    2       0       0       1176    1174    1       1520    4       0       0       1524    1520    1       477     3       0       1       698     478     1       0       0       0       0       0       0       0       1174    1       0       0       1175    1174    1       1133    1       0       0       1134    1133    1 chrM    16184   16185   C       0       2210    0       0       2210    0       0       0       2051    0       0       2051    0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       888     0       0       888     0       0       0       1181    0       0       1181    0       0       306     663     2       0       972     308     2       0       0       0       0       0       0       0       0       924     0       0       924     0       0       0       914     0       0       914     0       0 chrM    16189   16190   C       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       987     0       26      1013    26      2       0       1079    0       39      1118    39      2       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       2974    0       98      3072    98      2       0       998     0       36      1034    36      2       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0 chrM    16190   16191   C       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       49      0       931     980     931     2       0       61      0       1080    1141    1080    2       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       188     0       2842    3030    2842    2       0       55      0       951     1006    951     2       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0       0 chrM    16224   16225   T       4       17135   0       11      17150   17139   1       1       14988   0       0       14989   14989   1       0       1957    0       0       1957    1957    1       0       2510    0       2       2513    2510    1       0       6840    0       1       6841    6840    1       2       8277    0       9       8288    8279    1       1       6934    0       3       6938    6935    1       0       2431    1       0       2432    2432    1       1       8744    0       2       8747    8745    1       2       6450    1       3       6456    6453    1 chrM    16240   16241   C       1       48      1       22188   22238   22190   1       0       26      1       19721   19748   19722   1       0       3       0       2305    2308    2305    1       0       5       0       3050    3055    3050    1       0       11      2       8824    8837    8826    1       0       26      0       10813   10839   10813   1       1       7       0       8378    8387    8379    1       0       5       0       2884    2889    2884    1       1       26      0       11620   11647   11621   1       0       9       0       8493    8502    8493    1 chrM    16321   16322   T       4       55783   1       23      55811   55788   1       4       48176   0       16      48196   48180   1       0       4551    1       2       4554    4552    1       0       4846    0       3       4849    4846    1       3       20330   0       11      20344   20333   1       4       27565   0       12      27581   27569   1       2       14910   0       3       14916   14912   1       0       5105    0       2       5108    5105    1       1       26605   0       10      26616   26606   1       5       21141   0       8       21154   21146   1
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。