root/galaxy-central/test-data/ortho_ms_mut.tab

リビジョン 2, 6.5 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central

行番号 
1#Window Species_1       Window_Start    Window_End      Species_2       Groupby_Feature SubGroupby_Feature      Mutability      Count
25       hg18.chr1       6483    6496    panTro2.chr15   100042575       100042588       trinucleotide   GCT     0.00e+00        4
310      hg18.chr1       18452   18467   panTro2.chr15   100038029       100038042       mononucleotide  T       4.00e+00        13
410      hg18.chr1       18452   18467   panTro2.chr15   100038029       100038042       dinucleotide    GT      1.00e+00        5
512      hg18.chr1       20736   20756   panTro2.chr15_random    1091184 1091198 dinucleotide    TC      9.00e+00        7
613      hg18.chr1       20799   20812   panTro2.chrUn   1510811 1510831 dinucleotide    TC      1.10e+01        24
714      hg18.chr1       23384   23405   panTro2.chrUn   1508999 1509025 mononucleotide  A       1.00e+00        15
814      hg18.chr1       23384   23405   panTro2.chrUn   1508999 1509025 mononucleotide  T       1.30e+01        36
915      hg18.chr1       25352   25371   panTro2.chr15_random    1087905 1087924 tetranucleotide AAAT    0.00e+00        4
1016      hg18.chr1       30503   30522   panTro2.chrUn   139457  139482  trinucleotide   TTC     0.00e+00        4
1116      hg18.chr1       30503   30522   panTro2.chrUn   139457  139482  mononucleotide  A       1.00e+00        13
1216      hg18.chr1       30503   30522   panTro2.chrUn   139457  139482  mononucleotide  T       1.85e+01        32
1317      hg18.chr1       34037   34047   panTro2.chrUn   9698527 9698537 mononucleotide  A       4.50e+00        23
1419      hg18.chr1       41728   41741   panTro2.chrUn   9706479 9706495 mononucleotide  A       5.00e+00        23
1519      hg18.chr1       41728   41741   panTro2.chrUn   9706479 9706495 dinucleotide    GT      0.00e+00        16
1620      hg18.chr1       44654   44681   panTro2.chrUn   9709915 9709942 tetranucleotide TTTC    4.50e+00        21
1722      hg18.chr1       52103   52120   panTro2.chrUn   9718011 9718024 mononucleotide  T       1.00e+00        18
1822      hg18.chr1       52103   52120   panTro2.chrUn   9718011 9718024 dinucleotide    AC      4.00e+00        6
1925      hg18.chr1       63706   63720   panTro2.chrUn   9730896 9730914 mononucleotide  T       1.60e+01        14
2025      hg18.chr1       63706   63720   panTro2.chrUn   9730896 9730914 dinucleotide    TA      0.00e+00        6
2125      hg18.chr1       63706   63720   panTro2.chrUn   9730896 9730914 tetranucleotide ATAC    9.00e+00        5
2226      hg18.chr1       67038   67059   panTro2.chrUn   9734760 9734777 mononucleotide  A       1.60e+01        17
2327      hg18.chr1       72077   72088   panTro2.chrUn   9742946 9742957 dinucleotide    AC      0.00e+00        5
2428      hg18.chr1       73838   73906   panTro2.chr15   99975357        99975380        tetranucleotide AAAG    1.44e+02        10
2532      hg18.chr1       81064   81077   panTro2.chrUn   1797471 1797489 mononucleotide  A       2.50e+01        13
2635      hg18.chr1       82527   82541   panTro2.chr1_random     7070707 7070721 mononucleotide  A       0.00e+00        14
2740      hg18.chr1       91199   91212   panTro2.chr1_random     7089889 7089900 mononucleotide  A       4.00e+00        11
2841      hg18.chr1       91538   91554   panTro2.chr1    223998154       223998167       mononucleotide  A       9.00e+00        13
2942      hg18.chr1       95472   95491   panTro2.chr1_random     7092383 7092404 dinucleotide    AT      1.85e+01        22
3042      hg18.chr1       95472   95491   panTro2.chr1_random     7092383 7092404 dinucleotide    AC      3.60e+01        12
3143      hg18.chr1       96802   96815   panTro2.chr1    243988  244001  dinucleotide    TC      0.00e+00        6
3244      hg18.chr1       98409   98425   panTro2.chr1_random     7095323 7095342 mononucleotide  A       9.00e+00        16
3345      hg18.chr1       101230  101250  panTro2.chr1    248453  248467  mononucleotide  A       1.85e+01        25
3445      hg18.chr1       101230  101250  panTro2.chr1    248453  248467  dinucleotide    GT      4.00e+00        17
3549      hg18.chr1       112974  112995  panTro2.chr1    262299  262320  trinucleotide   TAA     4.00e+00        4
3649      hg18.chr1       112974  112995  panTro2.chr1    262299  262320  dinucleotide    TA      5.00e-01        15
3749      hg18.chr1       112974  112995  panTro2.chr1    262299  262320  mononucleotide  T       9.00e+00        15
3849      hg18.chr1       112974  112995  panTro2.chr1    262299  262320  dinucleotide    CA      1.00e+00        5
3955      hg18.chr1       114709  114728  panTro2.chr1    262958  262973  mononucleotide  A       1.60e+01        30
4056      hg18.chr1       120154  120164  panTro2.chr1    269287  269300  mononucleotide  A       8.89e+00        109
4156      hg18.chr1       120154  120164  panTro2.chr1    269287  269300  mononucleotide  T       8.80e+00        89
4272      hg18.chr1       141348  141361  panTro2.chr1_random     7195790 7195814 mononucleotide  T       3.65e+01        65
4372      hg18.chr1       141348  141361  panTro2.chr1_random     7195790 7195814 trinucleotide   GTG     0.00e+00        8
4472      hg18.chr1       141348  141361  panTro2.chr1_random     7195790 7195814 trinucleotide   AAC     0.00e+00        21
4572      hg18.chr1       141348  141361  panTro2.chr1_random     7195790 7195814 mononucleotide  A       8.33e+00        52
4672      hg18.chr1       141348  141361  panTro2.chr1_random     7195790 7195814 trinucleotide   TTA     0.00e+00        4
4772      hg18.chr1       141348  141361  panTro2.chr1_random     7195790 7195814 trinucleotide   AAT     0.00e+00        25
4873      hg18.chr1       145718  145733  panTro2.chr1_random     7202121 7202135 mononucleotide  A       1.00e+00        14
4974      hg18.chr1       146971  146985  panTro2.chr1_random     7209449 7209463 mononucleotide  A       2.00e+00        24
5074      hg18.chr1       146971  146985  panTro2.chr1_random     7209449 7209463 mononucleotide  T       4.00e+00        10
5175      hg18.chr1       156998  157017  panTro2.chr1_random     7219691 7219710 mononucleotide  T       4.00e+00        16
5275      hg18.chr1       156998  157017  panTro2.chr1_random     7219691 7219710 tetranucleotide GGAG    0.00e+00        16
5375      hg18.chr1       156998  157017  panTro2.chr1_random     7219691 7219710 tetranucleotide TTTA    0.00e+00        24
5475      hg18.chr1       156998  157017  panTro2.chr1_random     7219691 7219710 pentanucleotide AAAAC   1.00e+00        8
5575      hg18.chr1       156998  157017  panTro2.chr1_random     7219691 7219710 mononucleotide  A       3.00e+00        61
5675      hg18.chr1       156998  157017  panTro2.chr1_random     7219691 7219710 dinucleotide    AC      0.00e+00        34
5776      hg18.chr1       160798  160818  panTro2.chr1    224075335       224075355       mononucleotide  T       2.50e+01        13
5876      hg18.chr1       160798  160818  panTro2.chr1    224075335       224075355       pentanucleotide GTTTT   0.00e+00        4
5977      hg18.chr1       165310  165322  panTro2.chr1_random     7295748 7295770 mononucleotide  A       1.00e+02        24
6077      hg18.chr1       165310  165322  panTro2.chr1_random     7295748 7295770 dinucleotide    CA      0.00e+00        10
6178      hg18.chr1       166066  166095  panTro2.chr1    224080667       224080691       pentanucleotide AAAAC   1.00e+00        4
6283      hg18.chr1       219668  219689  panTro2.chr3    77587413        77587435        tetranucleotide TAAA    0.00e+00        5
6387      hg18.chr1       222298  222309  panTro2.chrUn   1781936 1781946 mononucleotide  T       1.00e+00        20
6493      hg18.chr1       228854  228869  panTro2.chr1_random     7327066 7327078 mononucleotide  A       2.90e+01        31
6594      hg18.chr1       231193  231209  panTro2.chr1    223990552       223990572       mononucleotide  T       1.60e+01        16
6697      hg18.chr1       237516  237529  panTro2.chr1_random     7333512 7333527 mononucleotide  A       1.00e+01        28
6797      hg18.chr1       237516  237529  panTro2.chr1_random     7333512 7333527 mononucleotide  T       1.60e+01        15
6897      hg18.chr1       237516  237529  panTro2.chr1_random     7333512 7333527 tetranucleotide TTTA    9.00e+00        7
6998      hg18.chr1       237855  237870  panTro2.chr1    223998154       223998167       mononucleotide  A       4.00e+00        13
7099      hg18.chr1       245760  245793  panTro2.chr1_random     7340006 7340026 dinucleotide    AT      2.50e+01        52
7199      hg18.chr1       245760  245793  panTro2.chr1_random     7340006 7340026 dinucleotide    TC      1.67e+01        64
7299      hg18.chr1       245760  245793  panTro2.chr1_random     7340006 7340026 mononucleotide  A       2.50e+01        34
7399      hg18.chr1       245760  245793  panTro2.chr1_random     7340006 7340026 dinucleotide    GT      2.31e+01        114
7499      hg18.chr1       245760  245793  panTro2.chr1_random     7340006 7340026 dinucleotide    AC      4.90e+01        34
75100     hg18.chr1       247545  247565  panTro2.chr1_random     7109243 7109259 mononucleotide  A       8.00e+00        26
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。