root/galaxy-central/test-data/perm_out1.sam @ 2

リビジョン 2, 5.8 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central
Rev行番号 
[2]1HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1761:343/1    65      PHIX174 5       255     50M     =       69      64      TTTATCGCTTCCATGACGCAGAAGTTAACACTTTCGGATATTTCTGATGA      IIIIIII""IIIIIIIIIII?I0IIIIHIIIGIIIII0II?I""IIIIII      NM:i:0
2HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1761:343/1    129     PHIX174 69      255     50M     =       5       64      TTGATAAAGCAGGAATTACTACTGCTTGTTTACGAATTAAATCGAAGTGG      IIIIIII""IIIIIII0II?I""IIIIIIIIIIII?I0IIIIHIIIGIII      NM:i:0
3HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1578:331/1    65      PHIX174 209     255     50M     =       268     59      TGTCAAAAACTGACGCGTTGGATGAGGAGAAGTGGCTTAATATGCTTGGC      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII"IIIIIII000IIII      NM:i:0
4HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1578:331/1    129     PHIX174 268     255     50M     =       209     59      AAGGACTGGTTTAGATATGAGTCACATTTTGTTCATGGTAGAGATTCTCT      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII?I0IIIIHIIIGIII      NM:i:0
5HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1647:512/1    65      PHIX174 401     255     50M     =       451     50      TACTGAACAATCCGTACGTTTCCAGACCGCTTTGGCCTCTATTAAGCTCA      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII"IIIIIII000IIII      NM:i:0
6HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1647:512/1    129     PHIX174 451     255     50M     =       401     50      TTCAGGCTTCTGCCGTTTTGGATTTAACCGAAGATGATTTCGATTTTCTG      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII?I0IIIIHIIIGIII      NM:i:0
7HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1570:620/2    0       PHIX174 559     255     50M     *       0       0       CTTGCGTTTATGGTACGCTGGACTTTGTGGGATACCCTCGCTTTCCTGCT      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIBIIIIIIIIIIII?I0IIIIHIIIGIII      NM:i:0
8HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1599:330/1    65      PHIX174 803     255     50M     =       868     65      AGAAGAAAACGTGCGTCAAAAATTACGTGCAGAAGGAGTGATGTAATGTC      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIIIIIII<III@II"IIIIIII000IIII      NM:i:0
9HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1599:330/1    129     PHIX174 868     255     50M     =       803     65      TTCTGGCGCTCGCCCTGGTCGTCCGCAGCCGTTGCGAGGTACTAAAGGCA      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIIIIIII<III@II?I0IIIIHIIIGIII      NM:i:0
10HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1652:270/2    0       PHIX174 973     255     50M     *       0       0       GCTTCGGCCCCTTACTTGAGGATAAATTATGTCTAATATTCAAACTGGCG      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII6II?I0IIIIHIIIGIII      NM:i:0
11HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1746:351/1    0       PHIX174 1218    255     50M     *       0       0       CTCATCGTCACGTTTATGGTGAACAGTGGATTAAGTTCATGAAGGATGGT      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII"IIIIIII000IIII      NM:i:0
12HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1582:633/1    0       PHIX174 1517    255     50M     *       0       0       CCGCTTCCTCCTGAGACTGAGCTTTCTCGCCAAATGACGACTTCTACCAC      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII"IIIIIII000IIII      NM:i:0
13HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1598:534/1    65      PHIX174 1717    255     50M     =       1772    55      GCGCTCTAATCTCTGGGCATCTGGCTATGATGTTGATGGAACTGACCAAA      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII"IIIIIII000IIII      NM:i:0
14HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1598:534/1    129     PHIX174 1772    255     50M     =       1717    55      TTAGGCCAGTTTTCTGGTCGTGTTCAACAGACCTATAAACATTCTGTGCC      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII?I0IIIIHIIIGIII      NM:i:0
15HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1572:324/2    0       PHIX174 1972    255     50M     *       0       0       GCCGCCGCGTGAAATTTCTATGAAGGATGTTTTCCGTTCTGGTGATTCGT      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIIIIIIII+7I05I?I0IIIIHIIIGIII      NM:i:0
16HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1749:466/1    65      PHIX174 2201    255     50M     =       2251    50      TTGCAGTGGAATAGTCAGGTTAAATTTAATGTGACCGTTTATCGCAATCT      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII"IIIIIII000IIII      NM:i:0
17HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1749:466/1    129     PHIX174 2251    255     50M     =       2201    50      GCCGACCACTCGCGATTCAATCATGACTTCGTGATAAAAGATTGAGTGTG      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII?I0IIIIHIIIGIII      NM:i:0
18HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1629:446/1    65      PHIX174 2301    255     50M     =       2355    54      AGGTTATAACGCCGAAGCGGTAAAAATTTTAATTTTTGCCGCTGAGGGGT      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII"IIIIIII000IIII      NM:i:0
19HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1629:446/1    129     PHIX174 2355    255     50M     =       2301    54      CAAGCGAAGCGCGGTAGGTTTTCTGCTTAGGAGTTTAATCATGTTTCAGA      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII?I0IIIIHIIIGIII      NM:i:0
20HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1763:587/1    65      PHIX174 2501    255     50M     =       2566    65      AAGCTACATCGTCAACGTTATATTTTGATAGTTTGACGGTTAATGCTGGT      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII"IIIIIII000IIII      NM:i:0
21HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1763:587/1    129     PHIX174 2566    255     50M     =       2501    65      CATTGCATTCAGATGGATACATCTGTCAACGCCGCTAATCAGGTTGTTTC      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII?I0IIIIHIIIGIII      NM:i:0
22HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1616:363/1    65      PHIX174 2718    255     50M     =       2773    55      TGTTTATCCTTTGAATGGTCGCCATGATGGTGGTTATTATACCGTCAAGG      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIDIII"IIIIIII000IIII      NM:i:0
23HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1616:363/1    129     PHIX174 2773    255     50M     =       2718    55      GTGACTATTGACGTCCTTCCCCGTACGCCGGGCAATAATGTTTATGTTGG      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIDIII?I0IIIIHIIIGIII      NM:i:0
24HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1768:715/1    65      PHIX174 3118    255     50M     =       3173    55      ACCCTGATGAGGCCGCCCCTAGTTTTGTTTCTGGTGCTATGGCTAAAGCT      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIDIIIIIIIIIIII"IIIIIII000IIII      NM:i:0
25HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1768:715/1    129     PHIX174 3173    255     50M     =       3118    55      AGGACTTCTTGAAGGTACGTTGCAGGCTGGCACTTCTGCCGTTTCTGATA      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIDIIIIIIIIIIII?I0IIIIHIIIGIII      NM:i:0
26HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1572:270/1    65      PHIX174 3518    255     50M     =       3577    59      TGAGATGCTTGCTTATCAACAGAAGGAGTCTACTGCTCGCGTTGCGTCTA      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII"IIIIIII000IIII      NM:i:0
27HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1572:270/1    129     PHIX174 3577    255     50M     =       3518    59      ACACCAATCTTTCCAAGCAACAGCAGGTTTCCGAGATTATGCGCCAAATG      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII?I0IIIIHIIIGIII      NM:i:0
28HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1785:1272/1   65      PHIX174 3818    255     50M     =       3873    55      TATTTTTCATGGTATTGATAAAGCTGTTGCCGATACTTGGAACAATTTCT      III""""""IIIIIIIII""FI"IIII""II+ICI"IIIIIII000IIII      NM:i:0
29HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1785:1272/1   129     PHIX174 3873    255     50M     =       3818    55      GACGGTAAAGCTGATGGTATTGGCTCTAATTTGTCTAGGAAATAACCGTC      III""""""IIIIIIIII""FI"IIII""II+ICI?I0IIIIHIIIGIII      NM:i:0
30HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1673:514/1    65      PHIX174 4018    255     50M     =       4072    54      ATTATTTTGACTTTGAGCGTATCGAGGCTCTTAAACCTGCTATTGAGGCT      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII1"IIIIIII000IIII      NM:i:0
31HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1673:514/1    129     PHIX174 4072    255     50M     =       4018    54      GCATTTCTACTCTTTCTCAATCCCCAATGCTTGGCTTCCATAAGCAGATG      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII1?I0IIIIHIIIGIII      NM:i:0
32HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1634:330/1    65      PHIX174 4418    255     50M     =       4473    55      GGATATTCGCGATGAGTATAATTACCCCAAAAAGAAAGGTATTAAGGATG      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII8II"IIIIIII000IIII      NM:i:0
33HWI-EAS91_1_30788AAXX:1:1:1634:330/1    129     PHIX174 4473    255     50M     =       4418    55      TCAAGATTGCTGGAGGCCTCCACTATGAAATCGCGTAGAGGCTTTACTAT      IIIIIII""IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII8II?I0IIIIHIIIGIII      NM:i:0
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。