root/galaxy-central/test-data/pileup_parser.6col.20-3-no-no.pileup.out

リビジョン 2, 18.9 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central

行番号 
1chrM    45      A       3       ..^:.   III     3       0       0       0       3
2chrM    46      G       4       ...^:.  IIII    0       0       4       0       4
3chrM    47      A       5       ....^:, IIIII   5       0       0       0       5
4chrM    48      T       5       ....,   IIIII   0       0       0       5       5
5chrM    49      G       5       ....,   IIIII   0       0       5       0       5
6chrM    50      A       5       ....,   IIIII   5       0       0       0       5
7chrM    51      G       5       ....,   IIIII   0       0       5       0       5
8chrM    52      T       5       ....,   IIIII   0       0       0       5       5
9chrM    53      A       5       ....,   IIIII   5       0       0       0       5
10chrM    54      T       5       ....,   IIIII   0       0       0       5       5
11chrM    55      T       5       ....,   IIIII   0       0       0       5       5
12chrM    56      C       5       ....,   IIIII   0       5       0       0       5
13chrM    57      T       5       ....,   IIIII   0       0       0       5       5
14chrM    58      T       5       ....,   IIIII   0       0       0       5       5
15chrM    59      A       5       ....,   IIIII   5       0       0       0       5
16chrM    60      C       5       ....,   IIIII   0       5       0       0       5
17chrM    61      T       5       ....,   IIIII   0       0       0       5       5
18chrM    62      C       5       ....,   IIIII   0       5       0       0       5
19chrM    63      C       5       ....,   IIIII   0       5       0       0       5
20chrM    64      A       5       ....,   IIIII   5       0       0       0       5
21chrM    65      T       5       ....,   IIIII   0       0       0       5       5
22chrM    66      A       5       ....,   IIIII   5       0       0       0       5
23chrM    67      A       5       ....,   IIIII   5       0       0       0       5
24chrM    68      A       5       ....,   IIICI   5       0       0       0       5
25chrM    69      C       5       ....,   IIIII   0       5       0       0       5
26chrM    70      A       5       ....,   IIIII   5       0       0       0       5
27chrM    71      C       5       ....,   IIIII   0       5       0       0       5
28chrM    72      A       5       ....,   IAIII   5       0       0       0       5
29chrM    73      T       5       ....,   IIIII   0       0       0       5       5
30chrM    74      A       5       ....,   IIIII   5       0       0       0       5
31chrM    75      G       5       ....,   %IIII   0       0       4       0       4
32chrM    76      G       5       T...,   *IIII   0       0       4       0       4
33chrM    77      C       5       .$...,  GIIII   0       5       0       0       5
34chrM    78      T       4       .$..,   IIII    0       0       0       4       4
35chrM    79      T       3       ..,     III     0       0       0       3       3
36chrM    80      G       3       .$.,    I1I     0       0       2       0       2
37chrM    181     A       3       ,,^:,   III     3       0       0       0       3
38chrM    182     G       3       ,,,     III     0       0       3       0       3
39chrM    183     G       3       ,,,     III     0       0       3       0       3
40chrM    184     T       3       ,,,     III     0       0       0       3       3
41chrM    185     A       3       ,,,     III     3       0       0       0       3
42chrM    186     T       3       ,,,     III     0       0       0       3       3
43chrM    187     C       3       ,,,     III     0       3       0       0       3
44chrM    188     A       3       ,,,     III     3       0       0       0       3
45chrM    189     A       3       ,,,     III     3       0       0       0       3
46chrM    190     G       3       ,,,     III     0       0       3       0       3
47chrM    191     C       3       ,$,,    III     0       3       0       0       3
48chrM    229     A       3       .^:,^:, %II     2       0       0       0       2
49chrM    230     C       3       .,,     8II     0       3       0       0       3
50chrM    231     C       3       .,,     9II     0       3       0       0       3
51chrM    232     C       3       .,,     III     0       3       0       0       3
52chrM    233     C       3       .,,     AI'     0       2       0       0       2
53chrM    234     C       3       .,,     DI+     0       2       0       0       2
54chrM    235     A       3       .,,     &I@     2       0       0       0       2
55chrM    236     C       3       .$,a    +I$     0       1       0       0       1
56chrM    244     A       3       ,,^:,   II;     3       0       0       0       3
57chrM    245     G       3       ,,,     II*     0       0       2       0       2
58chrM    246     C       3       ,,n     II"     0       2       0       0       2
59chrM    247     A       3       ,,,     III     3       0       0       0       3
60chrM    248     G       4       ,,,^:.  IIII    0       0       4       0       4
61chrM    249     T       4       ,,,.    II)I    0       0       0       3       3
62chrM    250     G       4       ,,,.    II2I    0       0       3       0       3
63chrM    251     A       4       ,,,.    II(I    3       0       0       0       3
64chrM    252     T       4       ,,,.    II*I    0       0       0       3       3
65chrM    253     A       4       ,,,.    II7I    4       0       0       0       4
66chrM    254     A       4       ,,,.    II1I    3       0       0       0       3
67chrM    255     A       4       ,,,.    II?I    4       0       0       0       4
68chrM    256     A       4       ,,,.    II9I    4       0       0       0       4
69chrM    257     A       4       ,,,.    II?I    4       0       0       0       4
70chrM    258     T       4       ,,,.    II$I    0       0       0       3       3
71chrM    259     T       5       ,,,.^:. II&II   0       0       0       4       4
72chrM    260     A       5       ,,,..   II,II   4       0       0       0       4
73chrM    261     A       5       ,,,..   II/II   4       0       0       0       4
74chrM    262     G       5       ,,,..   II5II   0       0       5       0       5
75chrM    263     C       5       ,,a..   II%II   0       4       0       0       4
76chrM    264     T       5       ,$,$,.. II%II   0       0       0       4       4
77chrM    265     A       3       ,..     )II     2       0       0       0       2
78chrM    266     T       3       ,..     +II     0       0       0       2       2
79chrM    267     G       4       ,..^:.  *III    0       0       3       0       3
80chrM    268     A       4       ,...    EIII    4       0       0       0       4
81chrM    269     A       4       ,...    =III    4       0       0       0       4
82chrM    270     C       4       a...    ;III    1       3       0       0       4
83chrM    271     G       4       ,...    ;III    0       0       4       0       4
84chrM    272     A       4       ,...    8@II    4       0       0       0       4
85chrM    273     A       4       ,...    1III    3       0       0       0       3
86chrM    274     A       4       ,...    ICII    4       0       0       0       4
87chrM    275     G       4       ,...    IIII    0       0       4       0       4
88chrM    276     T       4       ,...    IIII    0       0       0       4       4
89chrM    277     T       4       ,...    IIII    0       0       0       4       4
90chrM    278     C       4       ,...    IIII    0       4       0       0       4
91chrM    279     G       4       ,$...   IIII    0       0       4       0       4
92chrM    280     A       3       ...     III     3       0       0       0       3
93chrM    281     C       3       ...     GII     0       3       0       0       3
94chrM    282     T       3       ...     III     0       0       0       3       3
95chrM    283     A       3       .$..    IFI     3       0       0       0       3
96chrM    284     A       3       ..^:,   IAI     3       0       0       0       3
97chrM    285     G       3       ..,     ;II     0       0       3       0       3
98chrM    286     T       4       ..,^:.  IIII    0       0       0       4       4
99chrM    287     C       4       ..,.    II4I    0       3       0       0       3
100chrM    288     A       4       ..,.    @III    4       0       0       0       4
101chrM    289     T       4       ..,.    IIII    0       0       0       4       4
102chrM    290     A       4       ..,.    @:II    4       0       0       0       4
103chrM    291     T       4       ..,.    IIAI    0       0       0       4       4
104chrM    292     T       4       ..,.    IIII    0       0       0       4       4
105chrM    293     A       4       ..,.    8;II    4       0       0       0       4
106chrM    294     A       4       .$.,.   I<II    4       0       0       0       4
107chrM    295     A       3       .,.     4II     2       0       0       0       2
108chrM    296     T       3       .,.     III     0       0       0       3       3
109chrM    297     A       3       .,.     BII     3       0       0       0       3
110chrM    298     A       3       .,.     CII     3       0       0       0       3
111chrM    299     G       3       .,.     III     0       0       3       0       3
112chrM    300     G       3       .,.     ;II     0       0       3       0       3
113chrM    301     G       3       .,.     III     0       0       3       0       3
114chrM    302     T       3       .$,.    III     0       0       0       3       3
115chrM    312     T       3       ,.^:.   III     0       0       0       3       3
116chrM    313     C       3       ,..     III     0       3       0       0       3
117chrM    314     G       3       ,..     III     0       0       3       0       3
118chrM    315     T       3       ,..     III     0       0       0       3       3
119chrM    316     G       3       ,..     III     0       0       3       0       3
120chrM    317     C       3       ,..     III     0       3       0       0       3
121chrM    318     C       3       ,..     III     0       3       0       0       3
122chrM    319     A       3       ,$..    III     3       0       0       0       3
123chrM    390     A       3       ..^:.   III     3       0       0       0       3
124chrM    391     A       3       ...     >II     3       0       0       0       3
125chrM    392     A       3       ...     III     3       0       0       0       3
126chrM    393     T       3       ...     III     0       0       0       3       3
127chrM    394     A       3       ...     III     3       0       0       0       3
128chrM    395     A       3       .$..    III     3       0       0       0       3
129chrM    400     A       3       ..^:.   III     3       0       0       0       3
130chrM    401     A       3       ...     III     3       0       0       0       3
131chrM    402     A       3       ...     III     3       0       0       0       3
132chrM    403     A       3       ...     III     3       0       0       0       3
133chrM    404     C       3       ...     III     0       3       0       0       3
134chrM    405     C       3       ...     III     0       3       0       0       3
135chrM    406     C       3       ...     EII     0       3       0       0       3
136chrM    407     A       3       ...     III     3       0       0       0       3
137chrM    408     G       3       ...     III     0       0       3       0       3
138chrM    409     T       3       ...     0II     0       0       0       2       2
139chrM    410     T       3       ...     III     0       0       0       3       3
140chrM    411     A       4       ...^:,  IIII    4       0       0       0       4
141chrM    412     A       4       ...,    FIII    4       0       0       0       4
142chrM    413     G       4       ...,    IIIH    0       0       4       0       4
143chrM    414     C       4       ...a    III2    0       3       0       0       3
144chrM    415     C       4       TTTt    III7    0       0       0       4       4
145chrM    416     G       5       ...,^:, II?7:   0       0       5       0       5
146chrM    417     T       5       ...,,   ;IIE@   0       0       0       5       5
147chrM    418     A       5       ...,,   IIIII   5       0       0       0       5
148chrM    419     A       5       ...,,   IIIII   5       0       0       0       5
149chrM    420     A       5       ...,,   FIIII   5       0       0       0       5
150chrM    421     A       5       ...,,   IIIII   5       0       0       0       5
151chrM    422     A       5       ...,,   >IIII   5       0       0       0       5
152chrM    423     G       6       ...,,^:,        HII/I,  0       0       4       0       4
153chrM    424     C       6       .$..a,, ;II-I:  0       5       0       0       5
154chrM    425     T       5       .$.,,,  IIIIF   0       0       0       5       5
155chrM    426     A       5       .,,,^:, III@I   5       0       0       0       5
156chrM    427     C       5       .,,,,   III$I   0       4       0       0       4
157chrM    428     A       5       .,,,,   IIIII   5       0       0       0       5
158chrM    429     A       5       .,,,,   IIII.   4       0       0       0       4
159chrM    430     C       5       .,,,a   I%I5'   0       3       0       0       3
160chrM    431     C       5       .,,,,   I(I5<   0       4       0       0       4
161chrM    432     A       5       .,,,,   IIIII   5       0       0       0       5
162chrM    433     A       5       .,,,,   0IIII   4       0       0       0       4
163chrM    434     A       5       .,,,,   =IIII   5       0       0       0       5
164chrM    435     G       5       .$,,,,  EIIII   0       0       5       0       5
165chrM    436     T       4       ,,,,    III5    0       0       0       4       4
166chrM    437     A       4       ,,,,    IIII    4       0       0       0       4
167chrM    438     A       4       ,,,,    IIII    4       0       0       0       4
168chrM    439     A       4       ,,,,    IIII    4       0       0       0       4
169chrM    440     A       4       ,,,,    IIIF    4       0       0       0       4
170chrM    441     T       6       ,,,,^:.^:.      III;II  0       0       0       6       6
171chrM    442     A       6       ,,,,..  IIIIII  6       0       0       0       6
172chrM    443     G       6       ,,,,..  IIIIII  0       0       6       0       6
173chrM    444     A       6       ,,,,..  IIIIII  6       0       0       0       6
174chrM    445     C       6       ,,,,..  IIIIII  0       6       0       0       6
175chrM    446     T       6       ,$,,,.. IIIIII  0       0       0       6       6
176chrM    447     A       5       ,,,..   IIIII   5       0       0       0       5
177chrM    448     C       5       ,,,..   IIIII   0       5       0       0       5
178chrM    449     G       6       ,,,..^:,        IIIII6  0       0       6       0       6
179chrM    450     A       6       ,,,..,  IIIIII  6       0       0       0       6
180chrM    451     A       6       ,$,,.., IIIIII  6       0       0       0       6
181chrM    452     A       5       ,,..,   IIIII   5       0       0       0       5
182chrM    453     G       5       ,,..,   IIIII   0       0       5       0       5
183chrM    454     T       6       ,,..,^:,        IIIIII  0       0       0       6       6
184chrM    455     G       6       ,,..,,  IIIIII  0       0       6       0       6
185chrM    456     A       6       ,,..,,  IIIIII  6       0       0       0       6
186chrM    457     C       6       ,,..,,  IIIII=  0       6       0       0       6
187chrM    458     T       6       ,$,..,, IIIIII  0       0       0       6       6
188chrM    459     T       5       ,..,,   IIIII   0       0       0       5       5
189chrM    460     T       5       ,..,,   IIIII   0       0       0       5       5
190chrM    461     A       5       ,$..,,  IIIII   5       0       0       0       5
191chrM    462     A       4       ..,,    IIII    4       0       0       0       4
192chrM    463     T       4       ..,,    IIIC    0       0       0       4       4
193chrM    464     A       4       ..,,    IIII    4       0       0       0       4
194chrM    465     C       4       ..,,    IIII    0       4       0       0       4
195chrM    466     C       4       ..,,    IIII    0       4       0       0       4
196chrM    467     T       4       ..,,    II>?    0       0       0       4       4
197chrM    468     C       4       ..,,    IIII    0       4       0       0       4
198chrM    469     T       4       ..,,    IIIG    0       0       0       4       4
199chrM    470     G       4       ..,,    %III    0       0       3       0       3
200chrM    471     A       4       ..,,    4;II    3       0       0       0       3
201chrM    472     C       4       ..,,    II3I    0       3       0       0       3
202chrM    473     T       4       ..,,    IIII    0       0       0       4       4
203chrM    474     A       4       ..,,    ;III    4       0       0       0       4
204chrM    475     C       4       ..,,    IIII    0       4       0       0       4
205chrM    476     A       4       .$.$,,  32II    2       0       0       0       2
206chrM    480     T       3       ,,^:.   III     0       0       0       3       3
207chrM    481     A       3       ,,.     III     3       0       0       0       3
208chrM    482     G       3       ,,.     III     0       0       3       0       3
209chrM    483     C       4       ,,.^:,  IIIE    0       4       0       0       4
210chrM    484     T       4       ,$,.,   III9    0       0       0       4       4
211chrM    485     A       3       ,.,     III     3       0       0       0       3
212chrM    486     A       3       ,.,     III     3       0       0       0       3
213chrM    487     G       3       ,.,     III     0       0       3       0       3
214chrM    488     A       3       ,.,     III     3       0       0       0       3
215chrM    489     C       3       ,$.,    III     0       3       0       0       3
216chrM    510     C       3       .,^:.   III     0       3       0       0       3
217chrM    511     C       3       .,.     III     0       3       0       0       3
218chrM    512     A       3       .,.     6II     3       0       0       0       3
219chrM    513     C       3       .,.     III     0       3       0       0       3
220chrM    514     T       3       .,.     III     0       0       0       3       3
221chrM    515     A       3       .$,.    III     3       0       0       0       3
222chrM    518     C       3       ,$.^:.  III     0       3       0       0       3
223chrM    520     T       3       ..^:,   III     0       0       0       3       3
224chrM    521     A       3       ..,     III     3       0       0       0       3
225chrM    522     G       3       ..,     II,     0       0       2       0       2
226chrM    523     C       3       ..,     III     0       3       0       0       3
227chrM    524     C       3       ..,     II7     0       3       0       0       3
228chrM    525     C       3       ..,     III     0       3       0       0       3
229chrM    526     T       3       ..,     II?     0       0       0       3       3
230chrM    527     A       3       ..,     III     3       0       0       0       3
231chrM    528     A       3       ..,     III     3       0       0       0       3
232chrM    529     A       3       ..,     FII     3       0       0       0       3
233chrM    530     C       3       ..,     II+     0       2       0       0       2
234chrM    531     T       3       ..,     III     0       0       0       3       3
235chrM    532     A       3       ..,     :II     3       0       0       0       3
236chrM    533     A       3       ..,     DGI     3       0       0       0       3
237chrM    534     A       3       ..,     III     3       0       0       0       3
238chrM    535     A       3       ..,     ?CI     3       0       0       0       3
239chrM    536     T       3       ..,     III     0       0       0       3       3
240chrM    537     A       3       ..,     9II     3       0       0       0       3
241chrM    538     G       3       ..,     III     0       0       3       0       3
242chrM    539     C       3       ..,     III     0       3       0       0       3
243chrM    540     T       3       ..,     III     0       0       0       3       3
244chrM    541     T       3       ..,     III     0       0       0       3       3
245chrM    542     A       4       ..,^:.  IIII    4       0       0       0       4
246chrM    543     C       4       ..,.    IIII    0       4       0       0       4
247chrM    544     C       4       ..,.    IIII    0       4       0       0       4
248chrM    545     A       4       N$.,.   "III    3       0       0       0       3
249chrM    546     C       3       .,.     III     0       3       0       0       3
250chrM    547     A       3       .,.     DII     3       0       0       0       3
251chrM    548     A       3       .,.     EII     3       0       0       0       3
252chrM    549     C       3       .,.     III     0       3       0       0       3
253chrM    550     A       3       .,.     III     3       0       0       0       3
254chrM    551     A       3       .,.     6II     3       0       0       0       3
255chrM    552     A       3       .,.     GII     3       0       0       0       3
256chrM    553     G       3       .$,.    ?II     0       0       3       0       3
257chrM    577     A       3       .$.^:.  III     3       0       0       0       3
258chrM    580     A       3       ..^:,   III     3       0       0       0       3
259chrM    581     G       3       ..,     III     0       0       3       0       3
260chrM    582     C       3       ..,     II?     0       3       0       0       3
261chrM    583     C       3       ..a     II-     0       2       0       0       2
262chrM    584     T       3       ..,     IIH     0       0       0       3       3
263chrM    585     A       3       ..,     III     3       0       0       0       3
264chrM    586     A       3       ..,     III     3       0       0       0       3
265chrM    587     A       4       ..,^:,  IIII    4       0       0       0       4
266chrM    588     A       4       ..,,    IIII    4       0       0       0       4
267chrM    589     C       4       ..,,    IIII    0       4       0       0       4
268chrM    590     T       4       ..,,    II.5    0       0       0       3       3
269chrM    591     C       4       .$.,,   II<I    0       4       0       0       4
270chrM    592     A       3       .,,     III     3       0       0       0       3
271chrM    593     A       3       .,,     III     3       0       0       0       3
272chrM    594     A       3       .,,     III     3       0       0       0       3
273chrM    595     G       3       .,,     III     0       0       3       0       3
274chrM    596     G       3       .,,     III     0       0       3       0       3
275chrM    597     A       3       .,,     :EI     3       0       0       0       3
276chrM    598     C       3       .,,     III     0       3       0       0       3
277chrM    599     T       4       .,,^:.  II@I    0       0       0       4       4
278chrM    600     T       4       .,,.    IIII    0       0       0       4       4
279chrM    601     G       4       .,,.    IIII    0       0       4       0       4
280chrM    602     G       4       .,,.    IIII    0       0       4       0       4
281chrM    603     C       4       .,,.    IIII    0       4       0       0       4
282chrM    604     G       4       .,,.    IIII    0       0       4       0       4
283chrM    605     G       4       .,,.    IIII    0       0       4       0       4
284chrM    606     T       4       .,,.    5III    0       0       0       4       4
285chrM    607     G       4       .,,.    IIII    0       0       4       0       4
286chrM    608     C       4       .,,.    *III    0       3       0       0       3
287chrM    609     T       5       .,,.^:, ?IIII   0       0       0       5       5
288chrM    610     T       5       .,,.,   IIII8   0       0       0       5       5
289chrM    611     T       5       .,,.,   IIIII   0       0       0       5       5
290chrM    612     A       5       T$,,.,  3IIII   4       0       0       0       4
291chrM    613     C       4       ,,.,    III)    0       3       0       0       3
292chrM    614     A       4       ,,.,    IIII    4       0       0       0       4
293chrM    615     T       4       ,$,.,   IIII    0       0       0       4       4
294chrM    616     C       3       ,.,     III     0       3       0       0       3
295chrM    617     C       3       ,.,     III     0       3       0       0       3
296chrM    618     C       3       ,.,     III     0       3       0       0       3
297chrM    619     T       3       ,.,     IF9     0       0       0       3       3
298chrM    620     C       3       ,.,     II7     0       3       0       0       3
299chrM    621     T       3       ,.,     III     0       0       0       3       3
300chrM    622     A       3       ,$.,    I7I     3       0       0       0       3
301chrM    652     C       3       .,^:,   II)     0       2       0       0       2
302chrM    653     G       3       .,,     II2     0       0       2       0       2
303chrM    654     A       3       .,,     III     3       0       0       0       3
304chrM    655     T       4       .,,^:.  II*I    0       0       0       3       3
305chrM    656     A       4       .,,.    IIII    4       0       0       0       4
306chrM    657     A       4       .,,.    IIII    4       0       0       0       4
307chrM    658     A       4       .,,.    IIII    4       0       0       0       4
308chrM    659     C       4       .,,.    IIII    0       4       0       0       4
309chrM    660     C       4       .,,.    IIII    0       4       0       0       4
310chrM    661     C       4       .,,.    IIII    0       4       0       0       4
311chrM    662     C       4       .,,.    IIFI    0       4       0       0       4
312chrM    663     A       4       .,,.    =IDI    4       0       0       0       4
313chrM    664     C       4       .,,.    II6I    0       4       0       0       4
314chrM    665     C       5       .,,.^:, IIIII   0       5       0       0       5
315chrM    666     A       5       .,,.,   BIIII   5       0       0       0       5
316chrM    667     T       5       .,,.,   II5I+   0       0       0       4       4
317chrM    668     C       5       .,,.,   IIIII   0       5       0       0       5
318chrM    669     C       5       .,,.,   IIIII   0       5       0       0       5
319chrM    670     C       5       .,a.,   II.II   0       4       0       0       4
320chrM    671     T       5       .,,.,   IIIIA   0       0       0       5       5
321chrM    672     T       6       .,,.,^:.        FI9I.I  0       0       0       5       5
322chrM    673     G       6       .,,.,.  IIIIII  0       0       6       0       6
323chrM    674     C       6       .,,.,.  IIIIII  0       6       0       0       6
324chrM    675     T       6       .,,.,.  IIIIII  0       0       0       6       6
325chrM    676     A       6       .,,.,.  ,IIEII  5       0       0       0       5
326chrM    677     A       7       .,,.,.^:.       3II;III 6       0       0       0       6
327chrM    678     T       7       .,,.,.. IIIIDII 0       0       0       7       7
328chrM    679     T       7       .,,.,.. CIIIIII 0       0       0       7       7
329chrM    680     C       7       .,,.,.. IIIIIII 0       7       0       0       7
330chrM    681     A       7       .$,,.,..        9IIIIII 7       0       0       0       7
331chrM    682     G       6       ,,.,..  II$III  0       0       5       0       5
332chrM    683     C       6       ,,.,..  IIIIII  0       6       0       0       6
333chrM    684     C       6       ,$,.,.. IIIIII  0       6       0       0       6
334chrM    685     T       5       ,.,..   IIIII   0       0       0       5       5
335chrM    686     A       5       ,.,..   IIIII   5       0       0       0       5
336chrM    687     T       5       ,$.,..  IIIII   0       0       0       5       5
337chrM    688     A       4       .,..    IIII    4       0       0       0       4
338chrM    689     T       4       .,..    IIII    0       0       0       4       4
339chrM    690     A       4       .$,..   IIII    4       0       0       0       4
340chrM    691     C       3       ,..     III     0       3       0       0       3
341chrM    692     C       3       ,..     III     0       3       0       0       3
342chrM    693     G       4       ,..^:,  IIII    0       0       4       0       4
343chrM    694     C       4       ,..,    IIII    0       4       0       0       4
344chrM    695     C       4       ,..,    IIII    0       4       0       0       4
345chrM    696     A       4       ,..,    IIII    4       0       0       0       4
346chrM    697     T       4       ,..,    IIII    0       0       0       4       4
347chrM    698     C       4       ,..,    IIII    0       4       0       0       4
348chrM    699     T       4       ,..,    IIII    0       0       0       4       4
349chrM    700     T       4       ,$..,   IIII    0       0       0       4       4
350chrM    701     C       3       ..,     III     0       3       0       0       3
351chrM    702     A       3       ..,     III     3       0       0       0       3
352chrM    703     G       3       ..,     2II     0       0       2       0       2
353chrM    704     C       3       ..,     III     0       3       0       0       3
354chrM    705     A       3       N.,     "II     2       0       0       0       2
355chrM    706     A       3       ..,     I5I     3       0       0       0       3
356chrM    707     A       3       .$.,    GII     3       0       0       0       3
357chrM    726     A       3       ,,^:.   III     3       0       0       0       3
358chrM    727     G       3       ,,.     III     0       0       3       0       3
359chrM    728     T       3       ,$,.    III     0       0       0       3       3
360chrM    732     C       3       a.^:.   $II     0       2       0       0       2
361chrM    733     A       3       ,..     III     3       0       0       0       3
362chrM    734     C       3       ,..     %II     0       2       0       0       2
363chrM    735     A       3       ,..     III     3       0       0       0       3
364chrM    736     A       3       ,..     *II     2       0       0       0       2
365chrM    737     A       3       ,..     III     3       0       0       0       3
366chrM    738     T       3       ,..     III     0       0       0       3       3
367chrM    739     A       3       ,..     III     3       0       0       0       3
368chrM    740     T       3       ,..     III     0       0       0       3       3
369chrM    741     C       3       ,..     III     0       3       0       0       3
370chrM    742     C       3       ,..     III     0       3       0       0       3
371chrM    743     A       3       ,..     III     3       0       0       0       3
372chrM    744     A       3       ,..     III     3       0       0       0       3
373chrM    745     C       3       ,..     III     0       3       0       0       3
374chrM    746     A       3       ,..     IIE     3       0       0       0       3
375chrM    747     T       3       ,..     III     0       0       0       3       3
376chrM    748     A       3       ,..     III     3       0       0       0       3
377chrM    749     A       3       ,..     III     3       0       0       0       3
378chrM    750     A       3       ,..     III     3       0       0       0       3
379chrM    751     A       3       ,..     IAI     3       0       0       0       3
380chrM    752     A       3       ,..     III     3       0       0       0       3
381chrM    753     C       3       ,..     III     0       3       0       0       3
382chrM    754     G       3       ,$..    III     0       0       3       0       3
383chrM    756     T       3       ..^:,   III     0       0       0       3       3
384chrM    757     A       3       ..,     III     3       0       0       0       3
385chrM    758     G       3       ..,     III     0       0       3       0       3
386chrM    759     G       3       ..,     III     0       0       3       0       3
387chrM    760     T       3       ..,     =II     0       0       0       3       3
388chrM    761     C       3       .$.,    IID     0       3       0       0       3
389chrM    767     G       3       .$,^:,  III     0       0       3       0       3
390chrM    769     A       3       ,,^:,   III     3       0       0       0       3
391chrM    770     G       3       ,,,     III     0       0       3       0       3
392chrM    771     C       3       ,,,     IHI     0       3       0       0       3
393chrM    772     C       3       ,a,     I)/     0       1       0       0       1
394chrM    773     C       3       ,,,     I7I     0       3       0       0       3
395chrM    774     A       4       ,,,^:.  II:I    4       0       0       0       4
396chrM    775     T       4       ,,,.    IH.I    0       0       0       3       3
397chrM    776     G       4       ,,,.    IIII    0       0       4       0       4
398chrM    777     G       4       ,,,.    IIII    0       0       4       0       4
399chrM    778     G       4       ,,,.    IIII    0       0       4       0       4
400chrM    779     A       4       ,,,.    IIAI    4       0       0       0       4
401chrM    780     T       4       ,,,.    IIGI    0       0       0       4       4
402chrM    781     G       4       ,,,.    IIII    0       0       4       0       4
403chrM    782     G       4       ,,,.    IIII    0       0       4       0       4
404chrM    783     A       4       ,,,.    IIII    4       0       0       0       4
405chrM    784     G       4       ,,,.    IIII    0       0       4       0       4
406chrM    785     A       4       ,,,.    IIII    4       0       0       0       4
407chrM    786     G       4       ,,,.    IIII    0       0       4       0       4
408chrM    787     A       4       ,,,.    IIII    4       0       0       0       4
409chrM    788     A       4       ,,,.    IIII    4       0       0       0       4
410chrM    789     A       4       ,,,.    IIII    4       0       0       0       4
411chrM    790     T       5       ,,,.^:. IIIII   0       0       0       5       5
412chrM    791     G       5       ,$,,..  IIIII   0       0       5       0       5
413chrM    792     G       4       ,,..    IIII    0       0       4       0       4
414chrM    793     G       4       ,,..    IIII    0       0       4       0       4
415chrM    794     C       4       ,,..    IIII    0       4       0       0       4
416chrM    795     T       4       ,,..    IIII    0       0       0       4       4
417chrM    796     A       4       ,,..    IIII    4       0       0       0       4
418chrM    797     C       4       ,,..    IIII    0       4       0       0       4
419chrM    798     A       4       ,,..    IIII    4       0       0       0       4
420chrM    799     T       4       ,,..    IIII    0       0       0       4       4
421chrM    800     T       4       ,,..    IIII    0       0       0       4       4
422chrM    801     T       4       ,,..    IIII    0       0       0       4       4
423chrM    802     T       4       ,$,..   IIII    0       0       0       4       4
424chrM    803     C       3       ,..     III     0       3       0       0       3
425chrM    804     T       3       ,$..    III     0       0       0       3       3
426chrM    806     C       3       ..^:.   III     0       3       0       0       3
427chrM    807     C       3       ...     III     0       3       0       0       3
428chrM    808     C       3       ...     III     0       3       0       0       3
429chrM    809     T       3       .$..    III     0       0       0       3       3
430chrM    810     A       3       ..^:,   III     3       0       0       0       3
431chrM    811     A       3       ..,     III     3       0       0       0       3
432chrM    812     G       3       ..,     II7     0       0       3       0       3
433chrM    813     A       3       ..,     III     3       0       0       0       3
434chrM    814     A       3       ..,     III     3       0       0       0       3
435chrM    815     C       3       ..,     III     0       3       0       0       3
436chrM    816     A       3       ..,     III     3       0       0       0       3
437chrM    817     A       3       ..,     III     3       0       0       0       3
438chrM    818     G       3       ..,     III     0       0       3       0       3
439chrM    819     A       3       ..,     III     3       0       0       0       3
440chrM    820     A       3       ..,     &II     2       0       0       0       2
441chrM    821     C       3       ..,     III     0       3       0       0       3
442chrM    822     T       3       ..,     III     0       0       0       3       3
443chrM    823     T       3       ..n     II"     0       0       0       2       2
444chrM    824     T       3       ..,     III     0       0       0       3       3
445chrM    825     A       3       .$.,    III     3       0       0       0       3
446chrM    826     A       3       .,^:.   III     3       0       0       0       3
447chrM    827     C       3       .,.     III     0       3       0       0       3
448chrM    828     C       3       .,.     III     0       3       0       0       3
449chrM    829     C       4       .,.^:,  IIII    0       4       0       0       4
450chrM    830     G       4       .,.,    IIII    0       0       4       0       4
451chrM    831     G       4       .,.,    IIII    0       0       4       0       4
452chrM    832     A       4       .,.,    IIII    4       0       0       0       4
453chrM    833     C       4       .,.,    IIII    0       4       0       0       4
454chrM    834     G       4       .,.,    IIII    0       0       4       0       4
455chrM    835     A       4       .,.,    IIII    4       0       0       0       4
456chrM    836     A       4       .,.,    8III    4       0       0       0       4
457chrM    837     A       4       .,.,    IIII    4       0       0       0       4
458chrM    838     G       4       .,.,    IIII    0       0       4       0       4
459chrM    839     T       5       .,.,^:, 4:IIG   0       0       0       4       4
460chrM    840     C       5       .,.,,   IIIII   0       5       0       0       5
461chrM    841     T       5       .$,.,,  IIIII   0       0       0       5       5
462chrM    842     C       4       ,.,,    IIII    0       4       0       0       4
463chrM    843     C       4       ,.,,    IIII    0       4       0       0       4
464chrM    844     A       4       ,.,,    IIII    4       0       0       0       4
465chrM    845     T       4       ,$.,,   IIII    0       0       0       4       4
466chrM    846     G       3       .,,     @II     0       0       3       0       3
467chrM    847     A       3       .,,     III     3       0       0       0       3
468chrM    848     A       3       .,,     III     3       0       0       0       3
469chrM    849     A       3       .,,     III     3       0       0       0       3
470chrM    850     C       3       .,,     III     0       3       0       0       3
471chrM    851     T       3       .,,     III     0       0       0       3       3
472chrM    852     G       3       .,,     III     0       0       3       0       3
473chrM    853     G       3       .,,     III     0       0       3       0       3
474chrM    854     A       3       .,,     EII     3       0       0       0       3
475chrM    855     G       3       .,,     DII     0       0       3       0       3
476chrM    856     A       3       .,,     III     3       0       0       0       3
477chrM    857     C       3       .,,     III     0       3       0       0       3
478chrM    858     T       4       .,,^:,  IIIA    0       0       0       4       4
479chrM    859     A       4       .,,,    @III    4       0       0       0       4
480chrM    860     A       4       .,,,    IIII    4       0       0       0       4
481chrM    861     A       4       .$,,,   EIII    4       0       0       0       4
482chrM    862     G       3       ,,,     III     0       0       3       0       3
483chrM    863     G       3       ,,,     III     0       0       3       0       3
484chrM    864     A       3       ,$,,    III     3       0       0       0       3
485chrM    905     C       3       ,.^:,   III     0       3       0       0       3
486chrM    906     A       3       ,.,     III     3       0       0       0       3
487chrM    907     G       3       ,.,     III     0       0       3       0       3
488chrM    908     G       3       ,.,     III     0       0       3       0       3
489chrM    909     C       3       ,.,     III     0       3       0       0       3
490chrM    910     C       3       ,.,     III     0       3       0       0       3
491chrM    911     A       4       ,.,^:,  IIII    4       0       0       0       4
492chrM    912     T       4       ,.,,    IIEG    0       0       0       4       4
493chrM    913     G       4       ,.,,    III:    0       0       4       0       4
494chrM    914     A       4       ,.,,    IIII    4       0       0       0       4
495chrM    915     A       4       ,.,,    IIII    4       0       0       0       4
496chrM    916     G       4       ,.,,    III5    0       0       4       0       4
497chrM    917     C       4       ,.,,    III5    0       4       0       0       4
498chrM    918     G       4       ,.,,    IIII    0       0       4       0       4
499chrM    919     C       4       ,.,,    III<    0       4       0       0       4
500chrM    920     G       4       ,.,,    IIII    0       0       4       0       4
501chrM    921     C       4       ,.,,    IIII    0       4       0       0       4
502chrM    922     A       4       ,.,,    IIII    4       0       0       0       4
503chrM    923     C       4       ,.,,    III8    0       4       0       0       4
504chrM    924     A       4       ,.,,    IFII    4       0       0       0       4
505chrM    925     C       4       ,.,,    IIII    0       4       0       0       4
506chrM    926     A       4       ,.,,    IIII    4       0       0       0       4
507chrM    927     C       4       ,.,,    IIII    0       4       0       0       4
508chrM    928     C       5       ,.,,^:, IIII:   0       5       0       0       5
509chrM    929     G       5       ,.,,,   IIIE:   0       0       5       0       5
510chrM    930     C       5       ,.,,,   IIIII   0       5       0       0       5
511chrM    931     C       5       ,.,,,   IIIIF   0       5       0       0       5
512chrM    932     C       5       ,.,,,   IIIIC   0       5       0       0       5
513chrM    933     G       5       ,$.,,,  I?II:   0       0       5       0       5
514chrM    934     T       4       .$,,,   4II>    0       0       0       3       3
515chrM    935     C       3       ,,,     III     0       3       0       0       3
516chrM    936     A       3       ,,,     III     3       0       0       0       3
517chrM    937     C       3       ,,,     II1     0       2       0       0       2
518chrM    938     C       3       ,,,     III     0       3       0       0       3
519chrM    939     C       3       ,,,     III     0       3       0       0       3
520chrM    940     T       3       ,$,,    III     0       0       0       3       3
521chrM    958     C       3       ,.^:.   III     0       3       0       0       3
522chrM    959     A       3       ,..     III     3       0       0       0       3
523chrM    960     T       3       ,..     III     0       0       0       3       3
524chrM    961     A       3       ,..     III     3       0       0       0       3
525chrM    962     A       3       ,..     III     3       0       0       0       3
526chrM    963     C       4       ,$..^:. IIII    0       4       0       0       4
527chrM    964     A       3       ...     I(;     2       0       0       0       2
528chrM    965     T       3       ...     III     0       0       0       3       3
529chrM    966     A       4       ...^:.  IIII    4       0       0       0       4
530chrM    967     A       4       ....    IIII    4       0       0       0       4
531chrM    968     C       4       ....    IEII    0       4       0       0       4
532chrM    969     A       4       ....    IIII    4       0       0       0       4
533chrM    970     T       4       ....    IIII    0       0       0       4       4
534chrM    971     A       4       ....    IIII    4       0       0       0       4
535chrM    972     A       4       ....    IIII    4       0       0       0       4
536chrM    973     A       4       ....    II0I    3       0       0       0       3
537chrM    974     A       5       ....^:. IIIII   5       0       0       0       5
538chrM    975     C       5       .....   IIIII   0       5       0       0       5
539chrM    976     C       5       .....   IIIII   0       5       0       0       5
540chrM    977     G       5       .....   IIIII   0       0       5       0       5
541chrM    978     T       5       .....   IIIII   0       0       0       5       5
542chrM    979     G       5       .....   I0III   0       0       4       0       4
543chrM    980     A       5       .....   IIII4   4       0       0       0       4
544chrM    981     C       5       .....   IIIII   0       5       0       0       5
545chrM    982     C       5       .....   IIIII   0       5       0       0       5
546chrM    983     C       5       .....   IIIII   0       5       0       0       5
547chrM    984     A       5       .....   -IGII   4       0       0       0       4
548chrM    985     A       5       .....   4GIII   4       0       0       0       4
549chrM    986     A       5       .....   BDGII   5       0       0       0       5
550chrM    987     C       5       .....   IDIII   0       5       0       0       5
551chrM    988     A       5       .....   @<III   5       0       0       0       5
552chrM    989     T       5       .....   IIIII   0       0       0       5       5
553chrM    990     A       5       .$....  I@III   5       0       0       0       5
554chrM    991     T       4       ....    IICI    0       0       0       4       4
555chrM    992     G       4       T...    )III    0       0       3       0       3
556chrM    993     A       4       .$...   ?ICI    4       0       0       0       4
557chrM    994     A       3       ...     III     3       0       0       0       3
558chrM    995     A       3       ...     III     3       0       0       0       3
559chrM    996     G       3       ...     III     0       0       3       0       3
560chrM    997     G       3       ...     III     0       0       3       0       3
561chrM    998     A       3       .$..    4II     2       0       0       0       2
562chrM    999     G       3       ..^:.   III     0       0       3       0       3
563chrM    1000    A       3       ...     III     3       0       0       0       3
564chrM    1001    C       3       .$..    III     0       3       0       0       3
565chrM    1043    A       3       ..^:,   III     3       0       0       0       3
566chrM    1044    A       3       ..,     III     3       0       0       0       3
567chrM    1045    C       3       ..,     II7     0       3       0       0       3
568chrM    1046    C       3       ..,     II-     0       2       0       0       2
569chrM    1047    A       3       ..,     III     3       0       0       0       3
570chrM    1048    A       3       ..,     III     3       0       0       0       3
571chrM    1049    A       3       ..,     III     3       0       0       0       3
572chrM    1050    G       3       ..,     III     0       0       3       0       3
573chrM    1051    T       3       ..,     III     0       0       0       3       3
574chrM    1052    G       3       ..,     III     0       0       3       0       3
575chrM    1053    T       3       ..,     GII     0       0       0       3       3
576chrM    1054    A       3       ..,     III     3       0       0       0       3
577chrM    1055    G       3       ..,     :II     0       0       3       0       3
578chrM    1056    C       3       ..a     HI%     0       2       0       0       2
579chrM    1057    T       3       ..,     III     0       0       0       3       3
580chrM    1058    T       3       ..,     III     0       0       0       3       3
581chrM    1059    A       3       ..,     BII     3       0       0       0       3
582chrM    1060    A       3       ..,     GII     3       0       0       0       3
583chrM    1061    A       3       ..,     HII     3       0       0       0       3
584chrM    1062    C       3       ..,     III     0       3       0       0       3
585chrM    1063    A       3       ..,     DII     3       0       0       0       3
586chrM    1064    A       3       ..,     BII     3       0       0       0       3
587chrM    1065    A       3       ..,     1II     2       0       0       0       2
588chrM    1066    G       3       .$.,    &II     0       0       2       0       2
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。