root/galaxy-central/test-data/s2fq_paired_R3.csfasta @ 2

# Mon Jan 19 06:35:55 2009 /share/apps/corona/bin/filter_fasta.pl --output=/data/results/0176/0176_20090114_1/skmusc_cov_25/results.01/primary.20090119120505312 --name=0176_20090114_1_skmusc_cov_25_ --tag=R3 --minlength=25 --mask=1111111111111111111111111 --prefix=G /data/results/0176/0176_20090114_1/skmusc_cov_25/jobs/postPrimerSetPrimary.1512/rawseq 
# Cwd: /home/pipeline
# Title: 0176_20090114_1_skmusc_cov_25_
>1378_11_329_R3
G2233123221122322232333222
>1378_17_1788_R3
G3322232203232332312331032
>1378_25_2035_R3
G2232123122220222321323122
>1378_28_770_R3
G2223322202332212121232233
>1378_33_1945_R3
G2222222222222222222222222
>1378_34_789_R3
G3222133212330232020223323
>1378_35_263_R3
G2221222222222222222222222
>1378_43_186_R3
G3213022233322233321223222
>1378_51_1671_R3
G2223233233122032302123222
>1378_56_324_R3
G3213222320313002200323003
>1378_56_773_R3
G1313223122333122220232200
>1378_62_2027_R3
G2233221132211321123213212
>1378_62_2029_R3
G2221223232322321221323212
>1378_67_1795_R3
G1123211001201123113012202
>1378_68_466_R3
G1232310313202230002103323
>1378_68_1692_R3
G3323312033302231332113121
>1378_80_664_R3
G2323132123323031313223230
>1378_85_1786_R3
G3111302202123030112201202
>1378_86_1011_R3
G1022120322203033033330133
>1378_86_1789_R3
G1221102230130030003310010
>1378_91_1596_R3
G2213333310331223211333220
>1378_94_1595_R3
G3212223300111023011313221
>1378_95_1039_R3
G3233132321102232022301220
>1378_95_1767_R3
G2130033201122210021303300
>1378_96_1037_R3
G0132132221103332013301310
>1378_96_1764_R3
G3313332300111013302303331
>1378_98_1574_R3
G2022120232322222332333202
>1378_107_1647_R3
G3223132233130323322312013
>1378_111_829_R3
G2223133130322321300033023
>1378_111_1900_R3
G2210121133322213002112300
>1378_112_1483_R3
G3322023223232333213202110
>1378_125_1287_R3
G3320123222332311123202033
>1378_126_468_R3
G1000000122211222122013022
>1378_127_664_R3
G3312133321130323332331220
>1378_129_463_R3
G0000000000000000000000000
>1378_129_875_R3
G3201133301230332222233221
>1378_140_1251_R3
G3333113312323212321220232
>1378_141_809_R3
G3313123223331333333032323
>1378_144_983_R3
G2233123312322323012022232
>1378_153_270_R3
G2221123232122232302033220
>1378_155_1689_R3
G1121233122010002130210113
>1378_157_1580_R3
G3222033200222032303213022
>1378_161_317_R3
G2003110301110100002102211
>1378_177_735_R3
G2120211130001103202031220
>1378_181_1684_R3
G3333132332322333323322223
>1378_187_1407_R3
G3332223200031332312023220
>1378_203_721_R3
G1113330120310300011032011
>1378_206_2039_R3
G1111111111111111111111111