| 1 | # Mon Jan 19 06:35:55 2009 /share/apps/corona/bin/filter_fasta.pl --output=/data/results/0176/0176_20090114_1/skmusc_cov_25/results.01/primary.20090119120505312 --name=0176_20090114_1_skmusc_cov_25_ --tag=R3 --minlength=25 --mask=1111111111111111111111111 --prefix=G /data/results/0176/0176_20090114_1/skmusc_cov_25/jobs/postPrimerSetPrimary.1512/rawseq |
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| 2 | # Cwd: /home/pipeline |
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| 3 | # Title: 0176_20090114_1_skmusc_cov_25_ |
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| 4 | >1378_11_329_R3 |
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| 7 | 2 2 3 2 3 2 2 2 3 2 3 2 2 2 2 2 2 2 3 2 3 2 2 2 2 |
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| 8 | >1378_25_2035_R3 |
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| 10 | >1378_28_770_R3 |
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| 11 | 2 2 2 2 3 2 2 4 4 3 2 2 2 2 4 2 4 3 2 4 4 2 7 3 3 |
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| 12 | >1378_33_1945_R3 |
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| 13 | 26 13 21 26 30 26 20 20 21 24 22 29 23 22 22 24 19 20 22 24 23 21 17 21 19 |
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| 14 | >1378_34_789_R3 |
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| 15 | 3 2 2 2 4 3 4 3 4 4 2 2 2 3 2 2 2 2 3 2 2 2 3 2 5 |
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| 16 | >1378_35_263_R3 |
|---|
| 17 | 7 3 4 4 5 11 8 18 14 8 4 3 12 21 6 3 5 20 5 2 3 6 6 20 13 |
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| 18 | >1378_43_186_R3 |
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| 19 | 2 3 4 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 4 2 2 4 2 3 2 2 2 6 2 6 |
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| 20 | >1378_51_1671_R3 |
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| 21 | 2 2 2 4 3 3 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 15 2 2 |
|---|
| 22 | >1378_56_324_R3 |
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| 23 | 2 2 3 2 2 2 2 2 3 3 3 2 3 3 3 3 2 2 4 2 2 2 9 7 2 |
|---|
| 24 | >1378_56_773_R3 |
|---|
| 25 | 4 2 2 4 4 2 5 3 2 2 2 3 2 3 2 2 4 3 2 2 2 2 4 4 3 |
|---|
| 26 | >1378_62_2027_R3 |
|---|
| 27 | 10 9 2 2 8 11 14 4 2 2 3 8 2 4 2 2 16 3 2 6 4 13 2 5 2 |
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| 28 | >1378_62_2029_R3 |
|---|
| 29 | 8 14 3 3 3 28 7 2 2 2 2 4 2 2 2 2 8 3 3 4 3 12 5 4 2 |
|---|
| 30 | >1378_67_1795_R3 |
|---|
| 31 | 33 31 31 13 30 22 31 31 31 13 31 25 31 32 27 27 29 29 28 29 22 15 27 31 22 |
|---|
| 32 | >1378_68_466_R3 |
|---|
| 33 | 12 14 2 2 3 15 24 2 3 2 13 28 3 2 3 22 21 10 3 4 16 6 2 2 2 |
|---|
| 34 | >1378_68_1692_R3 |
|---|
| 35 | 4 2 2 2 4 4 3 4 4 2 2 4 3 2 3 2 2 3 2 2 2 3 3 2 3 |
|---|
| 36 | >1378_80_664_R3 |
|---|
| 37 | 4 4 2 2 4 11 4 3 3 2 5 3 3 2 2 2 3 2 3 4 2 2 6 4 2 |
|---|
| 38 | >1378_85_1786_R3 |
|---|
| 39 | 5 11 6 5 14 4 14 31 11 5 16 11 5 6 14 8 5 11 21 5 5 16 8 7 7 |
|---|
| 40 | >1378_86_1011_R3 |
|---|
| 41 | 11 25 3 2 2 2 8 4 2 2 3 24 3 2 2 2 16 3 3 2 3 17 2 2 2 |
|---|
| 42 | >1378_86_1789_R3 |
|---|
| 43 | 19 16 13 20 16 14 5 4 2 6 3 11 9 30 4 2 21 5 15 3 3 20 11 17 15 |
|---|
| 44 | >1378_91_1596_R3 |
|---|
| 45 | 11 6 29 4 14 18 4 28 7 8 23 6 2 13 4 30 20 15 3 5 20 29 4 8 4 |
|---|
| 46 | >1378_94_1595_R3 |
|---|
| 47 | 18 11 23 31 21 6 29 23 27 22 21 29 31 31 7 12 29 24 8 22 6 9 24 19 16 |
|---|
| 48 | >1378_95_1039_R3 |
|---|
| 49 | 6 5 2 2 11 13 14 2 3 5 8 21 2 2 10 11 6 2 3 3 15 7 2 2 3 |
|---|
| 50 | >1378_95_1767_R3 |
|---|
| 51 | 8 6 11 11 17 6 7 16 15 14 29 25 28 14 22 8 13 18 5 4 21 5 8 5 21 |
|---|
| 52 | >1378_96_1037_R3 |
|---|
| 53 | 13 6 3 2 10 2 7 2 2 12 4 20 2 2 10 9 5 2 2 2 12 13 3 3 3 |
|---|
| 54 | >1378_96_1764_R3 |
|---|
| 55 | 13 19 28 6 17 23 29 13 31 19 23 23 16 33 23 15 22 25 23 17 17 29 4 8 16 |
|---|
| 56 | >1378_98_1574_R3 |
|---|
| 57 | 3 10 4 4 3 2 8 2 2 4 2 2 3 2 2 2 2 4 2 2 2 3 4 3 2 |
|---|
| 58 | >1378_107_1647_R3 |
|---|
| 59 | 3 2 2 2 6 3 3 2 3 3 3 7 2 4 2 2 2 7 2 3 2 2 3 4 2 |
|---|
| 60 | >1378_111_829_R3 |
|---|
| 61 | 3 3 2 2 6 5 2 2 2 3 2 2 8 2 4 7 3 2 3 4 2 3 6 4 2 |
|---|
| 62 | >1378_111_1900_R3 |
|---|
| 63 | 6 8 3 8 6 2 4 3 2 2 2 2 2 2 2 2 3 6 2 5 4 3 2 7 2 |
|---|
| 64 | >1378_112_1483_R3 |
|---|
| 65 | 2 2 3 2 8 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 4 2 4 6 4 |
|---|
| 66 | >1378_125_1287_R3 |
|---|
| 67 | 2 2 2 3 4 4 2 3 2 2 2 3 2 2 3 3 2 5 4 2 2 3 7 4 4 |
|---|
| 68 | >1378_126_468_R3 |
|---|
| 69 | 30 31 31 33 31 31 31 29 31 17 29 16 10 30 25 24 17 8 29 31 23 5 5 27 10 |
|---|
| 70 | >1378_127_664_R3 |
|---|
| 71 | 2 2 4 3 4 2 5 2 2 3 4 2 4 4 2 2 2 3 3 2 2 2 8 12 6 |
|---|
| 72 | >1378_129_463_R3 |
|---|
| 73 | 13 11 8 5 17 15 4 23 6 7 5 18 20 12 9 9 9 16 12 17 5 10 20 16 15 |
|---|
| 74 | >1378_129_875_R3 |
|---|
| 75 | 4 2 2 2 8 2 2 2 10 2 2 2 3 2 2 3 2 5 4 2 2 3 11 2 3 |
|---|
| 76 | >1378_140_1251_R3 |
|---|
| 77 | 2 2 4 2 4 3 2 2 3 3 3 2 2 2 2 2 2 13 3 3 3 4 2 4 7 |
|---|
| 78 | >1378_141_809_R3 |
|---|
| 79 | 2 2 2 4 8 2 2 3 3 2 2 2 2 2 4 3 2 3 2 4 4 2 6 2 2 |
|---|
| 80 | >1378_144_983_R3 |
|---|
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|---|
| 82 | >1378_153_270_R3 |
|---|
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|---|
| 84 | >1378_155_1689_R3 |
|---|
| 85 | 31 31 19 31 31 28 21 28 31 31 27 19 25 31 31 21 23 16 31 31 31 13 17 19 13 |
|---|
| 86 | >1378_157_1580_R3 |
|---|
| 87 | 2 2 4 3 5 4 2 3 3 6 4 3 4 2 3 2 2 9 2 4 3 3 3 3 2 |
|---|
| 88 | >1378_161_317_R3 |
|---|
| 89 | 8 13 5 4 6 11 6 7 31 6 6 30 22 14 14 10 5 8 10 17 13 10 8 15 8 |
|---|
| 90 | >1378_177_735_R3 |
|---|
| 91 | 31 31 31 33 29 31 32 34 24 31 32 27 33 23 31 28 24 29 22 31 20 8 29 11 15 |
|---|
| 92 | >1378_181_1684_R3 |
|---|
| 93 | 2 3 2 2 6 3 4 6 2 2 4 2 2 3 4 3 2 3 3 2 2 2 2 3 9 |
|---|
| 94 | >1378_187_1407_R3 |
|---|
| 95 | 2 2 2 2 2 5 2 2 3 3 2 2 2 3 2 2 2 2 2 4 2 2 4 4 8 |
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| 96 | >1378_203_721_R3 |
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| 97 | 24 24 27 5 13 14 16 5 31 26 16 17 6 8 30 27 16 6 11 30 14 8 5 14 13 |
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| 98 | >1378_206_2039_R3 |
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| 99 | 31 30 28 29 29 30 28 25 26 27 29 29 19 25 25 27 28 20 21 16 24 24 7 15 20 |
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