root/galaxy-central/tool-data/shared/ucsc/manual_builds.txt @ 2

リビジョン 2, 47.3 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central

行番号 
1phiX    phiX174 phiX=5386
216079   Mycobacterium sp. JLS   NC_009077=6048425
3symbTher_IAM14863       Symbiobacterium thermophilum IAM 14863  chr=3566135
416070   Yersinia pseudotuberculosis IP 31758    NC_009708=4723306,NC_009705=153140,NC_009704=58679
518883   Mycobacterium tuberculosis H37Ra        NC_009525=4419977
6nocaJS61        Nocardioides sp. JS614  plasmid_pNOCA01=307814,chr=4985871
712521   Clostridium perfringens SM101   NC_008265=38092,NC_008264=12206,NC_008263=12397,NC_008262=2897393
8acidCryp_JF_5   Acidiphilium cryptum JF-5       plasmid_pACRY07=5629,plasmid_pACRY06=8781,plasmid_pACRY05=37155,plasmid_pACRY04=37415,plasmid_pACRY03=88953,plasmid_pACRY02=187422,plasmid_pACRY01=203589,plasmid_pACRY08=4909,chr=3389227
9lactLact        Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 chr=2365589
1013082   Bacillus licheniformis ATCC 14580       NC_006322=4222645
11344     Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 NC_008384=684202,NC_008382=151564,NC_008383=147463,NC_008380=5057142,NC_008381=488135,NC_008379=352782,NC_008378=870021
12siliPome_DSS_3  Silicibacter pomeroyi DSS-3     chr=4109442,megaplasmid=491611
13paraSp_UWE25    Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25     chr=2414465
14geobKaus_HTA426 Geobacillus kaustophilus HTA426 chr=3544776,plasmid_pHTA426=47890
15rhizEtli_CFN_42 Rhizobium etli CFN 42   d=371254,plasmid_p42c=250948,plasmid_p42b=184338,plasmid_p42a=194229,plasmid_p42f=642517,plasmid_p42e=505334,chr=4381608
1613162   Streptococcus thermophilus LMG 18311    NC_006448=1796846
1713163   Streptococcus thermophilus CNRZ1066     NC_006449=1796226
1818817   Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 NC_010510=586164,NC_010502=27836,NC_010505=6077833,NC_010504=22114,NC_010507=21022,NC_010509=47003,NC_010518=36410,NC_010514=42985,NC_010517=37743
1928109   Bartonella tribocorum CIP 105476        NC_010161=2619061,NC_010160=23343
20dichNodo_VCS1703A       Dichelobacter nodosus VCS1703A  chr=1389350
2112931   Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC10331 NC_006834=4941439
22eschColi_O157H7 Escherichia coli O157:H7 str. Sakai     plasmid_pOSAK1=3306,chr=5498450,plasmid_pO157=92721
23burk383 Burkholderia sp. 383    chr3=1395069,chr2=3587082,chr1=3694126
2415759   Psychrobacter sp. PRwf-1        NC_009524=2978976,NC_009516=13956,NC_009517=2117
2515758   Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 NC_009632=2906507,NC_009619=30429
2627835   Microcystis aeruginosa NIES-843 NC_010296=5842795
27campJeju_81_176 Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176       chr=1616554,plasmid_pVir=37473,plasmid_pTet=45025
2815751   Rhodopseudomonas palustris BisA53       NC_008435=5505494
2915750   Rhodopseudomonas palustris BisB18       NC_007925=5513844
3015757   Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9 NC_009477=30429,NC_009487=2906700
3115756   Xanthobacter autotrophicus Py2  NC_009717=316164,NC_009720=5308934
3215755   Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025      NC_009428=3217726,NC_009429=877879,NC_009433=13873,NC_009432=36198,NC_009431=121962,NC_009430=289489
3315754   Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029      NC_009050=1219053,NC_009040=122606,NC_009049=3147721
3413603   Ralstonia eutropha H16  NC_008314=2912490,NC_005241=452156,NC_008313=4052032
35shewPutrCN32    Shewanella putrefaciens CN-32   chr=4659220
36aerPer1 Aeropyrum pernix K1     chr=1669696
3718255   Bacillus thuringiensis str. Al Hakam    NC_008600=5257091,NC_008598=55939
38acinSp_ADP1     Acinetobacter sp. ADP1  chr=3598621
39anapMarg_ST_MARIES      Anaplasma marginale str. St. Maries     chr=1197687
40297     Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306       NC_003922=64920,NC_003921=33700,NC_003919=5175554
41desuPsyc_LSV54  Desulfotalea psychrophila LSv54 chr=3523383,plasmid_small=14664,plasmid_large=121587
4217227   Desulfovibrio vulgaris subsp. vulgaris DP4      NC_008751=3462887,NC_008741=198504
43190     Yersinia enterocolitica subsp. enterocolitica 8081      NC_008791=67721,NC_008800=4615899
44193     Clostridium botulinum A str. ATCC 3502  NC_009495=3886916,NC_009496=16344
45270     Streptococcus pyogenes str. Manfredo    NC_009332=1841271
4616252   Synechococcus sp. JA-2-3B'a(2-13)       NC_007776=3046682
4716251   Synechococcus sp. JA-3-3Ab      NC_007775=2932766
4816319   Arcobacter butzleri RM4018      NC_009850=2341251
49276     Listeria monocytogenes EGD-e    NC_003210=2944528
50277     Streptococcus pneumoniae TIGR4  NC_003028=2160842
5113427   Heliobacterium modesticaldum Ice1       NC_010337=3075407
52279     Staphylococcus epidermidis ATCC 12228   NC_005008=4439,NC_004461=2499279,NC_005003=6585,NC_005006=8007,NC_005007=4679,NC_005004=24365,NC_005005=17261
5319979   Flavobacterium psychrophilum JIP02/86   NC_009613=2861988
5413548   Prochlorococcus marinus str. AS9601     NC_008816=1669886
5516700   Yersinia pestis Pestoides F     NC_009378=137010,NC_009381=4517345,NC_009377=71507
56therTher_HB8    Thermus thermophilus HB8        chr=1849742,plasmid_pTT27=256992,plasmid_pTT8=9322
5728035   Streptococcus pneumoniae Hungary19A-6   NC_010380=2245615
5819575   Bradyrhizobium sp. ORS278       NC_009445=7456587
5918083   Escherichia coli C str. ATCC 8739       
60methStad1       Methanosphaera stadtmanae DSM 3091      chr=1767403
61magnMagn_AMB_1  Magnetospirillum magneticum AMB-1       chr=4967148
6213901   Thermoanaerobacter pseudethanolicus ATCC 33223  NC_010321=2362816
63methBurt2       Methanococcoides burtonii DSM 6242      chr=2575032
6413908   Rhodoferax ferrireducens T118   NC_007901=257447,NC_007908=4712337
6513909   Pseudomonas putida F1   NC_009512=5959964
6616400   Haemophilus influenzae PittEE   NC_009566=1813033
6716401   Haemophilus influenzae PittGG   NC_009567=1887192
68100     Mycoplasma pulmonis UAB CTIP    NC_002771=963879
69methMari_C7     Methanococcus maripaludis C7    chr=1772694
70106     Halobacterium salinarum R1      NC_010364=2000962,NC_010367=40894,NC_010366=147625,NC_010369=194963,NC_010368=284332
71geobSulf        Geobacter sulfurreducens PCA    chr=3814139
7238      Haemophilus ducreyi 35000HP     NC_002940=1698955
7328247   Synechococcus sp. PCC 7002      NC_010480=124030,NC_010479=38515,NC_010478=31972,NC_010475=3008047,NC_010474=186459,NC_010477=16103,NC_010476=4809
7416791   Coxiella burnetii RSA 331       NC_010117=2016427,NC_010115=37317
75procMari_CCMP1375       Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375    chr=1751080
7631      Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578       NC_009653=3478,NC_009652=4259,NC_009651=88582,NC_009650=107576,NC_009648=5315120,NC_009649=175879
77oenoOeni_PSU_1  Oenococcus oeni PSU-1   chr=1780517
7816817   Pseudomonas stutzeri A1501      NC_009434=4567418
79wiggBrev        Wigglesworthia glossinidia endosymbiont of Glossina brevipalpis chr=697724,plasmid_pWb1=5280
8010639   Mycoplasma hyopneumoniae 7448   NC_007332=920079
8110638   Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001      NC_005810=4595065,NC_005813=70159,NC_005815=106642,NC_005814=21742,NC_005816=9609
82caldMaqu1       Caldivirga maquilingensis IC-167        chr=2077567
83salmEnte_PARATYPI_ATC   Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150  chr=4585229
84onioYell_PHYTOPLASMA    Onion yellows phytoplasma OY-M  chr=860631
8518459   Francisella tularensis subsp. tularensis WY96-3418      NC_009257=1898476
86334     Streptococcus agalactiae NEM316 NC_004368=2211485
87mariAqua_VT8    Marinobacter aquaeolei VT8      plasmid_pMAQU01=239623,chr=4326849,plasmid_pMAQU02=213290
8816719   Fervidobacterium nodosum Rt17-B1        NC_009718=1948941
89330     Streptococcus agalactiae 2603V/R        NC_004116=2160267
90333     Streptococcus mutans UA159      NC_004350=2030921
919638    Lactobacillus johnsonii NCC 533 NC_005362=1992676
9217729   Anaeromyxobacter sp. Fw109-5    NC_009675=5277990
93shewLoihPV4     Shewanella loihica PV-4 chr=4602594
94candPela_UBIQUE_HTCC1   Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062 chr=1308759
95myxoXant_DK_1622        Myxococcus xanthus DK 1622      chr=9139763
969636    Rickettsia rickettsii str. 'Sheila Smith'       NC_009882=1257710
97salmTyph_TY2    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2      chr=4791961
98chloChlo_CAD3   Chlorobium chlorochromatii CaD3 chr=2572079
99mesoFlor_L1     Mesoplasma florum L1    chr=793224
10028921   Acinetobacter baumannii NC_010401=5644,NC_010402=9661,NC_010403=2726,NC_010404=94413,NC_010410=3936291
101hermArse        Herminiimonas arsenicoxydans    chr=3424307
102methMaze1       Methanosarcina mazei Go1        chr=4096345
10317343   Sphingomonas wittichii RW1      NC_009508=222757,NC_009507=310228,NC_009511=5382261
10499      Mycoplasma pneumoniae M129      NC_000912=816394
10513643   Synechococcus sp. CC9605        NC_007516=2510659
10613642   Synechococcus sp. WH 7803       NC_009481=2366980
107lawsIntr_PHE_MN1_00     Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00     plasmid_2=39794,plasmid_3=194553,chr=1457619,plasmid_1=27048
108jannCCS1        Jannaschia sp. CCS1     chr=4317977,plasmid1=86072
10991      Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10        NC_002944=4829781
11090      Mycobacterium leprae TN NC_002677=3268203
11192      Mycobacterium smegmatis str. MC2 155    NC_008596=6988209
11295      Tropheryma whipplei str. Twist  NC_004572=927303
11313649   Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10       NC_007505=19146,NC_007504=1852,NC_007507=182572,NC_007506=38116,NC_007508=5178466
11413885   Chlamydia trachomatis A/HAR-13  NC_007430=7510,NC_007429=1044459
11513884   Rickettsia felis URRWXCal2      NC_007109=1485148,NC_007110=62829,NC_007111=39263
11613887   Streptococcus pyogenes MGAS6180 NC_007296=1897573
11713760   Corynebacterium glutamicum ATCC 13032   NC_006958=3282708
11813888   Streptococcus pyogenes MGAS5005 NC_007297=1838554
119ureaUrea        Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970    chr=751719
120streCoel        Streptomyces coelicolor A3(2)   chr=8667507,plasmid_SCP2=31317,plasmid_SCP1=356023
121orieTsut_BORYONG        Orientia tsutsugamushi str. Boryong     chr=2127051
122polaJS66        Polaromonas sp. JS666   plasmid_2=338007,chr=5200264,plasmid_1=360405
123rhodRubr_ATCC11170      Rhodospirillum rubrum ATCC 11170        chr=4352825,plasmid_unnamed=53732
124rhodRHA1        Rhodococcus sp. RHA1    plasmid_pRHL1=1123075,chr=7804765,plasmid_pRHL3=332361,plasmid_pRHL2=442536
125pireSp  Rhodopirellula baltica SH 1     chr=7145576
126franTula_TULARENSIS     Francisella tularensis subsp. tularensis SCHU S4        chr=1892819
127syneSp_WH8102   Synechococcus sp. WH 8102       chr=2434428
12819521   Clostridium botulinum A str. Hall       NC_009698=3760560
129238     Staphylococcus aureus subsp. aureus COL NC_002951=2809422,NC_006629=4440
13015660   Prochlorococcus marinus str. NATL1A     NC_008819=1864731
13117823   Xylella fastidiosa M12  NC_010513=2475130
132methPetr_PM1    Methylibium petroleiphilum PM1  chr=4044195,plasmid_RPME01=599444
133237     Staphylococcus aureus subsp. aureus NCTC 8325   NC_007795=2821361
134thioCrun_XCL_2  Thiomicrospira crunogena XCL-2  chr=2427734
135haloHalo1       Halobacterium sp. NRC-1 chr=2014239,plasmid_pNRC100=191346,plasmid_pNRC200=365425
13616190   Roseiflexus sp. RS-1    NC_009523=5801598
137idioLoih_L2TR   Idiomarina loihiensis L2TR      chr=2839318
13818637   Methylobacterium extorquens PA1 NC_010172=5471154
139sodaGlos_MORSITANS      Sodalis glossinidius str. 'morsitans'   chr=4171146,plasmid_pSG3=10810,plasmid_pSG2=27240,plasmid_pSG1=83306
14018633   Prochlorococcus marinus str. MIT 9215   NC_009840=1738790
141mycoTube_H37RV  Mycobacterium tuberculosis H37Rv        chr=4411532
142polyQLWP        Polynucleobacter sp. QLW-P1DMWA-1       chr=2159490
143peloLute_DSM273 Pelodictyon luteolum DSM 273    chr=2364842
144burkCeno_AU_1054        Burkholderia cenocepacia AU 1054        chr3=1196094,chr2=2788459,chr1=3294563
14513942   Streptococcus sanguinis SK36    NC_009009=2388435
14613943   Burkholderia mallei NCTC 10229  NC_008835=2284095,NC_008836=3458208
147ente638 Enterobacter sp. 638    chr=4518712,plasmid_pENTE01=157749
14813946   Burkholderia mallei NCTC 10247  NC_009080=3495687,NC_009079=2352693
14913947   Burkholderia mallei SAVP1       NC_008784=1734922,NC_008785=3497479
15016363   Streptococcus pyogenes MGAS9429 NC_008021=1836467
151neorSenn_MIYAYAMA       Neorickettsia sennetsu str. Miyayama    chr=859006
152heliAcin_SHEEBA Helicobacter acinonychis str. Sheeba    chr=1553927,plasmid_pHac1=3661
15316366   Streptococcus pyogenes MGAS10750        NC_008024=1937111
15416365   Streptococcus pyogenes MGAS2096 NC_008023=1860355
15513473   Nitrobacter hamburgensis X14    NC_007961=121408,NC_007960=188318,NC_007964=4406967,NC_007959=294829
156burkCepa_AMMD   Burkholderia ambifaria AMMD     plasmid_1=43581,chr3=1281472,chr2=2646969,chr1=3556545
157methMari_C5_1   Methanococcus maripaludis C5    chr=1780761,plasmid_pMMC501=8285
15813478   Aster yellows witches'-broom phytoplasma AYWB   NC_007718=4009,NC_007719=5104,NC_007720=4316,NC_007716=706569,NC_007717=3972
15913370   Actinobacillus succinogenes 130Z        NC_009655=2319663
160methBark1       Methanosarcina barkeri str. Fusaro      chr=4837408,plasmid1=36358
161geobMeta_GS15   Geobacter metallireducens GS-15 chr=3997420,plasmid_unnamed=13762
162eschColi_CFT073 Escherichia coli CFT073 chr=5231428
163metMar1 Methanococcus maripaludis S2    chr=1661137
164enteFaec_V583   Enterococcus faecalis V583      chr=3218031,plasmid_pTEF1=66320,plasmid_pTEF3=17963,plasmid_pTEF2=57660
16517265   Francisella tularensis subsp. holarctica OSU18  NC_008369=1895727
166shigFlex_2A     Shigella flexneri 2a str. 301   chr=4607203,plasmid_pCP301=221618
167erwiCaro_ATROSEPTICA    Pectobacterium atrosepticum SCRI1043    chr=5064019
168pseuHalo_TAC125 Pseudoalteromonas haloplanktis TAC125   chrII=635328,chrI=3214944
16917163   Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97       NC_009707=1845106
17017161   Campylobacter curvus 525.92     NC_009715=1971264
17110690   Mesorhizobium sp. BNC1  NC_008243=131247,NC_008242=343931,NC_008254=4412446,NC_008244=47561
17210694   Ehrlichia canis str. Jake       NC_007354=1315030
17310697   Mycoplasma mobile 163K  NC_006908=777079
17425      Bordetella parapertussis 12822  NC_002928=4773551
17526      Bordetella pertussis Tohama I   NC_002929=4086189
17616841   Candidatus Ruthia magnifica str. Cm (Calyptogena magnifica)     NC_008610=1160782
177sulfToko1       Sulfolobus tokodaii str. 7      chr=2694756
178404     Lactobacillus brevis ATCC 367   NC_008498=13413,NC_008499=35595,NC_008497=2291220
179403     Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus ATCC BAA-365        NC_008529=1856951
18013920   Psychrobacter cryohalolentis K5 NC_007969=3059876,NC_007968=41221
181401     Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 NC_008527=2438589,NC_008503=14041,NC_008504=9554,NC_008505=74750,NC_008506=47208,NC_008507=14206
18216137   Bradyrhizobium sp. BTAi1        NC_009475=228826,NC_009485=8264687
183uncuMeth_RCI    uncultured methanogenic archaeon RC-I   chr=3179916
184coryEffi_YS_314 Corynebacterium efficiens YS-314        chr=3147090
18513485   Parabacteroides distasonis ATCC 8503    NC_009615=4811379
186409     Mycoplasma gallisepticum R      NC_004829=996422
18728743   Yersinia pseudotuberculosis YPIII       NC_010465=4689441
18819469   Escherichia coli SECEC SMS-3-5  NC_010488=130440,NC_010498=5068389,NC_010485=8909,NC_010486=4074,NC_010487=3565
189psycArct_273_4  Psychrobacter arcticus 273-4    chr=2650701
190propAcne_KPA171202      Propionibacterium acnes KPA171202       chr=2560265
191acidJS42        Acidovorax sp. JS42     plasmid_pAOVO01=72689,chr=4448856,plasmid_pAOVO02=63609
192chroSale_DSM3043        Chromohalobacter salexigens DSM 3043    chr=3696649
19319065   Clostridium kluyveri DSM 555    NC_009466=59182,NC_009706=3964618
19418801   Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman NC_009641=2878897
19513151   Shigella sonnei Ss046   NC_009346=5153,NC_009345=8401,NC_009347=2101,NC_007385=214396,NC_007384=4825265
19618965   Sulfurovum sp. NBC37-1  NC_009663=2562277
19718963   Nitratiruptor sp. SB155-2       NC_009662=1877931
19818809   Methylobacterium sp. 4-46       
199tropWhip_TW08_27        Tropheryma whipplei TW08/27     chr=925938
20028135   Bordetella petrii DSM 12804     NC_010170=5287950
201natrPhar1       Natronomonas pharaonis DSM 2160 plasmid_PL23=23486,chr=2595221,plasmid_PL131=130989
202370     Chlamydophila felis Fe/C-56     NC_007900=7552,NC_007899=1166239
203377     Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  NC_010123=16610,NC_010125=3944163,NC_010124=38818
204rubrXyla_DSM9941        Rubrobacter xylanophilus DSM 9941       chr=3225748
20515746   Prochlorococcus marinus str. MIT 9301   NC_009091=1641879
20615747   Rhodopseudomonas palustris HaA2 NC_007778=5331656
20718981   Finegoldia magna ATCC 29328     NC_010376=1797577,NC_010371=189163
208franCcI3        Frankia sp. CcI3        chr=5433628
20915749   Rhodopseudomonas palustris BisB5        NC_007958=4892717
21016549   Janthinobacterium sp. Marseille NC_009659=4110251
21189      Mycobacterium bovis AF2122/97   NC_002945=4345492
21212716   Citrobacter koseri ATCC BAA-895 NC_009792=4720462,NC_009793=9294,NC_009794=5601
21382      Lactobacillus acidophilus NCFM  NC_006814=1993560
21481      Clostridium tetani E88  NC_004557=2799251,NC_004565=74082
21516095   Mycoplasma agalactiae PG2       NC_009497=877438
21687      Corynebacterium diphtheriae NCTC 13129  NC_002935=2488635
21784      Lactobacillus gasseri ATCC 33323        NC_008530=1894360
21885      Listeria monocytogenes str. 4b F2365    NC_002973=2905187
21920197   Francisella tularensis subsp. holarctica FTA    NC_009749=1890909
220caldSacc_DSM8903        Caldicellulosiruptor saccharolyticus DSM 8903   chr=2970275
221anabVari_ATCC29413      Anabaena variabilis ATCC 29413  plasmid_B=35762,plasmid_C=300758,chr=6365727,plasmid_A=366354
222lactPlan        Lactobacillus plantarum WCFS1   chr=3308274,plasmid_pWCFS101=1917,plasmid_pWCFS103=36069,plasmid_pWCFS102=2365
223carbHydr_Z_2901 Carboxydothermus hydrogenoformans Z-2901        chr=2401520
22413617   Prochlorococcus marinus str. MIT 9515   NC_008817=1704176
22510878   Bacillus anthracis str. Sterne  NC_005945=5228663
22616067   Yersinia pestis Angola  NC_010158=114570,NC_010159=4504254,NC_010157=68190
22716062   Leuconostoc citreum KM20        NC_010466=31463,NC_010467=17971,NC_010471=1796284,NC_010470=38713,NC_010469=12183
22816148   Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis JB197    NC_008511=299762,NC_008510=3576473
22916146   Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis L550     NC_008508=3614446,NC_008509=317336
230vibrVuln_CMCP6_1        Vibrio vulnificus CMCP6 chrII=1844853,chrI=3281944
23110877   Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27     NC_006578=77112,NC_005957=5237682
23219517   Clostridium botulinum A str. ATCC 19397 NC_009697=3863450
233nitrWino_NB_255 Nitrobacter winogradskyi Nb-255 chr=3402093
23416321   Bifidobacterium adolescentis ATCC 15703 NC_008618=2089645
23517629   Pseudomonas putida GB-1 NC_010322=6078430
23617237   Rickettsia bellii OSU 85-389    NC_009883=1528980
23719519   Clostridium botulinum F str. Langeland  NC_009700=17531,NC_009699=3995387
238mesoLoti        Mesorhizobium loti MAFF303099   chr=7036071,plasmid_pMLa=351911,plasmid_pMLb=208315
239coxiBurn        Coxiella burnetii RSA 493       chr=1995281,plasmid_pQpH1=37393
240247     Chlamydophila pneumoniae AR39   NC_002179=1229853
241acidBact_ELLIN345       Acidobacteria bacterium Ellin345        chr=5650368
242241     Salmonella typhimurium LT2      NC_003277=93939,NC_003197=4857432
24316249   Bartonella bacilliformis KC583  NC_008783=1445021
24412997   Acaryochloris marina MBIC11017  NC_009929=226680,NC_009928=273121,NC_009934=2133,NC_009932=155110,NC_009933=120693,NC_009930=177162,NC_009931=172728,NC_009925=6503724,NC_009927=356087,NC_009926=374161
245xyleFast        Xylella fastidiosa 9a5c plasmid_pXF1.3=1286,chr=2679306,plasmid_pXF51=51158
24613435   Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K    NC_007576=1884661
24711752   Haemophilus influenzae 86-028NP NC_007146=1914490
24816393   Neisseria meningitidis 053442   NC_010120=2153416
24916394   Thermoanaerobacter sp. X514     NC_010320=2457259
250methKand1       Methanopyrus kandleri AV19      chr=1694969
251bifiLong        Bifidobacterium longum NCC2705  chr=2256640,plasmid_pBLO1=3626
252leptInte        Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601   chrII=358943,chrI=4332241
253burkCeno_HI2424 Burkholderia cenocepacia HI2424 plasmid_1=164857,chr3=1055417,chr2=2998664,chr1=3483902
25416364   Streptococcus pyogenes MGAS10270        NC_008022=1928252
25513875   Candidatus Blochmannia pennsylvanicus str. BPEN NC_007292=791654
256buchSp  Buchnera aphidicola str. APS (Acyrthosiphon pisum)      chr=640681,plasmid_pTrp=7258,plasmid_pLeu=7786
257178     Burkholderia pseudomallei K96243        NC_006351=3173005,NC_006350=4074542
258176     Mycoplasma penetrans HF-2       NC_004432=1358633
259pyroCali1       Pyrobaculum calidifontis JCM 11548      chr=2009313
260chloTepi_TLS    Chlorobium tepidum TLS  chr=2154946
26113282   Synechococcus elongatus PCC 6301        NC_006576=2696255
26216800   Pseudomonas entomophila L48     NC_008027=5888780
263picrTorr1       Picrophilus torridus DSM 9790   chr=1545895
264shewANA3        Shewanella sp. ANA-3    plasmid_1=278942,chr1=4972204
26513443   Listeria welshimeri serovar 6b str. SLCC5334    NC_008555=2814130
266bdelBact        Bdellovibrio bacteriovorus HD100        chr=3782950
267gramFors_KT0803 Gramella forsetii KT0803        chr=3798465
268184     Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus   
269189     Streptomyces avermitilis MA-4680        NC_004719=94287,NC_003155=9025608
270clavMich_NCPPB_382      Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382        chr=3297891,plasmid_pCM1=27357,plasmid_pCM2=69989
271peloCarb        Pelobacter carbinolicus DSM 2380        chr=3665893
27220083   Campylobacter hominis ATCC BAA-381      NC_009713=3678,NC_009714=1711273
273saliTrop_CNB_440        Salinispora tropica CNB-440     chr=5183331
27417057   Borrelia afzelii PKo    NC_008277=905394,NC_008274=26533,NC_008273=30017,NC_008568=28533,NC_008569=24794,NC_008566=34273,NC_008567=32368,NC_008564=59958,NC_008565=59804
275campJeju        Campylobacter jejuni subsp. jejuni NCTC 11168   chr=1641481
27617053   Pseudomonas putida W619 NC_010501=5774330
27712      Pseudomonas fluorescens PfO-1   NC_007492=6438405
27815      Xanthomonas campestris pv. campestris str. 8004 NC_007086=5148708
27912475   Wolbachia endosymbiont strain TRS of Brugia malayi      NC_006833=1080084
28013217   Azoarcus sp. BH72       NC_008702=4376040
281dehaEthe_195    Dehalococcoides ethenogenes 195 chr=1469720
282methTherPT1     Methanosaeta thermophila PT     chr=1879471
283shewMR7 Shewanella sp. MR-7     chr=4792610,plasmid1=6499
284shewMR4 Shewanella sp. MR-4     chr=4706287
28515708   Acidovorax avenae subsp. citrulli AAC00-1       NC_008752=5352772
28619087   Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 27815     
287geobUran_RF4    Geobacter uraniireducens Rf4    chr=5136364
288shewDeni        Shewanella denitrificans OS217  chr=4545906
289pyrFur2 Pyrococcus furiosus DSM 3638    chr=1908256
290desuRedu_MI_1   Desulfotomaculum reducens MI-1  chr=3608104
291syntFuma_MPOB   Syntrophobacter fumaroxidans MPOB       chr=4990251
292278     Streptococcus pneumoniae R6     NC_003098=2038615
29313654   Synechococcus sp. RCC307        NC_009482=2224914
29413655   Synechococcus sp. CC9902        NC_007513=2234828
29516313   Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300      NC_007790=3125,NC_007791=4439,NC_007792=37136,NC_007793=2872769
296legiPneu_PHILADELPHIA   Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1   chr=3397754
29720391   Bacillus pumilus SAFR-032       NC_009848=3704465
298chlaPneu_CWL029 Chlamydophila pneumoniae CWL029 chr=1230230
29916259   Escherichia coli UTI89  NC_007946=5065741,NC_007941=114230
30013067   Bacteroides fragilis YCH46      NC_006297=33716,NC_006347=5277274
301gloeViol        Gloeobacter violaceus PCC 7421  chr=4659019
302moorTher_ATCC39073      Moorella thermoacetica ATCC 39073       chr=2628784
303323     Pseudomonas syringae pv. syringae B728a NC_007005=6093698
304320     Brucella suis 1330      NC_004311=1207381,NC_004310=2107794
305roseDeni_OCH_114        Roseobacter denitrificans OCh 114       chr=5824
306326     Streptococcus agalactiae A909   NC_007432=2127839
307327     Pseudomonas fluorescens Pf-5    NC_004129=7074893
308325     Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas     NC_007799=1176248
309329     Desulfovibrio desulfuricans G20 NC_007519=3730232
31016203   Brucella melitensis biovar Abortus 2308 NC_007624=1156948,NC_007618=2121359
31112950   Yersinia pseudotuberculosis IP 32953    NC_006153=68525,NC_006155=4744671,NC_006154=27702
312heliPylo_26695  Helicobacter pylori 26695       chr=1667867
31312952   Rickettsia canadensis str. McKiel       NC_009879=1159772
31412953   Rickettsia akari str. Hartford  NC_009881=1231060
31516208   Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343      NC_007633=1010023
31617375   Francisella tularensis subsp. tularensis FSC198 NC_008245=1892616
31719259   Acholeplasma laidlawii PG-8A    NC_010163=1496992
31877      Clostridium acetobutylicum ATCC 824     NC_003030=3940880,NC_001988=192000
31974      Bacillus cereus ATCC 10987      NC_005707=208369,NC_003909=5224283
32015770   Dehalococcoides sp. BAV1        NC_009455=1341892
32179      Clostridium perfringens str. 13 NC_003042=54310,NC_003366=3031430
32278      Clostridium difficile 630       NC_009089=4290252,NC_008226=7881
32313624   Bacillus cereus subsp. cytotoxis NVH 391-98     NC_009674=4087024,NC_009673=7135
32413623   Bacillus weihenstephanensis KBAB4       NC_010184=5262775,NC_010181=75107,NC_010180=417054,NC_010183=52830,NC_010182=64977
325tricEryt_IMS101 Trichodesmium erythraeum IMS101 chr=7750108
326photLumi        Photorhabdus luminescens subsp. laumondii TTO1  chr=5688987
327peloTher_SI     Pelotomaculum thermopropionicum SI      chr=3025375
32818789   Shewanella sediminis HAW-EB3    NC_009831=5517674
329therKoda1       Thermococcus kodakarensis KOD1  chr=2088737
330oceaIhey        Oceanobacillus iheyensis HTE831 chr=3630528
33116297   Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAFF 311018       NC_007705=4940217
33219639   Methanococcus maripaludis C6    NC_009975=1744193
333blocFlor        Candidatus Blochmannia floridanus       chr=705557
334shewW318        Shewanella sp. W3-18-1  chr=4708380
33516184   Clostridium phytofermentans ISDg        NC_010001=4847594
33617477   Acinetobacter baumannii ATCC 17978      NC_009084=11302,NC_009085=3976747,NC_009083=13408
337therElon        Thermosynechococcus elongatus BP-1      chr=2593857
33813403   Bacillus amyloliquefaciens FZB42        NC_009725=3918589
33917679   Petrotoga mobilis SJ95  NC_010003=2169548
34016374   Streptococcus pneumoniae D39    NC_008533=2046115
34116375   Shigella flexneri 5 str. 8401   NC_008258=4574284
342methBoon1       Candidatus Methanoregula boonei 6A8     chr=2542943
343mariMari_MCS10  Maricaulis maris MCS10  chr=3368780
344ralsEutr_JMP134 Ralstonia eutropha JMP134       plasmid_1=87688,chr2=2726152,chr1=3806533,megaplasmid=634917
345baciSubt        Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168      chr=4214630
34616372   Buchnera aphidicola str. Cc (Cinara cedri)      NC_008513=416380
347213     Prochlorococcus marinus subsp. pastoris str. CCMP1986   NC_005072=1657990
348erytLito_HTCC2594       Erythrobacter litoralis HTCC2594        chr=3052398
349acidCell_11B    Acidothermus cellulolyticus 11B chr=2443540
350pyrAer1 Pyrobaculum aerophilum str. IM2 chr=2222430
351xantCamp        Xanthomonas campestris pv. campestris str. ATCC 33913   chr=5076188
352thioDeni_ATCC25259      Thiobacillus denitrificans ATCC 25259   chr=2909809
35328583   Chlamydia trachomatis 434/Bu    NC_010287=1038842
354deinRadi        Deinococcus radiodurans R1      plasmid_CP1=45704,plasmid_MP1=177466,chr2=412348,chr1=2648638
355yersPest_CO92   Yersinia pestis CO92    chr=4653728,plasmid_pCD1=70305,plasmid_pPCP1=9612,plasmid_pMT1=96210
35628585   Chlamydia trachomatis L2b/UCH-1/proctitis       NC_010280=1038869
357wolbEndo_OF_DROSOPHIL   Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster       chr=1267782
35817153   Streptococcus suis 05ZYH33      NC_009442=2096309
35910689   Kineococcus radiotolerans SRS30216      NC_009806=182572,NC_009664=4761183,NC_009660=12917
36017155   Streptococcus suis 98HAH33      NC_009443=2095698
36117159   Campylobacter concisus 13826    NC_009802=2052007,NC_009796=16457,NC_009795=30949
362ralsSola        Ralstonia solanacearum GMI1000  chr=3716413,plasmid_pGMI1000MP=2094509
36310687   Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130  NC_005823=4277185,NC_005824=350181
36417403   Frankia alni ACN14a     NC_008278=7497934
36516871   Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus ATCC 11842  NC_008054=1864998
36612388   Bacillus licheniformis ATCC 14580       NC_006270=4222597
367neisMeni_Z2491_1        Neisseria meningitidis Z2491    chr=2184406
368saliRube_DSM13855       Salinibacter ruber DSM 13855    chr=3551823,plasmid_pSR35=35505
36917953   Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81116        NC_009839=1628115
37010616   Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC str. PG1 NC_005364=1211703
37113496   Prochlorococcus marinus str. MIT 9303   NC_008820=2682675
37228507   Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree        NC_010520=3992906,NC_010418=266785
373colwPsyc_34H    Colwellia psychrerythraea 34H   chr=5373180
374hyphNept_ATCC15444      Hyphomonas neptunium ATCC 15444 chr=3705021
375vibrChol1       Vibrio cholerae O1 biovar eltor str. N16961     chrII=1072315,chrI=2961149
376deinGeot_DSM11300       Deinococcus geothermalis DSM 11300      chr=2467205,plasmid_1=574127
377312     Buchnera aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum)       NC_004061=641454
378311     Streptococcus pyogenes MGAS315  NC_004070=1900521
379metaSedu        Metallosphaera sedula DSM 5348  chr=2191517
380314     Clostridium thermocellum ATCC 27405     NC_009012=3843301
381lactSali_UCC118 Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid_pSF118-20=20417,chr=1827111,plasmid_pMP118=242436,plasmid_pSF118-44=44013
382pediPent_ATCC25745      Pediococcus pentosaceus ATCC 25745      chr=1832387
383flavJohn_UW101  Flavobacterium johnsoniae UW101 chr=6096872
384mannSucc_MBEL55E        Mannheimia succiniciproducens MBEL55E   chr=2314078
385haemSomn_129PT  Haemophilus somnus 129PT        chr=2007700,plasmid_pHS129=5178
38613145   Shigella dysenteriae Sd197      NC_007606=4369232,NC_007607=182726,NC_009344=8953
38713146   Shigella boydii Sb227   NC_007613=4519823,NC_007608=126697
38817491   Legionella pneumophila str. Corby       NC_009494=3576470
389nanEqu1 Nanoarchaeum equitans Kin4-M    chr=490885
39012508   Staphylococcus haemolyticus JCSC1435    NC_007168=2685015
39113384   Pelobacter propionicus DSM 2379 NC_008609=4008000,NC_008608=30722,NC_008607=202397
392chlaTrac        Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chr=1042519
393haloWals1       Haloquadratum walsbyi DSM 16790 chr=3132494,plasmid_PL47=46867
39413389   Shewanella baltica OS195        NC_009998=75605,NC_009999=75508,NC_010000=49148,NC_009997=5347283
395baciHalo        Bacillus halodurans C-125       chr=4202352
396hypeButy1       Hyperthermus butylicus DSM 5456 chr=1667163
397chroViol        Chromobacterium violaceum ATCC 12472    chr=4751080
39816088   Francisella tularensis subsp. novicida U112     NC_008601=1910031
399methJann1       Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661  chr=1664970,lg_extrachr=58407,sm_extrachr=16550
400384     Bacillus cereus ATCC 14579      NC_004721=15274,NC_004722=5411809
401pastMult        Pasteurella multocida subsp. multocida str. Pm70        chr=2257487
402386     Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14       NC_008463=6537648
403388     Haemophilus somnus 2336 NC_010519=2263857
40416083   Alkaliphilus oremlandii OhILAs  NC_009922=3123558
40527853   Francisella philomiragia subsp. philomiragia ATCC 25017 NC_010331=3936,NC_010336=2045775
40616081   Mycobacterium sp. KMS   NC_008703=302089,NC_008704=216763,NC_008705=5737227
407cytoHutc_ATCC33406      Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406       chr=4433218
408nitrEuro        Nitrosomonas europaea ATCC 19718        chr=2812094
40912720   Enterobacter sakazakii ATCC BAA-894     NC_009780=131196,NC_009778=4368373,NC_009779=31208
410therMari        Thermotoga maritima MSB8        chr=1860725
411mycoGeni        Mycoplasma genitalium G37       chr=580076
412vibrFisc_ES114_1        Vibrio fischeri ES114   chrII=1332022,plasmid_pES100=45849,chrI=2906179
413pyroIsla1       Pyrobaculum islandicum DSM 4184 chr=1826402
41417407   Burkholderia multivorans ATCC 17616     NC_010084=3448466,NC_010070=167422,NC_010086=2472928,NC_010087=919806
41513030   Salmonella enterica subsp. arizonae serovar 62:z4,z23:--        NC_010067=4600800
41618271   Rickettsia massiliae MTU5       NC_009897=15286,NC_009900=1360898
41721047   Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C      NC_010424=2349476
41819857   Vibrio harveyi ATCC BAA-1116    NC_009783=3765351,NC_009777=89008,NC_009784=2204018
41917639   Parvibaculum lavamentivorans DS-1       NC_009719=3914745
42018059   Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2     NC_008769=4374522
421vibrPara1       Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633    chrII=1877212,chrI=3288558
422259     Escherichia coli O157:H7 EDL933 NC_007414=92077,NC_002655=5528445
42364      Staphylococcus epidermidis RP62A        NC_006663=27310,NC_002976=2616530
424neisGono_FA1090_1       Neisseria gonorrhoeae FA 1090   chr=2153922
42566      Streptococcus gordonii str. Challis substr. CH1 NC_009785=2196662
42616723   Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449   NC_009349=166749,NC_009348=4702402,NC_009350=155098,NC_004923=5424,NC_004924=5616,NC_004925=5247
42716230   Mycobacterium ulcerans Agy99    NC_008611=5631606
42816721   Coxiella burnetii Dugway 5J108-111      NC_009727=2158758,NC_009726=54179
42916720   Pseudomonas aeruginosa PA7      NC_009656=6588339
430256     Buchnera aphidicola str. Bp (Baizongia pistaciae)       NC_004555=2399,NC_004545=615980
431257     Chlamydophila pneumoniae J138   NC_002491=1226565
432novoArom_DSM12444       Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444       chr=3561584,plasmid_pNL2=487268,plasmid_pNL1=184462
43315642   Mycobacterium tuberculosis F11  NC_009565=4424435
434azoaSp_EBN1     Azoarcus sp. EbN1       plasmid_2=223670,chr=4296230,plasmid_1=207355
435therTher_HB27   Thermus thermophilus HB27       chr=1894877,plasmid_pTT27=232605
436metAce1 Methanosarcina acetivorans C2A  chr=5751492
437glucOxyd_621H   Gluconobacter oxydans 621H      plasmid_pGOX2=26568,plasmid_pGOX1=163186,chr=2702173,plasmid_pGOX3=14547,plasmid_pGOX4=13223,plasmid_pGOX5=2687
438listInno        Listeria innocua Clip11262      chr=3011208,plasmid_pLI100=81905
439sulfAcid1       Sulfolobus acidocaldarius DSM 639       chr=2225959
440geobTher_NG80_2 Geobacillus thermodenitrificans NG80-2  chr=3550319,plasmid_pLW1071=57693
441402     Lactobacillus casei ATCC 334    NC_008502=29061,NC_008526=2895264
44213960   Escherichia coli E24377A        NC_009789=6199,NC_009788=70609,NC_009801=4979619,NC_009790=74224,NC_009791=5033,NC_009787=34367,NC_009786=79237
44313954   Burkholderia pseudomallei 1710b NC_007435=3181762,NC_007434=4126292
44417445   Marinomonas sp. MWYL1   NC_009654=5100344
44513967   Corynebacterium jeikeium K411   NC_003080=14323,NC_007164=2462499
446leifXyli_XYLI_CTCB0     Leifsonia xyli subsp. xyli str. CTCB07  chr=2584158
44710645   Synechococcus elongatus PCC 7942        NC_007604=2695903,NC_007595=46366
448campFetu_82_40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  chr=1773615
44913355   Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden  NC_006832=1512977
450desuHafn_Y51    Desulfitobacterium hafniense Y51        chr=5727534
45113356   Ehrlichia ruminantium str. Gardel       NC_006831=1499920
45213291   Bacillus clausii KSM-K16        NC_006582=4303871
45316421   Francisella tularensis subsp. holarctica        NC_007880=1895994
454therVolc1       Thermoplasma volcanium GSS1     chr=1584804
455soliUsit_ELLIN6076      Solibacter usitatus Ellin6076   chr=9965640
456bradJapo        Bradyrhizobium japonicum USDA 110       chr=9105828
457methTher1       Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H     chr=1751377
45813454   Pseudoalteromonas atlantica T6c NC_008228=5187005
459methAeol1       Methanococcus aeolicus Nankai-3 chr=1569500
460nostSp  Nostoc sp. PCC 7120     plasmid_pCC7120delta=55414,plasmid_pCC7120beta=186614,chr=6413771,plasmid_pCC7120gamma=101965,plasmid_pCC7120alpha=408101,plasmid_pCC7120zeta=5584,plasmid_pCC7120epsilon=40340
461sphiAlas_RB2256 Sphingopyxis alaskensis RB2256  F_plasmid=28543,chr=3345170
462saccDegr_2_40   Saccharophagus degradans 2-40   chr=5057531
463408     Shigella flexneri 2a str. 2457T NC_004741=4599354
464anaeDeha_2CP_C  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C     chr=5013479
465bordBron        Bordetella bronchiseptica RB50  chr=5339179
466rickBell_RML369_C       Rickettsia bellii RML369-C      chr=1522076
467pyroArse1       Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514       chr=2121076
468thioDeni_ATCC33889      Sulfurimonas denitrificans DSM 1251     chr=2201561
469methSmit1       Methanobrevibacter smithii ATCC 35061   chr=1853160
470halMar1 Haloarcula marismortui ATCC 43049       chrII=288050,plasmid_pNG600=155300,plasmid_pNG100=33303,plasmid_pNG200=33452,plasmid_pNG500=132678,plasmid_pNG400=50060,plasmid_pNG300=39521,chrI=3131724,plasmid_pNG700=410554
4719618    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67    NC_006855=49558,NC_006856=138742,NC_006905=4755700
4729619    Brucella abortus biovar 1 str. 9-941    NC_006933=1162204,NC_006932=2124241
473vermEise_EF01_2 Verminephrobacter eiseniae EF01-2       chr=5566749,plasmid_pVEIS01=31194
474granBeth_CGDNIH1        Granulibacter bethesdensis CGDNIH1      chr=2708355
475alcaBork_SK2    Alcanivorax borkumensis SK2     chr=3120143
476vibrChol_O395_1 Vibrio cholerae O395    chr2=3024069,chr1=1108250
477nitrOcea_ATCC19707      Nitrosococcus oceani ATCC 19707 chr=3481691,plasmid_A=40420
478campJeju_RM1221 Campylobacter jejuni RM1221     chr=1777831
47912468   Bacillus cereus E33L    NC_007103=466370,NC_007105=53501,NC_007104=5108,NC_007107=9150,NC_007106=8191,NC_006274=5300915
48012469   Streptococcus pyogenes MGAS10394        NC_006086=1899877
48119135   Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 3 str. JL03     NC_010278=2242062
482woliSucc        Wolinella succinogenes DSM 1740 chr=2110355
48319485   Ochrobactrum anthropi ATCC 49188        NC_009668=1895911,NC_009669=170351,NC_009667=2887297,NC_009671=93589,NC_009670=101491,NC_009672=57138
484therPend1       Thermofilum pendens Hrk 5       chr=1781889,pTPEN01=31504
48519489   Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516      NC_010079=2872915,NC_010063=27041
486therFusc_YX     Thermobifida fusca YX   chr=3642249
48712609   Chlorobium phaeobacteroides DSM 266     NC_008639=3133902
488aquiAeol        Aquifex aeolicus VF5    chr=1551335,plasmid_ece1=39456
489heliPylo_J99    Helicobacter pylori J99 chr=1643831
490burkPseu_1106A  Burkholderia pseudomallei 1106a chrII=3100794,chrI=3988455
491azorCaul2       Azorhizobium caulinodans ORS 571        chr=5369772
49212607   Prosthecochloris vibrioformis DSM 265   NC_009337=1966858
493synePCC6        Synechocystis sp. PCC 6803      plasmid_pSYSG=44343,chr=3573470,plasmid_pSYSM=119895,plasmid_pSYSA=103307,plasmid_pSYSX=106004
494baumCica_HOMALODISCA    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)       chr=686194
495355     Chlamydophila abortus S26/3     NC_004552=1144377
49628111   Sorangium cellulosum 'So ce 56' NC_010162=13033779
497shewBalt        Shewanella baltica OS155        plasmid_pSbal04=7995,chr=5127376,plasmid_pSbal01=116763,plasmid_pSbal02=74000,plasmid_pSbal03=16762
498therTeng        Thermoanaerobacter tengcongensis MB4    chr=2689445
499359     Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000     NC_004632=67473,NC_004578=6397126,NC_004633=73661
50019943   Rickettsia rickettsii str. Iowa NC_010263=1268175
501alkaEhrl_MLHE_1 Alkalilimnicola ehrlichei MLHE-1        chr=3275944
502sulSol1 Sulfolobus solfataricus P2      chr=2992245
50315604   Dehalococcoides sp. CBDB1       NC_007356=1395502
50419265   Nitrosopumilus maritimus SCM1   NC_010085=1645259
50519543   Thermotoga sp. RQ2     
506methHung1       Methanospirillum hungatei JF-1  chr=3544738
50727803   Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7       NC_010102=4858887
50828505   Clostridium botulinum B1 str. Okra      NC_010516=3958233,NC_010379=148780
50915766   Lactobacillus reuteri F275      NC_009513=1999618
51017929   Burkholderia cenocepacia MC0-3  NC_010512=1224595,NC_010508=3532883,NC_010515=3213911
51115762   Mycobacterium sp. MCS   NC_008146=5705448,NC_008147=215075
51215760   Mycobacterium gilvum PYR-GCK    NC_009341=16660,NC_009340=25309,NC_009338=5619607,NC_009339=321253
51315761   Mycobacterium vanbaalenii PYR-1 NC_008726=6491865
51418797   Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363       NC_009004=2529478
51520371   Brucella suis ATCC 23445        NC_010167=1400844,NC_010169=1923763
516desuVulg_HILDENBOROUG   Desulfovibrio vulgaris subsp. vulgaris str. Hildenborough       chr=3570858,megaplasmid=202301
51720079   Escherichia coli DH10B  NC_010473=4686137
518288     Yersinia pestis KIM     NC_004838=100990,NC_004088=4600755
51913006   Alkaliphilus metalliredigens QYMF       NC_009633=4929566
52013001   Acinetobacter baumannii NC_010398=24922,NC_010400=3421954,NC_010395=6106,NC_010396=25014
5214       Treponema denticola ATCC 35405  NC_002967=2843201
522283     Agrobacterium tumefaciens str. C58      NC_003062=2841580,NC_003063=2075577,NC_003064=542868,NC_003065=214233
523methVann1       Methanococcus vannielii SB      chr=1720048
524285     Xylella fastidiosa Temecula1    NC_004556=2519802,NC_004554=1346
525286     Streptococcus pyogenes MGAS8232 NC_003485=1895017
526candCars_RUDDII Candidatus Carsonella ruddii PV chr=159662
527336     Anaplasma phagocytophilum HZ    NC_007797=1471282
528burkMall_ATCC23344      Burkholderia mallei ATCC 23344  chr2=2325379,chr1=3510148
529leucMese_ATCC8293       Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293        chr=2038396,plasmid_pLEUM1=37367
530burkViet_G4     Burkholderia vietnamiensis G4   chr3=1241007,chr2=2411759,chr1=3652814,plasmid_pBVIE04=107231,plasmid_pBVIE05=88096,plasmid_pBVIE02=265616,plasmid_pBVIE03=226679,plasmid_pBVIE01=397868
531267     Pseudomonas putida KT2440       NC_002947=6181863
532266     Staphylococcus aureus subsp. aureus MSSA476     NC_005951=20652,NC_002953=2799802
533265     Staphylococcus aureus subsp. aureus MRSA252     NC_002952=2902619
534264     Staphylococcus aureus subsp. aureus N315        NC_003140=24653,NC_002745=2814816
53517643   Shewanella baltica OS185        NC_009665=5229686,NC_009661=83224
536archFulg1       Archaeoglobus fulgidus DSM 4304 chr=2178400
53713418   Polaromonas naphthalenivorans CJ2       NC_008757=353291,NC_008759=171866,NC_008758=190172,NC_008781=4410291,NC_008764=6459,NC_008760=143747,NC_008761=58808,NC_008762=21611,NC_008763=9898
53818007   Desulfococcus oleovorans Hxd3   NC_009943=3944167
53916304   Sinorhizobium medicae WSM419    NC_009622=219313,NC_009620=1570951,NC_009621=1245408,NC_009636=3781904
54016306   Caulobacter sp. K31     NC_010333=177878,NC_010338=5477872,NC_010335=233649
54159      Chloroflexus aurantiacus J-10-fl        NC_010175=5258541
54212530   Synechococcus sp. CC9311        NC_008319=2606748
54313551   Prochlorococcus marinus str. MIT 9211   NC_009976=1688963
54415691   Mycobacterium abscessus NC_010394=23319,NC_010397=5067172
545fusoNucl        Fusobacterium nucleatum subsp. nucleatum ATCC 25586     chr=2174500
54663      Staphylococcus aureus RF122     NC_007622=2742531
547heliHepa        Helicobacter hepaticus ATCC 51449       chr=1799146
54817249   Thermosipho melanesiensis BI429 NC_009616=1915238
54915596   Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305    NC_007350=2516575,NC_007351=38454,NC_007352=22870
550psycIngr_37     Psychromonas ingrahamii 37      chr=4559598
551syntAcid_SB     Syntrophus aciditrophicus SB    chr=3179300
552salmTyph        Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18     plasmid_pHCM2=106516,chr=4809037,plasmid_pHCM1=218160
553burkXeno_LB400  Burkholderia xenovorans LB400   chr3=1471779,chr2=3363523,chr1=4895836
554trepPall        Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chr=1138011
555neisMeni_MC58_1 Neisseria meningitidis MC58     chr=2272360
556syntWolf_GOETTINGEN     Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen     chr=2936195
55715644   Thermotoga lettingae TMO        NC_009828=2135342
55813913   Nitrosomonas eutropha C91       NC_008342=55635,NC_008341=65132,NC_008344=2661057
55917417   Dinoroseobacter shibae DFL 12   NC_009958=86208,NC_009959=72296,NC_009955=190506,NC_009956=152970,NC_009957=126304,NC_009952=3789584
56013911   Prochlorococcus marinus str. NATL2A     NC_007335=1842899
56113910   Prochlorococcus marinus str. MIT 9312   NC_007577=1709204
562250     Ralstonia metallidurans CH34    NC_007974=2580084,NC_007971=233720,NC_007972=171459,NC_007973=3928089
56313915   Frankia sp. EAN1pec     NC_009921=8982042
56413914   Ignicoccus hospitalis KIN4/I    NC_009776=1297538
565rhodSpha_2_4_1  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1   chr2=943016,chr1=3188609,plasmid_B=114178,plasmid_C=105284,plasmid_A=114045,plasmid_D=100828,plasmid_E=37100
56616235   Escherichia coli 536    NC_008253=4938920
567zymoMobi_ZM4    Zymomonas mobilis subsp. mobilis ZM4    chr=2056416
568rhodPalu_CGA009 Rhodopseudomonas palustris CGA009       chr=5459213,plasmid_pRPA=8427
569420     Chlamydophila pneumoniae TW-183 NC_005043=1225935
570stapMari1       Staphylothermus marinus F1      chr=1570485
571sinoMeli        Sinorhizobium meliloti 1021     chr=3654135,plasmid_pSymA=1354226,plasmid_pSymB=1683333
572bartHens_HOUSTON_1      Bartonella henselae str. Houston-1      chr=1931047
573301     Streptococcus pyogenes SSI-1    NC_004606=1894275
57419193   Corynebacterium glutamicum R    NC_009343=49120,NC_009342=3314179
575304     Clostridium perfringens ATCC 13124      NC_008261=3256683
576306     Staphylococcus aureus subsp. aureus MW2 NC_003923=2820462
577307     Corynebacterium glutamicum ATCC 13032   NC_003450=3309401
578caulCres        Caulobacter crescentus CB15     chr=4016947
579haheChej_KCTC_2396      Hahella chejuensis KCTC 2396    chr=7215267
58010784   Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor' NC_007530=5227419,NC_007323=94830,NC_007322=181677
581magnMC1 Magnetococcus sp. MC-1  chr=4719581
582heliPylo_HPAG1  Helicobacter pylori HPAG1       chr=1596366,plasmid_pHPAG1=9370
583pyrHor1 Pyrococcus horikoshii OT3       chr=1738505
58412514   Brucella ovis ATCC 25840        NC_009505=2111370,NC_009504=1164220
58512512   Arthrobacter aurescens TC1      NC_008711=4597686,NC_008713=300725,NC_008712=328237
586actiPleu_L20    Actinobacillus pleuropneumoniae L20     chr=2274482
587paraDeni_PD1222 Paracoccus denitrificans PD1222 plasmid_1=653815,chr2=1730097,chr1=2852282
588borrBurg        Borrelia burgdorferi B31        plasmid_cp26=26498,plasmid_lp21=18753,plasmid_lp25=24177,plasmid_lp28-4=27323,plasmid_lp28-2=29766,plasmid_lp28-3=28601,plasmid_lp28-1=26921,chr=910724,plasmid_cp9=9386,plasmid_lp5=5228,plasmid_lp38=38829,plasmid_lp17=16823,plasmid_cp32-1=30750,plasmid_cp32-6=29838,plasmid_cp32-7=30800,plasmid_cp32-4=30299,plasmid_cp32-8=30885,plasmid_cp32-9=30651,plasmid_lp36=36849,plasmid_lp56=52971,plasmid_lp54=53561,plasmid_cp32-3=30223
589strePyog_M1_GAS Streptococcus pyogenes M1 GAS   chr=1852441
590pseuAeru        Pseudomonas aeruginosa PAO1     chr=6264404
59116523   Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779    NC_009974=99204,NC_009972=6346587,NC_009973=339639
59216525   Candidatus Korarchaeum cryptofilum OPF8 NC_010482=1590757
59319619   Lysinibacillus sphaericus C3-41 NC_010382=4639821,NC_010381=177642
59419617   Candidatus Sulcia muelleri GWSS NC_010118=245530
595saccEryt_NRRL_2338      Saccharopolyspora erythraea NRRL 2338   chr=8212805
596methCaps_BATH   Methylococcus capsulatus str. Bath      chr=3304561
59716645   Yersinia pestis Antiqua NC_008150=4702289,NC_008122=70299,NC_008120=96471,NC_008121=10777
59816646   Yersinia pestis Nepal516        NC_008149=4534590,NC_008119=10778,NC_008118=100918
59912637   Clostridium beijerinckii NCIMB 8052     NC_009617=6000632
600ehrlRumi_WELGEVONDEN    Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden  chr=1516355
601methLabrZ_1     Methanocorpusculum labreanum Z  chr=1804962
602vibrVuln_YJ016_1        Vibrio vulnificus YJ016 plasmid_pYJ016=48508,chrII=1857073,chrI=3354505
60313773   Streptococcus thermophilus LMD-9        NC_008500=4449,NC_008501=3361,NC_008532=1856368
60420039   Leptothrix cholodnii SP-6       
605shewAmaz        Shewanella amazonensis SB2B     chr=4306142
60613126   Legionella pneumophila str. Lens        NC_006369=3345687,NC_006366=59832
60713127   Legionella pneumophila str. Paris       NC_006368=3503610,NC_006365=131885
60813120   Mycoplasma hyopneumoniae 232    NC_006360=892758
60918509   Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu3 NC_009782=2880168
61013040   Silicibacter sp. TM1040 NC_008043=821788,NC_008042=130973,NC_008044=3200938
61118267   Candidatus Vesicomyosocius okutanii HA  NC_009465=1022154
612methFlag_KT     Methylobacillus flagellatus KT  chr=2971517
613therAcid1       Thermoplasma acidophilum DSM 1728       chr=1564906
614therPetr_RKU_1  Thermotoga petrophila RKU-1     chr=1823511
615shewFrig        Shewanella frigidimarina NCIMB 400      chr=4845257
616photProf_SS9    Photobacterium profundum SS9    chr2=2237943,chr1=4085304,plasmid_pPBPR1=80033
617burkThai_E264   Burkholderia thailandensis E264 chrII=2914771,chrI=3809201
61817811   Lactobacillus helveticus DPC 4571       NC_010080=2080931
619229     Chlamydia muridarum Nigg        NC_002182=7501,NC_002620=1072950
620228     Chlamydophila caviae GPIC       NC_004720=7966,NC_003361=1173390
621nitrMult_ATCC25196      Nitrosospira multiformis ATCC 25196     plasmid_2=17036,plasmid_3=14159,plasmid_1=18871,chr1=3184243
622223     Mycobacterium tuberculosis CDC1551      NC_002755=4403837
623220     Prochlorococcus marinus str. MIT 9313   NC_005071=2410873
62420241   Shewanella halifaxensis HAW-EB4 NC_010334=5226917
62520243   Brucella canis ATCC 23365       NC_010104=1206800,NC_010103=2105969
62688      Mycobacterium avium 104 NC_008595=5475491
62719227   Renibacterium salmoninarum ATCC 33209   NC_010168=3155250
628neisMeni_FAM18_1        Neisseria meningitidis FAM18    chr=2194961
629arthFB24        Arthrobacter sp. FB24   plasmid_2=115507,plasmid_3=96488,plasmid_1=159538,chr1=4698945
63010679   Rickettsia typhi str. Wilmington        NC_006142=1111496
63117457   Pseudomonas mendocina ymp       NC_009439=5072807
63213959   Escherichia coli HS     NC_009800=4643538
63317455   Shewanella woodyi ATCC 51908    NC_010506=5935403
63417109   Salinispora arenicola CNS-205   NC_009953=5786361
63517459   Serratia proteamaculans 568     NC_009832=5448853,NC_009829=46804
63613953   Burkholderia pseudomallei 668   NC_009075=3127456,NC_009074=3912947
63710676   Mycoplasma synoviae 53  NC_007294=799476
63810675   Mycoplasma hyopneumoniae J      NC_007295=897405
63916820   Clostridium novyi NT    NC_008593=2547720
640nocaFarc_IFM10152       Nocardia farcinica IFM 10152    chr=6021225,plasmid_pNF1=184026,plasmid_pNF2=87093
64113378   Bacteroides vulgatus ATCC 8482  NC_009614=5163189
64216351   Escherichia coli W3110  AC_000091=4646332
643porpGing_W83    Porphyromonas gingivalis W83    chr=2343476
64417415   Shewanella pealeana ATCC 700345 NC_009901=5174581
645eschColi_APEC_O1        Escherichia coli APEC O1        chr=5082025
64646      Bacteroides fragilis NCTC 9343  NC_003228=5205140,NC_006873=36560
64713462   Roseiflexus castenholzii DSM 13941      NC_009767=5723298
64844      Bartonella quintana str. Toulouse       NC_005955=1581384
64942      Rickettsia conorii str. Malish 7        NC_003103=1268755
65043      Rickettsia prowazekii str. Madrid E     NC_000963=1111523
651bactThet_VPI_5482       Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482   chr=6260361,plasmid_p5482=33038
65217413   Delftia acidovorans SPH-1       NC_010002=6767514
653haemInfl_KW20   Haemophilus influenzae Rd KW20  chr=1830138
654brucMeli        Brucella melitensis 16M chrII=1177787,chrI=2117144
655haloHalo_SL1    Halorhodospira halophila SL1    chr=2678452
656pyrAby1 Pyrococcus abyssi GE5   chr=1765118,plasmid_pGT5=3444
657mculMari1       Methanoculleus marisnigri JR1   chr=2478101
65812554   Borrelia garinii PBi    NC_006128=27108,NC_006129=55560,NC_006156=904246
659dechArom_RCB    Dechloromonas aromatica RCB     chr=4501104
660stapAure_MU50   Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu50        chr=2878529,plasmid_VRSAp=25107
661eschColi_K12    Escherichia coli K12    chr=4639675
66212416   Pseudomonas syringae pv. phaseolicola 1448A     NC_005773=5928787,NC_007275=51711,NC_007274=131950
663aeroHydr_ATCC7966       Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966        chr=4744448
664baciAnth_AMES   Bacillus anthracis str. Ames    chr=5227293
665shewOnei        Shewanella oneidensis MR-1      plasmid_pMR-1=161613,chr=4969803
66615217   Human herpesvirus 1     NC_001806=152261
667lMaj5   Leishmania major 2005   chr1=268984,chr2=355714,chr3=384518,chr4=441313,chr5=465823,chr6=516874,chr7=596348,chr8=574972,chr9=573441,chr10=570864,chr11=582575,chr12=675347,chr13=654604,chr14=622648,chr15=629514,chr16=714659,chr17=684831,chr18=739751,chr19=702212,chr20=742551,chr21=772974,chr22=716608,chr23=772567,chr24=840950,chr25=912849,chr26=1091579,chr27=1130447,chr28=1160128,chr29=1212674,chr30=1403454,chr31=1484336,chr32=1604650,chr33=1583673,chr34=1866754,chr35=2090491,chr36=2682183
668arabidopsis     Arabidopsis thaliana TAIR9
669arabidopsis_tair8       Arabidopsis thaliana TAIR8
670araTha1 Arabidopsis thaliana TAIR7
671mm5     Mouse May 2004 (mm5)
672Sscrofa9.58     Pig May 2010 (SGSC Sscrofa9.58)
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。