チケット #215 (closed 仕様: fixed)

登録: 16 年

最終更新: 16 年

スタブを用いて、遺伝子名からモチーフ情報が取得できる(2pt)

報告者: h-morita 担当者: common
優先度: 現マイルストーンで作業の停滞を招く マイルストーン: 平成20年度開発
コンポーネント: Galaxy バージョン:
キーワード: 関係者:
GanttChart表示: OFF 依存TaskNo:
開始予定日: YYYY/MM/DD 終了予定日: YYYY/MM/DD

説明 (最終更新者: h-morita) (diff)

遺伝子名→タンパク質の取得は、遺伝子名から転写翻訳されてできるタンパク質を算出する。

リリースまでの難易度を下げる為に、算出部分をスタブ実装し、一通りの操作ができ使用感を確認できるものを作成する。

より具体的に、「PDB検索でシーケンス情報を取得し、シーケンス情報から検索でPfam IDリストを取得、そのPfam IDを元にしてエントリーからInterPRO IDを取得できる。」というストーリーを想定。

このストーリーが概要のストーリーを実現しているかどうかの確認が必要。

チケットの履歴

更新者: h-morita (16 年 前)

  • 分類不具合 から 仕様 に変更されました。

更新者: h-morita (16 年 前)

  • 概要スタブを用いて、遺伝子名からモチーフ情報が取得できる から スタブを用いて、遺伝子名からモチーフ情報が取得できる(2pt) に変更されました。

更新者: h-morita (16 年 前)

  • 説明 が変更されました (diff)

更新者: h-morita (16 年 前)

  • ステータスnew から closed に変更されました。
  • 解決方法fixed に設定されました。

更新者: h-morita (16 年 前)

  • マイルストーン平成20年度開発 に設定されました。
Note: チケットについてのヘルプは TracTickets を参照 して下さい。