チケット #215 (closed 仕様: fixed)
スタブを用いて、遺伝子名からモチーフ情報が取得できる(2pt)
報告者: | h-morita | 担当者: | common |
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優先度: | 現マイルストーンで作業の停滞を招く | マイルストーン: | 平成20年度開発 |
コンポーネント: | Galaxy | バージョン: | |
キーワード: | 関係者: | ||
GanttChart表示: | OFF | 依存TaskNo: | |
開始予定日: | YYYY/MM/DD | 終了予定日: | YYYY/MM/DD |
説明 (最終更新者: h-morita) (diff)
遺伝子名→タンパク質の取得は、遺伝子名から転写翻訳されてできるタンパク質を算出する。
リリースまでの難易度を下げる為に、算出部分をスタブ実装し、一通りの操作ができ使用感を確認できるものを作成する。
より具体的に、「PDB検索でシーケンス情報を取得し、シーケンス情報から検索でPfam IDリストを取得、そのPfam IDを元にしてエントリーからInterPRO IDを取得できる。」というストーリーを想定。
このストーリーが概要のストーリーを実現しているかどうかの確認が必要。
チケットの履歴
Note: チケットについてのヘルプは
TracTickets を参照
して下さい。