root/BH13SPARQLBuilder/src/org/biohackathon/SPARQLBuilder/OWL/OWLQueryBuilderImpl.java @ 27

リビジョン 27, 25.3 KB (コミッタ: nori, 11 年 前)

getNextClass のexists句を変えてSPARQLの処理速度が向上したはず
  • 属性 svn:mime-type の設定値 text/plain
行番号 
1package org.biohackathon.SPARQLBuilder.OWL;
2
3import java.util.ArrayList;
4import java.util.Collection;
5import java.util.HashMap;
6import java.util.HashSet;
7import java.util.Set;
8
9import com.hp.hpl.jena.query.Query;
10import com.hp.hpl.jena.query.QueryExecution;
11import com.hp.hpl.jena.query.QueryExecutionFactory;
12import com.hp.hpl.jena.query.QueryFactory;
13import com.hp.hpl.jena.query.QuerySolution;
14import com.hp.hpl.jena.query.ResultSet;
15import com.hp.hpl.jena.rdf.model.Literal;
16import com.hp.hpl.jena.rdf.model.Resource;
17
18/**
19 * 繧ｯ繧ｨ繝ｪ繧堤函謌舌☆繧九◆繧√�讖溯�繧呈署萓帙☆繧区ｸ繧ｯ繝ｩ繧ｹ
20 *
21 * @author Norio KOBAYASHI
22 * @since 28.01.2014
23 * @version 29.01.2014
24 */
25public class OWLQueryBuilderImpl implements OWLQueryBuilder {
26
27        // private Model model = null;
28        private String endpointURI = null;
29
30        /**
31         * 繧｢繧ｯ繧ｻ繧ｹ縺吶ｋSPARQL endpoint縺ｮURI繧呈欠螳壹☆繧区ｧ区�蟄�
32         *
33         * @param endpointURI
34         *            縲€繧｢繧ｯ繧ｻ繧ｹ縺吶ｋSPARQL endpoint縺ｮURI
35         * @throws Exception
36         * @since 28.01.2014
37         */
38        public OWLQueryBuilderImpl(String endpointURI) {
39                this.endpointURI = endpointURI;
40        }
41
42        /**
43         * 繝�せ繝医↓菴ｿ逕ｨ縺吶ｋmain繝｡繧ｽ繝�ラ
44         * <p>
45         * 繧ｯ繧ｨ繝ｪ繝薙Ν繝€繝ｼ縺ｮ譛ｬ逡ｪ繝励Ο繧ｰ繝ｩ繝縺ｧ縺ｯ縺薙�繝｡繧ｽ繝�ラ縺ｯ菴ｿ逕ｨ縺励↑縺�
46         * </p>
47         *
48         * @param args
49         *            菴ｿ逕ｨ縺励↑縺�
50         * @throws Exception
51         * @since 28.01.2014
52         */
53        public static void main(String[] args) throws Exception {
54                String sparqlEndpoint = "http://dbpedia.org/sparql";
55//              String sparqlEndpoint = "http://lsd.dbcls.jp/sparql";
56                String keyword = "artiste";
57//              String keyword = "Agent";
58                String[] graphURIs = new String[0];
59
60                OWLQueryBuilder builder = new OWLQueryBuilderImpl(sparqlEndpoint);
61                SClass[] clz = builder.getOWLClasses(graphURIs, keyword);
62                for (SClass cls : clz) {
63                        System.out.println(cls);
64                }
65
66                System.out.println("CLS");
67                ClassLink[] cls = builder.getNextClass(null, clz[1].getClassURI(), 100,
68                                false);
69                if (cls != null) {
70                        for (ClassLink cl : cls) {
71                                System.out.println(cl.toString());
72                        }
73                        cls = builder.countLinks(null, clz[1].getClassURI(), cls);
74                        for (ClassLink cl : cls) {
75                                System.out.println(cl.toString());
76                        }
77                }
78               
79               
80                /*
81                 * System.out.println("CLS-INS"); cls =
82                 * builder.getNextClassViaInstanceLink(null, clz[0].getClassURI(), 100);
83                 * if( cls != null ){ for( ClassLink cl: cls){
84                 * System.out.println(cl.toString()); } }
85                 *
86                 * System.out.println("Instances"); Instance[] ins =
87                 * builder.getInstances(null, "\"A.C. Reed\"@en"); if( ins != null ){
88                 * for( Instance in: ins){ System.out.println(in.toString()); } }
89                 *
90                 *
91                 * System.out.println("INS-INS"); ins = builder.getInstances(null,
92                 * "\"A.C. Reed\"@en"); InstanceLink[] iLinks =
93                 * builder.getNextInstancesViaInstanceLink(null,
94                 * ins[0].getInstanceURI(), 100);
95                 *
96                 *
97                 *
98                 * if( iLinks != null ){ for( InstanceLink in: iLinks){
99                 * System.out.println(in.toString()); } }
100                 */
101        }
102
103        /**
104         * 譏守､ｺ逧�↓RDF縺ｧ譖ｸ縺九ｌ縺ｦ縺�ｋ繧ｯ繝ｩ繧ｹ繧貞叙蠕励☆繧�
105         * <p>
106         * 謖�ｮ壹＆繧後◆graphURIs縺ｮ荳ｭ縺九ｉ縲√く繝ｼ繝ｯ繝ｼ繝峨↓繝偵ャ繝医☆繧九Λ繝吶Ν繧呈戟縺､繧ｯ繝ｩ繧ｹ��dfs:Class�峨ｒ縺吶∋縺ｦ霑斐☆ <br>
107         * </p>
108         *
109         * @param graphURIs
110         *            縲€讀懃ｴ｢蟇ｾ雎｡縺ｮgraph縺ｮURI驟榊� (null繧�聞縺�縺ｮ驟榊�繧ょ庄)
111         * @param keyword
112         *            ��ull繧�ｩｺ譁�ｭ励�荳榊庄��
113         * @return 繧ｯ繝ｩ繧ｹURI縺ｮ驟榊�
114         * @throws Exception
115         * @since 28.01.2014
116         */
117        public SClass[] getOWLClasses(String[] graphURIs, String keyword)
118                        throws Exception {
119                StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
120                queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
121                queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
122                queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
123                queryStr.append("SELECT DISTINCT ?c ?pLabel (COUNT(?i) AS ?numOfInstances)\n");
124                if (graphURIs != null) {
125                        for (String graphURI : graphURIs) {
126                                queryStr.append("FROM <");
127                                queryStr.append(graphURI);
128                                queryStr.append(">\n");
129                        }
130                }
131                queryStr.append("WHERE{\n");
132
133                queryStr.append(" {?c rdf:type rdfs:Class} UNION {?c rdf:type owl:Class}\n");
134
135                queryStr.append("      ?c rdfs:label ?label.\n");
136                queryStr.append("      ?c rdfs:label ?pLabel.\n");
137                queryStr.append("      ?i rdf:type ?c.\n");
138
139                // queryStr.append("      ?c rdfs:label ");
140                // queryStr.append(keyword);
141                // queryStr.append(".");
142
143                queryStr.append("  FILTER (\n");
144                queryStr.append("    REGEX( ?label , \"");
145                queryStr.append(keyword);
146                queryStr.append("\" , \"i\" )\n");
147                queryStr.append("  )");
148                queryStr.append("\n}  GROUP BY ?c ?pLabel");
149
150                System.out.println(queryStr.toString());
151
152                Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
153                QueryExecution qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(endpointURI,
154                                query);
155
156                ResultSet results = qexec.execSelect();
157                HashMap<String, SClass> classMap = new HashMap<String, SClass>();
158                for (; results.hasNext();) {
159                        QuerySolution sol = results.next();
160                        Resource res = sol.getResource("c");
161                        if (res != null) {
162                                String uri = res.getURI();
163                                int numOfInstances = sol.getLiteral("numOfInstances").getInt();
164                                // System.out.println(numOfInstances);
165                                Literal labelLiteral = sol.getLiteral("pLabel");
166                                SClass sClass = null;
167                                if (classMap.containsKey(uri)) {
168                                        sClass = classMap.get(uri);
169                                } else {
170                                        sClass = new SClass(uri, null, numOfInstances);
171                                        classMap.put(uri, sClass);
172                                }
173                                if (labelLiteral != null) {
174                                        String label = labelLiteral.getString();
175                                        String lang = labelLiteral.getLanguage();
176                                        sClass.addLabel(new Label(label, lang));
177                                }
178                        }
179                }
180                qexec.close();
181                return classMap.values().toArray(new SClass[0]);
182        }
183
184        /**
185         * 縲€繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ繧貞叙蠕励☆繧�
186         * <p>
187         * 謖�ｮ壹＆繧後◆graphURIs縺ｮ荳ｭ縺九ｉ縲√く繝ｼ繝ｯ繝ｼ繝峨↓繝偵ャ繝医☆繧九Λ繝吶Ν繧呈戟縺､繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ繧偵☆縺ｹ縺ｦ霑斐☆ <br>
188         * 縺薙％縺ｧ繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｨ縺ｯ縲〉df:type縺ｮ荳ｻ隱槭→縺励※險倩ｿｰ縺輔ｌ縺ｦ縺�ｋ繧ゅ�繧偵＞縺�<br>
189         * </p>
190         *
191         * @param graphURIs
192         *            縲€讀懃ｴ｢蟇ｾ雎｡縺ｮgraph縺ｮURI驟榊� (null繧�聞縺�縺ｮ驟榊�繧ょ庄)
193         * @param keyword
194         *            ��ull繧�ｩｺ譁�ｭ励�荳榊庄��
195         * @return 繧ｯ繝ｩ繧ｹURI縺ｮ驟榊�
196         * @throws Exception
197         * @since 28.01.2014
198         */
199        public Instance[] getInstances(String[] graphURIs, String keyword)
200                        throws Exception {
201                StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
202                queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
203                queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
204                queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
205                queryStr.append("SELECT DISTINCT ?ins ?c \n");
206                if (graphURIs != null) {
207                        for (String graphURI : graphURIs) {
208                                queryStr.append("FROM <");
209                                queryStr.append(graphURI);
210                                queryStr.append(">\n");
211                        }
212                }
213                queryStr.append("WHERE{\n");
214                // queryStr.append(" {?c rdf:type rdfs:Class} UNION {?c rdf:type owl:Class}\n");
215
216                queryStr.append("      ?ins rdf:type ?c.\n");
217                queryStr.append("      ?ins rdfs:label ");
218                queryStr.append(keyword);
219                queryStr.append(".\n");
220                queryStr.append(" FILTER (?c != rdf:Property)");
221                queryStr.append("}");
222
223                // System.out.println(queryStr.toString());
224
225                Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
226                QueryExecution qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(endpointURI,
227                                query);
228
229                ResultSet results = qexec.execSelect();
230                HashMap<String, HashSet<String>> instanceMap = new HashMap<String, HashSet<String>>();
231                for (; results.hasNext();) {
232                        QuerySolution sol = results.next();
233                        Resource cls = sol.getResource("c");
234                        Resource ins = sol.getResource("ins");
235                        String clsURI = cls.getURI();
236                        String insURI = ins.getURI();
237                        if (instanceMap.containsKey(insURI)) {
238                                HashSet<String> classes = instanceMap.get(insURI);
239                                classes.add(clsURI);
240                        } else {
241                                HashSet<String> classes = new HashSet<String>();
242                                instanceMap.put(insURI, classes);
243                                classes.add(clsURI);
244                        }
245                }
246                qexec.close();
247                Set<String> keySet = instanceMap.keySet();
248                ArrayList<Instance> instanceList = new ArrayList<Instance>();
249                for (String key : keySet) {
250                        Instance ins = new Instance(key, instanceMap.get(key).toArray(
251                                        new String[0]));
252                        instanceList.add(ins);
253                }
254                return instanceList.toArray(new Instance[0]);
255        }
256
257        /**
258         * 縲€謖�ｮ壹＆繧後◆繧ｯ繝ｩ繧ｹ繧定ｵｷ轤ｹ縺ｨ縺励€∵�遉ｺ逧�↓險倩ｿｰ縺輔ｌ縺ｦ縺�ｋOWL縺ｮproperty蛻ｶ邏�ｒ隱ｿ縺ｹ縲√◎縺ｮproperty蛻ｶ邏�〒
259         * 髢｢騾｣縺･縺代ｉ繧後※縺�ｋ繧ｯ繝ｩ繧ｹ繧堤ｶｲ鄒�噪縺ｫ蜿門ｾ励☆繧�
260         * <p>
261         * 蜃ｦ逅�ｯｾ雎｡繝��繧ｿ繧暖raphURIs縺ｧ謖�ｮ壹☆繧九％縺ｨ縺後〒縺阪ｋ <br>
262         * <br>
263         * </p>
264         *
265         * @param graphURIs
266         *            縲€讀懃ｴ｢蟇ｾ雎｡縺ｮgraph縺ｮURI驟榊� 縲€(null繧�聞縺�縺ｮ驟榊�繧ょ庄)
267         * @param originClass
268         *            襍ｷ轤ｹ縺ｨ縺ｪ繧九け繝ｩ繧ｹ縺ｮURI縲€��ull荳榊庄��
269         * @param limit
270         *            隗｣縺ｨ縺励※霑斐＆繧後ｋClassLink驟榊�縺ｮ髟ｷ縺輔�荳企剞蛟､繧呈欠螳壹☆繧九€�荳企剞蛟､繧定ｨｭ螳壹＠縺ｪ縺�ｴ蜷医�0莉･荳九�蛟､繧呈欠螳壹☆繧�
271         * @return ClassLink縺ｮ驟榊�縲ゅ％縺薙↓縺ｯ縲∝叙蠕励＆繧後◆繧ｯ繝ｩ繧ｹ縺ｨ髢｢菫ゅ▼縺代ｉ繧後※縺�ｋ繝励Ο繝代ユ繧｣縲�未菫ゅ�蜷代″縺悟性縺ｾ繧後ｋ縲�
272         * @throws Exception
273         * @since 28.01.2014
274         */
275        public ClassLink[] getNextClass(String[] graphURIs, String originClass,
276                        int limit, boolean countLinks) throws Exception {
277                StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
278                queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
279                queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
280                queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
281
282                // SELECT
283                if (countLinks) {
284                        queryStr.append("SELECT DISTINCT ?p ?pDirection ?c (COUNT(?s) AS ?numOfLinks) \n");
285                } else {
286                        queryStr.append("SELECT DISTINCT ?p ?pDirection ?c \n");
287                }
288
289                if (graphURIs != null) {
290                        for (String graphURI : graphURIs) {
291                                queryStr.append("FROM <");
292                                queryStr.append(graphURI);
293                                queryStr.append(">\n");
294                        }
295                }
296                queryStr.append("WHERE{\n");
297//              queryStr.append("  { ?c rdf:type rdfs:Class. }\n  UNION\n  { ?c rdf:type owl:Class. }\n");
298                queryStr.append("  { ?p rdfs:domain <");
299                queryStr.append(originClass);
300                queryStr.append(">.\n    ?p rdfs:range ?c.\n");
301
302               
303                if (countLinks) {
304                        queryStr.append("    ?o ?p ?s.");
305                }else{
306                        queryStr.append("filter(exists{\n");
307                        queryStr.append("  ?o rdf:type ?c.\n");
308                        queryStr.append(" ?s rdf:type <");
309                        queryStr.append(originClass);
310                        queryStr.append(">.\n");
311                        queryStr.append("       ?s ?p ?o.})\n");
312                }
313
314                queryStr.append("}\n  UNION\n");
315                queryStr.append("  { ?p rdfs:range <");
316                queryStr.append(originClass);
317                queryStr.append(">.\n");
318                queryStr.append("    ?p rdfs:domain ?c.\n");
319
320                if (countLinks) {
321                        queryStr.append("    ?s ?p ?o.");
322                }else{
323                        queryStr.append("filter(exists{\n");
324                        queryStr.append("  ?s rdf:type ?c.\n");
325                        queryStr.append(" ?o rdf:type <");
326                        queryStr.append(originClass);
327                        queryStr.append(">.\n");
328                        queryStr.append("       ?s ?p ?o.})\n");
329                }
330
331                queryStr.append("}\n");
332
333                queryStr.append("    ?p ?pDirection ?c.\n");
334
335                queryStr.append("  ?s rdf:type ?c.\n");
336
337                if (countLinks) {
338                        queryStr.append("}\nGROUP BY ?p ?pDirection ?c\n");
339                } else {
340                        queryStr.append("}\n");
341                }
342                if (limit > 0) {
343                        queryStr.append("limit ");
344                        queryStr.append(limit);
345                        queryStr.append("\n");
346                }
347
348                System.out.println(queryStr.toString());
349
350                Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
351                QueryExecution qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(endpointURI,
352                                query);
353
354                ResultSet results = qexec.execSelect();
355                ArrayList<ClassLink> solCLs = new ArrayList<ClassLink>();
356                for (; results.hasNext();) {
357                        QuerySolution sol = results.next();
358                        Resource pro = sol.getResource("p");
359                        if (pro != null) {
360                                Resource cls = sol.getResource("c");
361                                Resource dir = sol.getResource("pDirection");
362                                String proURI = pro.getURI();
363                                String clsURI = cls.getURI();
364                                String dirURI = dir.getURI();
365
366                                // System.out.println(pro.getURI() + " " + cls.getURI() + " " +
367                                // dir.getURI());
368
369                                Direction direction = null;
370                                if (dirURI
371                                                .equals("http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#domain")
372                                                || dirURI.equals("rdfs:domain")) {
373                                        direction = Direction.reverse;
374                                }
375                                if (dirURI.equals("http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#range")
376                                                || dirURI.equals("rdfs:range")) {
377                                        if (direction != null) {
378                                                direction = Direction.both;
379                                        } else {
380                                                direction = Direction.forward;
381                                        }
382                                }
383                                // System.out.println(direction);
384                                int numOfLinks = 0;
385                                if (countLinks) {
386                                        numOfLinks = sol.getLiteral("numOfLinks").getInt();
387                                }
388                                ClassLink cl = new ClassLink(proURI, clsURI, direction,
389                                                numOfLinks);
390                                solCLs.add(cl);
391                        }
392                }
393                qexec.close();
394                return solCLs.toArray(new ClassLink[0]);
395        }
396
397        /**
398         * 縲€謖�ｮ壹＆繧後◆繧ｯ繝ｩ繧ｹ繧定ｵｷ轤ｹ縺ｨ縺励€√◎縺ｮ繧ｯ繝ｩ繧ｹ縺ｫ螻槭＠縺ｦ縺�ｋ繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｨ繝ｪ繝ｳ繧ｯ縺悟ｼｵ繧峨ｌ縺ｦ縺�ｋ繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｮ髮�粋繧貞叙蠕励＠縲�
399         * 蜿門ｾ励＠縺溘う繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｮ繧ｯ繝ｩ繧ｹ繧堤ｶｲ鄒�噪縺ｫ蜿門ｾ励☆繧�
400         * <p>
401         * 縺薙％縺ｧ繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｨ縺ｯ縲〉df:type縺ｮ荳ｻ隱槭→縺励※險倩ｿｰ縺輔ｌ縺ｦ縺�ｋ繧ゅ�繧偵＞縺�<br>
402         * 蜃ｦ逅�ｯｾ雎｡繝��繧ｿ繧暖raphURIs縺ｧ謖�ｮ壹☆繧九％縺ｨ縺後〒縺阪ｋ <br>
403         * </p>
404         *
405         * @param graphURIs
406         *            縲€讀懃ｴ｢蟇ｾ雎｡縺ｮgraph縺ｮURI驟榊� 縲€(null繧�聞縺�縺ｮ驟榊�繧ょ庄)
407         * @param originClass
408         *            襍ｷ轤ｹ縺ｨ縺ｪ繧九け繝ｩ繧ｹ縺ｮURI縲€��ull荳榊庄��
409         * @param limit
410         *            隗｣縺ｨ縺励※霑斐＆繧後ｋClassLink驟榊�縺ｮ髟ｷ縺輔�荳企剞蛟､繧呈欠螳壹☆繧九€�荳企剞蛟､繧定ｨｭ螳壹＠縺ｪ縺�ｴ蜷医�0莉･荳九�蛟､繧呈欠螳壹☆繧�
411         * @return ClassLink縺ｮ驟榊�縲ゅ％縺薙↓縺ｯ縲∝叙蠕励＆繧後◆繧ｯ繝ｩ繧ｹ縺ｨ髢｢菫ゅ▼縺代ｉ繧後※縺�ｋ繝励Ο繝代ユ繧｣縲�未菫ゅ�蜷代″縺悟性縺ｾ繧後ｋ縲�
412         * @throws Exception
413         * @since 28.01.2014
414         */
415        public ClassLink[] getNextClassViaInstanceLink(String[] graphURIs,
416                        String originClass, int limit) throws Exception {
417                StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
418                queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
419                queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
420                queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
421                queryStr.append("SELECT DISTINCT ?pf ?pr ?c \n");
422                if (graphURIs != null) {
423                        for (String graphURI : graphURIs) {
424                                queryStr.append("FROM <");
425                                queryStr.append(graphURI);
426                                queryStr.append(">\n");
427                        }
428                }
429                queryStr.append("WHERE{\n");
430                queryStr.append("  ?ins rdf:type ?c.\n");
431                queryStr.append("  ?insOrg rdf:type <");
432                queryStr.append(originClass);
433                queryStr.append(">.\n");
434                queryStr.append("  { ?ins ?pr ?insOrg. }\n  UNION { ?insOrg ?pf ?ins. }\n");
435                queryStr.append("}\n");
436                if (limit > 0) {
437                        queryStr.append("limit ");
438                        queryStr.append(limit);
439                        queryStr.append("\n");
440                }
441
442                // System.out.println(queryStr.toString());
443
444                Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
445                QueryExecution qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(endpointURI,
446                                query);
447
448                ResultSet results = qexec.execSelect();
449                ArrayList<ClassLink> solCLs = new ArrayList<ClassLink>();
450                for (; results.hasNext();) {
451                        QuerySolution sol = results.next();
452                        Resource proForward = sol.getResource("pf");
453                        Resource proReverse = sol.getResource("pr");
454                        Resource cls = sol.getResource("c");
455                        Direction direction = null;
456                        String propURI = null;
457                        if (proForward != null) {
458                                if (proReverse != null) {
459                                        direction = Direction.both;
460                                } else {
461                                        direction = Direction.forward;
462                                }
463                                propURI = proForward.getURI();
464                        } else {
465                                direction = Direction.reverse;
466                                propURI = proReverse.getURI();
467                        }
468                        String clsURI = cls.getURI();
469                        // System.out.println(propURI + " " + clsURI + " " + direction);
470
471                        ClassLink cl = new ClassLink(propURI, clsURI, direction, 0);
472                        solCLs.add(cl);
473                }
474                qexec.close();
475                return solCLs.toArray(new ClassLink[0]);
476        }
477
478        public Path[] getPaths(String startClass, String endClass) throws Exception {
479                OWLClassGraph graph = new OWLClassGraph(startClass, endClass);
480                return graph.getPaths(this, 0);
481        }
482
483        public String createSPARQL(Path path) throws Exception {
484                return null;
485        }
486
487        /*
488         * private String executeSelect(String sparqlQuery) throws Exception {
489         * HttpClient client = HttpClientBuilder.create().build(); HttpPost httppost
490         * = new HttpPost(endpointURI); httppost.setHeader("Content-Type",
491         * "application/x-www-form-urlencoded"); httppost.setHeader("Accept",
492         * "application/sparql-results+xml"); List<NameValuePair> nvpList = new
493         * ArrayList<NameValuePair>(); nvpList.add(new BasicNameValuePair("query",
494         * sparqlQuery)); // nvpList.add(new BasicNameValuePair("format", //
495         * outputFormat.getMime())); httppost.setEntity(new
496         * UrlEncodedFormEntity(nvpList, Charset .forName("UTF-8"))); HttpResponse
497         * response = client.execute(httppost); //
498         * System.out.println("[StatusLine] " + response.getStatusLine());
499         * HttpEntity entity = response.getEntity(); String entityString =
500         * EntityUtils.toString(entity, "UTF-8"); return entityString; }
501         */
502
503        /**
504         * 縲€謖�ｮ壹＆繧後◆繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ繧定ｵｷ轤ｹ縺ｨ縺励€√◎縺ｮ繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｫ繝ｪ繝ｳ繧ｯ縺悟ｼｵ繧峨ｌ縺ｦ縺�ｋ繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｮ髮�粋繧貞叙蠕励☆繧九€�
505         * 縲€蜿門ｾ励＆繧後◆蜷�う繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｮ繧ｯ繝ｩ繧ｹ繧らｶｲ鄒�噪縺ｫ蜿門ｾ励☆繧�
506         * <p>
507         * 縺薙％縺ｧ繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｨ縺ｯ縲〉df:type縺ｮ荳ｻ隱槭→縺励※險倩ｿｰ縺輔ｌ縺ｦ縺�ｋ繧ゅ�繧偵＞縺�<br>
508         * 蜃ｦ逅�ｯｾ雎｡繝��繧ｿ繧暖raphURIs縺ｧ謖�ｮ壹☆繧九％縺ｨ縺後〒縺阪ｋ <br>
509         * </p>
510         *
511         * @param graphURIs
512         *            縲€讀懃ｴ｢蟇ｾ雎｡縺ｮgraph縺ｮURI驟榊� 縲€(null繧�聞縺�縺ｮ驟榊�繧ょ庄)
513         * @param originInstance
514         *            襍ｷ轤ｹ縺ｨ縺ｪ繧九う繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｮURI縲€��ull荳榊庄��
515         * @param limit
516         *            隗｣縺ｨ縺励※霑斐＆繧後ｋInstanceLink驟榊�縺ｮ髟ｷ縺輔�荳企剞蛟､繧呈欠螳壹☆繧九€�荳企剞蛟､繧定ｨｭ螳壹＠縺ｪ縺�ｴ蜷医�0莉･荳九�蛟､繧呈欠螳壹☆繧�
517         * @return InstanceLink縺ｮ驟榊�縲ゅ％縺薙↓縺ｯ縲∝叙蠕励＆繧後◆繧ｯ繝ｩ繧ｹ縺ｨ髢｢菫ゅ▼縺代ｉ繧後※縺�ｋ繝励Ο繝代ユ繧｣縲�未菫ゅ�蜷代″縺悟性縺ｾ繧後ｋ縲�
518         * @throws Exception
519         * @since 28.01.2014
520         */
521        public InstanceLink[] getNextInstancesViaInstanceLink(String[] graphURIs,
522                        String originInstance, int limit) throws Exception {
523                StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
524                queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
525                queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
526                queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
527                queryStr.append("SELECT DISTINCT ?pf ?pr ?ins ?c \n");
528                if (graphURIs != null) {
529                        for (String graphURI : graphURIs) {
530                                queryStr.append("FROM <");
531                                queryStr.append(graphURI);
532                                queryStr.append(">\n");
533                        }
534                }
535                queryStr.append("WHERE{\n");
536                // queryStr.append("  { ?c rdf:type rdfs:Class. }\n  UNION\n  { ?c rdf:type owl:Class. }\n");
537                queryStr.append("  ?ins rdf:type ?c.\n");
538                queryStr.append("  { ?ins ?pr <");
539                queryStr.append(originInstance);
540                queryStr.append(">. }\n  UNION { <");
541                queryStr.append(originInstance);
542                queryStr.append("> ?pf ?ins. }\n");
543
544                queryStr.append(" FILTER (?c != rdf:Property)");
545
546                queryStr.append("}\n");
547                if (limit > 0) {
548                        queryStr.append("limit ");
549                        queryStr.append(limit);
550                        queryStr.append("\n");
551                }
552
553                // System.out.println(queryStr.toString());
554
555                Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
556                QueryExecution qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(endpointURI,
557                                query);
558
559                ResultSet results = qexec.execSelect();
560                HashMap<String, InstanceLink> insLinkMap = new HashMap<String, InstanceLink>();
561                for (; results.hasNext();) {
562                        QuerySolution sol = results.next();
563                        Resource proForward = sol.getResource("pf");
564                        Resource proReverse = sol.getResource("pr");
565                        Resource ins = sol.getResource("ins");
566                        Resource cls = sol.getResource("c");
567                        Direction direction = null;
568                        String propURI = null;
569                        if (proForward != null) {
570                                if (proReverse != null) {
571                                        direction = Direction.both;
572                                } else {
573                                        direction = Direction.forward;
574                                }
575                                propURI = proForward.getURI();
576                        } else {
577                                direction = Direction.reverse;
578                                propURI = proReverse.getURI();
579                        }
580                        String clsURI = cls.getURI();
581                        String insURI = ins.getURI();
582                        String key = propURI + "\t" + insURI + "\t" + direction;
583                        if (insLinkMap.containsKey(key)) {
584                                InstanceLink insLink = insLinkMap.get(key);
585                                insLink.addLinkedClassURI(clsURI);
586                        } else {
587                                InstanceLink insLink = new InstanceLink(propURI, insURI,
588                                                new String[] { clsURI }, direction);
589                                insLinkMap.put(key, insLink);
590                        }
591                }
592                qexec.close();
593                Collection<InstanceLink> values = insLinkMap.values();
594                return values.toArray(new InstanceLink[0]);
595        }
596
597        public LabelMap[] getLabels(String[] graphURIs, String[] resourceURIs,
598                        String language) throws Exception {
599                if (resourceURIs == null || resourceURIs.length == 0) {
600                        return new LabelMap[0];
601                }
602                StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
603                queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
604                queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
605                queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
606                queryStr.append("SELECT DISTINCT ?res ?label \n");
607                if (graphURIs != null) {
608                        for (String graphURI : graphURIs) {
609                                queryStr.append("FROM <");
610                                queryStr.append(graphURI);
611                                queryStr.append(">\n");
612                        }
613                }
614                queryStr.append("WHERE{\n");
615                queryStr.append("  ?res rdfs:label ?label.\n");
616                queryStr.append("  FILTER(?res IN (");
617                boolean f = false;
618                for (String resourceURI : resourceURIs) {
619                        if (f) {
620                                queryStr.append(", ");
621                        }
622                        f = true;
623                        queryStr.append("<");
624                        queryStr.append(resourceURI);
625                        queryStr.append(">");
626                }
627                queryStr.append("))\n");
628                queryStr.append("}");
629
630                System.out.println(queryStr.toString());
631
632                Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
633                QueryExecution qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(endpointURI,
634                                query);
635
636                ResultSet results = qexec.execSelect();
637                HashMap<String, LabelMap> lMap = new HashMap<String, LabelMap>();
638                for (; results.hasNext();) {
639                        QuerySolution sol = results.next();
640                        String uri = sol.getResource("res").getURI();
641                        Literal literal = sol.getLiteral("label");
642                        if (literal != null) {
643                                String label = literal.getString();
644                                String lang = literal.getLanguage();
645                                if (language != null && language.equals(lang)) {
646                                        Label lbl = new Label(label, lang);
647                                        if (lMap.containsKey(uri)) {
648                                                LabelMap lm = lMap.get(uri);
649                                                lm.addLabel(lbl);
650                                        } else {
651                                                LabelMap lm = new LabelMap(uri, new Label[] { lbl });
652                                                lMap.put(uri, lm);
653                                        }
654                                }
655                        }
656                }
657                return lMap.values().toArray(new LabelMap[0]);
658        }
659
660        public ClassLink[] countLinks(String[] graphURIs, String startClassURI,
661                        ClassLink[] classLinks) throws Exception {
662                if (classLinks == null || classLinks.length == 0) {
663                        return new ClassLink[0];
664                }
665                for (ClassLink classLink : classLinks) {
666                        StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
667                        queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
668                        queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
669                        queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
670
671                        queryStr.append("SELECT (COUNT(?os) AS ?numOfLinks) \n");
672                        if (graphURIs != null) {
673                                for (String graphURI : graphURIs) {
674                                        queryStr.append("FROM <");
675                                        queryStr.append(graphURI);
676                                        queryStr.append(">\n");
677                                }
678                        }
679
680                        queryStr.append("WHERE{\n");
681                        if (classLink.getDirection() == Direction.forward) {
682                                queryStr.append("?is rdf:type  <");
683                                queryStr.append(startClassURI);
684                                queryStr.append(">.\n");
685                                queryStr.append("?os rdf:type  <");
686                                queryStr.append(classLink.getLinkedClassURI());
687                                queryStr.append(">.\n");
688                                queryStr.append("?is ?p ?os.\n");
689                                queryStr.append("}");
690                        } else {
691                                if (classLink.getDirection() == Direction.forward) {
692                                        queryStr.append("?os rdf:type  <");
693                                        queryStr.append(startClassURI);
694                                        queryStr.append(">.\n");
695                                        queryStr.append("?is rdf:type  <");
696                                        queryStr.append(classLink.getLinkedClassURI());
697                                        queryStr.append(">.\n");
698                                        queryStr.append("?is ?p ?os.\n");
699                                        queryStr.append("}");
700                                } else {
701                                        queryStr.append("?os rdf:type  <");
702                                        queryStr.append(startClassURI);
703                                        queryStr.append(">.\n");
704                                        queryStr.append("?is rdf:type  <");
705                                        queryStr.append(classLink.getLinkedClassURI());
706                                        queryStr.append(">.\n");
707                                        queryStr.append("{?is ?p ?os.}\n");
708                                        queryStr.append("UNION\n");
709                                        queryStr.append("{?os ?p ?is.}\n");
710                                        queryStr.append("}");
711                                }
712                        }
713                        System.out.println(queryStr.toString());
714
715                        Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
716                        QueryExecution qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(
717                                        endpointURI, query);
718
719                        ResultSet results = qexec.execSelect();
720                        if (results.hasNext()) {
721                                QuerySolution sol = results.next();
722                                Literal lit = sol.getLiteral("numOfLinks");
723                                if (lit != null) {
724                                        int numOfLinks = lit.getInt();
725                                        classLink.setNumOfLinks(numOfLinks);
726                                }
727                        }
728                        qexec.close();
729                }
730                return classLinks;
731        }
732
733}
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。