root/BH13SPARQLBuilder/src/org/biohackathon/SPARQLBuilder/OWL/OWLQueryBuilderImpl.java @ 56

リビジョン 56, 37.8 KB (コミッタ: nori, 11 年 前)

OWLQueryBuilderImpl.listClasses を実装した
  • 属性 svn:mime-type の設定値 text/plain
行番号 
1package org.biohackathon.SPARQLBuilder.OWL;
2
3import java.util.ArrayList;
4import java.util.Collection;
5import java.util.HashMap;
6import java.util.HashSet;
7import java.util.Set;
8
9import com.hp.hpl.jena.query.Query;
10import com.hp.hpl.jena.query.QueryExecution;
11import com.hp.hpl.jena.query.QueryExecutionFactory;
12import com.hp.hpl.jena.query.QueryFactory;
13import com.hp.hpl.jena.query.QuerySolution;
14import com.hp.hpl.jena.query.ResultSet;
15import com.hp.hpl.jena.rdf.model.Literal;
16import com.hp.hpl.jena.rdf.model.Resource;
17
18/**
19 * 繧ｯ繧ｨ繝ｪ繧堤函謌舌☆繧九◆繧√�讖溯�繧呈署萓帙☆繧区ｸ繧ｯ繝ｩ繧ｹ
20 *
21 * @author Norio KOBAYASHI
22 * @since 28.01.2014
23 * @version 29.01.2014
24 */
25public class OWLQueryBuilderImpl implements OWLQueryBuilder {
26
27        // private Model model = null;
28        private String endpointURI = null;
29
30        /**
31         * 繧｢繧ｯ繧ｻ繧ｹ縺吶ｋSPARQL endpoint縺ｮURI繧呈欠螳壹☆繧区ｧ区�蟄�
32         *
33         * @param endpointURI
34         *            縲€繧｢繧ｯ繧ｻ繧ｹ縺吶ｋSPARQL endpoint縺ｮURI
35         * @throws Exception
36         * @since 28.01.2014
37         */
38        public OWLQueryBuilderImpl(String endpointURI) {
39                this.endpointURI = endpointURI;
40        }
41
42        /**
43         * 繝�せ繝医↓菴ｿ逕ｨ縺吶ｋmain繝｡繧ｽ繝�ラ
44         * <p>
45         * 繧ｯ繧ｨ繝ｪ繝薙Ν繝€繝ｼ縺ｮ譛ｬ逡ｪ繝励Ο繧ｰ繝ｩ繝縺ｧ縺ｯ縺薙�繝｡繧ｽ繝�ラ縺ｯ菴ｿ逕ｨ縺励↑縺�
46         * </p>
47         *
48         * @param args
49         *            菴ｿ逕ｨ縺励↑縺�
50         * @throws Exception
51         * @since 28.01.2014
52         */
53        public static void main(String[] args) throws Exception {
54                // String sparqlEndpoint = "http://dbpedia.org/sparql";
55                String sparqlEndpoint = "http://lsd.dbcls.jp/sparql";
56                // String keyword = "artiste";
57                String keyword = "EnglishCode";
58                String[] graphURIs = new String[0];
59
60                keyword = null;
61
62                OWLQueryBuilder builder = new OWLQueryBuilderImpl(sparqlEndpoint);
63
64/*
65                SClass[] clz = builder.getOWLClasses(graphURIs, keyword, false);
66                for (SClass cls : clz) {
67                        System.out.println(cls);
68                }
69                clz = builder.countInstances(null, clz);
70                for (SClass cls : clz) {
71                        System.out.println(cls);
72                }
73*/
74
75
76                System.out.println("CLS");
77
78                String uri = "http://purl.jp/bio/10/lsd/ontology/201209#EnglishEntry";
79               
80                ClassLink[] cls = null;
81                try{
82                        cls = builder.getNextClass(null, uri, 100, false);
83                }catch(Exception ex) {
84                        ex.printStackTrace();
85                }
86
87                System.out.println("Solutions: ");
88                if (cls != null) {
89                        for (ClassLink cl : cls) {
90                                System.out.println(cl.toString());
91                        }
92                        cls = builder.countLinks(null, uri, cls);
93                        for (ClassLink cl : cls) {
94                                System.out.println(cl.toString());
95                        }
96                }
97
98/*
99               
100                String uri = "http://purl.jp/bio/10/lsd/ontology/201209#EnglishEntry";
101               
102                ClassLink[] cls = null;
103               
104                System.out.println("CLS-INS");
105                cls = null;
106                try{
107                        cls = builder.getNextClassViaInstanceLink(null, uri, 100);
108                }catch(Exception ex){
109                        ex.printStackTrace();
110                }
111                if (cls != null) {
112                        for (ClassLink cl : cls) {
113                                System.out.println(cl.toString());
114                        }
115                }
116*/
117                /*
118                System.out.println("Instances");
119                Instance[] ins = builder.getInstances(null, "\"A.C. Reed\"@en");
120                if (ins != null) {
121                        for (Instance in : ins) {
122                                System.out.println(in.toString());
123                        }
124                }
125*/
126                /*
127                 * System.out.println("INS-INS"); ins = builder.getInstances(null,
128                 * "\"A.C. Reed\"@en"); InstanceLink[] iLinks =
129                 * builder.getNextInstancesViaInstanceLink(null,
130                 * ins[0].getInstanceURI(), 100);
131                 *
132                 * if (iLinks != null) { for (InstanceLink in : iLinks) {
133                 * System.out.println(in.toString()); } }
134                 */
135        }
136
137       
138       
139       
140        /**
141         * 譏守､ｺ逧�↓RDF縺ｧ譖ｸ縺九ｌ縺ｦ縺�ｋ繧ｯ繝ｩ繧ｹ繧貞叙蠕励☆繧�
142         * <p>
143         * 謖�ｮ壹＆繧後◆graphURIs縺ｮ荳ｭ縺九ｉ縲√く繝ｼ繝ｯ繝ｼ繝峨↓繝偵ャ繝医☆繧九Λ繝吶Ν繧呈戟縺､繧ｯ繝ｩ繧ｹ��dfs:Class�峨ｒ縺吶∋縺ｦ霑斐☆ <br>
144         * </p>
145         *
146         * @param graphURIs
147         *            縲€讀懃ｴ｢蟇ｾ雎｡縺ｮgraph縺ｮURI驟榊� (null繧�聞縺�縺ｮ驟榊�繧ょ庄)
148         * @param keyword
149         *            ��ull繧�ｩｺ譁�ｭ励�荳榊庄��
150         * @return 繧ｯ繝ｩ繧ｹURI縺ｮ驟榊�
151         * @throws Exception
152         * @since 28.01.2014
153         */
154        public SClass[] getOWLClasses(String[] graphURIs, String[] keywords,
155                        boolean countInstances) throws Exception {
156                StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
157                queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
158                queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
159                queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
160                if (countInstances) {
161                        queryStr.append("SELECT DISTINCT ?c ?pLabel (COUNT(?i) AS ?numOfInstances)\n");
162                } else {
163                        queryStr.append("SELECT DISTINCT ?c ?pLabel \n");
164                }
165                if (graphURIs != null) {
166                        for (String graphURI : graphURIs) {
167                                queryStr.append("FROM <");
168                                queryStr.append(graphURI);
169                                queryStr.append(">\n");
170                        }
171                }
172                queryStr.append("WHERE{\n");
173
174                //
175                queryStr.append(" {?c rdf:type rdfs:Class} UNION {?c rdf:type owl:Class}\n");
176//              queryStr.append("  ?i rdf:type ?c.\n");
177
178
179               
180                if (countInstances) {
181                        queryStr.append("  ?c rdfs:label ?label.\n");
182                }
183                queryStr.append("  ?c rdfs:label ?pLabel.\n");
184                if (countInstances) {
185                        queryStr.append("      ?i rdf:type ?c.\n");
186                }
187                // queryStr.append("      ?c rdfs:label ");
188                // queryStr.append(keyword);
189                // queryStr.append(".");
190                if (keywords != null && keywords.length != 0) {
191                       
192                        // TODO
193
194                       
195//                      queryStr.append("  FILTER (\n");
196//                      queryStr.append("    REGEX( ?label , \"");
197//                      queryStr.append(keyword);
198//                      queryStr.append("\" , \"i\" )\n");
199//                      queryStr.append("  )\n");
200
201               
202                }
203                if (countInstances) {
204                        queryStr.append("}  GROUP BY ?c ?pLabel");
205                } else {
206                        queryStr.append("}");
207                }
208                System.out.println(queryStr.toString());
209
210                Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
211
212               
213                QueryExecution qexec = null;
214                try{
215                        long start = System.currentTimeMillis();
216                        qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(endpointURI,
217                                        query);
218                        long end = System.currentTimeMillis();
219                        System.out.println("EXEC TIME: " + (end-start));
220                }catch(Exception ex){
221                        ex.printStackTrace();
222                        throw ex;
223                }
224
225                ResultSet results = qexec.execSelect();
226                HashMap<String, SClass> classMap = new HashMap<String, SClass>();
227                for (; results.hasNext();) {
228                        QuerySolution sol = results.next();
229                        Resource res = sol.getResource("c");
230                        if (res != null) {
231                                String uri = res.getURI();
232                                int numOfInstances = 0;
233                                if (countInstances) {
234                                        numOfInstances = sol.getLiteral("numOfInstances").getInt();
235                                }
236                                // System.out.println(numOfInstances);
237                                Literal labelLiteral = sol.getLiteral("pLabel");
238                                SClass sClass = null;
239                                if (classMap.containsKey(uri)) {
240                                        sClass = classMap.get(uri);
241                                } else {
242                                        sClass = new SClass(uri, null, numOfInstances);
243                                        classMap.put(uri, sClass);
244                                }
245                                if (labelLiteral != null) {
246                                        String label = labelLiteral.getString();
247                                        String lang = labelLiteral.getLanguage();
248                                        sClass.addLabel(new Label(label, lang));
249                                }
250                        }
251                }
252                qexec.close();
253                return classMap.values().toArray(new SClass[0]);
254        }
255
256        public SClass[] listClasses(String[] graphURIs, boolean countInstances) throws Exception{
257                StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
258                queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
259                queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
260                queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
261                if (countInstances) {
262                        queryStr.append("SELECT DISTINCT ?cls ?pLabel (COUNT(?i) AS ?numOfInstances)\n");
263                } else {
264                        queryStr.append("SELECT DISTINCT ?cls ?pLabel \n");
265                }
266
267                if (graphURIs != null) {
268                        for (String graphURI : graphURIs) {
269                                queryStr.append("FROM <");
270                                queryStr.append(graphURI);
271                                queryStr.append(">\n");
272                        }
273                }
274                queryStr.append("WHERE{\n");
275                queryStr.append("\t{ ?cls rdf:type rdfs:Class. }\n");
276                queryStr.append("\tUNION\n");
277                queryStr.append("\t{ ?cls rdf:type owl:Class. }\n");
278                queryStr.append("\tUNION\n");
279                queryStr.append("\t{ [] rdfs:domain ?cls. }\n");
280                queryStr.append("\tUNION\n");
281                queryStr.append("\t{ [] rdfs:range ?cls. }\n");
282                queryStr.append("\tUNION\n");
283                queryStr.append("\t{ ?cls rdfs:subclassOf []. }\n");
284                queryStr.append("\t?cls rdfs:label ?pLabel.\n");
285                if (countInstances) {
286                        queryStr.append("\t?i rdf:type ?c.\n");
287                }
288                if (countInstances) {
289                        queryStr.append("}  GROUP BY ?c ?pLabel");
290                } else {
291                        queryStr.append("}");
292                }
293                System.out.println(queryStr.toString());
294
295                Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
296
297               
298                QueryExecution qexec = null;
299                try{
300                        long start = System.currentTimeMillis();
301                        qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(endpointURI,
302                                        query);
303                        long end = System.currentTimeMillis();
304                        System.out.println("EXEC TIME: " + (end-start));
305                }catch(Exception ex){
306                        ex.printStackTrace();
307                        throw ex;
308                }
309
310                ResultSet results = qexec.execSelect();
311                HashMap<String, SClass> classMap = new HashMap<String, SClass>();
312                for (; results.hasNext();) {
313                        QuerySolution sol = results.next();
314                        Resource res = sol.getResource("c");
315                        if (res != null) {
316                                String uri = res.getURI();
317                                int numOfInstances = 0;
318                                if (countInstances) {
319                                        numOfInstances = sol.getLiteral("numOfInstances").getInt();
320                                }
321                                // System.out.println(numOfInstances);
322                                Literal labelLiteral = sol.getLiteral("pLabel");
323                                SClass sClass = null;
324                                if (classMap.containsKey(uri)) {
325                                        sClass = classMap.get(uri);
326                                } else {
327                                        sClass = new SClass(uri, null, numOfInstances);
328                                        classMap.put(uri, sClass);
329                                }
330                                if (labelLiteral != null) {
331                                        String label = labelLiteral.getString();
332                                        String lang = labelLiteral.getLanguage();
333                                        sClass.addLabel(new Label(label, lang));
334                                }
335                        }
336                }
337                qexec.close();
338                return classMap.values().toArray(new SClass[0]);
339        }
340
341       
342       
343        /**
344         * 縲€繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ繧貞叙蠕励☆繧�
345         * <p>
346         * 謖�ｮ壹＆繧後◆graphURIs縺ｮ荳ｭ縺九ｉ縲√く繝ｼ繝ｯ繝ｼ繝峨↓繝偵ャ繝医☆繧九Λ繝吶Ν繧呈戟縺､繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ繧偵☆縺ｹ縺ｦ霑斐☆ <br>
347         * 縺薙％縺ｧ繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｨ縺ｯ縲〉df:type縺ｮ荳ｻ隱槭→縺励※險倩ｿｰ縺輔ｌ縺ｦ縺�ｋ繧ゅ�繧偵＞縺�<br>
348         * </p>
349         *
350         * @param graphURIs
351         *            縲€讀懃ｴ｢蟇ｾ雎｡縺ｮgraph縺ｮURI驟榊� (null繧�聞縺�縺ｮ驟榊�繧ょ庄)
352         * @param keyword
353         *            ��ull繧�ｩｺ譁�ｭ励�荳榊庄��
354         * @return 繧ｯ繝ｩ繧ｹURI縺ｮ驟榊�
355         * @throws Exception
356         * @since 28.01.2014
357         */
358        public Instance[] getInstances(String[] graphURIs, String keyword)
359                        throws Exception {
360                StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
361                queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
362                queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
363                queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
364                queryStr.append("SELECT DISTINCT ?ins ?c \n");
365                if (graphURIs != null) {
366                        for (String graphURI : graphURIs) {
367                                queryStr.append("FROM <");
368                                queryStr.append(graphURI);
369                                queryStr.append(">\n");
370                        }
371                }
372                queryStr.append("WHERE{\n");
373                // queryStr.append(" {?c rdf:type rdfs:Class} UNION {?c rdf:type owl:Class}\n");
374
375                queryStr.append("      ?ins rdf:type ?c.\n");
376                queryStr.append("      ?ins rdfs:label ");
377                queryStr.append(keyword);
378                queryStr.append(".\n");
379                queryStr.append(" FILTER (?c != rdf:Property)");
380                queryStr.append("}");
381
382                // System.out.println(queryStr.toString());
383
384                Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
385                QueryExecution qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(endpointURI,
386                                query);
387
388                ResultSet results = qexec.execSelect();
389                HashMap<String, HashSet<String>> instanceMap = new HashMap<String, HashSet<String>>();
390                for (; results.hasNext();) {
391                        QuerySolution sol = results.next();
392                        Resource cls = sol.getResource("c");
393                        Resource ins = sol.getResource("ins");
394                        String clsURI = cls.getURI();
395                        String insURI = ins.getURI();
396                        if (instanceMap.containsKey(insURI)) {
397                                HashSet<String> classes = instanceMap.get(insURI);
398                                classes.add(clsURI);
399                        } else {
400                                HashSet<String> classes = new HashSet<String>();
401                                instanceMap.put(insURI, classes);
402                                classes.add(clsURI);
403                        }
404                }
405                qexec.close();
406                Set<String> keySet = instanceMap.keySet();
407                ArrayList<Instance> instanceList = new ArrayList<Instance>();
408                for (String key : keySet) {
409                        Instance ins = new Instance(key, instanceMap.get(key).toArray(
410                                        new String[0]));
411                        instanceList.add(ins);
412                }
413                return instanceList.toArray(new Instance[0]);
414        }
415
416        /**
417         * 縲€謖�ｮ壹＆繧後◆繧ｯ繝ｩ繧ｹ繧定ｵｷ轤ｹ縺ｨ縺励€∵�遉ｺ逧�↓險倩ｿｰ縺輔ｌ縺ｦ縺�ｋOWL縺ｮproperty蛻ｶ邏�ｒ隱ｿ縺ｹ縲√◎縺ｮproperty蛻ｶ邏�〒
418         * 髢｢騾｣縺･縺代ｉ繧後※縺�ｋ繧ｯ繝ｩ繧ｹ繧堤ｶｲ鄒�噪縺ｫ蜿門ｾ励☆繧�
419         * <p>
420         * 蜃ｦ逅�ｯｾ雎｡繝��繧ｿ繧暖raphURIs縺ｧ謖�ｮ壹☆繧九％縺ｨ縺後〒縺阪ｋ <br>
421         * <br>
422         * </p>
423         *
424         * @param graphURIs
425         *            縲€讀懃ｴ｢蟇ｾ雎｡縺ｮgraph縺ｮURI驟榊� 縲€(null繧�聞縺�縺ｮ驟榊�繧ょ庄)
426         * @param originClass
427         *            襍ｷ轤ｹ縺ｨ縺ｪ繧九け繝ｩ繧ｹ縺ｮURI縲€��ull荳榊庄��
428         * @param limit
429         *            隗｣縺ｨ縺励※霑斐＆繧後ｋClassLink驟榊�縺ｮ髟ｷ縺輔�荳企剞蛟､繧呈欠螳壹☆繧九€�荳企剞蛟､繧定ｨｭ螳壹＠縺ｪ縺�ｴ蜷医�0莉･荳九�蛟､繧呈欠螳壹☆繧�
430         * @return ClassLink縺ｮ驟榊�縲ゅ％縺薙↓縺ｯ縲∝叙蠕励＆繧後◆繧ｯ繝ｩ繧ｹ縺ｨ髢｢菫ゅ▼縺代ｉ繧後※縺�ｋ繝励Ο繝代ユ繧｣縲�未菫ゅ�蜷代″縺悟性縺ｾ繧後ｋ縲�
431         * @throws Exception
432         * @since 28.01.2014
433         */
434        public ClassLink[] getNextClass(String[] graphURIs, String originClass,
435                        int limit, boolean countLinks) throws Exception {
436                ClassLink[] cLinks = getNextClassSub(graphURIs, originClass, limit, false);
437                if( countLinks ){
438                        cLinks = countLinks(graphURIs, originClass, cLinks);
439                }
440                return cLinks;
441        }
442
443        private ClassLink[] getNextClassSub(String[] graphURIs, String originClass,
444                        int limit, boolean countLinks) throws Exception {
445                                StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
446                queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
447                queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
448                queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
449
450                // SELECT
451                if (countLinks) {
452                        queryStr.append("SELECT DISTINCT ?p ?pDirection ?c (COUNT(?oci) AS ?numOfOriginalClassInstances) (COUNT(?lci) AS ?numOfLinkedClassInstances) (COUNT(?s) AS ?numOfLinks) (COUNT(DISTINCT(?s)) AS ?numOfLinkedInstances) \n");
453                } else {
454                        queryStr.append("SELECT DISTINCT ?p ?pDirection ?c \n");
455                }
456
457                if (graphURIs != null) {
458                        for (String graphURI : graphURIs) {
459                                queryStr.append("FROM <");
460                                queryStr.append(graphURI);
461                                queryStr.append(">\n");
462                        }
463                }
464                queryStr.append("WHERE{\n");
465                // queryStr.append("  { ?c rdf:type rdfs:Class. }\n  UNION\n  { ?c rdf:type owl:Class. }\n");
466                queryStr.append("  { ?p rdfs:domain <");
467                queryStr.append(originClass);
468                queryStr.append(">.\n    ?p rdfs:range ?c.\n");
469
470                if (countLinks) {
471                        queryStr.append("    ?o ?p ?s.");
472                } else {
473                        queryStr.append("filter(exists{\n");
474                        queryStr.append("  ?o rdf:type ?c.\n");
475                        queryStr.append(" ?s rdf:type <");
476                        queryStr.append(originClass);
477                        queryStr.append(">.\n");
478                        queryStr.append("       ?s ?p ?o.})\n");
479                }
480
481                queryStr.append("}\n  UNION\n");
482                queryStr.append("  { ?p rdfs:range <");
483                queryStr.append(originClass);
484                queryStr.append(">.\n");
485                queryStr.append("    ?p rdfs:domain ?c.\n");
486
487                if (countLinks) {
488                        queryStr.append("    ?s ?p ?o.");
489                } else {
490                        queryStr.append("filter(exists{\n");
491                        queryStr.append("  ?s rdf:type ?c.\n");
492                        queryStr.append(" ?o rdf:type <");
493                        queryStr.append(originClass);
494                        queryStr.append(">.\n");
495                        queryStr.append("       ?s ?p ?o.})\n");
496                }
497
498                queryStr.append("}\n");
499
500                queryStr.append("    ?p ?pDirection ?c.\n");
501
502//              queryStr.append("  ?s rdf:type ?c.\n");
503
504                if (countLinks) {
505                        queryStr.append("}\nGROUP BY ?p ?pDirection ?c\n");
506                } else {
507                        queryStr.append("}\n");
508                }
509                if (limit > 0) {
510                        queryStr.append("limit ");
511                        queryStr.append(limit);
512                        queryStr.append("\n");
513                }
514
515                System.out.println("getNextClasses SPARQL Query: ");
516                System.out.println(queryStr.toString());
517
518                Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
519                QueryExecution qexec = null;
520                try{
521                        qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(endpointURI,
522                                query);
523                }catch(Exception ex){
524                        ex.printStackTrace();
525                        throw ex;
526                }
527                       
528                ResultSet results = null;
529                try{
530                        long start = System.currentTimeMillis();
531                        results = qexec.execSelect();
532                        long end = System.currentTimeMillis();
533                        System.out.println("EXEC TIME: " + (end-start));
534                }catch(Exception ex){
535                        ex.printStackTrace();
536                        throw ex;
537                }
538                       
539                ArrayList<ClassLink> solCLs = new ArrayList<ClassLink>();
540                for (; results.hasNext();) {
541                        QuerySolution sol = results.next();
542                        Resource pro = sol.getResource("p");
543                        if (pro != null) {
544                                Resource cls = sol.getResource("c");
545                                Resource dir = sol.getResource("pDirection");
546                                String proURI = pro.getURI();
547                                String clsURI = cls.getURI();
548                                String dirURI = dir.getURI();
549
550                                // System.out.println(pro.getURI() + " " + cls.getURI() + " " +
551                                // dir.getURI());
552
553                                Direction direction = null;
554                                if (dirURI
555                                                .equals("http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#domain")
556                                                || dirURI.equals("rdfs:domain")) {
557                                        direction = Direction.reverse;
558                                }
559                                if (dirURI.equals("http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#range")
560                                                || dirURI.equals("rdfs:range")) {
561                                        if (direction != null) {
562                                                direction = Direction.both;
563                                        } else {
564                                                direction = Direction.forward;
565                                        }
566                                }
567                                // System.out.println(direction);
568                                int numOfLinks = 0;
569                                if (countLinks) {
570                                        numOfLinks = sol.getLiteral("numOfLinks").getInt();
571                                }
572                                ClassLink cl = new ClassLink(proURI, clsURI, direction,
573                                                numOfLinks, 0, 0, 0, 0 );
574                                solCLs.add(cl);
575                        }
576                }
577                qexec.close();
578                return solCLs.toArray(new ClassLink[0]);
579        }
580
581        /**
582         * 縲€謖�ｮ壹＆繧後◆繧ｯ繝ｩ繧ｹ繧定ｵｷ轤ｹ縺ｨ縺励€√◎縺ｮ繧ｯ繝ｩ繧ｹ縺ｫ螻槭＠縺ｦ縺�ｋ繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｨ繝ｪ繝ｳ繧ｯ縺悟ｼｵ繧峨ｌ縺ｦ縺�ｋ繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｮ髮�粋繧貞叙蠕励＠縲�
583         * 蜿門ｾ励＠縺溘う繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｮ繧ｯ繝ｩ繧ｹ繧堤ｶｲ鄒�噪縺ｫ蜿門ｾ励☆繧�
584         * <p>
585         * 縺薙％縺ｧ繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｨ縺ｯ縲〉df:type縺ｮ荳ｻ隱槭→縺励※險倩ｿｰ縺輔ｌ縺ｦ縺�ｋ繧ゅ�繧偵＞縺�<br>
586         * 蜃ｦ逅�ｯｾ雎｡繝��繧ｿ繧暖raphURIs縺ｧ謖�ｮ壹☆繧九％縺ｨ縺後〒縺阪ｋ <br>
587         * </p>
588         *
589         * @param graphURIs
590         *            縲€讀懃ｴ｢蟇ｾ雎｡縺ｮgraph縺ｮURI驟榊� 縲€(null繧�聞縺�縺ｮ驟榊�繧ょ庄)
591         * @param originClass
592         *            襍ｷ轤ｹ縺ｨ縺ｪ繧九け繝ｩ繧ｹ縺ｮURI縲€��ull荳榊庄��
593         * @param limit
594         *            隗｣縺ｨ縺励※霑斐＆繧後ｋClassLink驟榊�縺ｮ髟ｷ縺輔�荳企剞蛟､繧呈欠螳壹☆繧九€�荳企剞蛟､繧定ｨｭ螳壹＠縺ｪ縺�ｴ蜷医�0莉･荳九�蛟､繧呈欠螳壹☆繧�
595         * @return ClassLink縺ｮ驟榊�縲ゅ％縺薙↓縺ｯ縲∝叙蠕励＆繧後◆繧ｯ繝ｩ繧ｹ縺ｨ髢｢菫ゅ▼縺代ｉ繧後※縺�ｋ繝励Ο繝代ユ繧｣縲�未菫ゅ�蜷代″縺悟性縺ｾ繧後ｋ縲�
596         * @throws Exception
597         * @since 28.01.2014
598         */
599        public ClassLink[] getNextClassViaInstanceLink(String[] graphURIs,
600                        String originClass, int limit) throws Exception {
601                StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
602                queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
603                queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
604                queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
605                queryStr.append("SELECT DISTINCT ?pf ?pr (COUNT(?pf) AS ?numOfForwardLinks) (COUNT(?pr) AS ?numOfReverseLinks) (COUNT(DISTINCT(?insOrg)) AS ?numOfOriginInstances) (COUNT(DISTINCT(?ins)) AS ?numOfLinkedInstances)  ?c \n");
606                if (graphURIs != null) {
607                        for (String graphURI : graphURIs) {
608                                queryStr.append("FROM <");
609                                queryStr.append(graphURI);
610                                queryStr.append(">\n");
611                        }
612                }
613                queryStr.append("WHERE{\n");
614                queryStr.append("  ?ins rdf:type ?c.\n");
615                queryStr.append("  ?insOrg rdf:type <");
616                queryStr.append(originClass);
617                queryStr.append(">.\n");
618                queryStr.append("  { ?ins ?pr ?insOrg. }\n  UNION { ?insOrg ?pf ?ins. }\n");
619                queryStr.append("}\n");
620                queryStr.append("GROUP BY ?pf ?pr ?c\n");
621                if (limit > 0) {
622                        queryStr.append("limit ");
623                        queryStr.append(limit);
624                        queryStr.append("\n");
625                }
626
627System.out.println(queryStr.toString());
628
629                Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
630                QueryExecution qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(endpointURI,
631                                query);
632
633                ResultSet results = null;
634                try{
635                        long start = System.currentTimeMillis();
636                        results = qexec.execSelect();
637                        long end = System.currentTimeMillis();
638                        System.out.println("EXEC TIME: " + (end-start));
639                }catch(Exception ex){
640                        ex.printStackTrace();
641                        throw ex;
642                }
643
644                ArrayList<ClassLink> solCLs = new ArrayList<ClassLink>();
645                for (; results.hasNext();) {
646                        QuerySolution sol = results.next();
647                        Resource proForward = sol.getResource("pf");
648                        Resource proReverse = sol.getResource("pr");
649                        Resource cls = sol.getResource("c");
650                        Direction direction = null;
651                        String propURI = null;
652                        int numOfLinks = 0;
653                        int numOfLinkedInstances = 0;
654                        int numOfOriginInstances = 0;
655                        if (proForward != null) {
656                                if (proReverse != null) {
657                                        numOfLinks = sol.getLiteral("numOfForwardLinks").getInt();
658                                        numOfLinks += sol.getLiteral("numOfReverseLinks").getInt();
659                                        numOfLinkedInstances = sol.getLiteral("numOfLinkedInstances").getInt();
660                                        numOfOriginInstances = sol.getLiteral("numOfOriginInstances").getInt();
661                                        direction = Direction.both;
662                                } else {
663                                        numOfLinkedInstances = sol.getLiteral("numOfLinkedInstances").getInt();
664                                        numOfOriginInstances = sol.getLiteral("numOfOriginInstances").getInt();
665                                        numOfLinks = sol.getLiteral("numOfForwardLinks").getInt();
666                                        direction = Direction.forward;
667                                }
668                                propURI = proForward.getURI();
669                        } else {
670                                direction = Direction.reverse;
671                                propURI = proReverse.getURI();
672                                numOfLinkedInstances = sol.getLiteral("numOfOriginInstances").getInt();
673                                numOfOriginInstances = sol.getLiteral("numOfLinkedInstances").getInt();
674                                numOfLinks = sol.getLiteral("numOfReverseLinks").getInt();
675                        }
676                        String clsURI = cls.getURI();
677                        // System.out.println(propURI + " " + clsURI + " " + direction);
678
679                        ClassLink cl = new ClassLink(propURI, clsURI, direction, numOfLinks, numOfOriginInstances, numOfLinkedInstances, 0, 0);
680                        solCLs.add(cl);
681                }
682                qexec.close();
683                return solCLs.toArray(new ClassLink[0]);
684        }
685
686        public Path[] getPaths(String startClass, String endClass, int mode,
687                        boolean countLinks) throws Exception {
688                OWLClassGraph graph = new OWLClassGraph(startClass, endClass);
689                return graph.getPaths(this, mode, countLinks);
690        }
691
692        public String createSPARQL(Path path) throws Exception {
693                return null;
694        }
695
696        /*
697         * private String executeSelect(String sparqlQuery) throws Exception {
698         * HttpClient client = HttpClientBuilder.create().build(); HttpPost httppost
699         * = new HttpPost(endpointURI); httppost.setHeader("Content-Type",
700         * "application/x-www-form-urlencoded"); httppost.setHeader("Accept",
701         * "application/sparql-results+xml"); List<NameValuePair> nvpList = new
702         * ArrayList<NameValuePair>(); nvpList.add(new BasicNameValuePair("query",
703         * sparqlQuery)); // nvpList.add(new BasicNameValuePair("format", //
704         * outputFormat.getMime())); httppost.setEntity(new
705         * UrlEncodedFormEntity(nvpList, Charset .forName("UTF-8"))); HttpResponse
706         * response = client.execute(httppost); //
707         * System.out.println("[StatusLine] " + response.getStatusLine());
708         * HttpEntity entity = response.getEntity(); String entityString =
709         * EntityUtils.toString(entity, "UTF-8"); return entityString; }
710         */
711
712        /**
713         * 縲€謖�ｮ壹＆繧後◆繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ繧定ｵｷ轤ｹ縺ｨ縺励€√◎縺ｮ繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｫ繝ｪ繝ｳ繧ｯ縺悟ｼｵ繧峨ｌ縺ｦ縺�ｋ繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｮ髮�粋繧貞叙蠕励☆繧九€�
714         * 縲€蜿門ｾ励＆繧後◆蜷�う繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｮ繧ｯ繝ｩ繧ｹ繧らｶｲ鄒�噪縺ｫ蜿門ｾ励☆繧�
715         * <p>
716         * 縺薙％縺ｧ繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｨ縺ｯ縲〉df:type縺ｮ荳ｻ隱槭→縺励※險倩ｿｰ縺輔ｌ縺ｦ縺�ｋ繧ゅ�繧偵＞縺�<br>
717         * 蜃ｦ逅�ｯｾ雎｡繝��繧ｿ繧暖raphURIs縺ｧ謖�ｮ壹☆繧九％縺ｨ縺後〒縺阪ｋ <br>
718         * </p>
719         *
720         * @param graphURIs
721         *            縲€讀懃ｴ｢蟇ｾ雎｡縺ｮgraph縺ｮURI驟榊� 縲€(null繧�聞縺�縺ｮ驟榊�繧ょ庄)
722         * @param originInstance
723         *            襍ｷ轤ｹ縺ｨ縺ｪ繧九う繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｮURI縲€��ull荳榊庄��
724         * @param limit
725         *            隗｣縺ｨ縺励※霑斐＆繧後ｋInstanceLink驟榊�縺ｮ髟ｷ縺輔�荳企剞蛟､繧呈欠螳壹☆繧九€�荳企剞蛟､繧定ｨｭ螳壹＠縺ｪ縺�ｴ蜷医�0莉･荳九�蛟､繧呈欠螳壹☆繧�
726         * @return InstanceLink縺ｮ驟榊�縲ゅ％縺薙↓縺ｯ縲∝叙蠕励＆繧後◆繧ｯ繝ｩ繧ｹ縺ｨ髢｢菫ゅ▼縺代ｉ繧後※縺�ｋ繝励Ο繝代ユ繧｣縲�未菫ゅ�蜷代″縺悟性縺ｾ繧後ｋ縲�
727         * @throws Exception
728         * @since 28.01.2014
729         */
730        public InstanceLink[] getNextInstancesViaInstanceLink(String[] graphURIs,
731                        String originInstance, int limit) throws Exception {
732                StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
733                queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
734                queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
735                queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
736                queryStr.append("SELECT DISTINCT ?pf ?pr ?ins ?c \n");
737                if (graphURIs != null) {
738                        for (String graphURI : graphURIs) {
739                                queryStr.append("FROM <");
740                                queryStr.append(graphURI);
741                                queryStr.append(">\n");
742                        }
743                }
744                queryStr.append("WHERE{\n");
745                // queryStr.append("  { ?c rdf:type rdfs:Class. }\n  UNION\n  { ?c rdf:type owl:Class. }\n");
746                queryStr.append("  ?ins rdf:type ?c.\n");
747                queryStr.append("  { ?ins ?pr <");
748                queryStr.append(originInstance);
749                queryStr.append(">. }\n  UNION { <");
750                queryStr.append(originInstance);
751                queryStr.append("> ?pf ?ins. }\n");
752
753                queryStr.append(" FILTER (?c != rdf:Property)");
754
755                queryStr.append("}\n");
756                if (limit > 0) {
757                        queryStr.append("limit ");
758                        queryStr.append(limit);
759                        queryStr.append("\n");
760                }
761
762                // System.out.println(queryStr.toString());
763
764                Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
765                QueryExecution qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(endpointURI,
766                                query);
767
768                ResultSet results = qexec.execSelect();
769                HashMap<String, InstanceLink> insLinkMap = new HashMap<String, InstanceLink>();
770                for (; results.hasNext();) {
771                        QuerySolution sol = results.next();
772                        Resource proForward = sol.getResource("pf");
773                        Resource proReverse = sol.getResource("pr");
774                        Resource ins = sol.getResource("ins");
775                        Resource cls = sol.getResource("c");
776                        Direction direction = null;
777                        String propURI = null;
778                        if (proForward != null) {
779                                if (proReverse != null) {
780                                        direction = Direction.both;
781                                } else {
782                                        direction = Direction.forward;
783                                }
784                                propURI = proForward.getURI();
785                        } else {
786                                direction = Direction.reverse;
787                                propURI = proReverse.getURI();
788                        }
789                        String clsURI = cls.getURI();
790                        String insURI = ins.getURI();
791                        String key = propURI + "\t" + insURI + "\t" + direction;
792                        if (insLinkMap.containsKey(key)) {
793                                InstanceLink insLink = insLinkMap.get(key);
794                                insLink.addLinkedClassURI(clsURI);
795                        } else {
796                                InstanceLink insLink = new InstanceLink(propURI, insURI,
797                                                new String[] { clsURI }, direction);
798                                insLinkMap.put(key, insLink);
799                        }
800                }
801                qexec.close();
802                Collection<InstanceLink> values = insLinkMap.values();
803                return values.toArray(new InstanceLink[0]);
804        }
805
806        public LabelMap[] getLabels(String[] graphURIs, String[] resourceURIs,
807                        String language) throws Exception {
808                if (resourceURIs == null || resourceURIs.length == 0) {
809                        return new LabelMap[0];
810                }
811                StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
812                queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
813                queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
814                queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
815                queryStr.append("SELECT DISTINCT ?res ?label \n");
816                if (graphURIs != null) {
817                        for (String graphURI : graphURIs) {
818                                queryStr.append("FROM <");
819                                queryStr.append(graphURI);
820                                queryStr.append(">\n");
821                        }
822                }
823                queryStr.append("WHERE{\n");
824                queryStr.append("  ?res rdfs:label ?label.\n");
825                queryStr.append("  FILTER(?res IN (");
826                boolean f = false;
827                for (String resourceURI : resourceURIs) {
828                        if (f) {
829                                queryStr.append(", ");
830                        }
831                        f = true;
832                        queryStr.append("<");
833                        queryStr.append(resourceURI);
834                        queryStr.append(">");
835                }
836                queryStr.append("))\n");
837                queryStr.append("}");
838
839                System.out.println(queryStr.toString());
840
841                Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
842                QueryExecution qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(endpointURI,
843                                query);
844
845                ResultSet results = qexec.execSelect();
846                HashMap<String, LabelMap> lMap = new HashMap<String, LabelMap>();
847                for (; results.hasNext();) {
848                        QuerySolution sol = results.next();
849                        String uri = sol.getResource("res").getURI();
850                        Literal literal = sol.getLiteral("label");
851                        if (literal != null) {
852                                String label = literal.getString();
853                                String lang = literal.getLanguage();
854                                if (language != null && language.equals(lang)) {
855                                        Label lbl = new Label(label, lang);
856                                        if (lMap.containsKey(uri)) {
857                                                LabelMap lm = lMap.get(uri);
858                                                lm.addLabel(lbl);
859                                        } else {
860                                                LabelMap lm = new LabelMap(uri, new Label[] { lbl });
861                                                lMap.put(uri, lm);
862                                        }
863                                }
864                        }
865                }
866                return lMap.values().toArray(new LabelMap[0]);
867        }
868
869        public ClassLink[] countLinks(String[] graphURIs, String startClassURI,
870                        ClassLink[] classLinks) throws Exception {
871                if (classLinks == null || classLinks.length == 0) {
872                        return new ClassLink[0];
873                }
874                for (ClassLink classLink : classLinks) {
875                        StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
876                        queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
877                        queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
878                        queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
879
880                        queryStr.append("SELECT (COUNT(?os) AS ?numOfLinks) (COUNT(DISTINCT(?is)) AS ?numOfOriginInstances) (COUNT(DISTINCT(?os)) AS ?numOfLinkedInstances) \n");
881                        if (graphURIs != null) {
882                                for (String graphURI : graphURIs) {
883                                        queryStr.append("FROM <");
884                                        queryStr.append(graphURI);
885                                        queryStr.append(">\n");
886                                }
887                        }
888
889                        queryStr.append("WHERE{\n");
890                        if (classLink.getDirection() == Direction.forward) {
891                                queryStr.append("?is rdf:type  <");
892                                queryStr.append(startClassURI);
893                                queryStr.append(">.\n");
894                                queryStr.append("?os rdf:type  <");
895                                queryStr.append(classLink.getLinkedClassURI());
896                                queryStr.append(">.\n");
897                                queryStr.append("?is <");
898                                queryStr.append(classLink.getPropertyURI());
899                                queryStr.append("> ?os.\n");
900                                queryStr.append("}");
901                        } else {
902                                if (classLink.getDirection() == Direction.forward) {
903                                        queryStr.append("?os rdf:type  <");
904                                        queryStr.append(startClassURI);
905                                        queryStr.append(">.\n");
906                                        queryStr.append("?is rdf:type  <");
907                                        queryStr.append(classLink.getLinkedClassURI());
908                                        queryStr.append(">.\n");
909                                        queryStr.append("?is <");
910                                        queryStr.append(classLink.getPropertyURI());
911                                        queryStr.append("> ?os.\n");
912                                        queryStr.append("}");
913                                } else {
914                                        queryStr.append("?os rdf:type  <");
915                                        queryStr.append(startClassURI);
916                                        queryStr.append(">.\n");
917                                        queryStr.append("?is rdf:type  <");
918                                        queryStr.append(classLink.getLinkedClassURI());
919                                        queryStr.append(">.\n");
920                                        queryStr.append("{?is <");
921                                        queryStr.append(classLink.getPropertyURI());
922                                        queryStr.append("> ?os.}\n");
923                                        queryStr.append("UNION\n");
924                                        queryStr.append("{?os <");
925                                        queryStr.append(classLink.getPropertyURI());
926                                        queryStr.append("> ?is.}\n");
927                                        queryStr.append("}");
928                                }
929                        }
930                        System.out.println(queryStr.toString());
931
932                        Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
933                        QueryExecution qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(
934                                        endpointURI, query);
935
936                        ResultSet results = qexec.execSelect();
937                        if (results.hasNext()) {
938                                QuerySolution sol = results.next();
939                                Literal lit = sol.getLiteral("numOfLinks");
940                                if (lit != null) {
941                                        int numOfLinks = lit.getInt();
942                                        classLink.setNumOfLinks(numOfLinks);
943                                }
944                                lit = sol.getLiteral("numOfLinkedInstances");
945                                if (lit != null) {
946                                        int numOfLinkedInstances = lit.getInt();
947                                        classLink.setNumOfLinkedInstances(numOfLinkedInstances);
948                                }
949                                lit = sol.getLiteral("numOfOriginInstances");
950                                if (lit != null) {
951                                        int numOfOriginInstances = lit.getInt();
952                                        classLink.setNumOfOriginInstances(numOfOriginInstances);
953                                }
954                                lit = sol.getLiteral("numOfOriginClassInstances");
955                                if (lit != null) {
956                                        int numOfOriginClassInstances = lit.getInt();
957                                        classLink.setNumOfOriginClassInstances(numOfOriginClassInstances);
958                                }
959                                lit = sol.getLiteral("numOfLinkedClassInstances");
960                                if (lit != null) {
961                                        int numOfLinkedClassInstances = lit.getInt();
962                                        classLink.setNumOfLinkedClassInstances(numOfLinkedClassInstances);
963                                }
964                        }
965                        qexec.close();
966
967                        // count instances
968                        queryStr = new StringBuffer();
969                        queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
970                        queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
971                        queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
972
973                        queryStr.append("SELECT (COUNT(?ics) AS ?numOfOriginClassInstances) \n");
974                        if (graphURIs != null) {
975                                for (String graphURI : graphURIs) {
976                                        queryStr.append("FROM <");
977                                        queryStr.append(graphURI);
978                                        queryStr.append(">\n");
979                                }
980                        }
981
982                        queryStr.append("WHERE{\n");
983                        if (classLink.getDirection() == Direction.forward) {
984                                queryStr.append("?ics rdf:type  <");
985                                queryStr.append(startClassURI);
986                                queryStr.append(">.\n");
987                                queryStr.append("}");
988                        } else {
989                                if (classLink.getDirection() == Direction.forward) {
990                                        queryStr.append("?ics rdf:type  <");
991                                        queryStr.append(classLink.getLinkedClassURI());
992                                        queryStr.append(">.\n");
993                                        queryStr.append("}");
994                                } else {
995                                        queryStr.append("?ics rdf:type  <");
996                                        queryStr.append(classLink.getLinkedClassURI());
997                                        queryStr.append(">.\n");
998                                        queryStr.append("}");
999                                }
1000                        }
1001       
1002                        System.out.println(queryStr.toString());
1003
1004                        query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
1005                        qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(
1006                                        endpointURI, query);
1007
1008                        results = qexec.execSelect();
1009                        if (results.hasNext()) {
1010                                QuerySolution sol = results.next();
1011                                Literal lit = null;
1012                                lit = sol.getLiteral("numOfOriginClassInstances");
1013                                if (lit != null) {
1014                                        int numOfOriginClassInstances = lit.getInt();
1015                                        classLink.setNumOfOriginClassInstances(numOfOriginClassInstances);
1016                                }
1017                        }
1018                        qexec.close();
1019
1020                        // count instances
1021                        queryStr = new StringBuffer();
1022                        queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
1023                        queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
1024                        queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
1025
1026                        queryStr.append("SELECT (COUNT(?ocs) AS ?numOfLinkedClassInstances) \n");
1027                        if (graphURIs != null) {
1028                                for (String graphURI : graphURIs) {
1029                                        queryStr.append("FROM <");
1030                                        queryStr.append(graphURI);
1031                                        queryStr.append(">\n");
1032                                }
1033                        }
1034
1035                        queryStr.append("WHERE{\n");
1036                        if (classLink.getDirection() == Direction.forward) {
1037                                queryStr.append("?ocs rdf:type  <");
1038                                queryStr.append(classLink.getLinkedClassURI());
1039                                queryStr.append(">.\n");
1040                                queryStr.append("}");
1041                        } else {
1042                                if (classLink.getDirection() == Direction.forward) {
1043                                        queryStr.append("?ocs rdf:type  <");
1044                                        queryStr.append(startClassURI);
1045                                        queryStr.append(">.\n");
1046                                        queryStr.append("}");
1047                                } else {
1048                                        queryStr.append("?ocs rdf:type  <");
1049                                        queryStr.append(startClassURI);
1050                                        queryStr.append(">.\n");
1051                                        queryStr.append("}");
1052                                }
1053                        }
1054       
1055                        System.out.println(queryStr.toString());
1056
1057                        query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
1058                        qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(
1059                                        endpointURI, query);
1060
1061                        results = qexec.execSelect();
1062                        if (results.hasNext()) {
1063                                QuerySolution sol = results.next();
1064                                Literal lit = null;
1065                                lit = sol.getLiteral("numOfLinkedClassInstances");
1066                                if (lit != null) {
1067                                        int numOfLinkedClassInstances = lit.getInt();
1068                                        classLink.setNumOfLinkedClassInstances(numOfLinkedClassInstances);
1069                                }
1070                        }
1071                        qexec.close();
1072                       
1073                }
1074                return classLinks;
1075        }
1076
1077       
1078        public SClass[] countInstances(String[] graphURIs, SClass[] classes)
1079                        throws Exception {
1080                if (classes == null || classes.length == 0) {
1081                        return new SClass[0];
1082                }
1083                HashMap<String, SClass> classMap = new HashMap<String, SClass>();
1084                for (SClass sc : classes) {
1085                        classMap.put(sc.getClassURI(), sc);
1086                }
1087                StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
1088                queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
1089                queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
1090                queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
1091                queryStr.append("SELECT DISTINCT ?cls  (COUNT(?is) AS ?numOfInstances)\n");
1092                if (graphURIs != null) {
1093                        for (String graphURI : graphURIs) {
1094                                queryStr.append("FROM <");
1095                                queryStr.append(graphURI);
1096                                queryStr.append(">\n");
1097                        }
1098                }
1099                queryStr.append("WHERE{\n");
1100                queryStr.append("  ?is rdf:type ?cls.\n");
1101                queryStr.append("  FILTER(?cls IN (");
1102                boolean f = false;
1103                Set<String> clsSet = classMap.keySet();
1104                for (String clsURI : clsSet) {
1105                        if (f) {
1106                                queryStr.append(", ");
1107                        }
1108                        f = true;
1109                        queryStr.append("<");
1110                        queryStr.append(clsURI);
1111                        queryStr.append(">");
1112                }
1113                queryStr.append("))\n");
1114                queryStr.append("} GROUP BY ?cls");
1115
1116                System.out.println(queryStr.toString());
1117
1118                Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
1119                QueryExecution qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(endpointURI,
1120                                query);
1121
1122                ResultSet results = qexec.execSelect();
1123                for (; results.hasNext();) {
1124                        QuerySolution sol = results.next();
1125                        String uri = sol.getResource("cls").getURI();
1126                        SClass sc = classMap.get(uri);
1127                        Literal lit = sol.getLiteral("numOfInstances");
1128                        if (lit != null) {
1129                                int numOfInstances = lit.getInt();
1130                                sc.setNumOfInstances(numOfInstances);
1131                        }
1132                }
1133                qexec.close();
1134
1135                return classes;
1136        }
1137
1138}
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。