root/galaxy-central/database/compiled_templates/root/index.mako.py

リビジョン 3, 15.0 KB (コミッタ: kohda, 14 年 前)

Install Unix tools  http://hannonlab.cshl.edu/galaxy_unix_tools/galaxy.html
行番号 
1from mako import runtime, filters, cache
2UNDEFINED = runtime.UNDEFINED
3__M_dict_builtin = dict
4__M_locals_builtin = locals
5_magic_number = 5
6_modified_time = 1287725326.7005551
7_template_filename='templates/root/index.mako'
8_template_uri='root/index.mako'
9_template_cache=cache.Cache(__name__, _modified_time)
10_source_encoding=None
11_exports = ['init', 'left_panel', 'center_panel', 'late_javascripts', 'right_panel']
12
13
14def _mako_get_namespace(context, name):
15    try:
16        return context.namespaces[(__name__, name)]
17    except KeyError:
18        _mako_generate_namespaces(context)
19        return context.namespaces[(__name__, name)]
20def _mako_generate_namespaces(context):
21    pass
22def _mako_inherit(template, context):
23    _mako_generate_namespaces(context)
24    return runtime._inherit_from(context, u'/webapps/galaxy/base_panels.mako', _template_uri)
25def render_body(context,**pageargs):
26    context.caller_stack._push_frame()
27    try:
28        __M_locals = __M_dict_builtin(pageargs=pageargs)
29        __M_writer = context.writer()
30        # SOURCE LINE 1
31        __M_writer(u'\n\n')
32        # SOURCE LINE 156
33        __M_writer(u'\n\n')
34        # SOURCE LINE 176
35        __M_writer(u'\n\n')
36        # SOURCE LINE 190
37        __M_writer(u'\n\n')
38        # SOURCE LINE 212
39        __M_writer(u'\n\n')
40        # SOURCE LINE 226
41        __M_writer(u'\n')
42        return ''
43    finally:
44        context.caller_stack._pop_frame()
45
46
47def render_init(context):
48    context.caller_stack._push_frame()
49    try:
50        self = context.get('self', UNDEFINED)
51        trans = context.get('trans', UNDEFINED)
52        __M_writer = context.writer()
53        # SOURCE LINE 158
54        __M_writer(u'\n')
55        # SOURCE LINE 159
56
57        if trans.app.config.cloud_controller_instance:
58                self.has_left_panel=False
59                self.has_right_panel=False
60                self.active_view="cloud"
61        else:
62                self.has_left_panel=True
63                self.has_right_panel=True
64                self.active_view="analysis"
65       
66       
67        # SOURCE LINE 168
68        __M_writer(u'\n')
69        # SOURCE LINE 169
70        if trans.app.config.require_login and not trans.user:
71            # SOURCE LINE 170
72            __M_writer(u'    <script type="text/javascript">\n        if ( window != top ) {\n            top.location.href = location.href;\n        }\n    </script>\n')
73        return ''
74    finally:
75        context.caller_stack._pop_frame()
76
77
78def render_left_panel(context):
79    context.caller_stack._push_frame()
80    try:
81        h = context.get('h', UNDEFINED)
82        _ = context.get('_', UNDEFINED)
83        n_ = context.get('n_', UNDEFINED)
84        __M_writer = context.writer()
85        # SOURCE LINE 178
86        __M_writer(u'\n    <div class="unified-panel-header" unselectable="on">\n        <div class=\'unified-panel-header-inner\'>\n            <div style="float: right">\n                <a class=\'panel-header-button popup\' id="tools-options-button" href="#">')
87        # SOURCE LINE 182
88        __M_writer(unicode(_('Options')))
89        __M_writer(u'</a>\n            </div>\n            ')
90        # SOURCE LINE 184
91        __M_writer(unicode(n_('Tools')))
92        __M_writer(u'\n        </div>\n    </div>\n    <div class="unified-panel-body" style="overflow: hidden;">\n        <iframe name="galaxy_tools" id="galaxy_tools" src="')
93        # SOURCE LINE 188
94        __M_writer(unicode(h.url_for( controller='root', action='tool_menu' )))
95        __M_writer(u'" frameborder="0" style="position: absolute; margin: 0; border: 0 none; height: 100%; width: 100%;"> </iframe>\n    </div>\n')
96        return ''
97    finally:
98        context.caller_stack._pop_frame()
99
100
101def render_center_panel(context):
102    context.caller_stack._push_frame()
103    try:
104        tool_id = context.get('tool_id', UNDEFINED)
105        m_c = context.get('m_c', UNDEFINED)
106        h = context.get('h', UNDEFINED)
107        m_a = context.get('m_a', UNDEFINED)
108        workflow_id = context.get('workflow_id', UNDEFINED)
109        trans = context.get('trans', UNDEFINED)
110        __M_writer = context.writer()
111        # SOURCE LINE 192
112        __M_writer(u'\n\n')
113        # SOURCE LINE 195
114        __M_writer(u'    ')
115
116        if trans.app.config.require_login and not trans.user:
117            center_url = h.url_for( controller='user', action='login' )
118        elif tool_id is not None:
119            center_url = h.url_for( 'tool_runner', tool_id=tool_id, from_noframe=True )
120        elif workflow_id is not None:
121            center_url = h.url_for( controller='workflow', action='run', id=workflow_id )
122        elif m_c is not None:
123            center_url = h.url_for( controller=m_c, action=m_a )
124        elif trans.app.config.cloud_controller_instance:
125            center_url = h.url_for( controller='cloud', action='list' )
126        else:
127            center_url = h.url_for( '/static/welcome.html' )
128       
129       
130        # SOURCE LINE 208
131        __M_writer(u'\n    \n    <iframe name="galaxy_main" id="galaxy_main" frameborder="0" style="position: absolute; width: 100%; height: 100%;" src="')
132        # SOURCE LINE 210
133        __M_writer(unicode(center_url))
134        __M_writer(u'"> </iframe>\n\n')
135        return ''
136    finally:
137        context.caller_stack._pop_frame()
138
139
140def render_late_javascripts(context):
141    context.caller_stack._push_frame()
142    try:
143        h = context.get('h', UNDEFINED)
144        trans = context.get('trans', UNDEFINED)
145        parent = context.get('parent', UNDEFINED)
146        __M_writer = context.writer()
147        # SOURCE LINE 3
148        __M_writer(u'\n    ')
149        # SOURCE LINE 4
150        __M_writer(unicode(parent.late_javascripts()))
151        __M_writer(u'\n    <script type="text/javascript">\n    // Set up GalaxyAsync object.\n    var galaxy_async = new GalaxyAsync();\n    galaxy_async.set_func_url(galaxy_async.set_user_pref, "')
152        # SOURCE LINE 8
153        __M_writer(unicode(h.url_for( controller='user', action='set_user_pref_async' )))
154        __M_writer(u'");\n    \n    $(function(){\n        // Init history options.\n        $("#history-options-button").css( "position", "relative" );\n        make_popupmenu( $("#history-options-button"), {\n            "History Lists": null,\n            "Saved Histories": function() {\n                galaxy_main.location = "')
155        # SOURCE LINE 16
156        __M_writer(unicode(h.url_for( controller='history', action='list')))
157        __M_writer(u'";\n            },\n            "Histories Shared with Me": function() {\n                galaxy_main.location = "')
158        # SOURCE LINE 19
159        __M_writer(unicode(h.url_for( controller='history', action='list_shared')))
160        __M_writer(u'";\n            },\n            "Current History": null,\n            "Create New": function() {\n                galaxy_history.location = "')
161        # SOURCE LINE 23
162        __M_writer(unicode(h.url_for( controller='root', action='history_new' )))
163        __M_writer(u'";\n            },\n            "Clone": function() {\n                galaxy_main.location = "')
164        # SOURCE LINE 26
165        __M_writer(unicode(h.url_for( controller='history', action='clone')))
166        __M_writer(u'";\n            },\n            "Share or Publish": function() {\n                galaxy_main.location = "')
167        # SOURCE LINE 29
168        __M_writer(unicode(h.url_for( controller='history', action='sharing' )))
169        __M_writer(u'";\n            },\n            "Extract Workflow": function() {\n                galaxy_main.location = "')
170        # SOURCE LINE 32
171        __M_writer(unicode(h.url_for( controller='workflow', action='build_from_current_history' )))
172        __M_writer(u'";\n            },\n            "Dataset Security": function() {\n                galaxy_main.location = "')
173        # SOURCE LINE 35
174        __M_writer(unicode(h.url_for( controller='root', action='history_set_default_permissions' )))
175        __M_writer(u'";\n            },\n            "Show Deleted Datasets": function() {\n                galaxy_history.location = "')
176        # SOURCE LINE 38
177        __M_writer(unicode(h.url_for( controller='root', action='history', show_deleted=True)))
178        __M_writer(u'";\n            },\n            "Show Hidden Datasets": function() {\n                galaxy_history.location = "')
179        # SOURCE LINE 41
180        __M_writer(unicode(h.url_for( controller='root', action='history', show_hidden=True)))
181        __M_writer(u'";\n            },\n            "Show structure": function() {\n                galaxy_main.location = "')
182        # SOURCE LINE 44
183        __M_writer(unicode(h.url_for( controller='history', action='display_structured' )))
184        __M_writer(u'";\n            },\n            "Export to File": function() {\n                galaxy_main.location = "')
185        # SOURCE LINE 47
186        __M_writer(unicode(h.url_for( controller='history', action='export_archive' )))
187        __M_writer(u'";\n            },\n            "Delete": function()\n            {\n                if ( confirm( "Really delete the current history?" ) )\n                {\n                    galaxy_main.location = "')
188        # SOURCE LINE 53
189        __M_writer(unicode(h.url_for( controller='history', action='delete_current' )))
190        __M_writer(u'";\n                }\n            },\n')
191        # SOURCE LINE 60
192        __M_writer(u'        });\n        \n        // Init tool options.\n        make_popupmenu( $("#tools-options-button"), {\n')
193        # SOURCE LINE 65
194        if trans.app.toolbox_search.enabled:
195            # SOURCE LINE 66
196            __M_writer(u'                ')
197 
198            show_tool_search = False
199            if trans.user:
200                show_tool_search = trans.user.preferences.get( "show_tool_search", "False" )
201               
202            if show_tool_search == "True":
203                initial_text = "Hide Search"
204            else:
205                initial_text = "Search Tools"
206                           
207           
208            # SOURCE LINE 75
209            __M_writer(u'\n                "')
210            # SOURCE LINE 76
211            __M_writer(unicode(initial_text))
212            __M_writer(u'": function() {\n                    // Show/hide menu and update vars, user preferences.\n                    var menu = $("#galaxy_tools").contents().find(\'#tool-search\');\n                    if (menu.is(":visible"))\n                    {\n                        // Hide menu.\n                        pref_value = "False";\n                        menu_option_text = "Search Tools";\n                        menu.toggle();\n                        \n                        // Reset search.\n                        reset_tool_search(true);\n                    }\n                    else\n                    {\n                        // Show menu.\n                        pref_value = "True";\n                        menu_option_text = "Hide Search";\n                        menu.toggle();\n                    }\n            \n                    // Update menu option.\n                    $("#tools-options-button-menu").find("li").eq(0).text(menu_option_text);\n            \n                    galaxy_async.set_user_pref("show_tool_search", pref_value);\n                },\n')
213        # SOURCE LINE 104
214        if trans.user:
215            # SOURCE LINE 105
216            __M_writer(u'                ')
217
218            if trans.user.preferences.get( 'show_recently_used_menu', 'False' ) == 'True':
219                action = "Hide"
220            else:
221                action = "Show"
222                           
223           
224            # SOURCE LINE 110
225            __M_writer(u'\n                "')
226            # SOURCE LINE 111
227            __M_writer(unicode(action))
228            __M_writer(u' Recently Used": function() {\n                    // Show/hide menu.\n                    var ru_menu = $(\'#galaxy_tools\').contents().find(\'#recently_used_wrapper\');\n                    var ru_menu_body = ru_menu.find(".toolSectionBody");\n                    var pref_value = null;\n                    var menu_option_text = null;\n                    if (ru_menu.hasClass("user_pref_visible"))\n                    {\n                        // Hide menu.\n                        ru_menu_body.slideUp();\n                        ru_menu.slideUp();\n                        \n                        // Set vars used below and in tool menu frame.\n                        pref_value = "False";\n                        menu_option_text = "Show Recently Used";\n                    }\n                    else\n                    {\n                        // "Show" menu.\n                        if (!$(\'#galaxy_tools\').contents().find(\'#tool-search-query\').hasClass("search_active"))\n                            // Default.\n                            ru_menu.slideDown();\n                        else\n                            // Search active: tf there are matching tools in RU menu, show menu.\n                            if ( ru_menu.find(".toolTitle.search_match").length != 0 )\n                            {\n                                ru_menu.slideDown();\n                                ru_menu_body.slideDown();\n                            }\n                        \n                        // Set vars used below and in tool menu frame.\n                        pref_value = "True";\n                        menu_option_text = "Hide Recently Used";\n                    }\n                 \n                    // Update menu class and option.\n                    ru_menu.toggleClass("user_pref_hidden user_pref_visible");\n                    $("#tools-options-button-menu").find("li").eq(1).text(menu_option_text);\n\n                    galaxy_async.set_user_pref("show_recently_used_menu", pref_value);\n                }\n')
229        # SOURCE LINE 153
230        __M_writer(u'        });\n    });\n    </script>\n')
231        return ''
232    finally:
233        context.caller_stack._pop_frame()
234
235
236def render_right_panel(context):
237    context.caller_stack._push_frame()
238    try:
239        h = context.get('h', UNDEFINED)
240        _ = context.get('_', UNDEFINED)
241        __M_writer = context.writer()
242        # SOURCE LINE 214
243        __M_writer(u'\n    <div class="unified-panel-header" unselectable="on">\n        <div class="unified-panel-header-inner">\n            <div style="float: right">\n                <a id="history-options-button" class=\'panel-header-button popup\' href="')
244        # SOURCE LINE 218
245        __M_writer(unicode(h.url_for( controller='root', action='history_options' )))
246        __M_writer(u'" target="galaxy_main">')
247        __M_writer(unicode(_('Options')))
248        __M_writer(u'</a>\n            </div>\n            <div class="panel-header-text">')
249        # SOURCE LINE 220
250        __M_writer(unicode(_('History')))
251        __M_writer(u'</div>\n        </div>\n    </div>\n    <div class="unified-panel-body" style="overflow: hidden;">\n        <iframe name="galaxy_history" width="100%" height="100%" frameborder="0" style="position: absolute; margin: 0; border: 0 none; height: 100%;" src="')
252        # SOURCE LINE 224
253        __M_writer(unicode(h.url_for( controller='root', action='history' )))
254        __M_writer(u'"></iframe>\n    </div>\n')
255        return ''
256    finally:
257        context.caller_stack._pop_frame()
258
259
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。