root/galaxy-central/eggs/bx_python-0.5.0_dev_f74aec067563-py2.6-macosx-10.6-universal-ucs2.egg/EGG-INFO/scripts/nib_length.py

リビジョン 3, 203 bytes (コミッタ: kohda, 14 年 前)

Install Unix tools  http://hannonlab.cshl.edu/galaxy_unix_tools/galaxy.html

行番号 
1#!/usr/bin/python2.6
2
3"""
4Print the number of bases in a nib file.
5
6usage: %prog nib_file
7"""
8
9from bx.seq import nib as seq_nib
10import sys
11
12nib = seq_nib.NibFile( file( sys.argv[1] ) )
13print nib.length
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。