root/galaxy-central/lib/galaxy/datatypes/converters/fasta_to_bowtie_base_index_converter.xml @ 2

リビジョン 2, 0.7 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central

行番号 
1<tool id="CONVERTER_fasta_to_bowtie_base_index" name="Convert FASTA to Bowtie base space Index" version="1.0.0">
2  <requirements><requirement type='package'>bowtie</requirement></requirements>
3  <!-- <description>__NOT_USED_CURRENTLY_FOR_CONVERTERS__</description> -->
4  <!-- Used on the metadata edit page. -->
5  <command>
6  mkdir ${output.files_path}
7  &amp;&amp; bowtie-build --quiet
8  -f
9  $input  ${output.files_path}/${output.metadata.base_name}
10  </command>
11  <inputs>
12    <param name="input" type="data" format="fasta" label="Fasta file"/>
13  </inputs>
14  <outputs>
15    <data name="output" format="bowtie_base_index"/>
16  </outputs>
17  <help>
18  </help>
19</tool>
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。