root/galaxy-central/lib/galaxy/datatypes/converters/interval_to_coverage.xml @ 2

リビジョン 2, 0.8 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central

行番号 
1<tool id="CONVERTER_interval_to_coverage_0" name="Convert Genomic Intervals To COVERAGE">
2  <!--  <description>__NOT_USED_CURRENTLY_FOR_CONVERTERS__</description> -->
3  <!-- Used on the metadata edit page. -->
4  <command interpreter="python">interval_to_coverage.py $input1 $output1
5  -1 ${input1.metadata.chromCol},${input1.metadata.startCol},${input1.metadata.endCol},${input1.metadata.strandCol}
6  -2 ${output1.metadata.chromCol},${output1.metadata.positionCol},${output1.metadata.forwardCol},${output1.metadata.reverseCol}
7  </command>
8  <inputs>
9    <page>
10      <param format="interval" name="input1" type="data" label="Choose intervals"/>
11    </page>
12   </inputs>
13  <outputs>
14    <data format="coverage" name="output1"/>
15  </outputs>
16  <help>
17  </help>
18</tool>
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。