root/galaxy-central/lib/galaxy/datatypes/indexers/interval_awk.xml @ 2

リビジョン 2, 0.6 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central

行番号 
1<tool id="INDEXER_Interval_0" name="Index Interval for Track Viewer">
2  <!-- Used internally to generate track indexes -->
3  <command interpreter="awk -f">interval.awk
4    chrom=${input_dataset.metadata.chromCol} start=${input_dataset.metadata.startCol}
5    end=${input_dataset.metadata.endCol} strand=${input_dataset.metadata.strandCol}
6    storepath=${store_path}
7    $input_dataset 2&gt;&amp;1
8  </command>
9  <inputs>
10    <page>
11      <param format="interval" name="input_dataset" type="data" label="Choose intervals"/>
12    </page>
13   </inputs>
14  <help>
15  </help>
16</tool>
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。