root/galaxy-central/lib/galaxy/datatypes/test/1.sam @ 2

リビジョン 2, 11.1 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central
行番号 
1@QNAME  FLAG    RNAME   POS     MAPQ    CIGAR   MRNM    MPOS    ISIZE   SEQ     QUAL    OPT
21378_11_329     69      *       0       0       *       *       0       0       AGACCGGGCGGGGTGGCGTTCGGT        %##+'#######%###$#$##$(#
31378_11_329     133     *       0       0       *       *       0       0       GTTCGTGGCCGGTGGGTGTTTGGG        ###$$#$#$&#####$'$#$###$
41378_17_1788    69      *       0       0       *       *       0       0       TGCCGTGTCTTGCTAACGCCGATT        #'#$$#$###%%##$$$$######
51378_17_1788    133     *       0       0       *       *       0       0       TGGGTGGATGTGTTGTCGTTCATG        #$#$###$#$#######$#$####
61378_25_2035    69      *       0       0       *       *       0       0       CTGCGTGTTGGTGTCTACTGGGGT        #%#'##$#$##&%#%$$$%#%#'#
71378_25_2035    133     *       0       0       *       *       0       0       GTGCGTCGGGGAGGGTGCTGTCGG        ######%#$%#$$###($###&&%
81378_28_770     89      chr11.nib:1-134452384   72131356        37      17M1I5M =       72131356        0       CACACTGTGACAGACAGCGCAGC 00/02!!0//1200210!!44/1 XT:A:U  CM:i:2  SM:i:37 AM:i:0  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:22
91378_28_770     181     chr11.nib:1-134452384   72131356        0       24M     =       72131356        0       TTGGTGCGCGCGGTTGAGGGTTGG        $$(#%%#$%#%####$%%##$###
101378_33_1945    113     chr2.nib:1-242951149    181247988       0       23M     chr12.nib:1-132349534   41710908        0       GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG PQRVUMNXYRPUXYXWXSOSZ]M XT:A:R  CM:i:0  SM:i:0  AM:i:0  X0:i:163148     XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
111378_33_1945    177     chr12.nib:1-132349534   41710908        0       23M     chr2.nib:1-242951149    181247988       0       AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA SQQWZYURVYWX]]YXTSY]]ZM XT:A:R  CM:i:0  SM:i:0  AM:i:0  X0:i:163148     XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
121378_34_789     69      *       0       0       *       *       0       0       ATGGTGGCTGACGCGTTTGACTGT        #$##%#$##$&$#%##$##$###$
131378_34_789     133     *       0       0       *       *       0       0       GGGCTTGCGTTAGTGAGAGGTTGT        ###%$%$%%###$####$###$#&
141378_35_263     115     chr16.nib:1-88827254    19671878        0       23M     =       19671877        -1      AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTCT 77543:<55#"4!&=964518A> XT:A:R  CM:i:2  SM:i:0  AM:i:0  X0:i:4  X1:i:137        XM:i:2  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
151378_35_263     179     chr16.nib:1-88827254    19671877        0       23M     =       19671878        1       GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTC LE7402DD34FL:27AKE>;432 XT:A:R  CM:i:0  SM:i:0  AM:i:0  X0:i:265        XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
161378_43_186     69      *       0       0       *       *       0       0       ATACTAGTTGGGACGCGTTGTGCT        #$(4%$########$#$###$$$#
171378_43_186     133     *       0       0       *       *       0       0       GCTAGGGTTTGGGTTTGCGGTGGG        $%#$########%##%#$###'#'
181378_51_1671    117     chr2.nib:1-242951149    190342418       0       24M     =       190342418       0       CTGGCGTTCTCGGCGTGGATGGGT        #####$$##$#%#%%###%$#$##
191378_51_1671    153     chr2.nib:1-242951149    190342418       37      16M1I6M =       190342418       0       TCTAACTTAGCCTCATAATAGCT /<<!"0///////00/!!0121/ XT:A:U  CM:i:2  SM:i:37 AM:i:0  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:22
201378_56_324     117     chr2.nib:1-242951149    80324999        0       24M     =       80324999        0       TCCAGTCGCGTTGTTAGGTTCGGA        #$#$$$#####%##%%###**#+/
211378_56_324     153     chr2.nib:1-242951149    80324999        37      8M1I14M =       80324999        0       TTTAGCCCGAAATGCCTAGAGCA 4;6//11!"11100110////00 XT:A:U  CM:i:2  SM:i:37 AM:i:0  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:22
221378_56_773     69      *       0       0       *       *       0       0       TGTCGTGAGGTCACTTATCCCCAT        &%#%##%%#####&#$%##$%##$
231378_56_773     133     *       0       0       *       *       0       0       TCTGGTCGGTTTCGGGGAGTGGAA        ##%%#&$###$#$##%$####%%$
241378_62_2027    69      *       0       0       *       *       0       0       CTTCCACGATCTGCTCGCTGTGGT        (#&&$##$$#$%#%$$$#$###'#
251378_62_2027    133     *       0       0       *       *       0       0       GTTGGCCTGGCCTGCCGTGCTGCG        *##),/%##$)#%##1$#'%.#&#
261378_62_2029    69      *       0       0       *       *       0       0       TCTGGGCTGTCTTCGGGTCGGTGT        $%$$####$##$$#)##%%#$###
271378_62_2029    133     *       0       0       *       *       0       0       GGCGGTGTGTGGTGCGGCTGTGCG        /$$$=(####%####)$$%$-&%#
281378_67_1795    81      chr16.nib:1-88827254    26739130        0       23M     chrY.nib:1-57772954     57401793        0       TGGCATTCCTGTAGGCAGAGAGG AZWWZS]!"QNXZ]VQ]]]/2]] XT:A:R  CM:i:2  SM:i:0  AM:i:0  X0:i:3  X1:i:0  XM:i:2  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
291378_67_1795    161     chrY.nib:1-57772954     57401793        37      23M     chr16.nib:1-88827254    26739130        0       GATCACCCAGGTGATGTAACTCC ]WV]]]]WW]]]]]]]]]]PU]] XT:A:U  CM:i:0  SM:i:37 AM:i:0  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
301378_68_466     69      *       0       0       *       *       0       0       GTGATCGTCGGTGCCAGTCCCTGT        #(%)+##$#$#%#+$%##$#####
311378_68_466     133     *       0       0       *       *       0       0       GTGTCATCTGAGGTAAAGCATTGT        /##$09#$#.=$#$76+$%1'###
321378_68_1692    117     chr13.nib:1-114142980   36365609        0       24M     =       36365609        0       TTGAACCGGGCACGGGTCTTCTGG        #$#######%###$##%&'%)###
331378_68_1692    153     chr13.nib:1-114142980   36365609        37      10M1D13M        =       36365609        0       CTGCACATACAGAATATTCATAG 0010/!"0/!!021/132231// XT:A:U  CM:i:2  SM:i:37 AM:i:0  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:10^T13
341378_80_664     69      *       0       0       *       *       0       0       CTGCTTTGATCCCCGGTGGAGCAC        7#%###$$6#######$##$$$##
351378_80_664     133     *       0       0       *       *       0       0       TGTCTGCGTTGTATCTCTGGTGTA        %##%,%$$#&$$###$#$%##'%#
361378_85_1786    69      *       0       0       *       *       0       0       ATACTATGTCGATCTGTAAAAAAA        )&.)#3%@$&%-,2#&+.-%0&./
371378_85_1786    133     *       0       0       *       *       0       0       CCCTAGGAGCGTATACCGGACGAG        ,'&/%/@,&1,&'/)&,6&&1)((
381378_86_1011    69      *       0       0       *       *       0       0       CTACGTTATTGCTCTGTTTGTCCT        ######$%##$$$%###%#$####
391378_86_1011    133     *       0       0       *       *       0       0       AGGCGATGGGATATTATTTTACTT        :$###)%##$9$###1$$#$2###
401378_86_1789    89      chr12.nib:1-132349534   39007065        37      23M     =       39007065        0       GCTTTCCATAGATGTGTAATTTC J2K]]Z5!GN?@U]]]VX]UYYP XT:A:U  CM:i:1  SM:i:37 AM:i:0  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
411378_86_1789    181     chr12.nib:1-132349534   39007065        0       24M     =       39007065        0       ACAACTTAAATAATCATGGACCGG        02,5$$0&6#%?*,$'#%&/15.1
421378_91_1596    69      *       0       0       *       *       0       0       TTAGCGGTTGACTATCTGCTGACA        *&+'#9'(%*'#//,&<),/)'*#
431378_91_1596    133     *       0       0       *       *       0       0       GCTTTTTCATTCGGTGCCTTTGGA        '>%/3%=()8'#.%?50$&5>%)%
441378_94_1595    69      chr7.nib:1-158821424    127518258       0       24M     =       127518258       0       CGTGCGACAGCCCATGTTTTCAGA        -=..5,3826&*+.+#+#%%6;%#
451378_94_1595    137     chr7.nib:1-158821424    127518258       37      23M     =       127518258       0       TGAGATAAACACCTAACATGCTC M]]FN]]\V]]]Q>T]KIG:LVN XT:A:U  CM:i:0  SM:i:37 AM:i:0  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
461378_95_1039    69      *       0       0       *       *       0       0       CGGCGTCCATCTTCGCCTTGAGAT        $##.#$##$$#%$#$%%$###$)$
471378_95_1039    133     *       0       0       *       *       0       0       GTTCTGTGCCAGGTGAGGTACGGA        &##,./#$&)6##+,'#$$0(##$
481378_95_1767    65      chr11.nib:1-134452384   65333552        25      23M     chr3.nib:1-199501827    123725482       0       CAACTGGTGGCATCTGGACAAAC W[[TZYY]]RO<BI7!!:!!>@2 XT:A:U  CM:i:2  SM:i:25 AM:i:25 X0:i:1  X1:i:0  XM:i:2  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
491378_95_1767    129     chr3.nib:1-199501827    123725482       37      6M1I16M chr11.nib:1-134452384   65333552        0       ATTTATCTGTCTCATTCATTATT <AGB8B"!V]]UO/&JB4DE88E XT:A:U  CM:i:2  SM:i:37 AM:i:25 X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:22
501378_96_1037    69      *       0       0       *       *       0       0       ATCCCCCAAGATGCCTGTTGATTG        $#$'##$$$#%$$#%###+##$#$
511378_96_1037    133     *       0       0       *       *       0       0       CTGCTGGGCCATTTGACTTACTCA        '$#+#(##-%5##+*&###-.$$$
521378_96_1764    81      chr15.nib:1-100338915   89251272        25      23M     chr7.nib:1-158821424    19412615        0       AGAAATGGTCGCACCCTCTGGTT E*2ZEHX\SN]O>SYRL):LIOL XT:A:U  CM:i:2  SM:i:25 AM:i:25 X0:i:1  X1:i:0  XM:i:2  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
531378_96_1764    161     chr7.nib:1-158821424    19412615        37      23M     chr15.nib:1-100338915   89251272        0       GTATAGCCCACAACGCCTAATAT ZMBS]UW]UYR\]QPZ[SMYL7C XT:A:U  CM:i:0  SM:i:37 AM:i:25 X0:i:1  X1:i:0  XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
541378_98_1574    69      *       0       0       *       *       0       0       GTTCTGCCGGTGTCTGTGGCGGGC        $$#+&$$####%$$$###$%#%%#
551378_98_1574    133     *       0       0       *       *       0       0       AGGCGAGTGTGGGGGTTGTTTGAG        +%%$#)##%##$####%###$%$#
561378_107_1647   69      *       0       0       *       *       0       0       AGGCCTACTACGCGTCATTGATAG        &#$$#$(.#%#$$####&$%##($
571378_107_1647   133     *       0       0       *       *       0       0       GGTCTGGTTCTATGTTGGTCGACT        ###'$$#$$$(#%###(#$##$%#
581378_111_829    69      chr9.nib:1-140273252    82506894        0       24M     =       82506894        0       TGCGGCACTTGCTTCTTCGTATTT        %#%##%#$%#$#%###$$##&#$$
591378_111_829    137     chr9.nib:1-140273252    82506894        37      4M1I18M =       82506894        0       GATGCGTAATCTAGTAAAATAAG 0/362//00/5516500210451 XT:A:U  CM:i:2  SM:i:37 AM:i:0  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:22
601378_111_1900   69      *       0       0       *       *       0       0       TCCCCTCGCTCGGCTCTGTGCTGT        $&%*$#(#)##$#'##%(##$#$%
611378_111_1900   133     *       0       0       *       *       0       0       GCACGCCTTTGGGCTAAGCCGTAA        )$)'#%$########$'#&%$#(#
621378_112_1483   69      *       0       0       *       *       0       0       TGTCCAGCTATGCGGCTTCCTCCT        %#$+#%#&#$#####%####%$##
631378_112_1483   133     *       0       0       *       *       0       0       TGGAGTGGTGTGTTTGCTGAGCCA        #$#)#############$#%#%'%
641378_125_1287   69      *       0       0       *       *       0       0       TGTCTCTGGGGGGCCTGGTTAGGT        $##13$'%#$###$$###$$$#&#
651378_125_1287   133     *       0       0       *       *       0       0       TGACGTGGGTTGTCCCGTGAGATT        ##$%%#$###$##$$#&%##$(%%
661378_126_468    117     chr11.nib:1-134452384   72541052        0       24M     =       72541052        0       TGCCTCTATACAGATTAGTCCTCT        )7,7..?97594@8=,=?813@>7
671378_126_468    153     chr11.nib:1-134452384   72541052        0       23M     =       72541052        0       AGGCAAGACTCTGTCTCAAAAAA PK5G]]PDT\]SEXY[]]]]]]] XT:A:R  CM:i:0  SM:i:0  AM:i:0  X0:i:4  X1:i:15713      XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
681378_127_664    69      *       0       0       *       *       0       0       AGAGGTTGGTGTCTTGTCGCAGCT        ##'#$######$$%######$$$#
691378_127_664    133     *       0       0       *       *       0       0       TCGCTTTGCCTATGTTTGTTCGGA        #%$%#&##$%#%%###$$###)-'
701378_129_463    97      chr8.nib:1-146274826    29931771        37      23M     chr19.nib:1-63811651    5702213 0       GTAGCTCTGTTTCACATTAGGGG J>AQ[G>C?NM:GD=)*PLORIF XT:A:U  CM:i:1  SM:i:37 AM:i:0  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
711378_129_463    145     chr19.nib:1-63811651    5702213 0       23M     chr8.nib:1-146274826    29931771        0       AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA JOI:AHGD==@KQB78HF>KA8> XT:A:R  CM:i:0  SM:i:0  AM:i:0  X0:i:583698     XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
721378_129_875    69      *       0       0       *       *       0       0       TTTCTATGGCTTACGCTGTCTGCC        #$($##%####%$#$#####$###
731378_129_875    133     *       0       0       *       *       0       0       GACCTTTACGTATTGGGGGTTGGC        ###)###+###$##$#&%##$,#$
741378_140_1251   69      *       0       0       *       *       0       0       ATCCTAGCGCGGTGTCTTGGGGAC        #$%1#$$$##$##$#$#$##$%$$
751378_140_1251   133     *       0       0       *       *       0       0       TTTCCTTCGTGTGCGTGCGGAGTG        #%#%$##$$$######.$$$%#%(
761378_141_809    69      *       0       0       *       *       0       0       TGTCCTCCAGTGTCTGTTGGGTGT        %&,-##$$#(%###$#$$'###'#
771378_141_809    133     *       0       0       *       *       0       0       TCTCGTGGTTTCTTTTTTATGTGT        ##%)##$$#####%$#$#%%#'##
781378_144_983    69      *       0       0       *       *       0       0       AGCGCCCGGTTGGTGCGGCTCGTC        -$(&%*$#*#))#$$$#%%$#$##
791378_144_983    133     *       0       0       *       *       0       0       GTTCGTTCGTGGTGTACGAGGGTG        #(#%#####($#%##$$#%##%#)
801378_153_270    69      *       0       0       *       *       0       0       AGTCCTTGTCCCCTGGGTTTTCCC        +''$#&%$%#$##&$$($#&#$$#
811378_153_270    133     *       0       0       *       *       0       0       GGCCGTGTGCGGGTGTAGATTGGA        %$##($######&##$&$$$$%##
821378_155_1689   65      chrX.nib:1-154913754    106941539       37      23M     =       106940385       -1154   ATCTCCTCTTCCTTCCATTCCAC \]]]Y]]]]]UV]]]ZYZZ]]RV XT:A:U  CM:i:0  SM:i:37 AM:i:37 X0:i:1  X1:i:0  XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
831378_155_1689   129     chrX.nib:1-154913754    106940385       37      23M     =       106941539       1154    GACTATGAGGTTTTCATTCAACA ]]]]\\]]]YW]]]WRZ]]WIOK XT:A:U  CM:i:0  SM:i:37 AM:i:37 X0:i:1  X1:i:0  XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
841378_157_1580   69      *       0       0       *       *       0       0       TGGGCCTCGGTGCCCTTGGTCTGT        #%)$##'#$$$&#####%#$#$##
851378_157_1580   133     *       0       0       *       *       0       0       GGGATTGAAGGGATGTATGCTAGG        #%$&%#$$'%$%#$##*#%$$$$#
861378_161_317    69      *       0       0       *       *       0       0       TTGGCCGGCAACCCCGGTACCTAA        7<,<'@)@>.)2@/')'&(?/-<(
871378_161_317    133     *       0       0       *       *       0       0       AATCCATACCCACAAAAGCAGGCC        .&%','(@''?7//+&)+2.+)0)
881378_177_735    113     chr2.nib:1-242951149    222173182       25      23M     =       222173882       700     TTGTTCAGCGCCGATTGTCAATC KPNICFMS]]]Z]]]]Y]]]]]] XT:A:U  CM:i:2  SM:i:25 AM:i:25 X0:i:1  X1:i:0  XM:i:2  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:1G21
891378_177_735    177     chr2.nib:1-242951149    222173882       37      23M     =       222173182       -700    AGAATTCCTAACAAAATGTGAAG ES6-]]]]]]]]]]]]]]]]]]] XT:A:U  CM:i:1  SM:i:37 AM:i:25 X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
901378_181_1684   69      *       0       0       *       *       0       0       CGACTCCCGCATTCACGGTCAAGT        &*#,##$#&$*$$#$#$$$#%$##
911378_181_1684   133     *       0       0       *       *       0       0       TTTCTGTTGTGGTTTTGTTGGGGT        $##'$%'##%##$%$#$$####$*
921378_187_1407   69      *       0       0       *       *       0       0       TGGCGTCCACTCGTGGGTCTATCG        $#$'%#$%$%&$%#####$#$#%#
931378_187_1407   133     *       0       0       *       *       0       0       TTGGGTGAAATCTTGTCGAGTGGA        ####&##$$###$#####%##%%)
941378_203_721    97      chr1.nib:1-247249719    245680524       25      23M     chr2.nib:1-242951149    213173999       0       GTAAAATTTGTGGAGATTTAAGT ]VEFFEZ]XPW]TOVINQ,;T!! XT:A:U  CM:i:2  SM:i:25 AM:i:25 X0:i:1  X1:i:0  XM:i:2  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
951378_203_721    145     chr2.nib:1-242951149    213173999       37      4M1I18M chr1.nib:1-247249719    245680524       0       ACCTAACAAAATTGTTCAATATG F>8AWT<AV]Q9B"+]O@IF=K] XT:A:U  CM:i:2  SM:i:37 AM:i:25 X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:22
961378_206_2039   113     chr4.nib:1-191273063    103793427       0       23M     chr18.nib:1-76117153    57165542        0       ACACACACACACACACACACACA NKWZVWZ]]XV[]]]]]]]]]]] XT:A:R  CM:i:0  SM:i:0  AM:i:0  X0:i:1292040    XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
971378_206_2039   177     chr18.nib:1-76117153    57165542        0       23M     chr4.nib:1-191273063    103793427       0       CACACACACACACACACACACAC NAJ[SPT[]]]W[]]]]]]]]]] XT:A:R  CM:i:0  SM:i:0  AM:i:0  X0:i:1292040    XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。