root/galaxy-central/lib/galaxy/datatypes/test/alignment.lav @ 2

#:lav
d {
  "blastz out.seq1m seq2data Y=3400 H=0 W=8 B=2 K=3000 C=0 m=83886080 P=0
     A    C    G    T
    91 -114  -31 -123
  -114  100 -125  -31
   -31 -125  100 -114
  -123  -31 -114   91
  O = 400, E = 30, K = 3000, L = 3000, M = 50"
}
#:lav
s {
  "out.seq1m" 1 1680 0 1
  "seq2data" 1 1680 0 1
}
h {
   ">seqmask seq1data out.repeats"
   ">seq2"
}
a {
  s 161304
  b 1 1
  e 1680 1680
  l 1 1 1680 1680 100
}
a {
  s 15173
  b 186 251
  e 450 505
  l 186 251 244 309 92
  l 256 310 280 334 84
  l 281 336 307 362 78
  l 308 374 329 395 91
  l 341 396 367 422 81
  l 369 423 419 473 94
  l 422 474 425 477 75
  l 426 481 450 505 96
}
a {
  s 12134
  b 191 343
  e 361 503
  l 191 343 215 367 80
  l 216 369 244 397 86
  l 256 398 361 503 95
}
a {
  s 4422
  b 192 431
  e 276 505
  l 192 431 212 451 100
  l 223 452 244 473 95
  l 247 474 254 481 63
  l 255 484 276 505 91
}
a {
  s 6872
  b 192 311
  e 330 450
  l 192 311 215 334 83
  l 216 336 275 395 73
  l 286 396 307 417 91
  l 308 428 330 450 96
}
a {
  s 14437
  b 192 224
  e 472 505
  l 192 224 223 255 84
  l 224 257 255 288 84
  l 257 289 277 309 90
  l 288 310 308 330 90
  l 309 342 362 395 85
  l 374 396 395 417 91
  l 396 428 417 449 95
  l 428 450 449 471 95
  l 450 483 472 505 91
}
a {
  s 7306
  b 192 399
  e 308 505
  l 192 399 244 451 94
  l 256 452 277 473 91
  l 280 474 283 477 100
  l 284 481 308 505 92
}
a {
  s 11180
  b 193 290
  e 396 505
  l 193 290 212 309 100
  l 223 310 280 367 76
  l 281 369 332 420 88
  l 333 422 335 424 100
  l 336 429 341 434 83
  l 342 451 396 505 87
}
a {
  s 14437
  b 224 192
  e 505 472
  l 224 192 255 223 84
  l 257 224 288 255 84
  l 289 257 309 277 90
  l 310 288 330 308 90
  l 342 309 395 362 85
  l 396 374 417 395 91
  l 428 396 449 417 95
  l 450 428 471 449 95
  l 483 450 505 472 91
}
a {
  s 15173
  b 251 186
  e 505 450
  l 251 186 309 244 92
  l 310 256 334 280 84
  l 336 281 362 307 78
  l 374 308 395 329 91
  l 396 341 422 367 81
  l 423 369 473 419 94
  l 474 422 477 425 75
  l 481 426 505 450 96
}
a {
  s 11180
  b 290 193
  e 505 396
  l 290 193 309 212 100
  l 310 223 367 280 76
  l 369 281 420 332 88
  l 422 333 424 335 100
  l 429 336 434 341 83
  l 451 342 505 396 87
}
a {
  s 6872
  b 311 192
  e 450 330
  l 311 192 334 215 83
  l 336 216 395 275 73
  l 396 286 417 307 91
  l 428 308 450 330 96
}
a {
  s 12134
  b 343 191
  e 503 361
  l 343 191 367 215 80
  l 369 216 397 244 86
  l 398 256 503 361 95
}
a {
  s 7306
  b 399 192
  e 505 308
  l 399 192 451 244 94
  l 452 256 473 277 91
  l 474 280 477 283 100
  l 481 284 505 308 92
}
a {
  s 4422
  b 431 192
  e 505 276
  l 431 192 451 212 100
  l 452 223 473 244 95
  l 474 247 481 254 63
  l 484 255 505 276 91
}
x {
  n 0
}
m {
  n 0
}
#:eof