root/galaxy-central/lib/galaxy/datatypes/test/megablast_xml_parser_test1.blastxml @ 2

リビジョン 2, 172.6 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central
行番号 
1<?xml version="1.0"?>
2<!DOCTYPE BlastOutput PUBLIC "-//NCBI//NCBI BlastOutput/EN" "http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dtd/NCBI_BlastOutput.dtd">
3<BlastOutput>
4  <BlastOutput_program>blastn</BlastOutput_program>
5  <BlastOutput_version>blastn 2.2.17 [Aug-26-2007]</BlastOutput_version>
6  <BlastOutput_reference>~Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, ~Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), ~&quot;Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search~programs&quot;,  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.</BlastOutput_reference>
7  <BlastOutput_db>Ecoli.fa</BlastOutput_db>
8  <BlastOutput_query-ID>lcl|1_0</BlastOutput_query-ID>
9  <BlastOutput_query-def>0_0.666667</BlastOutput_query-def>
10  <BlastOutput_query-len>30</BlastOutput_query-len>
11  <BlastOutput_param>
12    <Parameters>
13      <Parameters_expect>10</Parameters_expect>
14      <Parameters_sc-match>1</Parameters_sc-match>
15      <Parameters_sc-mismatch>-3</Parameters_sc-mismatch>
16      <Parameters_gap-open>0</Parameters_gap-open>
17      <Parameters_gap-extend>0</Parameters_gap-extend>
18      <Parameters_filter>F</Parameters_filter>
19    </Parameters>
20  </BlastOutput_param>
21  <BlastOutput_iterations>
22    <Iteration>
23      <Iteration_iter-num>1</Iteration_iter-num>
24      <Iteration_query-ID>lcl|1_0</Iteration_query-ID>
25      <Iteration_query-def>0_0.666667</Iteration_query-def>
26      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
27      <Iteration_hits>
28        <Hit>
29          <Hit_num>1</Hit_num>
30          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
31          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
32          <Hit_accession>0</Hit_accession>
33          <Hit_len>5528445</Hit_len>
34          <Hit_hsps>
35            <Hsp>
36              <Hsp_num>1</Hsp_num>
37              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
38              <Hsp_score>30</Hsp_score>
39              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
40              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
41              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
42              <Hsp_hit-from>5436010</Hsp_hit-from>
43              <Hsp_hit-to>5436039</Hsp_hit-to>
44              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
45              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
46              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
47              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
48              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
49              <Hsp_qseq>CGGACAGCGCCGCCACCAACAAAGCCACCA</Hsp_qseq>
50              <Hsp_hseq>CGGACAGCGCCGCCACCAACAAAGCCACCA</Hsp_hseq>
51              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
52            </Hsp>
53          </Hit_hsps>
54        </Hit>
55      </Iteration_hits>
56      <Iteration_stat>
57        <Statistics>
58          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
59          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
60          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
61          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
62          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
63          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
64          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
65        </Statistics>
66      </Iteration_stat>
67    </Iteration>
68    <Iteration>
69      <Iteration_iter-num>2</Iteration_iter-num>
70      <Iteration_query-ID>lcl|2_0</Iteration_query-ID>
71      <Iteration_query-def>1_0.600000</Iteration_query-def>
72      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
73      <Iteration_hits>
74        <Hit>
75          <Hit_num>1</Hit_num>
76          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
77          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
78          <Hit_accession>0</Hit_accession>
79          <Hit_len>5528445</Hit_len>
80          <Hit_hsps>
81            <Hsp>
82              <Hsp_num>1</Hsp_num>
83              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
84              <Hsp_score>30</Hsp_score>
85              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
86              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
87              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
88              <Hsp_hit-from>696993</Hsp_hit-from>
89              <Hsp_hit-to>697022</Hsp_hit-to>
90              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
91              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
92              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
93              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
94              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
95              <Hsp_qseq>AAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGAT</Hsp_qseq>
96              <Hsp_hseq>AAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGAT</Hsp_hseq>
97              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
98            </Hsp>
99          </Hit_hsps>
100        </Hit>
101      </Iteration_hits>
102      <Iteration_stat>
103        <Statistics>
104          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
105          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
106          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
107          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
108          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
109          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
110          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
111        </Statistics>
112      </Iteration_stat>
113    </Iteration>
114    <Iteration>
115      <Iteration_iter-num>3</Iteration_iter-num>
116      <Iteration_query-ID>lcl|3_0</Iteration_query-ID>
117      <Iteration_query-def>2_0.400000</Iteration_query-def>
118      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
119      <Iteration_hits>
120        <Hit>
121          <Hit_num>1</Hit_num>
122          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
123          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
124          <Hit_accession>0</Hit_accession>
125          <Hit_len>5528445</Hit_len>
126          <Hit_hsps>
127            <Hsp>
128              <Hsp_num>1</Hsp_num>
129              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
130              <Hsp_score>30</Hsp_score>
131              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
132              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
133              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
134              <Hsp_hit-from>4100018</Hsp_hit-from>
135              <Hsp_hit-to>4100047</Hsp_hit-to>
136              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
137              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
138              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
139              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
140              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
141              <Hsp_qseq>TTTGCTTTTAGTACACCGGATTCAGAACCA</Hsp_qseq>
142              <Hsp_hseq>TTTGCTTTTAGTACACCGGATTCAGAACCA</Hsp_hseq>
143              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
144            </Hsp>
145          </Hit_hsps>
146        </Hit>
147      </Iteration_hits>
148      <Iteration_stat>
149        <Statistics>
150          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
151          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
152          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
153          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
154          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
155          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
156          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
157        </Statistics>
158      </Iteration_stat>
159    </Iteration>
160    <Iteration>
161      <Iteration_iter-num>4</Iteration_iter-num>
162      <Iteration_query-ID>lcl|4_0</Iteration_query-ID>
163      <Iteration_query-def>3_0.566667</Iteration_query-def>
164      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
165      <Iteration_hits>
166        <Hit>
167          <Hit_num>1</Hit_num>
168          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
169          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
170          <Hit_accession>0</Hit_accession>
171          <Hit_len>5528445</Hit_len>
172          <Hit_hsps>
173            <Hsp>
174              <Hsp_num>1</Hsp_num>
175              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
176              <Hsp_score>30</Hsp_score>
177              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
178              <Hsp_query-from>30</Hsp_query-from>
179              <Hsp_query-to>1</Hsp_query-to>
180              <Hsp_hit-from>2305844</Hsp_hit-from>
181              <Hsp_hit-to>2305873</Hsp_hit-to>
182              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
183              <Hsp_hit-frame>-1</Hsp_hit-frame>
184              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
185              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
186              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
187              <Hsp_qseq>CCGTCCAGAAAGGTGTATTCATGGGGACGG</Hsp_qseq>
188              <Hsp_hseq>CCGTCCAGAAAGGTGTATTCATGGGGACGG</Hsp_hseq>
189              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
190            </Hsp>
191          </Hit_hsps>
192        </Hit>
193      </Iteration_hits>
194      <Iteration_stat>
195        <Statistics>
196          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
197          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
198          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
199          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
200          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
201          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
202          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
203        </Statistics>
204      </Iteration_stat>
205    </Iteration>
206    <Iteration>
207      <Iteration_iter-num>5</Iteration_iter-num>
208      <Iteration_query-ID>lcl|5_0</Iteration_query-ID>
209      <Iteration_query-def>4_0.766667</Iteration_query-def>
210      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
211      <Iteration_hits>
212        <Hit>
213          <Hit_num>1</Hit_num>
214          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
215          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
216          <Hit_accession>0</Hit_accession>
217          <Hit_len>5528445</Hit_len>
218          <Hit_hsps>
219            <Hsp>
220              <Hsp_num>1</Hsp_num>
221              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
222              <Hsp_score>30</Hsp_score>
223              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
224              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
225              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
226              <Hsp_hit-from>3457901</Hsp_hit-from>
227              <Hsp_hit-to>3457930</Hsp_hit-to>
228              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
229              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
230              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
231              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
232              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
233              <Hsp_qseq>CACGCTACGTGCGCCCCCGCCCAGAAGGCG</Hsp_qseq>
234              <Hsp_hseq>CACGCTACGTGCGCCCCCGCCCAGAAGGCG</Hsp_hseq>
235              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
236            </Hsp>
237          </Hit_hsps>
238        </Hit>
239      </Iteration_hits>
240      <Iteration_stat>
241        <Statistics>
242          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
243          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
244          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
245          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
246          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
247          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
248          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
249        </Statistics>
250      </Iteration_stat>
251    </Iteration>
252    <Iteration>
253      <Iteration_iter-num>6</Iteration_iter-num>
254      <Iteration_query-ID>lcl|6_0</Iteration_query-ID>
255      <Iteration_query-def>5_0.533333</Iteration_query-def>
256      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
257      <Iteration_hits>
258        <Hit>
259          <Hit_num>1</Hit_num>
260          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
261          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
262          <Hit_accession>0</Hit_accession>
263          <Hit_len>5528445</Hit_len>
264          <Hit_hsps>
265            <Hsp>
266              <Hsp_num>1</Hsp_num>
267              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
268              <Hsp_score>30</Hsp_score>
269              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
270              <Hsp_query-from>30</Hsp_query-from>
271              <Hsp_query-to>1</Hsp_query-to>
272              <Hsp_hit-from>1264131</Hsp_hit-from>
273              <Hsp_hit-to>1264160</Hsp_hit-to>
274              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
275              <Hsp_hit-frame>-1</Hsp_hit-frame>
276              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
277              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
278              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
279              <Hsp_qseq>GCACTTAACCCGCTTCGGCGGGTTTTGTTT</Hsp_qseq>
280              <Hsp_hseq>GCACTTAACCCGCTTCGGCGGGTTTTGTTT</Hsp_hseq>
281              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
282            </Hsp>
283            <Hsp>
284              <Hsp_num>2</Hsp_num>
285              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
286              <Hsp_score>30</Hsp_score>
287              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
288              <Hsp_query-from>30</Hsp_query-from>
289              <Hsp_query-to>1</Hsp_query-to>
290              <Hsp_hit-from>1636485</Hsp_hit-from>
291              <Hsp_hit-to>1636514</Hsp_hit-to>
292              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
293              <Hsp_hit-frame>-1</Hsp_hit-frame>
294              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
295              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
296              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
297              <Hsp_qseq>GCACTTAACCCGCTTCGGCGGGTTTTGTTT</Hsp_qseq>
298              <Hsp_hseq>GCACTTAACCCGCTTCGGCGGGTTTTGTTT</Hsp_hseq>
299              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
300            </Hsp>
301            <Hsp>
302              <Hsp_num>3</Hsp_num>
303              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
304              <Hsp_score>30</Hsp_score>
305              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
306              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
307              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
308              <Hsp_hit-from>2318694</Hsp_hit-from>
309              <Hsp_hit-to>2318723</Hsp_hit-to>
310              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
311              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
312              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
313              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
314              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
315              <Hsp_qseq>AAACAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGC</Hsp_qseq>
316              <Hsp_hseq>AAACAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGC</Hsp_hseq>
317              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
318            </Hsp>
319            <Hsp>
320              <Hsp_num>4</Hsp_num>
321              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
322              <Hsp_score>30</Hsp_score>
323              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
324              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
325              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
326              <Hsp_hit-from>2777043</Hsp_hit-from>
327              <Hsp_hit-to>2777072</Hsp_hit-to>
328              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
329              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
330              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
331              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
332              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
333              <Hsp_qseq>AAACAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGC</Hsp_qseq>
334              <Hsp_hseq>AAACAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGC</Hsp_hseq>
335              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
336            </Hsp>
337          </Hit_hsps>
338        </Hit>
339      </Iteration_hits>
340      <Iteration_stat>
341        <Statistics>
342          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
343          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
344          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
345          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
346          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
347          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
348          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
349        </Statistics>
350      </Iteration_stat>
351    </Iteration>
352    <Iteration>
353      <Iteration_iter-num>7</Iteration_iter-num>
354      <Iteration_query-ID>lcl|7_0</Iteration_query-ID>
355      <Iteration_query-def>6_0.533333</Iteration_query-def>
356      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
357      <Iteration_hits>
358        <Hit>
359          <Hit_num>1</Hit_num>
360          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
361          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
362          <Hit_accession>0</Hit_accession>
363          <Hit_len>5528445</Hit_len>
364          <Hit_hsps>
365            <Hsp>
366              <Hsp_num>1</Hsp_num>
367              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
368              <Hsp_score>30</Hsp_score>
369              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
370              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
371              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
372              <Hsp_hit-from>1185124</Hsp_hit-from>
373              <Hsp_hit-to>1185153</Hsp_hit-to>
374              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
375              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
376              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
377              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
378              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
379              <Hsp_qseq>TAAGCCGTTACTGGCAGCAAGTGCAGGCAA</Hsp_qseq>
380              <Hsp_hseq>TAAGCCGTTACTGGCAGCAAGTGCAGGCAA</Hsp_hseq>
381              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
382            </Hsp>
383          </Hit_hsps>
384        </Hit>
385      </Iteration_hits>
386      <Iteration_stat>
387        <Statistics>
388          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
389          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
390          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
391          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
392          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
393          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
394          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
395        </Statistics>
396      </Iteration_stat>
397    </Iteration>
398    <Iteration>
399      <Iteration_iter-num>8</Iteration_iter-num>
400      <Iteration_query-ID>lcl|8_0</Iteration_query-ID>
401      <Iteration_query-def>7_0.400000</Iteration_query-def>
402      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
403      <Iteration_hits>
404        <Hit>
405          <Hit_num>1</Hit_num>
406          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
407          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
408          <Hit_accession>0</Hit_accession>
409          <Hit_len>5528445</Hit_len>
410          <Hit_hsps>
411            <Hsp>
412              <Hsp_num>1</Hsp_num>
413              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
414              <Hsp_score>30</Hsp_score>
415              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
416              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
417              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
418              <Hsp_hit-from>2458203</Hsp_hit-from>
419              <Hsp_hit-to>2458232</Hsp_hit-to>
420              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
421              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
422              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
423              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
424              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
425              <Hsp_qseq>TGAATTTACCGTTATCTATCTTGCCTGCCT</Hsp_qseq>
426              <Hsp_hseq>TGAATTTACCGTTATCTATCTTGCCTGCCT</Hsp_hseq>
427              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
428            </Hsp>
429          </Hit_hsps>
430        </Hit>
431      </Iteration_hits>
432      <Iteration_stat>
433        <Statistics>
434          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
435          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
436          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
437          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
438          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
439          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
440          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
441        </Statistics>
442      </Iteration_stat>
443    </Iteration>
444    <Iteration>
445      <Iteration_iter-num>10</Iteration_iter-num>
446      <Iteration_query-ID>lcl|10_0</Iteration_query-ID>
447      <Iteration_query-def>9_0.400000</Iteration_query-def>
448      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
449      <Iteration_hits>
450        <Hit>
451          <Hit_num>1</Hit_num>
452          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
453          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
454          <Hit_accession>0</Hit_accession>
455          <Hit_len>5528445</Hit_len>
456          <Hit_hsps>
457            <Hsp>
458              <Hsp_num>1</Hsp_num>
459              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
460              <Hsp_score>30</Hsp_score>
461              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
462              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
463              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
464              <Hsp_hit-from>5286666</Hsp_hit-from>
465              <Hsp_hit-to>5286695</Hsp_hit-to>
466              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
467              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
468              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
469              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
470              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
471              <Hsp_qseq>GCGTTTTGCTAAACTTCTGCCGGAATATAA</Hsp_qseq>
472              <Hsp_hseq>GCGTTTTGCTAAACTTCTGCCGGAATATAA</Hsp_hseq>
473              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
474            </Hsp>
475          </Hit_hsps>
476        </Hit>
477      </Iteration_hits>
478      <Iteration_stat>
479        <Statistics>
480          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
481          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
482          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
483          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
484          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
485          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
486          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
487        </Statistics>
488      </Iteration_stat>
489    </Iteration>
490    <Iteration>
491      <Iteration_iter-num>11</Iteration_iter-num>
492      <Iteration_query-ID>lcl|11_0</Iteration_query-ID>
493      <Iteration_query-def>10_0.500000</Iteration_query-def>
494      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
495      <Iteration_hits>
496        <Hit>
497          <Hit_num>1</Hit_num>
498          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
499          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
500          <Hit_accession>0</Hit_accession>
501          <Hit_len>5528445</Hit_len>
502          <Hit_hsps>
503            <Hsp>
504              <Hsp_num>1</Hsp_num>
505              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
506              <Hsp_score>30</Hsp_score>
507              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
508              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
509              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
510              <Hsp_hit-from>2787672</Hsp_hit-from>
511              <Hsp_hit-to>2787701</Hsp_hit-to>
512              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
513              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
514              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
515              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
516              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
517              <Hsp_qseq>AAAGAGGCGAGCAGAGTAAAACGCAGGCAA</Hsp_qseq>
518              <Hsp_hseq>AAAGAGGCGAGCAGAGTAAAACGCAGGCAA</Hsp_hseq>
519              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
520            </Hsp>
521          </Hit_hsps>
522        </Hit>
523      </Iteration_hits>
524      <Iteration_stat>
525        <Statistics>
526          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
527          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
528          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
529          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
530          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
531          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
532          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
533        </Statistics>
534      </Iteration_stat>
535    </Iteration>
536    <Iteration>
537      <Iteration_iter-num>13</Iteration_iter-num>
538      <Iteration_query-ID>lcl|13_0</Iteration_query-ID>
539      <Iteration_query-def>12_0.700000</Iteration_query-def>
540      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
541      <Iteration_hits>
542        <Hit>
543          <Hit_num>1</Hit_num>
544          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
545          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
546          <Hit_accession>0</Hit_accession>
547          <Hit_len>5528445</Hit_len>
548          <Hit_hsps>
549            <Hsp>
550              <Hsp_num>1</Hsp_num>
551              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
552              <Hsp_score>30</Hsp_score>
553              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
554              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
555              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
556              <Hsp_hit-from>4116145</Hsp_hit-from>
557              <Hsp_hit-to>4116174</Hsp_hit-to>
558              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
559              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
560              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
561              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
562              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
563              <Hsp_qseq>GCGGACGATCTTCACGGTCGCCACGCGGAC</Hsp_qseq>
564              <Hsp_hseq>GCGGACGATCTTCACGGTCGCCACGCGGAC</Hsp_hseq>
565              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
566            </Hsp>
567          </Hit_hsps>
568        </Hit>
569      </Iteration_hits>
570      <Iteration_stat>
571        <Statistics>
572          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
573          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
574          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
575          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
576          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
577          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
578          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
579        </Statistics>
580      </Iteration_stat>
581    </Iteration>
582    <Iteration>
583      <Iteration_iter-num>14</Iteration_iter-num>
584      <Iteration_query-ID>lcl|14_0</Iteration_query-ID>
585      <Iteration_query-def>13_0.533333</Iteration_query-def>
586      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
587      <Iteration_hits>
588        <Hit>
589          <Hit_num>1</Hit_num>
590          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
591          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
592          <Hit_accession>0</Hit_accession>
593          <Hit_len>5528445</Hit_len>
594          <Hit_hsps>
595            <Hsp>
596              <Hsp_num>1</Hsp_num>
597              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
598              <Hsp_score>30</Hsp_score>
599              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
600              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
601              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
602              <Hsp_hit-from>5442351</Hsp_hit-from>
603              <Hsp_hit-to>5442380</Hsp_hit-to>
604              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
605              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
606              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
607              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
608              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
609              <Hsp_qseq>TTCTTGTTGGATGGCATACTCCGGCAGCCA</Hsp_qseq>
610              <Hsp_hseq>TTCTTGTTGGATGGCATACTCCGGCAGCCA</Hsp_hseq>
611              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
612            </Hsp>
613          </Hit_hsps>
614        </Hit>
615      </Iteration_hits>
616      <Iteration_stat>
617        <Statistics>
618          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
619          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
620          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
621          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
622          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
623          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
624          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
625        </Statistics>
626      </Iteration_stat>
627    </Iteration>
628    <Iteration>
629      <Iteration_iter-num>15</Iteration_iter-num>
630      <Iteration_query-ID>lcl|15_0</Iteration_query-ID>
631      <Iteration_query-def>14_0.666667</Iteration_query-def>
632      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
633      <Iteration_hits>
634        <Hit>
635          <Hit_num>1</Hit_num>
636          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
637          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
638          <Hit_accession>0</Hit_accession>
639          <Hit_len>5528445</Hit_len>
640          <Hit_hsps>
641            <Hsp>
642              <Hsp_num>1</Hsp_num>
643              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
644              <Hsp_score>30</Hsp_score>
645              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
646              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
647              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
648              <Hsp_hit-from>4626492</Hsp_hit-from>
649              <Hsp_hit-to>4626521</Hsp_hit-to>
650              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
651              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
652              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
653              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
654              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
655              <Hsp_qseq>ACCCCGATATCGTCGCAGGCGTTGCCGCAC</Hsp_qseq>
656              <Hsp_hseq>ACCCCGATATCGTCGCAGGCGTTGCCGCAC</Hsp_hseq>
657              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
658            </Hsp>
659          </Hit_hsps>
660        </Hit>
661      </Iteration_hits>
662      <Iteration_stat>
663        <Statistics>
664          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
665          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
666          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
667          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
668          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
669          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
670          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
671        </Statistics>
672      </Iteration_stat>
673    </Iteration>
674    <Iteration>
675      <Iteration_iter-num>16</Iteration_iter-num>
676      <Iteration_query-ID>lcl|16_0</Iteration_query-ID>
677      <Iteration_query-def>15_0.666667</Iteration_query-def>
678      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
679      <Iteration_hits>
680        <Hit>
681          <Hit_num>1</Hit_num>
682          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
683          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
684          <Hit_accession>0</Hit_accession>
685          <Hit_len>5528445</Hit_len>
686          <Hit_hsps>
687            <Hsp>
688              <Hsp_num>1</Hsp_num>
689              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
690              <Hsp_score>30</Hsp_score>
691              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
692              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
693              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
694              <Hsp_hit-from>346897</Hsp_hit-from>
695              <Hsp_hit-to>346926</Hsp_hit-to>
696              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
697              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
698              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
699              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
700              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
701              <Hsp_qseq>GGCTGCTGTCTCCGCTGGAAGAGGCGCTTC</Hsp_qseq>
702              <Hsp_hseq>GGCTGCTGTCTCCGCTGGAAGAGGCGCTTC</Hsp_hseq>
703              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
704            </Hsp>
705            <Hsp>
706              <Hsp_num>2</Hsp_num>
707              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
708              <Hsp_score>30</Hsp_score>
709              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
710              <Hsp_query-from>30</Hsp_query-from>
711              <Hsp_query-to>1</Hsp_query-to>
712              <Hsp_hit-from>1466536</Hsp_hit-from>
713              <Hsp_hit-to>1466565</Hsp_hit-to>
714              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
715              <Hsp_hit-frame>-1</Hsp_hit-frame>
716              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
717              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
718              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
719              <Hsp_qseq>GAAGCGCCTCTTCCAGCGGAGACAGCAGCC</Hsp_qseq>
720              <Hsp_hseq>GAAGCGCCTCTTCCAGCGGAGACAGCAGCC</Hsp_hseq>
721              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
722            </Hsp>
723            <Hsp>
724              <Hsp_num>3</Hsp_num>
725              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
726              <Hsp_score>30</Hsp_score>
727              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
728              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
729              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
730              <Hsp_hit-from>1750132</Hsp_hit-from>
731              <Hsp_hit-to>1750161</Hsp_hit-to>
732              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
733              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
734              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
735              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
736              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
737              <Hsp_qseq>GGCTGCTGTCTCCGCTGGAAGAGGCGCTTC</Hsp_qseq>
738              <Hsp_hseq>GGCTGCTGTCTCCGCTGGAAGAGGCGCTTC</Hsp_hseq>
739              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
740            </Hsp>
741            <Hsp>
742              <Hsp_num>4</Hsp_num>
743              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
744              <Hsp_score>30</Hsp_score>
745              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
746              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
747              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
748              <Hsp_hit-from>1908046</Hsp_hit-from>
749              <Hsp_hit-to>1908075</Hsp_hit-to>
750              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
751              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
752              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
753              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
754              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
755              <Hsp_qseq>GGCTGCTGTCTCCGCTGGAAGAGGCGCTTC</Hsp_qseq>
756              <Hsp_hseq>GGCTGCTGTCTCCGCTGGAAGAGGCGCTTC</Hsp_hseq>
757              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
758            </Hsp>
759            <Hsp>
760              <Hsp_num>5</Hsp_num>
761              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
762              <Hsp_score>30</Hsp_score>
763              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
764              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
765              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
766              <Hsp_hit-from>2279107</Hsp_hit-from>
767              <Hsp_hit-to>2279136</Hsp_hit-to>
768              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
769              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
770              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
771              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
772              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
773              <Hsp_qseq>GGCTGCTGTCTCCGCTGGAAGAGGCGCTTC</Hsp_qseq>
774              <Hsp_hseq>GGCTGCTGTCTCCGCTGGAAGAGGCGCTTC</Hsp_hseq>
775              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
776            </Hsp>
777            <Hsp>
778              <Hsp_num>6</Hsp_num>
779              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
780              <Hsp_score>30</Hsp_score>
781              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
782              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
783              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
784              <Hsp_hit-from>2813407</Hsp_hit-from>
785              <Hsp_hit-to>2813436</Hsp_hit-to>
786              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
787              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
788              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
789              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
790              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
791              <Hsp_qseq>GGCTGCTGTCTCCGCTGGAAGAGGCGCTTC</Hsp_qseq>
792              <Hsp_hseq>GGCTGCTGTCTCCGCTGGAAGAGGCGCTTC</Hsp_hseq>
793              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
794            </Hsp>
795            <Hsp>
796              <Hsp_num>7</Hsp_num>
797              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
798              <Hsp_score>30</Hsp_score>
799              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
800              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
801              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
802              <Hsp_hit-from>3939162</Hsp_hit-from>
803              <Hsp_hit-to>3939191</Hsp_hit-to>
804              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
805              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
806              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
807              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
808              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
809              <Hsp_qseq>GGCTGCTGTCTCCGCTGGAAGAGGCGCTTC</Hsp_qseq>
810              <Hsp_hseq>GGCTGCTGTCTCCGCTGGAAGAGGCGCTTC</Hsp_hseq>
811              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
812            </Hsp>
813            <Hsp>
814              <Hsp_num>8</Hsp_num>
815              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
816              <Hsp_score>30</Hsp_score>
817              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
818              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
819              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
820              <Hsp_hit-from>4656510</Hsp_hit-from>
821              <Hsp_hit-to>4656539</Hsp_hit-to>
822              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
823              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
824              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
825              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
826              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
827              <Hsp_qseq>GGCTGCTGTCTCCGCTGGAAGAGGCGCTTC</Hsp_qseq>
828              <Hsp_hseq>GGCTGCTGTCTCCGCTGGAAGAGGCGCTTC</Hsp_hseq>
829              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
830            </Hsp>
831          </Hit_hsps>
832        </Hit>
833      </Iteration_hits>
834      <Iteration_stat>
835        <Statistics>
836          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
837          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
838          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
839          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
840          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
841          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
842          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
843        </Statistics>
844      </Iteration_stat>
845    </Iteration>
846    <Iteration>
847      <Iteration_iter-num>17</Iteration_iter-num>
848      <Iteration_query-ID>lcl|17_0</Iteration_query-ID>
849      <Iteration_query-def>16_0.566667</Iteration_query-def>
850      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
851      <Iteration_hits>
852        <Hit>
853          <Hit_num>1</Hit_num>
854          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
855          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
856          <Hit_accession>0</Hit_accession>
857          <Hit_len>5528445</Hit_len>
858          <Hit_hsps>
859            <Hsp>
860              <Hsp_num>1</Hsp_num>
861              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
862              <Hsp_score>30</Hsp_score>
863              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
864              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
865              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
866              <Hsp_hit-from>2595157</Hsp_hit-from>
867              <Hsp_hit-to>2595186</Hsp_hit-to>
868              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
869              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
870              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
871              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
872              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
873              <Hsp_qseq>ATGTCCTGATCGAGCGGCGTTTTACCGACC</Hsp_qseq>
874              <Hsp_hseq>ATGTCCTGATCGAGCGGCGTTTTACCGACC</Hsp_hseq>
875              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
876            </Hsp>
877          </Hit_hsps>
878        </Hit>
879      </Iteration_hits>
880      <Iteration_stat>
881        <Statistics>
882          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
883          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
884          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
885          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
886          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
887          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
888          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
889        </Statistics>
890      </Iteration_stat>
891    </Iteration>
892    <Iteration>
893      <Iteration_iter-num>18</Iteration_iter-num>
894      <Iteration_query-ID>lcl|18_0</Iteration_query-ID>
895      <Iteration_query-def>17_0.533333</Iteration_query-def>
896      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
897      <Iteration_hits>
898        <Hit>
899          <Hit_num>1</Hit_num>
900          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
901          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
902          <Hit_accession>0</Hit_accession>
903          <Hit_len>5528445</Hit_len>
904          <Hit_hsps>
905            <Hsp>
906              <Hsp_num>1</Hsp_num>
907              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
908              <Hsp_score>30</Hsp_score>
909              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
910              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
911              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
912              <Hsp_hit-from>717743</Hsp_hit-from>
913              <Hsp_hit-to>717772</Hsp_hit-to>
914              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
915              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
916              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
917              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
918              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
919              <Hsp_qseq>GGTGTTGAGTGTCCAGGTAATACGCTCTCG</Hsp_qseq>
920              <Hsp_hseq>GGTGTTGAGTGTCCAGGTAATACGCTCTCG</Hsp_hseq>
921              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
922            </Hsp>
923          </Hit_hsps>
924        </Hit>
925      </Iteration_hits>
926      <Iteration_stat>
927        <Statistics>
928          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
929          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
930          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
931          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
932          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
933          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
934          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
935        </Statistics>
936      </Iteration_stat>
937    </Iteration>
938    <Iteration>
939      <Iteration_iter-num>20</Iteration_iter-num>
940      <Iteration_query-ID>lcl|20_0</Iteration_query-ID>
941      <Iteration_query-def>19_0.566667</Iteration_query-def>
942      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
943      <Iteration_hits>
944        <Hit>
945          <Hit_num>1</Hit_num>
946          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
947          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
948          <Hit_accession>0</Hit_accession>
949          <Hit_len>5528445</Hit_len>
950          <Hit_hsps>
951            <Hsp>
952              <Hsp_num>1</Hsp_num>
953              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
954              <Hsp_score>30</Hsp_score>
955              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
956              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
957              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
958              <Hsp_hit-from>1237938</Hsp_hit-from>
959              <Hsp_hit-to>1237967</Hsp_hit-to>
960              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
961              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
962              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
963              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
964              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
965              <Hsp_qseq>GTTGTAAGCGTCAGAACCGATGCGGTCGGT</Hsp_qseq>
966              <Hsp_hseq>GTTGTAAGCGTCAGAACCGATGCGGTCGGT</Hsp_hseq>
967              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
968            </Hsp>
969          </Hit_hsps>
970        </Hit>
971      </Iteration_hits>
972      <Iteration_stat>
973        <Statistics>
974          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
975          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
976          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
977          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
978          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
979          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
980          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
981        </Statistics>
982      </Iteration_stat>
983    </Iteration>
984    <Iteration>
985      <Iteration_iter-num>21</Iteration_iter-num>
986      <Iteration_query-ID>lcl|21_0</Iteration_query-ID>
987      <Iteration_query-def>20_0.566667</Iteration_query-def>
988      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
989      <Iteration_hits>
990        <Hit>
991          <Hit_num>1</Hit_num>
992          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
993          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
994          <Hit_accession>0</Hit_accession>
995          <Hit_len>5528445</Hit_len>
996          <Hit_hsps>
997            <Hsp>
998              <Hsp_num>1</Hsp_num>
999              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
1000              <Hsp_score>30</Hsp_score>
1001              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
1002              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
1003              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
1004              <Hsp_hit-from>4792054</Hsp_hit-from>
1005              <Hsp_hit-to>4792083</Hsp_hit-to>
1006              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
1007              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
1008              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
1009              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
1010              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
1011              <Hsp_qseq>CGACATCCTGTAGGCTGGCTTCAATGCGAC</Hsp_qseq>
1012              <Hsp_hseq>CGACATCCTGTAGGCTGGCTTCAATGCGAC</Hsp_hseq>
1013              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
1014            </Hsp>
1015          </Hit_hsps>
1016        </Hit>
1017      </Iteration_hits>
1018      <Iteration_stat>
1019        <Statistics>
1020          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
1021          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
1022          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
1023          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
1024          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
1025          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
1026          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
1027        </Statistics>
1028      </Iteration_stat>
1029    </Iteration>
1030    <Iteration>
1031      <Iteration_iter-num>22</Iteration_iter-num>
1032      <Iteration_query-ID>lcl|22_0</Iteration_query-ID>
1033      <Iteration_query-def>21_0.733333</Iteration_query-def>
1034      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
1035      <Iteration_hits>
1036        <Hit>
1037          <Hit_num>1</Hit_num>
1038          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
1039          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
1040          <Hit_accession>0</Hit_accession>
1041          <Hit_len>5528445</Hit_len>
1042          <Hit_hsps>
1043            <Hsp>
1044              <Hsp_num>1</Hsp_num>
1045              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
1046              <Hsp_score>30</Hsp_score>
1047              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
1048              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
1049              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
1050              <Hsp_hit-from>269757</Hsp_hit-from>
1051              <Hsp_hit-to>269786</Hsp_hit-to>
1052              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
1053              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
1054              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
1055              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
1056              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
1057              <Hsp_qseq>GGGAAGGCTGACGGGCGTCCACACCACGGC</Hsp_qseq>
1058              <Hsp_hseq>GGGAAGGCTGACGGGCGTCCACACCACGGC</Hsp_hseq>
1059              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
1060            </Hsp>
1061            <Hsp>
1062              <Hsp_num>2</Hsp_num>
1063              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
1064              <Hsp_score>30</Hsp_score>
1065              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
1066              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
1067              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
1068              <Hsp_hit-from>274007</Hsp_hit-from>
1069              <Hsp_hit-to>274036</Hsp_hit-to>
1070              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
1071              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
1072              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
1073              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
1074              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
1075              <Hsp_qseq>GGGAAGGCTGACGGGCGTCCACACCACGGC</Hsp_qseq>
1076              <Hsp_hseq>GGGAAGGCTGACGGGCGTCCACACCACGGC</Hsp_hseq>
1077              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
1078            </Hsp>
1079          </Hit_hsps>
1080        </Hit>
1081      </Iteration_hits>
1082      <Iteration_stat>
1083        <Statistics>
1084          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
1085          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
1086          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
1087          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
1088          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
1089          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
1090          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
1091        </Statistics>
1092      </Iteration_stat>
1093    </Iteration>
1094    <Iteration>
1095      <Iteration_iter-num>23</Iteration_iter-num>
1096      <Iteration_query-ID>lcl|23_0</Iteration_query-ID>
1097      <Iteration_query-def>22_0.566667</Iteration_query-def>
1098      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
1099      <Iteration_hits>
1100        <Hit>
1101          <Hit_num>1</Hit_num>
1102          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
1103          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
1104          <Hit_accession>0</Hit_accession>
1105          <Hit_len>5528445</Hit_len>
1106          <Hit_hsps>
1107            <Hsp>
1108              <Hsp_num>1</Hsp_num>
1109              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
1110              <Hsp_score>30</Hsp_score>
1111              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
1112              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
1113              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
1114              <Hsp_hit-from>2706426</Hsp_hit-from>
1115              <Hsp_hit-to>2706455</Hsp_hit-to>
1116              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
1117              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
1118              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
1119              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
1120              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
1121              <Hsp_qseq>CGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGCCTG</Hsp_qseq>
1122              <Hsp_hseq>CGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGCCTG</Hsp_hseq>
1123              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
1124            </Hsp>
1125          </Hit_hsps>
1126        </Hit>
1127      </Iteration_hits>
1128      <Iteration_stat>
1129        <Statistics>
1130          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
1131          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
1132          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
1133          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
1134          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
1135          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
1136          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
1137        </Statistics>
1138      </Iteration_stat>
1139    </Iteration>
1140    <Iteration>
1141      <Iteration_iter-num>24</Iteration_iter-num>
1142      <Iteration_query-ID>lcl|24_0</Iteration_query-ID>
1143      <Iteration_query-def>23_0.600000</Iteration_query-def>
1144      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
1145      <Iteration_hits>
1146        <Hit>
1147          <Hit_num>1</Hit_num>
1148          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
1149          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
1150          <Hit_accession>0</Hit_accession>
1151          <Hit_len>5528445</Hit_len>
1152          <Hit_hsps>
1153            <Hsp>
1154              <Hsp_num>1</Hsp_num>
1155              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
1156              <Hsp_score>30</Hsp_score>
1157              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
1158              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
1159              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
1160              <Hsp_hit-from>1512107</Hsp_hit-from>
1161              <Hsp_hit-to>1512136</Hsp_hit-to>
1162              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
1163              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
1164              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
1165              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
1166              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
1167              <Hsp_qseq>TTGCCGTTACGCACCACGCCTTCAGTAGCG</Hsp_qseq>
1168              <Hsp_hseq>TTGCCGTTACGCACCACGCCTTCAGTAGCG</Hsp_hseq>
1169              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
1170            </Hsp>
1171          </Hit_hsps>
1172        </Hit>
1173      </Iteration_hits>
1174      <Iteration_stat>
1175        <Statistics>
1176          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
1177          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
1178          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
1179          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
1180          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
1181          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
1182          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
1183        </Statistics>
1184      </Iteration_stat>
1185    </Iteration>
1186    <Iteration>
1187      <Iteration_iter-num>25</Iteration_iter-num>
1188      <Iteration_query-ID>lcl|25_0</Iteration_query-ID>
1189      <Iteration_query-def>24_0.733333</Iteration_query-def>
1190      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
1191      <Iteration_hits>
1192        <Hit>
1193          <Hit_num>1</Hit_num>
1194          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
1195          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
1196          <Hit_accession>0</Hit_accession>
1197          <Hit_len>5528445</Hit_len>
1198          <Hit_hsps>
1199            <Hsp>
1200              <Hsp_num>1</Hsp_num>
1201              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
1202              <Hsp_score>30</Hsp_score>
1203              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
1204              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
1205              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
1206              <Hsp_hit-from>2032108</Hsp_hit-from>
1207              <Hsp_hit-to>2032137</Hsp_hit-to>
1208              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
1209              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
1210              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
1211              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
1212              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
1213              <Hsp_qseq>CGCGGGCGCACCACGTCGCTGCTGCTGTTC</Hsp_qseq>
1214              <Hsp_hseq>CGCGGGCGCACCACGTCGCTGCTGCTGTTC</Hsp_hseq>
1215              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
1216            </Hsp>
1217          </Hit_hsps>
1218        </Hit>
1219      </Iteration_hits>
1220      <Iteration_stat>
1221        <Statistics>
1222          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
1223          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
1224          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
1225          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
1226          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
1227          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
1228          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
1229        </Statistics>
1230      </Iteration_stat>
1231    </Iteration>
1232    <Iteration>
1233      <Iteration_iter-num>26</Iteration_iter-num>
1234      <Iteration_query-ID>lcl|26_0</Iteration_query-ID>
1235      <Iteration_query-def>25_0.266667</Iteration_query-def>
1236      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
1237      <Iteration_hits>
1238        <Hit>
1239          <Hit_num>1</Hit_num>
1240          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
1241          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
1242          <Hit_accession>0</Hit_accession>
1243          <Hit_len>5528445</Hit_len>
1244          <Hit_hsps>
1245            <Hsp>
1246              <Hsp_num>1</Hsp_num>
1247              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
1248              <Hsp_score>30</Hsp_score>
1249              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
1250              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
1251              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
1252              <Hsp_hit-from>1343811</Hsp_hit-from>
1253              <Hsp_hit-to>1343840</Hsp_hit-to>
1254              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
1255              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
1256              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
1257              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
1258              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
1259              <Hsp_qseq>TTTTGGGAAAACTAAATACGCATCAAAAAT</Hsp_qseq>
1260              <Hsp_hseq>TTTTGGGAAAACTAAATACGCATCAAAAAT</Hsp_hseq>
1261              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
1262            </Hsp>
1263          </Hit_hsps>
1264        </Hit>
1265      </Iteration_hits>
1266      <Iteration_stat>
1267        <Statistics>
1268          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
1269          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
1270          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
1271          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
1272          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
1273          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
1274          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
1275        </Statistics>
1276      </Iteration_stat>
1277    </Iteration>
1278    <Iteration>
1279      <Iteration_iter-num>27</Iteration_iter-num>
1280      <Iteration_query-ID>lcl|27_0</Iteration_query-ID>
1281      <Iteration_query-def>26_0.566667</Iteration_query-def>
1282      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
1283      <Iteration_hits>
1284        <Hit>
1285          <Hit_num>1</Hit_num>
1286          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
1287          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
1288          <Hit_accession>0</Hit_accession>
1289          <Hit_len>5528445</Hit_len>
1290          <Hit_hsps>
1291            <Hsp>
1292              <Hsp_num>1</Hsp_num>
1293              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
1294              <Hsp_score>30</Hsp_score>
1295              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
1296              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
1297              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
1298              <Hsp_hit-from>3112551</Hsp_hit-from>
1299              <Hsp_hit-to>3112580</Hsp_hit-to>
1300              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
1301              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
1302              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
1303              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
1304              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
1305              <Hsp_qseq>CAACGAGGCGCTACCGAGTTGTTCAATGCG</Hsp_qseq>
1306              <Hsp_hseq>CAACGAGGCGCTACCGAGTTGTTCAATGCG</Hsp_hseq>
1307              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
1308            </Hsp>
1309          </Hit_hsps>
1310        </Hit>
1311      </Iteration_hits>
1312      <Iteration_stat>
1313        <Statistics>
1314          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
1315          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
1316          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
1317          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
1318          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
1319          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
1320          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
1321        </Statistics>
1322      </Iteration_stat>
1323    </Iteration>
1324    <Iteration>
1325      <Iteration_iter-num>29</Iteration_iter-num>
1326      <Iteration_query-ID>lcl|29_0</Iteration_query-ID>
1327      <Iteration_query-def>28_0.666667</Iteration_query-def>
1328      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
1329      <Iteration_hits>
1330        <Hit>
1331          <Hit_num>1</Hit_num>
1332          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
1333          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
1334          <Hit_accession>0</Hit_accession>
1335          <Hit_len>5528445</Hit_len>
1336          <Hit_hsps>
1337            <Hsp>
1338              <Hsp_num>1</Hsp_num>
1339              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
1340              <Hsp_score>30</Hsp_score>
1341              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
1342              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
1343              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
1344              <Hsp_hit-from>4405442</Hsp_hit-from>
1345              <Hsp_hit-to>4405471</Hsp_hit-to>
1346              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
1347              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
1348              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
1349              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
1350              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
1351              <Hsp_qseq>CGCTCAATCTGCTCGCGCCTGGCTGGCGTT</Hsp_qseq>
1352              <Hsp_hseq>CGCTCAATCTGCTCGCGCCTGGCTGGCGTT</Hsp_hseq>
1353              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
1354            </Hsp>
1355          </Hit_hsps>
1356        </Hit>
1357      </Iteration_hits>
1358      <Iteration_stat>
1359        <Statistics>
1360          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
1361          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
1362          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
1363          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
1364          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
1365          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
1366          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
1367        </Statistics>
1368      </Iteration_stat>
1369    </Iteration>
1370    <Iteration>
1371      <Iteration_iter-num>30</Iteration_iter-num>
1372      <Iteration_query-ID>lcl|30_0</Iteration_query-ID>
1373      <Iteration_query-def>29_0.700000</Iteration_query-def>
1374      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
1375      <Iteration_hits>
1376        <Hit>
1377          <Hit_num>1</Hit_num>
1378          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
1379          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
1380          <Hit_accession>0</Hit_accession>
1381          <Hit_len>5528445</Hit_len>
1382          <Hit_hsps>
1383            <Hsp>
1384              <Hsp_num>1</Hsp_num>
1385              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
1386              <Hsp_score>30</Hsp_score>
1387              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
1388              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
1389              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
1390              <Hsp_hit-from>3600547</Hsp_hit-from>
1391              <Hsp_hit-to>3600576</Hsp_hit-to>
1392              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
1393              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
1394              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
1395              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
1396              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
1397              <Hsp_qseq>CTCGTCCGGCGGGCGGTTTTGCCGACAAGG</Hsp_qseq>
1398              <Hsp_hseq>CTCGTCCGGCGGGCGGTTTTGCCGACAAGG</Hsp_hseq>
1399              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
1400            </Hsp>
1401          </Hit_hsps>
1402        </Hit>
1403      </Iteration_hits>
1404      <Iteration_stat>
1405        <Statistics>
1406          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
1407          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
1408          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
1409          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
1410          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
1411          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
1412          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
1413        </Statistics>
1414      </Iteration_stat>
1415    </Iteration>
1416    <Iteration>
1417      <Iteration_iter-num>33</Iteration_iter-num>
1418      <Iteration_query-ID>lcl|33_0</Iteration_query-ID>
1419      <Iteration_query-def>32_0.600000</Iteration_query-def>
1420      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
1421      <Iteration_hits>
1422        <Hit>
1423          <Hit_num>1</Hit_num>
1424          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
1425          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
1426          <Hit_accession>0</Hit_accession>
1427          <Hit_len>5528445</Hit_len>
1428          <Hit_hsps>
1429            <Hsp>
1430              <Hsp_num>1</Hsp_num>
1431              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
1432              <Hsp_score>30</Hsp_score>
1433              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
1434              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
1435              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
1436              <Hsp_hit-from>1435670</Hsp_hit-from>
1437              <Hsp_hit-to>1435699</Hsp_hit-to>
1438              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
1439              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
1440              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
1441              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
1442              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
1443              <Hsp_qseq>TGAGGATGGTCCTCTGACTCTGCAGGCGCA</Hsp_qseq>
1444              <Hsp_hseq>TGAGGATGGTCCTCTGACTCTGCAGGCGCA</Hsp_hseq>
1445              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
1446            </Hsp>
1447          </Hit_hsps>
1448        </Hit>
1449      </Iteration_hits>
1450      <Iteration_stat>
1451        <Statistics>
1452          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
1453          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
1454          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
1455          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
1456          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
1457          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
1458          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
1459        </Statistics>
1460      </Iteration_stat>
1461    </Iteration>
1462    <Iteration>
1463      <Iteration_iter-num>34</Iteration_iter-num>
1464      <Iteration_query-ID>lcl|34_0</Iteration_query-ID>
1465      <Iteration_query-def>33_0.300000</Iteration_query-def>
1466      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
1467      <Iteration_hits>
1468        <Hit>
1469          <Hit_num>1</Hit_num>
1470          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
1471          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
1472          <Hit_accession>0</Hit_accession>
1473          <Hit_len>5528445</Hit_len>
1474          <Hit_hsps>
1475            <Hsp>
1476              <Hsp_num>1</Hsp_num>
1477              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
1478              <Hsp_score>30</Hsp_score>
1479              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
1480              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
1481              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
1482              <Hsp_hit-from>3788178</Hsp_hit-from>
1483              <Hsp_hit-to>3788207</Hsp_hit-to>
1484              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
1485              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
1486              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
1487              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
1488              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
1489              <Hsp_qseq>TAGTAACCCTTTAATAAGATTGTCGATTAG</Hsp_qseq>
1490              <Hsp_hseq>TAGTAACCCTTTAATAAGATTGTCGATTAG</Hsp_hseq>
1491              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
1492            </Hsp>
1493          </Hit_hsps>
1494        </Hit>
1495      </Iteration_hits>
1496      <Iteration_stat>
1497        <Statistics>
1498          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
1499          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
1500          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
1501          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
1502          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
1503          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
1504          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
1505        </Statistics>
1506      </Iteration_stat>
1507    </Iteration>
1508    <Iteration>
1509      <Iteration_iter-num>35</Iteration_iter-num>
1510      <Iteration_query-ID>lcl|35_0</Iteration_query-ID>
1511      <Iteration_query-def>34_0.533333</Iteration_query-def>
1512      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
1513      <Iteration_hits>
1514        <Hit>
1515          <Hit_num>1</Hit_num>
1516          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
1517          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
1518          <Hit_accession>0</Hit_accession>
1519          <Hit_len>5528445</Hit_len>
1520          <Hit_hsps>
1521            <Hsp>
1522              <Hsp_num>1</Hsp_num>
1523              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
1524              <Hsp_score>30</Hsp_score>
1525              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
1526              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
1527              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
1528              <Hsp_hit-from>484499</Hsp_hit-from>
1529              <Hsp_hit-to>484528</Hsp_hit-to>
1530              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
1531              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
1532              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
1533              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
1534              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
1535              <Hsp_qseq>TGATGTTAAATGCATGGCACCTGCCGGTGC</Hsp_qseq>
1536              <Hsp_hseq>TGATGTTAAATGCATGGCACCTGCCGGTGC</Hsp_hseq>
1537              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
1538            </Hsp>
1539          </Hit_hsps>
1540        </Hit>
1541      </Iteration_hits>
1542      <Iteration_stat>
1543        <Statistics>
1544          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
1545          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
1546          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
1547          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
1548          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
1549          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
1550          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
1551        </Statistics>
1552      </Iteration_stat>
1553    </Iteration>
1554    <Iteration>
1555      <Iteration_iter-num>36</Iteration_iter-num>
1556      <Iteration_query-ID>lcl|36_0</Iteration_query-ID>
1557      <Iteration_query-def>35_0.466667</Iteration_query-def>
1558      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
1559      <Iteration_hits>
1560        <Hit>
1561          <Hit_num>1</Hit_num>
1562          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
1563          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
1564          <Hit_accession>0</Hit_accession>
1565          <Hit_len>5528445</Hit_len>
1566          <Hit_hsps>
1567            <Hsp>
1568              <Hsp_num>1</Hsp_num>
1569              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
1570              <Hsp_score>30</Hsp_score>
1571              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
1572              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
1573              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
1574              <Hsp_hit-from>2250064</Hsp_hit-from>
1575              <Hsp_hit-to>2250093</Hsp_hit-to>
1576              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
1577              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
1578              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
1579              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
1580              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
1581              <Hsp_qseq>ACTGCTTTGCCGAGATATTCGAGGTTAACC</Hsp_qseq>
1582              <Hsp_hseq>ACTGCTTTGCCGAGATATTCGAGGTTAACC</Hsp_hseq>
1583              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
1584            </Hsp>
1585          </Hit_hsps>
1586        </Hit>
1587      </Iteration_hits>
1588      <Iteration_stat>
1589        <Statistics>
1590          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
1591          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
1592          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
1593          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
1594          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
1595          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
1596          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
1597        </Statistics>
1598      </Iteration_stat>
1599    </Iteration>
1600    <Iteration>
1601      <Iteration_iter-num>37</Iteration_iter-num>
1602      <Iteration_query-ID>lcl|37_0</Iteration_query-ID>
1603      <Iteration_query-def>36_0.433333</Iteration_query-def>
1604      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
1605      <Iteration_hits>
1606        <Hit>
1607          <Hit_num>1</Hit_num>
1608          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
1609          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
1610          <Hit_accession>0</Hit_accession>
1611          <Hit_len>5528445</Hit_len>
1612          <Hit_hsps>
1613            <Hsp>
1614              <Hsp_num>1</Hsp_num>
1615              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
1616              <Hsp_score>30</Hsp_score>
1617              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
1618              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
1619              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
1620              <Hsp_hit-from>3698178</Hsp_hit-from>
1621              <Hsp_hit-to>3698207</Hsp_hit-to>
1622              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
1623              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
1624              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
1625              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
1626              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
1627              <Hsp_qseq>TGTTGGCAACATGGCGAGCGTAATCAATTA</Hsp_qseq>
1628              <Hsp_hseq>TGTTGGCAACATGGCGAGCGTAATCAATTA</Hsp_hseq>
1629              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
1630            </Hsp>
1631          </Hit_hsps>
1632        </Hit>
1633      </Iteration_hits>
1634      <Iteration_stat>
1635        <Statistics>
1636          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
1637          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
1638          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
1639          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
1640          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
1641          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
1642          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
1643        </Statistics>
1644      </Iteration_stat>
1645    </Iteration>
1646    <Iteration>
1647      <Iteration_iter-num>39</Iteration_iter-num>
1648      <Iteration_query-ID>lcl|39_0</Iteration_query-ID>
1649      <Iteration_query-def>38_0.533333</Iteration_query-def>
1650      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
1651      <Iteration_hits>
1652        <Hit>
1653          <Hit_num>1</Hit_num>
1654          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
1655          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
1656          <Hit_accession>0</Hit_accession>
1657          <Hit_len>5528445</Hit_len>
1658          <Hit_hsps>
1659            <Hsp>
1660              <Hsp_num>1</Hsp_num>
1661              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
1662              <Hsp_score>30</Hsp_score>
1663              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
1664              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
1665              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
1666              <Hsp_hit-from>4242501</Hsp_hit-from>
1667              <Hsp_hit-to>4242530</Hsp_hit-to>
1668              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
1669              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
1670              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
1671              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
1672              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
1673              <Hsp_qseq>GCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCT</Hsp_qseq>
1674              <Hsp_hseq>GCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCT</Hsp_hseq>
1675              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
1676            </Hsp>
1677          </Hit_hsps>
1678        </Hit>
1679      </Iteration_hits>
1680      <Iteration_stat>
1681        <Statistics>
1682          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
1683          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
1684          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
1685          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
1686          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
1687          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
1688          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
1689        </Statistics>
1690      </Iteration_stat>
1691    </Iteration>
1692    <Iteration>
1693      <Iteration_iter-num>40</Iteration_iter-num>
1694      <Iteration_query-ID>lcl|40_0</Iteration_query-ID>
1695      <Iteration_query-def>39_0.400000</Iteration_query-def>
1696      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
1697      <Iteration_hits>
1698        <Hit>
1699          <Hit_num>1</Hit_num>
1700          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
1701          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
1702          <Hit_accession>0</Hit_accession>
1703          <Hit_len>5528445</Hit_len>
1704          <Hit_hsps>
1705            <Hsp>
1706              <Hsp_num>1</Hsp_num>
1707              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
1708              <Hsp_score>30</Hsp_score>
1709              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
1710              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
1711              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
1712              <Hsp_hit-from>3683151</Hsp_hit-from>
1713              <Hsp_hit-to>3683180</Hsp_hit-to>
1714              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
1715              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
1716              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
1717              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
1718              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
1719              <Hsp_qseq>TAATGCGGCATTCTCCTGATTTATTGTCAC</Hsp_qseq>
1720              <Hsp_hseq>TAATGCGGCATTCTCCTGATTTATTGTCAC</Hsp_hseq>
1721              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
1722            </Hsp>
1723          </Hit_hsps>
1724        </Hit>
1725      </Iteration_hits>
1726      <Iteration_stat>
1727        <Statistics>
1728          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
1729          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
1730          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
1731          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
1732          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
1733          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
1734          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
1735        </Statistics>
1736      </Iteration_stat>
1737    </Iteration>
1738    <Iteration>
1739      <Iteration_iter-num>42</Iteration_iter-num>
1740      <Iteration_query-ID>lcl|42_0</Iteration_query-ID>
1741      <Iteration_query-def>41_0.566667</Iteration_query-def>
1742      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
1743      <Iteration_hits>
1744        <Hit>
1745          <Hit_num>1</Hit_num>
1746          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
1747          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
1748          <Hit_accession>0</Hit_accession>
1749          <Hit_len>5528445</Hit_len>
1750          <Hit_hsps>
1751            <Hsp>
1752              <Hsp_num>1</Hsp_num>
1753              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
1754              <Hsp_score>30</Hsp_score>
1755              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
1756              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
1757              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
1758              <Hsp_hit-from>789086</Hsp_hit-from>
1759              <Hsp_hit-to>789115</Hsp_hit-to>
1760              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
1761              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
1762              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
1763              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
1764              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
1765              <Hsp_qseq>AGCTGACGGTCAGCAGGGATACTTCCTGCA</Hsp_qseq>
1766              <Hsp_hseq>AGCTGACGGTCAGCAGGGATACTTCCTGCA</Hsp_hseq>
1767              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
1768            </Hsp>
1769          </Hit_hsps>
1770        </Hit>
1771      </Iteration_hits>
1772      <Iteration_stat>
1773        <Statistics>
1774          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
1775          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
1776          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
1777          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
1778          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
1779          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
1780          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
1781        </Statistics>
1782      </Iteration_stat>
1783    </Iteration>
1784    <Iteration>
1785      <Iteration_iter-num>43</Iteration_iter-num>
1786      <Iteration_query-ID>lcl|43_0</Iteration_query-ID>
1787      <Iteration_query-def>42_0.566667</Iteration_query-def>
1788      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
1789      <Iteration_hits>
1790        <Hit>
1791          <Hit_num>1</Hit_num>
1792          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
1793          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
1794          <Hit_accession>0</Hit_accession>
1795          <Hit_len>5528445</Hit_len>
1796          <Hit_hsps>
1797            <Hsp>
1798              <Hsp_num>1</Hsp_num>
1799              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
1800              <Hsp_score>30</Hsp_score>
1801              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
1802              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
1803              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
1804              <Hsp_hit-from>1714771</Hsp_hit-from>
1805              <Hsp_hit-to>1714800</Hsp_hit-to>
1806              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
1807              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
1808              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
1809              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
1810              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
1811              <Hsp_qseq>GCAGTGACTACATCCGCGAGGTGAATGTGG</Hsp_qseq>
1812              <Hsp_hseq>GCAGTGACTACATCCGCGAGGTGAATGTGG</Hsp_hseq>
1813              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
1814            </Hsp>
1815          </Hit_hsps>
1816        </Hit>
1817      </Iteration_hits>
1818      <Iteration_stat>
1819        <Statistics>
1820          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
1821          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
1822          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
1823          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
1824          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
1825          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
1826          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
1827        </Statistics>
1828      </Iteration_stat>
1829    </Iteration>
1830    <Iteration>
1831      <Iteration_iter-num>44</Iteration_iter-num>
1832      <Iteration_query-ID>lcl|44_0</Iteration_query-ID>
1833      <Iteration_query-def>43_0.466667</Iteration_query-def>
1834      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
1835      <Iteration_hits>
1836        <Hit>
1837          <Hit_num>1</Hit_num>
1838          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
1839          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
1840          <Hit_accession>0</Hit_accession>
1841          <Hit_len>5528445</Hit_len>
1842          <Hit_hsps>
1843            <Hsp>
1844              <Hsp_num>1</Hsp_num>
1845              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
1846              <Hsp_score>30</Hsp_score>
1847              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
1848              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
1849              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
1850              <Hsp_hit-from>4272582</Hsp_hit-from>
1851              <Hsp_hit-to>4272611</Hsp_hit-to>
1852              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
1853              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
1854              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
1855              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
1856              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
1857              <Hsp_qseq>GCTTTTTCCAGCATCAACGCCACTGAACAA</Hsp_qseq>
1858              <Hsp_hseq>GCTTTTTCCAGCATCAACGCCACTGAACAA</Hsp_hseq>
1859              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
1860            </Hsp>
1861          </Hit_hsps>
1862        </Hit>
1863      </Iteration_hits>
1864      <Iteration_stat>
1865        <Statistics>
1866          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
1867          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
1868          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
1869          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
1870          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
1871          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
1872          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
1873        </Statistics>
1874      </Iteration_stat>
1875    </Iteration>
1876    <Iteration>
1877      <Iteration_iter-num>45</Iteration_iter-num>
1878      <Iteration_query-ID>lcl|45_0</Iteration_query-ID>
1879      <Iteration_query-def>44_0.433333</Iteration_query-def>
1880      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
1881      <Iteration_hits>
1882        <Hit>
1883          <Hit_num>1</Hit_num>
1884          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
1885          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
1886          <Hit_accession>0</Hit_accession>
1887          <Hit_len>5528445</Hit_len>
1888          <Hit_hsps>
1889            <Hsp>
1890              <Hsp_num>1</Hsp_num>
1891              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
1892              <Hsp_score>30</Hsp_score>
1893              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
1894              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
1895              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
1896              <Hsp_hit-from>5481023</Hsp_hit-from>
1897              <Hsp_hit-to>5481052</Hsp_hit-to>
1898              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
1899              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
1900              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
1901              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
1902              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
1903              <Hsp_qseq>AAAGTGGTAGATAACGTGGTGCAGACTATG</Hsp_qseq>
1904              <Hsp_hseq>AAAGTGGTAGATAACGTGGTGCAGACTATG</Hsp_hseq>
1905              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
1906            </Hsp>
1907          </Hit_hsps>
1908        </Hit>
1909      </Iteration_hits>
1910      <Iteration_stat>
1911        <Statistics>
1912          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
1913          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
1914          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
1915          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
1916          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
1917          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
1918          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
1919        </Statistics>
1920      </Iteration_stat>
1921    </Iteration>
1922    <Iteration>
1923      <Iteration_iter-num>46</Iteration_iter-num>
1924      <Iteration_query-ID>lcl|46_0</Iteration_query-ID>
1925      <Iteration_query-def>45_0.500000</Iteration_query-def>
1926      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
1927      <Iteration_hits>
1928        <Hit>
1929          <Hit_num>1</Hit_num>
1930          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
1931          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
1932          <Hit_accession>0</Hit_accession>
1933          <Hit_len>5528445</Hit_len>
1934          <Hit_hsps>
1935            <Hsp>
1936              <Hsp_num>1</Hsp_num>
1937              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
1938              <Hsp_score>30</Hsp_score>
1939              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
1940              <Hsp_query-from>30</Hsp_query-from>
1941              <Hsp_query-to>1</Hsp_query-to>
1942              <Hsp_hit-from>1271829</Hsp_hit-from>
1943              <Hsp_hit-to>1271858</Hsp_hit-to>
1944              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
1945              <Hsp_hit-frame>-1</Hsp_hit-frame>
1946              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
1947              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
1948              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
1949              <Hsp_qseq>ATCCGCGATAAGGTCATCCGGTATCAGGAA</Hsp_qseq>
1950              <Hsp_hseq>ATCCGCGATAAGGTCATCCGGTATCAGGAA</Hsp_hseq>
1951              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
1952            </Hsp>
1953            <Hsp>
1954              <Hsp_num>2</Hsp_num>
1955              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
1956              <Hsp_score>30</Hsp_score>
1957              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
1958              <Hsp_query-from>30</Hsp_query-from>
1959              <Hsp_query-to>1</Hsp_query-to>
1960              <Hsp_hit-from>1357952</Hsp_hit-from>
1961              <Hsp_hit-to>1357981</Hsp_hit-to>
1962              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
1963              <Hsp_hit-frame>-1</Hsp_hit-frame>
1964              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
1965              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
1966              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
1967              <Hsp_qseq>ATCCGCGATAAGGTCATCCGGTATCAGGAA</Hsp_qseq>
1968              <Hsp_hseq>ATCCGCGATAAGGTCATCCGGTATCAGGAA</Hsp_hseq>
1969              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
1970            </Hsp>
1971            <Hsp>
1972              <Hsp_num>3</Hsp_num>
1973              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
1974              <Hsp_score>30</Hsp_score>
1975              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
1976              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
1977              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
1978              <Hsp_hit-from>2310674</Hsp_hit-from>
1979              <Hsp_hit-to>2310703</Hsp_hit-to>
1980              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
1981              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
1982              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
1983              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
1984              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
1985              <Hsp_qseq>TTCCTGATACCGGATGACCTTATCGCGGAT</Hsp_qseq>
1986              <Hsp_hseq>TTCCTGATACCGGATGACCTTATCGCGGAT</Hsp_hseq>
1987              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
1988            </Hsp>
1989            <Hsp>
1990              <Hsp_num>4</Hsp_num>
1991              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
1992              <Hsp_score>30</Hsp_score>
1993              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
1994              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
1995              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
1996              <Hsp_hit-from>2769319</Hsp_hit-from>
1997              <Hsp_hit-to>2769348</Hsp_hit-to>
1998              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
1999              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
2000              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
2001              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
2002              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
2003              <Hsp_qseq>TTCCTGATACCGGATGACCTTATCGCGGAT</Hsp_qseq>
2004              <Hsp_hseq>TTCCTGATACCGGATGACCTTATCGCGGAT</Hsp_hseq>
2005              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
2006            </Hsp>
2007            <Hsp>
2008              <Hsp_num>5</Hsp_num>
2009              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
2010              <Hsp_score>30</Hsp_score>
2011              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
2012              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
2013              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
2014              <Hsp_hit-from>2991293</Hsp_hit-from>
2015              <Hsp_hit-to>2991322</Hsp_hit-to>
2016              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
2017              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
2018              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
2019              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
2020              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
2021              <Hsp_qseq>TTCCTGATACCGGATGACCTTATCGCGGAT</Hsp_qseq>
2022              <Hsp_hseq>TTCCTGATACCGGATGACCTTATCGCGGAT</Hsp_hseq>
2023              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
2024            </Hsp>
2025          </Hit_hsps>
2026        </Hit>
2027      </Iteration_hits>
2028      <Iteration_stat>
2029        <Statistics>
2030          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
2031          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
2032          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
2033          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
2034          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
2035          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
2036          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
2037        </Statistics>
2038      </Iteration_stat>
2039    </Iteration>
2040    <Iteration>
2041      <Iteration_iter-num>47</Iteration_iter-num>
2042      <Iteration_query-ID>lcl|47_0</Iteration_query-ID>
2043      <Iteration_query-def>46_0.466667</Iteration_query-def>
2044      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
2045      <Iteration_hits>
2046        <Hit>
2047          <Hit_num>1</Hit_num>
2048          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
2049          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
2050          <Hit_accession>0</Hit_accession>
2051          <Hit_len>5528445</Hit_len>
2052          <Hit_hsps>
2053            <Hsp>
2054              <Hsp_num>1</Hsp_num>
2055              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
2056              <Hsp_score>30</Hsp_score>
2057              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
2058              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
2059              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
2060              <Hsp_hit-from>1080570</Hsp_hit-from>
2061              <Hsp_hit-to>1080599</Hsp_hit-to>
2062              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
2063              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
2064              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
2065              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
2066              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
2067              <Hsp_qseq>ACCTGTACCCCAGGACCATGGTACATTTAT</Hsp_qseq>
2068              <Hsp_hseq>ACCTGTACCCCAGGACCATGGTACATTTAT</Hsp_hseq>
2069              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
2070            </Hsp>
2071            <Hsp>
2072              <Hsp_num>2</Hsp_num>
2073              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
2074              <Hsp_score>30</Hsp_score>
2075              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
2076              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
2077              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
2078              <Hsp_hit-from>1476177</Hsp_hit-from>
2079              <Hsp_hit-to>1476206</Hsp_hit-to>
2080              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
2081              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
2082              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
2083              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
2084              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
2085              <Hsp_qseq>ACCTGTACCCCAGGACCATGGTACATTTAT</Hsp_qseq>
2086              <Hsp_hseq>ACCTGTACCCCAGGACCATGGTACATTTAT</Hsp_hseq>
2087              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
2088            </Hsp>
2089          </Hit_hsps>
2090        </Hit>
2091      </Iteration_hits>
2092      <Iteration_stat>
2093        <Statistics>
2094          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
2095          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
2096          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
2097          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
2098          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
2099          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
2100          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
2101        </Statistics>
2102      </Iteration_stat>
2103    </Iteration>
2104    <Iteration>
2105      <Iteration_iter-num>48</Iteration_iter-num>
2106      <Iteration_query-ID>lcl|48_0</Iteration_query-ID>
2107      <Iteration_query-def>47_0.533333</Iteration_query-def>
2108      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
2109      <Iteration_hits>
2110        <Hit>
2111          <Hit_num>1</Hit_num>
2112          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
2113          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
2114          <Hit_accession>0</Hit_accession>
2115          <Hit_len>5528445</Hit_len>
2116          <Hit_hsps>
2117            <Hsp>
2118              <Hsp_num>1</Hsp_num>
2119              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
2120              <Hsp_score>30</Hsp_score>
2121              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
2122              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
2123              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
2124              <Hsp_hit-from>2887871</Hsp_hit-from>
2125              <Hsp_hit-to>2887900</Hsp_hit-to>
2126              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
2127              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
2128              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
2129              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
2130              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
2131              <Hsp_qseq>ACAATGCAACCAGACCAGCCCGGATCGATA</Hsp_qseq>
2132              <Hsp_hseq>ACAATGCAACCAGACCAGCCCGGATCGATA</Hsp_hseq>
2133              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
2134            </Hsp>
2135          </Hit_hsps>
2136        </Hit>
2137      </Iteration_hits>
2138      <Iteration_stat>
2139        <Statistics>
2140          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
2141          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
2142          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
2143          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
2144          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
2145          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
2146          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
2147        </Statistics>
2148      </Iteration_stat>
2149    </Iteration>
2150    <Iteration>
2151      <Iteration_iter-num>50</Iteration_iter-num>
2152      <Iteration_query-ID>lcl|50_0</Iteration_query-ID>
2153      <Iteration_query-def>49_0.433333</Iteration_query-def>
2154      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
2155      <Iteration_hits>
2156        <Hit>
2157          <Hit_num>1</Hit_num>
2158          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
2159          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
2160          <Hit_accession>0</Hit_accession>
2161          <Hit_len>5528445</Hit_len>
2162          <Hit_hsps>
2163            <Hsp>
2164              <Hsp_num>1</Hsp_num>
2165              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
2166              <Hsp_score>30</Hsp_score>
2167              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
2168              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
2169              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
2170              <Hsp_hit-from>4152853</Hsp_hit-from>
2171              <Hsp_hit-to>4152882</Hsp_hit-to>
2172              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
2173              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
2174              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
2175              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
2176              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
2177              <Hsp_qseq>CGTTATACGGAACAACATTTAACTCCAGCG</Hsp_qseq>
2178              <Hsp_hseq>CGTTATACGGAACAACATTTAACTCCAGCG</Hsp_hseq>
2179              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
2180            </Hsp>
2181          </Hit_hsps>
2182        </Hit>
2183      </Iteration_hits>
2184      <Iteration_stat>
2185        <Statistics>
2186          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
2187          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
2188          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
2189          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
2190          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
2191          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
2192          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
2193        </Statistics>
2194      </Iteration_stat>
2195    </Iteration>
2196    <Iteration>
2197      <Iteration_iter-num>51</Iteration_iter-num>
2198      <Iteration_query-ID>lcl|51_0</Iteration_query-ID>
2199      <Iteration_query-def>50_0.466667</Iteration_query-def>
2200      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
2201      <Iteration_hits>
2202        <Hit>
2203          <Hit_num>1</Hit_num>
2204          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
2205          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
2206          <Hit_accession>0</Hit_accession>
2207          <Hit_len>5528445</Hit_len>
2208          <Hit_hsps>
2209            <Hsp>
2210              <Hsp_num>1</Hsp_num>
2211              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
2212              <Hsp_score>30</Hsp_score>
2213              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
2214              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
2215              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
2216              <Hsp_hit-from>3568677</Hsp_hit-from>
2217              <Hsp_hit-to>3568706</Hsp_hit-to>
2218              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
2219              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
2220              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
2221              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
2222              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
2223              <Hsp_qseq>TTGCTGTTGCCATCGCTTTTCAGGACATAC</Hsp_qseq>
2224              <Hsp_hseq>TTGCTGTTGCCATCGCTTTTCAGGACATAC</Hsp_hseq>
2225              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
2226            </Hsp>
2227          </Hit_hsps>
2228        </Hit>
2229      </Iteration_hits>
2230      <Iteration_stat>
2231        <Statistics>
2232          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
2233          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
2234          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
2235          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
2236          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
2237          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
2238          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
2239        </Statistics>
2240      </Iteration_stat>
2241    </Iteration>
2242    <Iteration>
2243      <Iteration_iter-num>52</Iteration_iter-num>
2244      <Iteration_query-ID>lcl|52_0</Iteration_query-ID>
2245      <Iteration_query-def>51_0.533333</Iteration_query-def>
2246      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
2247      <Iteration_hits>
2248        <Hit>
2249          <Hit_num>1</Hit_num>
2250          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
2251          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
2252          <Hit_accession>0</Hit_accession>
2253          <Hit_len>5528445</Hit_len>
2254          <Hit_hsps>
2255            <Hsp>
2256              <Hsp_num>1</Hsp_num>
2257              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
2258              <Hsp_score>30</Hsp_score>
2259              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
2260              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
2261              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
2262              <Hsp_hit-from>3739788</Hsp_hit-from>
2263              <Hsp_hit-to>3739817</Hsp_hit-to>
2264              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
2265              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
2266              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
2267              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
2268              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
2269              <Hsp_qseq>CGACGGTATCGGTACGCAGATTGTGATGGA</Hsp_qseq>
2270              <Hsp_hseq>CGACGGTATCGGTACGCAGATTGTGATGGA</Hsp_hseq>
2271              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
2272            </Hsp>
2273          </Hit_hsps>
2274        </Hit>
2275      </Iteration_hits>
2276      <Iteration_stat>
2277        <Statistics>
2278          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
2279          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
2280          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
2281          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
2282          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
2283          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
2284          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
2285        </Statistics>
2286      </Iteration_stat>
2287    </Iteration>
2288    <Iteration>
2289      <Iteration_iter-num>53</Iteration_iter-num>
2290      <Iteration_query-ID>lcl|53_0</Iteration_query-ID>
2291      <Iteration_query-def>52_0.366667</Iteration_query-def>
2292      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
2293      <Iteration_hits>
2294        <Hit>
2295          <Hit_num>1</Hit_num>
2296          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
2297          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
2298          <Hit_accession>0</Hit_accession>
2299          <Hit_len>5528445</Hit_len>
2300          <Hit_hsps>
2301            <Hsp>
2302              <Hsp_num>1</Hsp_num>
2303              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
2304              <Hsp_score>30</Hsp_score>
2305              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
2306              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
2307              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
2308              <Hsp_hit-from>3789407</Hsp_hit-from>
2309              <Hsp_hit-to>3789436</Hsp_hit-to>
2310              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
2311              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
2312              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
2313              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
2314              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
2315              <Hsp_qseq>ATGAGCATCAACATCGAAATCTCAAACCAA</Hsp_qseq>
2316              <Hsp_hseq>ATGAGCATCAACATCGAAATCTCAAACCAA</Hsp_hseq>
2317              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
2318            </Hsp>
2319          </Hit_hsps>
2320        </Hit>
2321      </Iteration_hits>
2322      <Iteration_stat>
2323        <Statistics>
2324          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
2325          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
2326          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
2327          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
2328          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
2329          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
2330          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
2331        </Statistics>
2332      </Iteration_stat>
2333    </Iteration>
2334    <Iteration>
2335      <Iteration_iter-num>55</Iteration_iter-num>
2336      <Iteration_query-ID>lcl|55_0</Iteration_query-ID>
2337      <Iteration_query-def>54_0.400000</Iteration_query-def>
2338      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
2339      <Iteration_hits>
2340        <Hit>
2341          <Hit_num>1</Hit_num>
2342          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
2343          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
2344          <Hit_accession>0</Hit_accession>
2345          <Hit_len>5528445</Hit_len>
2346          <Hit_hsps>
2347            <Hsp>
2348              <Hsp_num>1</Hsp_num>
2349              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
2350              <Hsp_score>30</Hsp_score>
2351              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
2352              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
2353              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
2354              <Hsp_hit-from>3161991</Hsp_hit-from>
2355              <Hsp_hit-to>3162020</Hsp_hit-to>
2356              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
2357              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
2358              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
2359              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
2360              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
2361              <Hsp_qseq>GTATTCTTCATTGATTTGTAAGCGGGTACC</Hsp_qseq>
2362              <Hsp_hseq>GTATTCTTCATTGATTTGTAAGCGGGTACC</Hsp_hseq>
2363              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
2364            </Hsp>
2365          </Hit_hsps>
2366        </Hit>
2367      </Iteration_hits>
2368      <Iteration_stat>
2369        <Statistics>
2370          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
2371          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
2372          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
2373          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
2374          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
2375          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
2376          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
2377        </Statistics>
2378      </Iteration_stat>
2379    </Iteration>
2380    <Iteration>
2381      <Iteration_iter-num>56</Iteration_iter-num>
2382      <Iteration_query-ID>lcl|56_0</Iteration_query-ID>
2383      <Iteration_query-def>55_0.466667</Iteration_query-def>
2384      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
2385      <Iteration_hits>
2386        <Hit>
2387          <Hit_num>1</Hit_num>
2388          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
2389          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
2390          <Hit_accession>0</Hit_accession>
2391          <Hit_len>5528445</Hit_len>
2392          <Hit_hsps>
2393            <Hsp>
2394              <Hsp_num>1</Hsp_num>
2395              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
2396              <Hsp_score>30</Hsp_score>
2397              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
2398              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
2399              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
2400              <Hsp_hit-from>4384753</Hsp_hit-from>
2401              <Hsp_hit-to>4384782</Hsp_hit-to>
2402              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
2403              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
2404              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
2405              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
2406              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
2407              <Hsp_qseq>AAGCGCTGTTCAACATAAATTGGCTGACGG</Hsp_qseq>
2408              <Hsp_hseq>AAGCGCTGTTCAACATAAATTGGCTGACGG</Hsp_hseq>
2409              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
2410            </Hsp>
2411          </Hit_hsps>
2412        </Hit>
2413      </Iteration_hits>
2414      <Iteration_stat>
2415        <Statistics>
2416          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
2417          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
2418          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
2419          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
2420          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
2421          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
2422          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
2423        </Statistics>
2424      </Iteration_stat>
2425    </Iteration>
2426    <Iteration>
2427      <Iteration_iter-num>57</Iteration_iter-num>
2428      <Iteration_query-ID>lcl|57_0</Iteration_query-ID>
2429      <Iteration_query-def>56_0.433333</Iteration_query-def>
2430      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
2431      <Iteration_hits>
2432        <Hit>
2433          <Hit_num>1</Hit_num>
2434          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
2435          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
2436          <Hit_accession>0</Hit_accession>
2437          <Hit_len>5528445</Hit_len>
2438          <Hit_hsps>
2439            <Hsp>
2440              <Hsp_num>1</Hsp_num>
2441              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
2442              <Hsp_score>30</Hsp_score>
2443              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
2444              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
2445              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
2446              <Hsp_hit-from>2915787</Hsp_hit-from>
2447              <Hsp_hit-to>2915816</Hsp_hit-to>
2448              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
2449              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
2450              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
2451              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
2452              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
2453              <Hsp_qseq>AACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCC</Hsp_qseq>
2454              <Hsp_hseq>AACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCC</Hsp_hseq>
2455              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
2456            </Hsp>
2457          </Hit_hsps>
2458        </Hit>
2459      </Iteration_hits>
2460      <Iteration_stat>
2461        <Statistics>
2462          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
2463          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
2464          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
2465          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
2466          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
2467          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
2468          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
2469        </Statistics>
2470      </Iteration_stat>
2471    </Iteration>
2472    <Iteration>
2473      <Iteration_iter-num>58</Iteration_iter-num>
2474      <Iteration_query-ID>lcl|58_0</Iteration_query-ID>
2475      <Iteration_query-def>57_0.566667</Iteration_query-def>
2476      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
2477      <Iteration_hits>
2478        <Hit>
2479          <Hit_num>1</Hit_num>
2480          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
2481          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
2482          <Hit_accession>0</Hit_accession>
2483          <Hit_len>5528445</Hit_len>
2484          <Hit_hsps>
2485            <Hsp>
2486              <Hsp_num>1</Hsp_num>
2487              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
2488              <Hsp_score>30</Hsp_score>
2489              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
2490              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
2491              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
2492              <Hsp_hit-from>294604</Hsp_hit-from>
2493              <Hsp_hit-to>294633</Hsp_hit-to>
2494              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
2495              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
2496              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
2497              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
2498              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
2499              <Hsp_qseq>CGCGAAATCCTCGACGTCCAGGCACGTATT</Hsp_qseq>
2500              <Hsp_hseq>CGCGAAATCCTCGACGTCCAGGCACGTATT</Hsp_hseq>
2501              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
2502            </Hsp>
2503          </Hit_hsps>
2504        </Hit>
2505      </Iteration_hits>
2506      <Iteration_stat>
2507        <Statistics>
2508          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
2509          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
2510          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
2511          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
2512          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
2513          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
2514          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
2515        </Statistics>
2516      </Iteration_stat>
2517    </Iteration>
2518    <Iteration>
2519      <Iteration_iter-num>59</Iteration_iter-num>
2520      <Iteration_query-ID>lcl|59_0</Iteration_query-ID>
2521      <Iteration_query-def>58_0.300000</Iteration_query-def>
2522      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
2523      <Iteration_hits>
2524        <Hit>
2525          <Hit_num>1</Hit_num>
2526          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
2527          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
2528          <Hit_accession>0</Hit_accession>
2529          <Hit_len>5528445</Hit_len>
2530          <Hit_hsps>
2531            <Hsp>
2532              <Hsp_num>1</Hsp_num>
2533              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
2534              <Hsp_score>30</Hsp_score>
2535              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
2536              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
2537              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
2538              <Hsp_hit-from>1553483</Hsp_hit-from>
2539              <Hsp_hit-to>1553512</Hsp_hit-to>
2540              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
2541              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
2542              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
2543              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
2544              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
2545              <Hsp_qseq>GTTATCCATTAAAATAGATCGGATCGATAT</Hsp_qseq>
2546              <Hsp_hseq>GTTATCCATTAAAATAGATCGGATCGATAT</Hsp_hseq>
2547              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
2548            </Hsp>
2549          </Hit_hsps>
2550        </Hit>
2551      </Iteration_hits>
2552      <Iteration_stat>
2553        <Statistics>
2554          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
2555          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
2556          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
2557          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
2558          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
2559          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
2560          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
2561        </Statistics>
2562      </Iteration_stat>
2563    </Iteration>
2564    <Iteration>
2565      <Iteration_iter-num>60</Iteration_iter-num>
2566      <Iteration_query-ID>lcl|60_0</Iteration_query-ID>
2567      <Iteration_query-def>59_0.300000</Iteration_query-def>
2568      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
2569      <Iteration_hits>
2570        <Hit>
2571          <Hit_num>1</Hit_num>
2572          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
2573          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
2574          <Hit_accession>0</Hit_accession>
2575          <Hit_len>5528445</Hit_len>
2576          <Hit_hsps>
2577            <Hsp>
2578              <Hsp_num>1</Hsp_num>
2579              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
2580              <Hsp_score>30</Hsp_score>
2581              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
2582              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
2583              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
2584              <Hsp_hit-from>1351506</Hsp_hit-from>
2585              <Hsp_hit-to>1351535</Hsp_hit-to>
2586              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
2587              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
2588              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
2589              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
2590              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
2591              <Hsp_qseq>AAAATCTGCATATCATGATAAGAGTGGTTA</Hsp_qseq>
2592              <Hsp_hseq>AAAATCTGCATATCATGATAAGAGTGGTTA</Hsp_hseq>
2593              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
2594            </Hsp>
2595            <Hsp>
2596              <Hsp_num>2</Hsp_num>
2597              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
2598              <Hsp_score>30</Hsp_score>
2599              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
2600              <Hsp_query-from>30</Hsp_query-from>
2601              <Hsp_query-to>1</Hsp_query-to>
2602              <Hsp_hit-from>2997458</Hsp_hit-from>
2603              <Hsp_hit-to>2997487</Hsp_hit-to>
2604              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
2605              <Hsp_hit-frame>-1</Hsp_hit-frame>
2606              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
2607              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
2608              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
2609              <Hsp_qseq>TAACCACTCTTATCATGATATGCAGATTTT</Hsp_qseq>
2610              <Hsp_hseq>TAACCACTCTTATCATGATATGCAGATTTT</Hsp_hseq>
2611              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
2612            </Hsp>
2613          </Hit_hsps>
2614        </Hit>
2615      </Iteration_hits>
2616      <Iteration_stat>
2617        <Statistics>
2618          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
2619          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
2620          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
2621          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
2622          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
2623          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
2624          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
2625        </Statistics>
2626      </Iteration_stat>
2627    </Iteration>
2628    <Iteration>
2629      <Iteration_iter-num>62</Iteration_iter-num>
2630      <Iteration_query-ID>lcl|62_0</Iteration_query-ID>
2631      <Iteration_query-def>61_0.366667</Iteration_query-def>
2632      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
2633      <Iteration_hits>
2634        <Hit>
2635          <Hit_num>1</Hit_num>
2636          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
2637          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
2638          <Hit_accession>0</Hit_accession>
2639          <Hit_len>5528445</Hit_len>
2640          <Hit_hsps>
2641            <Hsp>
2642              <Hsp_num>1</Hsp_num>
2643              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
2644              <Hsp_score>30</Hsp_score>
2645              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
2646              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
2647              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
2648              <Hsp_hit-from>1987157</Hsp_hit-from>
2649              <Hsp_hit-to>1987186</Hsp_hit-to>
2650              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
2651              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
2652              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
2653              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
2654              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
2655              <Hsp_qseq>TCAGTTTGAAAGCTTTGTCAGCCGTTTTTT</Hsp_qseq>
2656              <Hsp_hseq>TCAGTTTGAAAGCTTTGTCAGCCGTTTTTT</Hsp_hseq>
2657              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
2658            </Hsp>
2659          </Hit_hsps>
2660        </Hit>
2661      </Iteration_hits>
2662      <Iteration_stat>
2663        <Statistics>
2664          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
2665          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
2666          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
2667          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
2668          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
2669          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
2670          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
2671        </Statistics>
2672      </Iteration_stat>
2673    </Iteration>
2674    <Iteration>
2675      <Iteration_iter-num>63</Iteration_iter-num>
2676      <Iteration_query-ID>lcl|63_0</Iteration_query-ID>
2677      <Iteration_query-def>62_0.366667</Iteration_query-def>
2678      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
2679      <Iteration_hits>
2680        <Hit>
2681          <Hit_num>1</Hit_num>
2682          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
2683          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
2684          <Hit_accession>0</Hit_accession>
2685          <Hit_len>5528445</Hit_len>
2686          <Hit_hsps>
2687            <Hsp>
2688              <Hsp_num>1</Hsp_num>
2689              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
2690              <Hsp_score>30</Hsp_score>
2691              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
2692              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
2693              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
2694              <Hsp_hit-from>1667830</Hsp_hit-from>
2695              <Hsp_hit-to>1667859</Hsp_hit-to>
2696              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
2697              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
2698              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
2699              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
2700              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
2701              <Hsp_qseq>AATCCTAAACCTAGGAATGCCAGAATATCT</Hsp_qseq>
2702              <Hsp_hseq>AATCCTAAACCTAGGAATGCCAGAATATCT</Hsp_hseq>
2703              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
2704            </Hsp>
2705          </Hit_hsps>
2706        </Hit>
2707      </Iteration_hits>
2708      <Iteration_stat>
2709        <Statistics>
2710          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
2711          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
2712          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
2713          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
2714          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
2715          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
2716          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
2717        </Statistics>
2718      </Iteration_stat>
2719    </Iteration>
2720    <Iteration>
2721      <Iteration_iter-num>64</Iteration_iter-num>
2722      <Iteration_query-ID>lcl|64_0</Iteration_query-ID>
2723      <Iteration_query-def>63_0.566667</Iteration_query-def>
2724      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
2725      <Iteration_hits>
2726        <Hit>
2727          <Hit_num>1</Hit_num>
2728          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
2729          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
2730          <Hit_accession>0</Hit_accession>
2731          <Hit_len>5528445</Hit_len>
2732          <Hit_hsps>
2733            <Hsp>
2734              <Hsp_num>1</Hsp_num>
2735              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
2736              <Hsp_score>30</Hsp_score>
2737              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
2738              <Hsp_query-from>30</Hsp_query-from>
2739              <Hsp_query-to>1</Hsp_query-to>
2740              <Hsp_hit-from>231418</Hsp_hit-from>
2741              <Hsp_hit-to>231447</Hsp_hit-to>
2742              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
2743              <Hsp_hit-frame>-1</Hsp_hit-frame>
2744              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
2745              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
2746              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
2747              <Hsp_qseq>TGGCATAAGCCAGCTTGACTGCGAGCGTGA</Hsp_qseq>
2748              <Hsp_hseq>TGGCATAAGCCAGCTTGACTGCGAGCGTGA</Hsp_hseq>
2749              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
2750            </Hsp>
2751            <Hsp>
2752              <Hsp_num>2</Hsp_num>
2753              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
2754              <Hsp_score>30</Hsp_score>
2755              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
2756              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
2757              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
2758              <Hsp_hit-from>3516862</Hsp_hit-from>
2759              <Hsp_hit-to>3516891</Hsp_hit-to>
2760              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
2761              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
2762              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
2763              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
2764              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
2765              <Hsp_qseq>TCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCA</Hsp_qseq>
2766              <Hsp_hseq>TCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCA</Hsp_hseq>
2767              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
2768            </Hsp>
2769            <Hsp>
2770              <Hsp_num>3</Hsp_num>
2771              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
2772              <Hsp_score>30</Hsp_score>
2773              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
2774              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
2775              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
2776              <Hsp_hit-from>4226650</Hsp_hit-from>
2777              <Hsp_hit-to>4226679</Hsp_hit-to>
2778              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
2779              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
2780              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
2781              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
2782              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
2783              <Hsp_qseq>TCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCA</Hsp_qseq>
2784              <Hsp_hseq>TCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCA</Hsp_hseq>
2785              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
2786            </Hsp>
2787            <Hsp>
2788              <Hsp_num>4</Hsp_num>
2789              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
2790              <Hsp_score>30</Hsp_score>
2791              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
2792              <Hsp_query-from>30</Hsp_query-from>
2793              <Hsp_query-to>1</Hsp_query-to>
2794              <Hsp_hit-from>4808457</Hsp_hit-from>
2795              <Hsp_hit-to>4808486</Hsp_hit-to>
2796              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
2797              <Hsp_hit-frame>-1</Hsp_hit-frame>
2798              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
2799              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
2800              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
2801              <Hsp_qseq>TGGCATAAGCCAGCTTGACTGCGAGCGTGA</Hsp_qseq>
2802              <Hsp_hseq>TGGCATAAGCCAGCTTGACTGCGAGCGTGA</Hsp_hseq>
2803              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
2804            </Hsp>
2805            <Hsp>
2806              <Hsp_num>5</Hsp_num>
2807              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
2808              <Hsp_score>30</Hsp_score>
2809              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
2810              <Hsp_query-from>30</Hsp_query-from>
2811              <Hsp_query-to>1</Hsp_query-to>
2812              <Hsp_hit-from>4904735</Hsp_hit-from>
2813              <Hsp_hit-to>4904764</Hsp_hit-to>
2814              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
2815              <Hsp_hit-frame>-1</Hsp_hit-frame>
2816              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
2817              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
2818              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
2819              <Hsp_qseq>TGGCATAAGCCAGCTTGACTGCGAGCGTGA</Hsp_qseq>
2820              <Hsp_hseq>TGGCATAAGCCAGCTTGACTGCGAGCGTGA</Hsp_hseq>
2821              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
2822            </Hsp>
2823            <Hsp>
2824              <Hsp_num>6</Hsp_num>
2825              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
2826              <Hsp_score>30</Hsp_score>
2827              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
2828              <Hsp_query-from>30</Hsp_query-from>
2829              <Hsp_query-to>1</Hsp_query-to>
2830              <Hsp_hit-from>5048915</Hsp_hit-from>
2831              <Hsp_hit-to>5048944</Hsp_hit-to>
2832              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
2833              <Hsp_hit-frame>-1</Hsp_hit-frame>
2834              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
2835              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
2836              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
2837              <Hsp_qseq>TGGCATAAGCCAGCTTGACTGCGAGCGTGA</Hsp_qseq>
2838              <Hsp_hseq>TGGCATAAGCCAGCTTGACTGCGAGCGTGA</Hsp_hseq>
2839              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
2840            </Hsp>
2841            <Hsp>
2842              <Hsp_num>7</Hsp_num>
2843              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
2844              <Hsp_score>30</Hsp_score>
2845              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
2846              <Hsp_query-from>30</Hsp_query-from>
2847              <Hsp_query-to>1</Hsp_query-to>
2848              <Hsp_hit-from>5089922</Hsp_hit-from>
2849              <Hsp_hit-to>5089951</Hsp_hit-to>
2850              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
2851              <Hsp_hit-frame>-1</Hsp_hit-frame>
2852              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
2853              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
2854              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
2855              <Hsp_qseq>TGGCATAAGCCAGCTTGACTGCGAGCGTGA</Hsp_qseq>
2856              <Hsp_hseq>TGGCATAAGCCAGCTTGACTGCGAGCGTGA</Hsp_hseq>
2857              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
2858            </Hsp>
2859          </Hit_hsps>
2860        </Hit>
2861      </Iteration_hits>
2862      <Iteration_stat>
2863        <Statistics>
2864          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
2865          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
2866          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
2867          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
2868          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
2869          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
2870          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
2871        </Statistics>
2872      </Iteration_stat>
2873    </Iteration>
2874    <Iteration>
2875      <Iteration_iter-num>65</Iteration_iter-num>
2876      <Iteration_query-ID>lcl|65_0</Iteration_query-ID>
2877      <Iteration_query-def>64_0.500000</Iteration_query-def>
2878      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
2879      <Iteration_hits>
2880        <Hit>
2881          <Hit_num>1</Hit_num>
2882          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
2883          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
2884          <Hit_accession>0</Hit_accession>
2885          <Hit_len>5528445</Hit_len>
2886          <Hit_hsps>
2887            <Hsp>
2888              <Hsp_num>1</Hsp_num>
2889              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
2890              <Hsp_score>30</Hsp_score>
2891              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
2892              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
2893              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
2894              <Hsp_hit-from>5440369</Hsp_hit-from>
2895              <Hsp_hit-to>5440398</Hsp_hit-to>
2896              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
2897              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
2898              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
2899              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
2900              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
2901              <Hsp_qseq>GAGATGACGGTTGCAGAGTCATGCGTTTGA</Hsp_qseq>
2902              <Hsp_hseq>GAGATGACGGTTGCAGAGTCATGCGTTTGA</Hsp_hseq>
2903              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
2904            </Hsp>
2905          </Hit_hsps>
2906        </Hit>
2907      </Iteration_hits>
2908      <Iteration_stat>
2909        <Statistics>
2910          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
2911          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
2912          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
2913          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
2914          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
2915          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
2916          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
2917        </Statistics>
2918      </Iteration_stat>
2919    </Iteration>
2920    <Iteration>
2921      <Iteration_iter-num>66</Iteration_iter-num>
2922      <Iteration_query-ID>lcl|66_0</Iteration_query-ID>
2923      <Iteration_query-def>65_0.533333</Iteration_query-def>
2924      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
2925      <Iteration_hits>
2926        <Hit>
2927          <Hit_num>1</Hit_num>
2928          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
2929          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
2930          <Hit_accession>0</Hit_accession>
2931          <Hit_len>5528445</Hit_len>
2932          <Hit_hsps>
2933            <Hsp>
2934              <Hsp_num>1</Hsp_num>
2935              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
2936              <Hsp_score>30</Hsp_score>
2937              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
2938              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
2939              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
2940              <Hsp_hit-from>3963858</Hsp_hit-from>
2941              <Hsp_hit-to>3963887</Hsp_hit-to>
2942              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
2943              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
2944              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
2945              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
2946              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
2947              <Hsp_qseq>TCTGGATCACGCGCAAACACTGGCTATCGT</Hsp_qseq>
2948              <Hsp_hseq>TCTGGATCACGCGCAAACACTGGCTATCGT</Hsp_hseq>
2949              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
2950            </Hsp>
2951          </Hit_hsps>
2952        </Hit>
2953      </Iteration_hits>
2954      <Iteration_stat>
2955        <Statistics>
2956          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
2957          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
2958          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
2959          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
2960          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
2961          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
2962          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
2963        </Statistics>
2964      </Iteration_stat>
2965    </Iteration>
2966    <Iteration>
2967      <Iteration_iter-num>67</Iteration_iter-num>
2968      <Iteration_query-ID>lcl|67_0</Iteration_query-ID>
2969      <Iteration_query-def>66_0.466667</Iteration_query-def>
2970      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
2971      <Iteration_hits>
2972        <Hit>
2973          <Hit_num>1</Hit_num>
2974          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
2975          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
2976          <Hit_accession>0</Hit_accession>
2977          <Hit_len>5528445</Hit_len>
2978          <Hit_hsps>
2979            <Hsp>
2980              <Hsp_num>1</Hsp_num>
2981              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
2982              <Hsp_score>30</Hsp_score>
2983              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
2984              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
2985              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
2986              <Hsp_hit-from>4142497</Hsp_hit-from>
2987              <Hsp_hit-to>4142526</Hsp_hit-to>
2988              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
2989              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
2990              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
2991              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
2992              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
2993              <Hsp_qseq>TCTGCTTTAGCAAACAGAGTGTGGTCACGA</Hsp_qseq>
2994              <Hsp_hseq>TCTGCTTTAGCAAACAGAGTGTGGTCACGA</Hsp_hseq>
2995              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
2996            </Hsp>
2997          </Hit_hsps>
2998        </Hit>
2999      </Iteration_hits>
3000      <Iteration_stat>
3001        <Statistics>
3002          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
3003          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
3004          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
3005          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
3006          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
3007          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
3008          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
3009        </Statistics>
3010      </Iteration_stat>
3011    </Iteration>
3012    <Iteration>
3013      <Iteration_iter-num>68</Iteration_iter-num>
3014      <Iteration_query-ID>lcl|68_0</Iteration_query-ID>
3015      <Iteration_query-def>67_0.400000</Iteration_query-def>
3016      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
3017      <Iteration_hits>
3018        <Hit>
3019          <Hit_num>1</Hit_num>
3020          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
3021          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
3022          <Hit_accession>0</Hit_accession>
3023          <Hit_len>5528445</Hit_len>
3024          <Hit_hsps>
3025            <Hsp>
3026              <Hsp_num>1</Hsp_num>
3027              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
3028              <Hsp_score>30</Hsp_score>
3029              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
3030              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
3031              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
3032              <Hsp_hit-from>3532236</Hsp_hit-from>
3033              <Hsp_hit-to>3532265</Hsp_hit-to>
3034              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
3035              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
3036              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
3037              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
3038              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
3039              <Hsp_qseq>GCCTTTTGTCTGATCATCCACAATAATGAC</Hsp_qseq>
3040              <Hsp_hseq>GCCTTTTGTCTGATCATCCACAATAATGAC</Hsp_hseq>
3041              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
3042            </Hsp>
3043          </Hit_hsps>
3044        </Hit>
3045      </Iteration_hits>
3046      <Iteration_stat>
3047        <Statistics>
3048          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
3049          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
3050          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
3051          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
3052          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
3053          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
3054          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
3055        </Statistics>
3056      </Iteration_stat>
3057    </Iteration>
3058    <Iteration>
3059      <Iteration_iter-num>69</Iteration_iter-num>
3060      <Iteration_query-ID>lcl|69_0</Iteration_query-ID>
3061      <Iteration_query-def>68_0.566667</Iteration_query-def>
3062      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
3063      <Iteration_hits>
3064        <Hit>
3065          <Hit_num>1</Hit_num>
3066          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
3067          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
3068          <Hit_accession>0</Hit_accession>
3069          <Hit_len>5528445</Hit_len>
3070          <Hit_hsps>
3071            <Hsp>
3072              <Hsp_num>1</Hsp_num>
3073              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
3074              <Hsp_score>30</Hsp_score>
3075              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
3076              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
3077              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
3078              <Hsp_hit-from>779994</Hsp_hit-from>
3079              <Hsp_hit-to>780023</Hsp_hit-to>
3080              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
3081              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
3082              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
3083              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
3084              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
3085              <Hsp_qseq>GAAGGATAGTTGGTCAGCAACACCAGCGGC</Hsp_qseq>
3086              <Hsp_hseq>GAAGGATAGTTGGTCAGCAACACCAGCGGC</Hsp_hseq>
3087              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
3088            </Hsp>
3089          </Hit_hsps>
3090        </Hit>
3091      </Iteration_hits>
3092      <Iteration_stat>
3093        <Statistics>
3094          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
3095          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
3096          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
3097          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
3098          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
3099          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
3100          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
3101        </Statistics>
3102      </Iteration_stat>
3103    </Iteration>
3104    <Iteration>
3105      <Iteration_iter-num>71</Iteration_iter-num>
3106      <Iteration_query-ID>lcl|71_0</Iteration_query-ID>
3107      <Iteration_query-def>70_0.466667</Iteration_query-def>
3108      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
3109      <Iteration_hits>
3110        <Hit>
3111          <Hit_num>1</Hit_num>
3112          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
3113          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
3114          <Hit_accession>0</Hit_accession>
3115          <Hit_len>5528445</Hit_len>
3116          <Hit_hsps>
3117            <Hsp>
3118              <Hsp_num>1</Hsp_num>
3119              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
3120              <Hsp_score>30</Hsp_score>
3121              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
3122              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
3123              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
3124              <Hsp_hit-from>1317239</Hsp_hit-from>
3125              <Hsp_hit-to>1317268</Hsp_hit-to>
3126              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
3127              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
3128              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
3129              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
3130              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
3131              <Hsp_qseq>TGGTGTTCAGCATCTCAACGGTAATTCGCT</Hsp_qseq>
3132              <Hsp_hseq>TGGTGTTCAGCATCTCAACGGTAATTCGCT</Hsp_hseq>
3133              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
3134            </Hsp>
3135          </Hit_hsps>
3136        </Hit>
3137      </Iteration_hits>
3138      <Iteration_stat>
3139        <Statistics>
3140          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
3141          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
3142          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
3143          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
3144          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
3145          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
3146          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
3147        </Statistics>
3148      </Iteration_stat>
3149    </Iteration>
3150    <Iteration>
3151      <Iteration_iter-num>72</Iteration_iter-num>
3152      <Iteration_query-ID>lcl|72_0</Iteration_query-ID>
3153      <Iteration_query-def>71_0.533333</Iteration_query-def>
3154      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
3155      <Iteration_hits>
3156        <Hit>
3157          <Hit_num>1</Hit_num>
3158          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
3159          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
3160          <Hit_accession>0</Hit_accession>
3161          <Hit_len>5528445</Hit_len>
3162          <Hit_hsps>
3163            <Hsp>
3164              <Hsp_num>1</Hsp_num>
3165              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
3166              <Hsp_score>30</Hsp_score>
3167              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
3168              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
3169              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
3170              <Hsp_hit-from>5080463</Hsp_hit-from>
3171              <Hsp_hit-to>5080492</Hsp_hit-to>
3172              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
3173              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
3174              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
3175              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
3176              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
3177              <Hsp_qseq>CAGGATGCAAACTGCCGGGAGATCCAGTTA</Hsp_qseq>
3178              <Hsp_hseq>CAGGATGCAAACTGCCGGGAGATCCAGTTA</Hsp_hseq>
3179              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
3180            </Hsp>
3181          </Hit_hsps>
3182        </Hit>
3183      </Iteration_hits>
3184      <Iteration_stat>
3185        <Statistics>
3186          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
3187          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
3188          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
3189          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
3190          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
3191          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
3192          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
3193        </Statistics>
3194      </Iteration_stat>
3195    </Iteration>
3196    <Iteration>
3197      <Iteration_iter-num>73</Iteration_iter-num>
3198      <Iteration_query-ID>lcl|73_0</Iteration_query-ID>
3199      <Iteration_query-def>72_0.533333</Iteration_query-def>
3200      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
3201      <Iteration_hits>
3202        <Hit>
3203          <Hit_num>1</Hit_num>
3204          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
3205          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
3206          <Hit_accession>0</Hit_accession>
3207          <Hit_len>5528445</Hit_len>
3208          <Hit_hsps>
3209            <Hsp>
3210              <Hsp_num>1</Hsp_num>
3211              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
3212              <Hsp_score>30</Hsp_score>
3213              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
3214              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
3215              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
3216              <Hsp_hit-from>3605409</Hsp_hit-from>
3217              <Hsp_hit-to>3605438</Hsp_hit-to>
3218              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
3219              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
3220              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
3221              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
3222              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
3223              <Hsp_qseq>AACTGGAAGGGCTTGGGATGACACAACAGC</Hsp_qseq>
3224              <Hsp_hseq>AACTGGAAGGGCTTGGGATGACACAACAGC</Hsp_hseq>
3225              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
3226            </Hsp>
3227          </Hit_hsps>
3228        </Hit>
3229      </Iteration_hits>
3230      <Iteration_stat>
3231        <Statistics>
3232          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
3233          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
3234          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
3235          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
3236          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
3237          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
3238          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
3239        </Statistics>
3240      </Iteration_stat>
3241    </Iteration>
3242    <Iteration>
3243      <Iteration_iter-num>74</Iteration_iter-num>
3244      <Iteration_query-ID>lcl|74_0</Iteration_query-ID>
3245      <Iteration_query-def>73_0.500000</Iteration_query-def>
3246      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
3247      <Iteration_hits>
3248        <Hit>
3249          <Hit_num>1</Hit_num>
3250          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
3251          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
3252          <Hit_accession>0</Hit_accession>
3253          <Hit_len>5528445</Hit_len>
3254          <Hit_hsps>
3255            <Hsp>
3256              <Hsp_num>1</Hsp_num>
3257              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
3258              <Hsp_score>30</Hsp_score>
3259              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
3260              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
3261              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
3262              <Hsp_hit-from>3280815</Hsp_hit-from>
3263              <Hsp_hit-to>3280844</Hsp_hit-to>
3264              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
3265              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
3266              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
3267              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
3268              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
3269              <Hsp_qseq>TTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTGGTTGC</Hsp_qseq>
3270              <Hsp_hseq>TTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTGGTTGC</Hsp_hseq>
3271              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
3272            </Hsp>
3273          </Hit_hsps>
3274        </Hit>
3275      </Iteration_hits>
3276      <Iteration_stat>
3277        <Statistics>
3278          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
3279          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
3280          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
3281          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
3282          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
3283          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
3284          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
3285        </Statistics>
3286      </Iteration_stat>
3287    </Iteration>
3288    <Iteration>
3289      <Iteration_iter-num>76</Iteration_iter-num>
3290      <Iteration_query-ID>lcl|76_0</Iteration_query-ID>
3291      <Iteration_query-def>75_0.533333</Iteration_query-def>
3292      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
3293      <Iteration_hits>
3294        <Hit>
3295          <Hit_num>1</Hit_num>
3296          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
3297          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
3298          <Hit_accession>0</Hit_accession>
3299          <Hit_len>5528445</Hit_len>
3300          <Hit_hsps>
3301            <Hsp>
3302              <Hsp_num>1</Hsp_num>
3303              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
3304              <Hsp_score>30</Hsp_score>
3305              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
3306              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
3307              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
3308              <Hsp_hit-from>2230266</Hsp_hit-from>
3309              <Hsp_hit-to>2230295</Hsp_hit-to>
3310              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
3311              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
3312              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
3313              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
3314              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
3315              <Hsp_qseq>ATAACCCTCTGCAACCGCCGCTTCAGCAAA</Hsp_qseq>
3316              <Hsp_hseq>ATAACCCTCTGCAACCGCCGCTTCAGCAAA</Hsp_hseq>
3317              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
3318            </Hsp>
3319          </Hit_hsps>
3320        </Hit>
3321      </Iteration_hits>
3322      <Iteration_stat>
3323        <Statistics>
3324          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
3325          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
3326          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
3327          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
3328          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
3329          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
3330          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
3331        </Statistics>
3332      </Iteration_stat>
3333    </Iteration>
3334    <Iteration>
3335      <Iteration_iter-num>77</Iteration_iter-num>
3336      <Iteration_query-ID>lcl|77_0</Iteration_query-ID>
3337      <Iteration_query-def>76_0.600000</Iteration_query-def>
3338      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
3339      <Iteration_hits>
3340        <Hit>
3341          <Hit_num>1</Hit_num>
3342          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
3343          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
3344          <Hit_accession>0</Hit_accession>
3345          <Hit_len>5528445</Hit_len>
3346          <Hit_hsps>
3347            <Hsp>
3348              <Hsp_num>1</Hsp_num>
3349              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
3350              <Hsp_score>30</Hsp_score>
3351              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
3352              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
3353              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
3354              <Hsp_hit-from>462631</Hsp_hit-from>
3355              <Hsp_hit-to>462660</Hsp_hit-to>
3356              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
3357              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
3358              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
3359              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
3360              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
3361              <Hsp_qseq>TGAAGCCGTACAACGGGCGCTGGAATTCGC</Hsp_qseq>
3362              <Hsp_hseq>TGAAGCCGTACAACGGGCGCTGGAATTCGC</Hsp_hseq>
3363              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
3364            </Hsp>
3365          </Hit_hsps>
3366        </Hit>
3367      </Iteration_hits>
3368      <Iteration_stat>
3369        <Statistics>
3370          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
3371          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
3372          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
3373          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
3374          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
3375          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
3376          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
3377        </Statistics>
3378      </Iteration_stat>
3379    </Iteration>
3380    <Iteration>
3381      <Iteration_iter-num>78</Iteration_iter-num>
3382      <Iteration_query-ID>lcl|78_0</Iteration_query-ID>
3383      <Iteration_query-def>77_0.700000</Iteration_query-def>
3384      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
3385      <Iteration_hits>
3386        <Hit>
3387          <Hit_num>1</Hit_num>
3388          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
3389          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
3390          <Hit_accession>0</Hit_accession>
3391          <Hit_len>5528445</Hit_len>
3392          <Hit_hsps>
3393            <Hsp>
3394              <Hsp_num>1</Hsp_num>
3395              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
3396              <Hsp_score>30</Hsp_score>
3397              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
3398              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
3399              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
3400              <Hsp_hit-from>2939076</Hsp_hit-from>
3401              <Hsp_hit-to>2939105</Hsp_hit-to>
3402              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
3403              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
3404              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
3405              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
3406              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
3407              <Hsp_qseq>GAGCTGCAACGCGGTCAGCCAGCTGGCGGT</Hsp_qseq>
3408              <Hsp_hseq>GAGCTGCAACGCGGTCAGCCAGCTGGCGGT</Hsp_hseq>
3409              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
3410            </Hsp>
3411          </Hit_hsps>
3412        </Hit>
3413      </Iteration_hits>
3414      <Iteration_stat>
3415        <Statistics>
3416          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
3417          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
3418          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
3419          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
3420          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
3421          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
3422          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
3423        </Statistics>
3424      </Iteration_stat>
3425    </Iteration>
3426    <Iteration>
3427      <Iteration_iter-num>79</Iteration_iter-num>
3428      <Iteration_query-ID>lcl|79_0</Iteration_query-ID>
3429      <Iteration_query-def>78_0.566667</Iteration_query-def>
3430      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
3431      <Iteration_hits>
3432        <Hit>
3433          <Hit_num>1</Hit_num>
3434          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
3435          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
3436          <Hit_accession>0</Hit_accession>
3437          <Hit_len>5528445</Hit_len>
3438          <Hit_hsps>
3439            <Hsp>
3440              <Hsp_num>1</Hsp_num>
3441              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
3442              <Hsp_score>30</Hsp_score>
3443              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
3444              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
3445              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
3446              <Hsp_hit-from>5422053</Hsp_hit-from>
3447              <Hsp_hit-to>5422082</Hsp_hit-to>
3448              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
3449              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
3450              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
3451              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
3452              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
3453              <Hsp_qseq>CGGAGTATCCGTTCCCCAACGACAAGCATC</Hsp_qseq>
3454              <Hsp_hseq>CGGAGTATCCGTTCCCCAACGACAAGCATC</Hsp_hseq>
3455              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
3456            </Hsp>
3457          </Hit_hsps>
3458        </Hit>
3459      </Iteration_hits>
3460      <Iteration_stat>
3461        <Statistics>
3462          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
3463          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
3464          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
3465          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
3466          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
3467          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
3468          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
3469        </Statistics>
3470      </Iteration_stat>
3471    </Iteration>
3472    <Iteration>
3473      <Iteration_iter-num>80</Iteration_iter-num>
3474      <Iteration_query-ID>lcl|80_0</Iteration_query-ID>
3475      <Iteration_query-def>79_0.500000</Iteration_query-def>
3476      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
3477      <Iteration_hits>
3478        <Hit>
3479          <Hit_num>1</Hit_num>
3480          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
3481          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
3482          <Hit_accession>0</Hit_accession>
3483          <Hit_len>5528445</Hit_len>
3484          <Hit_hsps>
3485            <Hsp>
3486              <Hsp_num>1</Hsp_num>
3487              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
3488              <Hsp_score>30</Hsp_score>
3489              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
3490              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
3491              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
3492              <Hsp_hit-from>4387420</Hsp_hit-from>
3493              <Hsp_hit-to>4387449</Hsp_hit-to>
3494              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
3495              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
3496              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
3497              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
3498              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
3499              <Hsp_qseq>AATACCGGGAAGAGACAACGGGGTCTCTTT</Hsp_qseq>
3500              <Hsp_hseq>AATACCGGGAAGAGACAACGGGGTCTCTTT</Hsp_hseq>
3501              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
3502            </Hsp>
3503          </Hit_hsps>
3504        </Hit>
3505      </Iteration_hits>
3506      <Iteration_stat>
3507        <Statistics>
3508          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
3509          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
3510          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
3511          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
3512          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
3513          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
3514          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
3515        </Statistics>
3516      </Iteration_stat>
3517    </Iteration>
3518    <Iteration>
3519      <Iteration_iter-num>82</Iteration_iter-num>
3520      <Iteration_query-ID>lcl|82_0</Iteration_query-ID>
3521      <Iteration_query-def>81_0.433333</Iteration_query-def>
3522      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
3523      <Iteration_hits>
3524        <Hit>
3525          <Hit_num>1</Hit_num>
3526          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
3527          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
3528          <Hit_accession>0</Hit_accession>
3529          <Hit_len>5528445</Hit_len>
3530          <Hit_hsps>
3531            <Hsp>
3532              <Hsp_num>1</Hsp_num>
3533              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
3534              <Hsp_score>30</Hsp_score>
3535              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
3536              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
3537              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
3538              <Hsp_hit-from>1037150</Hsp_hit-from>
3539              <Hsp_hit-to>1037179</Hsp_hit-to>
3540              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
3541              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
3542              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
3543              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
3544              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
3545              <Hsp_qseq>ATTAATGTTGCCGGCACAACATAATAGGGC</Hsp_qseq>
3546              <Hsp_hseq>ATTAATGTTGCCGGCACAACATAATAGGGC</Hsp_hseq>
3547              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
3548            </Hsp>
3549          </Hit_hsps>
3550        </Hit>
3551      </Iteration_hits>
3552      <Iteration_stat>
3553        <Statistics>
3554          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
3555          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
3556          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
3557          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
3558          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
3559          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
3560          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
3561        </Statistics>
3562      </Iteration_stat>
3563    </Iteration>
3564    <Iteration>
3565      <Iteration_iter-num>83</Iteration_iter-num>
3566      <Iteration_query-ID>lcl|83_0</Iteration_query-ID>
3567      <Iteration_query-def>82_0.500000</Iteration_query-def>
3568      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
3569      <Iteration_hits>
3570        <Hit>
3571          <Hit_num>1</Hit_num>
3572          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
3573          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
3574          <Hit_accession>0</Hit_accession>
3575          <Hit_len>5528445</Hit_len>
3576          <Hit_hsps>
3577            <Hsp>
3578              <Hsp_num>1</Hsp_num>
3579              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
3580              <Hsp_score>30</Hsp_score>
3581              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
3582              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
3583              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
3584              <Hsp_hit-from>1182188</Hsp_hit-from>
3585              <Hsp_hit-to>1182217</Hsp_hit-to>
3586              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
3587              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
3588              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
3589              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
3590              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
3591              <Hsp_qseq>ACTGGGTTGCTCTGAACAAGAAAGGCGCTA</Hsp_qseq>
3592              <Hsp_hseq>ACTGGGTTGCTCTGAACAAGAAAGGCGCTA</Hsp_hseq>
3593              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
3594            </Hsp>
3595          </Hit_hsps>
3596        </Hit>
3597      </Iteration_hits>
3598      <Iteration_stat>
3599        <Statistics>
3600          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
3601          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
3602          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
3603          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
3604          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
3605          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
3606          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
3607        </Statistics>
3608      </Iteration_stat>
3609    </Iteration>
3610    <Iteration>
3611      <Iteration_iter-num>84</Iteration_iter-num>
3612      <Iteration_query-ID>lcl|84_0</Iteration_query-ID>
3613      <Iteration_query-def>83_0.533333</Iteration_query-def>
3614      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
3615      <Iteration_hits>
3616        <Hit>
3617          <Hit_num>1</Hit_num>
3618          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
3619          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
3620          <Hit_accession>0</Hit_accession>
3621          <Hit_len>5528445</Hit_len>
3622          <Hit_hsps>
3623            <Hsp>
3624              <Hsp_num>1</Hsp_num>
3625              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
3626              <Hsp_score>30</Hsp_score>
3627              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
3628              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
3629              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
3630              <Hsp_hit-from>5430210</Hsp_hit-from>
3631              <Hsp_hit-to>5430239</Hsp_hit-to>
3632              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
3633              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
3634              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
3635              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
3636              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
3637              <Hsp_qseq>CGCCAGGGACGTATCGCGTCGATATCTATT</Hsp_qseq>
3638              <Hsp_hseq>CGCCAGGGACGTATCGCGTCGATATCTATT</Hsp_hseq>
3639              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
3640            </Hsp>
3641          </Hit_hsps>
3642        </Hit>
3643      </Iteration_hits>
3644      <Iteration_stat>
3645        <Statistics>
3646          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
3647          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
3648          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
3649          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
3650          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
3651          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
3652          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
3653        </Statistics>
3654      </Iteration_stat>
3655    </Iteration>
3656    <Iteration>
3657      <Iteration_iter-num>85</Iteration_iter-num>
3658      <Iteration_query-ID>lcl|85_0</Iteration_query-ID>
3659      <Iteration_query-def>84_0.533333</Iteration_query-def>
3660      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
3661      <Iteration_hits>
3662        <Hit>
3663          <Hit_num>1</Hit_num>
3664          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
3665          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
3666          <Hit_accession>0</Hit_accession>
3667          <Hit_len>5528445</Hit_len>
3668          <Hit_hsps>
3669            <Hsp>
3670              <Hsp_num>1</Hsp_num>
3671              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
3672              <Hsp_score>30</Hsp_score>
3673              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
3674              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
3675              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
3676              <Hsp_hit-from>310995</Hsp_hit-from>
3677              <Hsp_hit-to>311024</Hsp_hit-to>
3678              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
3679              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
3680              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
3681              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
3682              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
3683              <Hsp_qseq>TGCTCGTTCCCGTCGTGATGAAGCTCGAAA</Hsp_qseq>
3684              <Hsp_hseq>TGCTCGTTCCCGTCGTGATGAAGCTCGAAA</Hsp_hseq>
3685              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
3686            </Hsp>
3687          </Hit_hsps>
3688        </Hit>
3689      </Iteration_hits>
3690      <Iteration_stat>
3691        <Statistics>
3692          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
3693          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
3694          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
3695          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
3696          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
3697          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
3698          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
3699        </Statistics>
3700      </Iteration_stat>
3701    </Iteration>
3702    <Iteration>
3703      <Iteration_iter-num>86</Iteration_iter-num>
3704      <Iteration_query-ID>lcl|86_0</Iteration_query-ID>
3705      <Iteration_query-def>85_0.500000</Iteration_query-def>
3706      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
3707      <Iteration_hits>
3708        <Hit>
3709          <Hit_num>1</Hit_num>
3710          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
3711          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
3712          <Hit_accession>0</Hit_accession>
3713          <Hit_len>5528445</Hit_len>
3714          <Hit_hsps>
3715            <Hsp>
3716              <Hsp_num>1</Hsp_num>
3717              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
3718              <Hsp_score>30</Hsp_score>
3719              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
3720              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
3721              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
3722              <Hsp_hit-from>4174173</Hsp_hit-from>
3723              <Hsp_hit-to>4174202</Hsp_hit-to>
3724              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
3725              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
3726              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
3727              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
3728              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
3729              <Hsp_qseq>AGGAAAGCAAACAACACGACCACCATCAGC</Hsp_qseq>
3730              <Hsp_hseq>AGGAAAGCAAACAACACGACCACCATCAGC</Hsp_hseq>
3731              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
3732            </Hsp>
3733          </Hit_hsps>
3734        </Hit>
3735      </Iteration_hits>
3736      <Iteration_stat>
3737        <Statistics>
3738          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
3739          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
3740          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
3741          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
3742          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
3743          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
3744          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
3745        </Statistics>
3746      </Iteration_stat>
3747    </Iteration>
3748    <Iteration>
3749      <Iteration_iter-num>87</Iteration_iter-num>
3750      <Iteration_query-ID>lcl|87_0</Iteration_query-ID>
3751      <Iteration_query-def>86_0.566667</Iteration_query-def>
3752      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
3753      <Iteration_hits>
3754        <Hit>
3755          <Hit_num>1</Hit_num>
3756          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
3757          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
3758          <Hit_accession>0</Hit_accession>
3759          <Hit_len>5528445</Hit_len>
3760          <Hit_hsps>
3761            <Hsp>
3762              <Hsp_num>1</Hsp_num>
3763              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
3764              <Hsp_score>30</Hsp_score>
3765              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
3766              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
3767              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
3768              <Hsp_hit-from>163690</Hsp_hit-from>
3769              <Hsp_hit-to>163719</Hsp_hit-to>
3770              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
3771              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
3772              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
3773              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
3774              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
3775              <Hsp_qseq>GGCAACGCAGGCGCATGATTCTGCTTGGAA</Hsp_qseq>
3776              <Hsp_hseq>GGCAACGCAGGCGCATGATTCTGCTTGGAA</Hsp_hseq>
3777              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
3778            </Hsp>
3779          </Hit_hsps>
3780        </Hit>
3781      </Iteration_hits>
3782      <Iteration_stat>
3783        <Statistics>
3784          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
3785          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
3786          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
3787          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
3788          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
3789          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
3790          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
3791        </Statistics>
3792      </Iteration_stat>
3793    </Iteration>
3794    <Iteration>
3795      <Iteration_iter-num>89</Iteration_iter-num>
3796      <Iteration_query-ID>lcl|89_0</Iteration_query-ID>
3797      <Iteration_query-def>88_0.533333</Iteration_query-def>
3798      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
3799      <Iteration_hits>
3800        <Hit>
3801          <Hit_num>1</Hit_num>
3802          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
3803          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
3804          <Hit_accession>0</Hit_accession>
3805          <Hit_len>5528445</Hit_len>
3806          <Hit_hsps>
3807            <Hsp>
3808              <Hsp_num>1</Hsp_num>
3809              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
3810              <Hsp_score>30</Hsp_score>
3811              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
3812              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
3813              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
3814              <Hsp_hit-from>3071785</Hsp_hit-from>
3815              <Hsp_hit-to>3071814</Hsp_hit-to>
3816              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
3817              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
3818              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
3819              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
3820              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
3821              <Hsp_qseq>CGTACCGGGCTGAAAGTAGAAGAGCGTTTC</Hsp_qseq>
3822              <Hsp_hseq>CGTACCGGGCTGAAAGTAGAAGAGCGTTTC</Hsp_hseq>
3823              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
3824            </Hsp>
3825          </Hit_hsps>
3826        </Hit>
3827      </Iteration_hits>
3828      <Iteration_stat>
3829        <Statistics>
3830          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
3831          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
3832          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
3833          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
3834          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
3835          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
3836          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
3837        </Statistics>
3838      </Iteration_stat>
3839    </Iteration>
3840    <Iteration>
3841      <Iteration_iter-num>91</Iteration_iter-num>
3842      <Iteration_query-ID>lcl|91_0</Iteration_query-ID>
3843      <Iteration_query-def>90_0.466667</Iteration_query-def>
3844      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
3845      <Iteration_hits>
3846        <Hit>
3847          <Hit_num>1</Hit_num>
3848          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
3849          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
3850          <Hit_accession>0</Hit_accession>
3851          <Hit_len>5528445</Hit_len>
3852          <Hit_hsps>
3853            <Hsp>
3854              <Hsp_num>1</Hsp_num>
3855              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
3856              <Hsp_score>30</Hsp_score>
3857              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
3858              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
3859              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
3860              <Hsp_hit-from>692131</Hsp_hit-from>
3861              <Hsp_hit-to>692160</Hsp_hit-to>
3862              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
3863              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
3864              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
3865              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
3866              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
3867              <Hsp_qseq>ATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAAC</Hsp_qseq>
3868              <Hsp_hseq>ATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAAC</Hsp_hseq>
3869              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
3870            </Hsp>
3871          </Hit_hsps>
3872        </Hit>
3873      </Iteration_hits>
3874      <Iteration_stat>
3875        <Statistics>
3876          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
3877          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
3878          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
3879          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
3880          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
3881          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
3882          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
3883        </Statistics>
3884      </Iteration_stat>
3885    </Iteration>
3886    <Iteration>
3887      <Iteration_iter-num>92</Iteration_iter-num>
3888      <Iteration_query-ID>lcl|92_0</Iteration_query-ID>
3889      <Iteration_query-def>91_0.566667</Iteration_query-def>
3890      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
3891      <Iteration_hits>
3892        <Hit>
3893          <Hit_num>1</Hit_num>
3894          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
3895          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
3896          <Hit_accession>0</Hit_accession>
3897          <Hit_len>5528445</Hit_len>
3898          <Hit_hsps>
3899            <Hsp>
3900              <Hsp_num>1</Hsp_num>
3901              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
3902              <Hsp_score>30</Hsp_score>
3903              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
3904              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
3905              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
3906              <Hsp_hit-from>3307050</Hsp_hit-from>
3907              <Hsp_hit-to>3307079</Hsp_hit-to>
3908              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
3909              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
3910              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
3911              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
3912              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
3913              <Hsp_qseq>TTCGCCCGGCAAGCTTACCCAACGCTTATC</Hsp_qseq>
3914              <Hsp_hseq>TTCGCCCGGCAAGCTTACCCAACGCTTATC</Hsp_hseq>
3915              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
3916            </Hsp>
3917          </Hit_hsps>
3918        </Hit>
3919      </Iteration_hits>
3920      <Iteration_stat>
3921        <Statistics>
3922          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
3923          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
3924          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
3925          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
3926          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
3927          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
3928          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
3929        </Statistics>
3930      </Iteration_stat>
3931    </Iteration>
3932    <Iteration>
3933      <Iteration_iter-num>95</Iteration_iter-num>
3934      <Iteration_query-ID>lcl|95_0</Iteration_query-ID>
3935      <Iteration_query-def>94_0.466667</Iteration_query-def>
3936      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
3937      <Iteration_hits>
3938        <Hit>
3939          <Hit_num>1</Hit_num>
3940          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
3941          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
3942          <Hit_accession>0</Hit_accession>
3943          <Hit_len>5528445</Hit_len>
3944          <Hit_hsps>
3945            <Hsp>
3946              <Hsp_num>1</Hsp_num>
3947              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
3948              <Hsp_score>30</Hsp_score>
3949              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
3950              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
3951              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
3952              <Hsp_hit-from>1813009</Hsp_hit-from>
3953              <Hsp_hit-to>1813038</Hsp_hit-to>
3954              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
3955              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
3956              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
3957              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
3958              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
3959              <Hsp_qseq>CCACGGTGATATCTGGTGCCATACTGATAA</Hsp_qseq>
3960              <Hsp_hseq>CCACGGTGATATCTGGTGCCATACTGATAA</Hsp_hseq>
3961              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
3962            </Hsp>
3963          </Hit_hsps>
3964        </Hit>
3965      </Iteration_hits>
3966      <Iteration_stat>
3967        <Statistics>
3968          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
3969          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
3970          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
3971          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
3972          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
3973          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
3974          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
3975        </Statistics>
3976      </Iteration_stat>
3977    </Iteration>
3978    <Iteration>
3979      <Iteration_iter-num>97</Iteration_iter-num>
3980      <Iteration_query-ID>lcl|97_0</Iteration_query-ID>
3981      <Iteration_query-def>96_0.533333</Iteration_query-def>
3982      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
3983      <Iteration_hits>
3984        <Hit>
3985          <Hit_num>1</Hit_num>
3986          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
3987          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
3988          <Hit_accession>0</Hit_accession>
3989          <Hit_len>5528445</Hit_len>
3990          <Hit_hsps>
3991            <Hsp>
3992              <Hsp_num>1</Hsp_num>
3993              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
3994              <Hsp_score>30</Hsp_score>
3995              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
3996              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
3997              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
3998              <Hsp_hit-from>573782</Hsp_hit-from>
3999              <Hsp_hit-to>573811</Hsp_hit-to>
4000              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
4001              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
4002              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
4003              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
4004              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
4005              <Hsp_qseq>TTGCCGGGAAGAGAGATATCAATGGCAGGC</Hsp_qseq>
4006              <Hsp_hseq>TTGCCGGGAAGAGAGATATCAATGGCAGGC</Hsp_hseq>
4007              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
4008            </Hsp>
4009          </Hit_hsps>
4010        </Hit>
4011      </Iteration_hits>
4012      <Iteration_stat>
4013        <Statistics>
4014          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
4015          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
4016          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
4017          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
4018          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
4019          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
4020          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
4021        </Statistics>
4022      </Iteration_stat>
4023    </Iteration>
4024    <Iteration>
4025      <Iteration_iter-num>98</Iteration_iter-num>
4026      <Iteration_query-ID>lcl|98_0</Iteration_query-ID>
4027      <Iteration_query-def>97_0.566667</Iteration_query-def>
4028      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
4029      <Iteration_hits>
4030        <Hit>
4031          <Hit_num>1</Hit_num>
4032          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
4033          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
4034          <Hit_accession>0</Hit_accession>
4035          <Hit_len>5528445</Hit_len>
4036          <Hit_hsps>
4037            <Hsp>
4038              <Hsp_num>1</Hsp_num>
4039              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
4040              <Hsp_score>30</Hsp_score>
4041              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
4042              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
4043              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
4044              <Hsp_hit-from>3570563</Hsp_hit-from>
4045              <Hsp_hit-to>3570592</Hsp_hit-to>
4046              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
4047              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
4048              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
4049              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
4050              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
4051              <Hsp_qseq>TGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTT</Hsp_qseq>
4052              <Hsp_hseq>TGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTT</Hsp_hseq>
4053              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
4054            </Hsp>
4055          </Hit_hsps>
4056        </Hit>
4057      </Iteration_hits>
4058      <Iteration_stat>
4059        <Statistics>
4060          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
4061          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
4062          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
4063          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
4064          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
4065          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
4066          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
4067        </Statistics>
4068      </Iteration_stat>
4069    </Iteration>
4070    <Iteration>
4071      <Iteration_iter-num>99</Iteration_iter-num>
4072      <Iteration_query-ID>lcl|99_0</Iteration_query-ID>
4073      <Iteration_query-def>98_0.366667</Iteration_query-def>
4074      <Iteration_query-len>30</Iteration_query-len>
4075      <Iteration_hits>
4076        <Hit>
4077          <Hit_num>1</Hit_num>
4078          <Hit_id>gnl|BL_ORD_ID|0</Hit_id>
4079          <Hit_def>/depot/data2/galaxy/microbes/eschColi_O157H7EDL933_1/seq/chr.nib:1-5528445</Hit_def>
4080          <Hit_accession>0</Hit_accession>
4081          <Hit_len>5528445</Hit_len>
4082          <Hit_hsps>
4083            <Hsp>
4084              <Hsp_num>1</Hsp_num>
4085              <Hsp_bit-score>59.96</Hsp_bit-score>
4086              <Hsp_score>30</Hsp_score>
4087              <Hsp_evalue>8.38112e-11</Hsp_evalue>
4088              <Hsp_query-from>1</Hsp_query-from>
4089              <Hsp_query-to>30</Hsp_query-to>
4090              <Hsp_hit-from>4545136</Hsp_hit-from>
4091              <Hsp_hit-to>4545165</Hsp_hit-to>
4092              <Hsp_query-frame>1</Hsp_query-frame>
4093              <Hsp_hit-frame>1</Hsp_hit-frame>
4094              <Hsp_identity>30</Hsp_identity>
4095              <Hsp_positive>30</Hsp_positive>
4096              <Hsp_align-len>30</Hsp_align-len>
4097              <Hsp_qseq>AACGCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATT</Hsp_qseq>
4098              <Hsp_hseq>AACGCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATT</Hsp_hseq>
4099              <Hsp_midline>||||||||||||||||||||||||||||||</Hsp_midline>
4100            </Hsp>
4101          </Hit_hsps>
4102        </Hit>
4103      </Iteration_hits>
4104      <Iteration_stat>
4105        <Statistics>
4106          <Statistics_db-num>1</Statistics_db-num>
4107          <Statistics_db-len>5528445</Statistics_db-len>
4108          <Statistics_hsp-len>0</Statistics_hsp-len>
4109          <Statistics_eff-space>0</Statistics_eff-space>
4110          <Statistics_kappa>0.711</Statistics_kappa>
4111          <Statistics_lambda>1.374</Statistics_lambda>
4112          <Statistics_entropy>1.31</Statistics_entropy>
4113        </Statistics>
4114      </Iteration_stat>
4115    </Iteration>
4116  </BlastOutput_iterations>
4117</BlastOutput>
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。