root/galaxy-central/test-data/1.lav
リビジョン 2, 2.7 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前) |
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行番号 | |
---|---|
1 | #:lav |
2 | d { |
3 | "blastz out.seq1m seq2data Y=3400 H=0 W=8 B=2 K=3000 C=0 m=83886080 P=0 |
4 | A C G T |
5 | 91 -114 -31 -123 |
6 | -114 100 -125 -31 |
7 | -31 -125 100 -114 |
8 | -123 -31 -114 91 |
9 | O = 400, E = 30, K = 3000, L = 3000, M = 50" |
10 | } |
11 | #:lav |
12 | s { |
13 | "out.seq1m" 1 1680 0 1 |
14 | "seq2data" 1 1680 0 1 |
15 | } |
16 | h { |
17 | ">seqmask seq1data out.repeats" |
18 | ">seq2" |
19 | } |
20 | a { |
21 | s 161304 |
22 | b 1 1 |
23 | e 1680 1680 |
24 | l 1 1 1680 1680 100 |
25 | } |
26 | a { |
27 | s 15173 |
28 | b 186 251 |
29 | e 450 505 |
30 | l 186 251 244 309 92 |
31 | l 256 310 280 334 84 |
32 | l 281 336 307 362 78 |
33 | l 308 374 329 395 91 |
34 | l 341 396 367 422 81 |
35 | l 369 423 419 473 94 |
36 | l 422 474 425 477 75 |
37 | l 426 481 450 505 96 |
38 | } |
39 | a { |
40 | s 12134 |
41 | b 191 343 |
42 | e 361 503 |
43 | l 191 343 215 367 80 |
44 | l 216 369 244 397 86 |
45 | l 256 398 361 503 95 |
46 | } |
47 | a { |
48 | s 4422 |
49 | b 192 431 |
50 | e 276 505 |
51 | l 192 431 212 451 100 |
52 | l 223 452 244 473 95 |
53 | l 247 474 254 481 63 |
54 | l 255 484 276 505 91 |
55 | } |
56 | a { |
57 | s 6872 |
58 | b 192 311 |
59 | e 330 450 |
60 | l 192 311 215 334 83 |
61 | l 216 336 275 395 73 |
62 | l 286 396 307 417 91 |
63 | l 308 428 330 450 96 |
64 | } |
65 | a { |
66 | s 14437 |
67 | b 192 224 |
68 | e 472 505 |
69 | l 192 224 223 255 84 |
70 | l 224 257 255 288 84 |
71 | l 257 289 277 309 90 |
72 | l 288 310 308 330 90 |
73 | l 309 342 362 395 85 |
74 | l 374 396 395 417 91 |
75 | l 396 428 417 449 95 |
76 | l 428 450 449 471 95 |
77 | l 450 483 472 505 91 |
78 | } |
79 | a { |
80 | s 7306 |
81 | b 192 399 |
82 | e 308 505 |
83 | l 192 399 244 451 94 |
84 | l 256 452 277 473 91 |
85 | l 280 474 283 477 100 |
86 | l 284 481 308 505 92 |
87 | } |
88 | a { |
89 | s 11180 |
90 | b 193 290 |
91 | e 396 505 |
92 | l 193 290 212 309 100 |
93 | l 223 310 280 367 76 |
94 | l 281 369 332 420 88 |
95 | l 333 422 335 424 100 |
96 | l 336 429 341 434 83 |
97 | l 342 451 396 505 87 |
98 | } |
99 | a { |
100 | s 14437 |
101 | b 224 192 |
102 | e 505 472 |
103 | l 224 192 255 223 84 |
104 | l 257 224 288 255 84 |
105 | l 289 257 309 277 90 |
106 | l 310 288 330 308 90 |
107 | l 342 309 395 362 85 |
108 | l 396 374 417 395 91 |
109 | l 428 396 449 417 95 |
110 | l 450 428 471 449 95 |
111 | l 483 450 505 472 91 |
112 | } |
113 | a { |
114 | s 15173 |
115 | b 251 186 |
116 | e 505 450 |
117 | l 251 186 309 244 92 |
118 | l 310 256 334 280 84 |
119 | l 336 281 362 307 78 |
120 | l 374 308 395 329 91 |
121 | l 396 341 422 367 81 |
122 | l 423 369 473 419 94 |
123 | l 474 422 477 425 75 |
124 | l 481 426 505 450 96 |
125 | } |
126 | a { |
127 | s 11180 |
128 | b 290 193 |
129 | e 505 396 |
130 | l 290 193 309 212 100 |
131 | l 310 223 367 280 76 |
132 | l 369 281 420 332 88 |
133 | l 422 333 424 335 100 |
134 | l 429 336 434 341 83 |
135 | l 451 342 505 396 87 |
136 | } |
137 | a { |
138 | s 6872 |
139 | b 311 192 |
140 | e 450 330 |
141 | l 311 192 334 215 83 |
142 | l 336 216 395 275 73 |
143 | l 396 286 417 307 91 |
144 | l 428 308 450 330 96 |
145 | } |
146 | a { |
147 | s 12134 |
148 | b 343 191 |
149 | e 503 361 |
150 | l 343 191 367 215 80 |
151 | l 369 216 397 244 86 |
152 | l 398 256 503 361 95 |
153 | } |
154 | a { |
155 | s 7306 |
156 | b 399 192 |
157 | e 505 308 |
158 | l 399 192 451 244 94 |
159 | l 452 256 473 277 91 |
160 | l 474 280 477 283 100 |
161 | l 481 284 505 308 92 |
162 | } |
163 | a { |
164 | s 4422 |
165 | b 431 192 |
166 | e 505 276 |
167 | l 431 192 451 212 100 |
168 | l 452 223 473 244 95 |
169 | l 474 247 481 254 63 |
170 | l 484 255 505 276 91 |
171 | } |
172 | x { |
173 | n 0 |
174 | } |
175 | m { |
176 | n 0 |
177 | } |
178 | #:eof |
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser
を参照してください。