root/galaxy-central/test-data/bwa_wrapper_out2.sam

リビジョン 2, 3.9 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central
行番号 
1seq1    16      phiX    322     25      36M     *       0       0       GATATTTTAAAGGAGCGTGGATTACTATCTGAGTCC    B&&I13A$G$*%$IIIIIII9(.+5$IIIIIII#II    XT:A:U  NM:i:2  X0:i:1  XM:i:2  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:2C8A24
2seq10   0       phiX    4149    37      17M1D19M        *       0       0       ATTCTTTCTTTTCGTATCAGGGCGTTGAGTTCGATA    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII    XT:A:U  NM:i:2  X0:i:1  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:5G11^G19
3seq11   0       phiX    4072    37      18M1D18M        *       0       0       GCATTTCTACTCCTTCTCATCCCCAATGCTTGGCTT    II#IIIIIII$5+.(9IIIIIII$%*$G$A31I&&B    XT:A:U  NM:i:2  X0:i:1  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:12T5^A18
4seq12   4       *       0       0       *       *       0       0       CGCGCTTCGATAAAAATGGGATTGGCGTTTCCAACC    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII
5seq13   4       *       0       0       *       *       0       0       ATTTCTACTCTTTCTCATCCCCAATCCTTGCCTTCC    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIAAIIIIIIIIIIIII
6seq14   0       phiX    3998    37      21M1D15M        *       0       0       CCCTTTTGAATGTCACGCTGATATTTTGACTTTGAG    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII    XT:A:U  NM:i:2  X0:i:1  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:5C15^T15
7seq15   4       *       0       0       *       *       0       0       CCAACTTACCAAGGTGGGTTACGAAACGCGACGCCG    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII
8seq16   4       *       0       0       *       *       0       0       TCAGGGTATTAAAAGAGATTATTTTTCTCCAGCCAC    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII
9seq17   0       phiX    3034    37      19M1D17M        *       0       0       GTGATGTGCTTGCTACCGAAACAATACTTTAGGCAT    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII    XT:A:U  NM:i:2  X0:i:1  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:19^T9G7
10seq18   4       *       0       0       *       *       0       0       TCAATCCCCCATGCTTGGCCGTTCCATAAGCAGATG    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII
11seq19   4       *       0       0       *       *       0       0       TTCCTGCGCTTAATGCTTGAGCGTCCTGGTGCTGAT    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII
12seq2    0       phiX    141     37      36M     *       0       0       ATTCGACCTATCCTTGCGCAGCTCGAGAAGCTCTTA    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII    XT:A:U  NM:i:0  X0:i:1  XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:36
13seq20   0       phiX    1082    37      36M     *       0       0       CTTATTACCATTTCAACTACTCCGGTTATCGCTGGC    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII    XT:A:U  NM:i:0  X0:i:1  XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:36
14seq21   0       phiX    1344    37      15M1D21M        *       0       0       CTGATACCAATAAAACCCTAAGCATTTGGTTCAGGG    II#IIIIIII$5+.(9IIIIIII$%*$G$A31I&&B    XT:A:U  NM:i:2  X0:i:1  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:15^T13T7
15seq22   4       *       0       0       *       *       0       0       AATCAAACTTACCAAGGGGTTACGACGCGACGCCGT    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII
16seq23   4       *       0       0       *       *       0       0       TGTGCTTCCCCAACTTGATTTAATAACCCTATAGAC    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII
17seq24   0       phiX    4084    37      17M1I18M        *       0       0       TTTCTCAATCCCCAATGCCTTGGCTTCCCTAAGCAG    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII    XT:A:U  NM:i:2  X0:i:1  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:27A7
18seq25   0       phiX    520     37      16M1I19M        *       0       0       TTGCTACTGACCGCTCTTCGTGCTCGTTGCTGCGTT    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII    XT:A:U  NM:i:2  X0:i:1  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:26C8
19seq26   0       phiX    1976    37      36M     *       0       0       CCGCGTGAAATTTCTATGAAGGATGTTTTCCGTTCT    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII    XT:A:U  NM:i:0  X0:i:1  XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:36
20seq27   0       phiX    2598    37      20M1I15M        *       0       0       CGCTAATCAAGTTGTTTCTGTTTGGTGCTGATATTG    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII    XT:A:U  NM:i:2  X0:i:1  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:9G25
21seq28   4       *       0       0       *       *       0       0       AAAGAGATTATTTGTCGGTCCAGCCACTAAAGTGAG    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII
22seq29   4       *       0       0       *       *       0       0       CAAATTAATGCGCGCTTCGATAATGATTGGGGTATC    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII
23seq3    0       phiX    505     37      36M     *       0       0       GTAACAAAGTTTGGATTGCTACTGACCGCTCTCGTG    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII    XT:A:U  NM:i:0  X0:i:1  XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:36
24seq30   0       phiX    4091    37      18M1I17M        *       0       0       ATCCCCTATGCTTGGCTTACCATAAGCAGATGGATA    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII    XT:A:U  NM:i:2  X0:i:1  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:6A28
25seq4    4       *       0       0       *       *       0       0       AGCCGCTCGTCTTTTATGTAGGTGGTCAACCATTTT    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII
26seq5    0       phiX    4985    25      36M     *       0       0       CAGTTATATGGCTTTTGGTTTCTATGTGGCTTAATA    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII    XT:A:U  NM:i:2  X0:i:1  XM:i:2  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:13G17A4
27seq6    0       phiX    925     37      11M1D25M        *       0       0       AGGCGCTCGTCTTGGTATGTAGGTGGTCAACAATTT    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII    XT:A:U  NM:i:1  X0:i:1  XM:i:0  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:11^T25
28seq7    0       phiX    943     37      13M1I22M        *       0       0       TGTAGGTGGTCAACCAATTTTAATTGCAGGGGCTTC    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII    XT:A:U  NM:i:1  X0:i:1  XM:i:0  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:35
29seq8    4       *       0       0       *       *       0       0       ACACCCGTCCTTTACGTCATGCGCTCTATTCTCTGG    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII
30seq9    0       phiX    2596    37      16M1I19M        *       0       0       GCCGCTATTCAGGTTGTTTTCTGTTGGTGCTGATAT    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII    XT:A:U  NM:i:2  X0:i:1  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:7A27
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。