root/galaxy-central/test-data/cufflinks_out1.gtf

リビジョン 2, 0.9 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central
行番号 
1test_chromosome Cufflinks       transcript      53      550     1000    +       .       gene_id "CUFF.1"; transcript_id "CUFF.1.1"; FPKM "3355704.6979865772"; frac "1.000000"; conf_lo "2697596.861952"; conf_hi "4013812.534021"; cov "46.057047";
2test_chromosome Cufflinks       exon    53      250     1000    +       .       gene_id "CUFF.1"; transcript_id "CUFF.1.1"; exon_number "1"; FPKM "3355704.6979865772"; frac "1.000000"; conf_lo "2697596.861952"; conf_hi "4013812.534021"; cov "46.057047";
3test_chromosome Cufflinks       exon    351     400     1000    +       .       gene_id "CUFF.1"; transcript_id "CUFF.1.1"; exon_number "2"; FPKM "3355704.6979865772"; frac "1.000000"; conf_lo "2697596.861952"; conf_hi "4013812.534021"; cov "46.057047";
4test_chromosome Cufflinks       exon    501     550     1000    +       .       gene_id "CUFF.1"; transcript_id "CUFF.1.1"; exon_number "3"; FPKM "3355704.6979865772"; frac "1.000000"; conf_lo "2697596.861952"; conf_hi "4013812.534021"; cov "46.057047";
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。