root/galaxy-central/test-data/customTrack2.bed

リビジョン 2, 10.6 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central

行番号 
1chr2    36124   36160   GC_rich 29      +
2chr2    36572   36711   (CCCCG)n        247     +
3chr2    36610   36800   C-rich  392     +
4chr2    37778   37853   GA-rich 206     +
5chr2    38158   39025   L1PA10  6050    +
6chr2    39034   39201   L1M4c   431     -
7chr2    39235   39279   MIR     201     +
8chr2    39436   40499   L1PA16  5353    +
9chr2    40733   40949   L1M5    321     +
10chr2    41007   41090   Charlie1        360     +
11chr2    41090   41137   LTR45   532     -
12chr2    41137   41554   MSTB    2312    +
13chr2    41554   41696   LTR45B  626     -
14chr2    41651   41716   MER5A1  236     -
15chr2    41739   41815   LTR45   469     -
16chr2    41852   41969   Charlie1        236     +
17chr2    41987   42034   FLAM_C  702     +
18chr2    42034   42445   MSTA    2481    +
19chr2    42445   42548   FLAM_C  702     +
20chr2    42565   42681   Charlie1        470     +
21chr2    42761   42807   L2      185     -
22chr2    42835   43469   L1M5    903     +
23chr2    43469   43551   AluJ/FLAM       508     +
24chr2    43626   43721   MER33   393     +
25chr2    43770   43929   L1M5    262     +
26chr2    44897   45496   LTR71B  1895    -
27chr2    45970   46426   L1M2b   1705    +
28chr2    46426   46670   THE1B   1704    -
29chr2    46744   46941   MER52D  245     +
30chr2    47216   47483   MER52D  1052    +
31chr2    47484   48495   MER52D  4223    +
32chr2    48495   49053   MER52-int       3942    +
33chr2    49172   49903   MER52-int       5089    +
34chr2    49932   50066   THE1B   735     -
35chr2    50070   51136   L1M2b   3786    +
36chr2    51136   51399   AluY    2214    +
37chr2    51399   51727   L1M2b   3786    +
38chr2    51719   52002   L1MA5   1983    +
39chr2    52002   52275   AluJb   1906    +
40chr2    52289   52336   (TAAA)n 423     +
41chr2    52336   52400   L1MA5   1983    +
42chr2    52400   52625   AluSq   1665    +
43chr2    52625   52683   L1MA5   1983    +
44chr2    52709   52837   FLAM_C  734     -
45chr2    54453   54517   MER94   494     +
46chr2    54517   54809   AluSx   2081    -
47chr2    54809   54860   MER94   494     +
48chr2    54866   54998   MIR3    332     +
49chr2    59062   59093   AT_rich 31      +
50chr2    60498   60560   MIRb    192     +
51chr2    61205   61717   MLT1H   754     +
52chr2    62079   62552   MLT1D   2121    +
53chr2    62909   63061   MER67A  375     +
54chr2    63742   64034   AluSx   1506    -
55chr2    64185   64306   MLT1H   280     -
56chr2    64641   65101   MER4A1  3135    +
57chr2    66342   66707   THE1B   2550    -
58chr2    66707   68238   MLT1H-int       3238    -
59chr2    68240   68605   THE1B   2399    -
60chr2    69792   69907   MIRb    240     +
61chr2    69909   70264   MER4A1  2647    -
62chr2    70452   70639   MIR     228     +
63chr2    70876   71234   MLT1J1  575     -
64chr2    72494   72620   L1ME3B  400     -
65chr2    72645   73168   MER90a  2062    -
66chr2    74780   74914   MIRb    213     +
67chr2    74983   75046   MIR3    180     +
68chr2    75251   75291   MIRm    198     -
69chr2    75313   75430   MIRb    215     -
70chr2    75652   75823   MIRb    225     +
71chr2    77049   77357   AluJo   1747    +
72chr2    77438   77474   AT_rich 22      +
73chr2    77475   77811   L1MC4   683     -
74chr2    77813   78125   L1MC4a  1528    -
75chr2    78125   78408   AluJo   1550    +
76chr2    78408   78515   L1MC4a  1528    -
77chr2    78515   78553   (CA)n   342     +
78chr2    78553   78726   L1MC4a  1528    -
79chr2    79305   79613   L1MC4   506     +
80chr2    80122   80210   L1MC4   231     +
81chr2    80251   80559   L1MC    1036    +
82chr2    80569   80809   L1PA7   11967   +
83chr2    80809   82246   LTR12C  9549    +
84chr2    82246   84045   L1PA7   11967   +
85chr2    84045   85055   LTR5A   8123    +
86chr2    85055   89392   L1PA7   20590   +
87chr2    89556   89820   AluY    1994    +
88chr2    90168   90462   L2      554     -
89chr2    90462   90717   AluSx   1621    +
90chr2    90717   90841   L2      554     -
91chr2    91794   91832   AT_rich 24      +
92chr2    92171   92375   MIRb    363     +
93chr2    92468   93502   L1MA4A  4118    -
94chr2    93497   96075   L1MA4A  11775   -
95chr2    96408   97310   L1MA4A  9242    -
96chr2    97310   97600   AluSx   2107    -
97chr2    97600   99410   L1MA4A  9242    -
98chr2    99671   99720   (GGAA)n 317     +
99chr2    100500  100526  AT_rich 26      +
100chr2    100790  100850  L1M5    226     +
101chr2    101493  101736  MIRb    664     -
102chr2    102084  102384  AluSx   2334    -
103chr2    103029  103104  L2      287     +
104chr2    103525  103696  L3      282     -
105chr2    103888  104191  AluSx   2269    +
106chr2    104206  104332  L2      292     +
107chr2    104498  104580  MIRb    248     -
108chr2    105772  105883  L2      270     +
109chr2    106293  106594  AluSc   2269    +
110chr2    106705  107055  L2      539     -
111chr2    107056  107905  MER45B  3388    -
112chr2    107963  108173  Charlie4a       1340    +
113chr2    108173  108471  AluSg   2024    +
114chr2    108471  108687  Charlie4a       1340    +
115chr2    108706  109100  L2      906     -
116chr2    109366  109439  HAL1    264     -
117chr2    109439  109730  AluSx   1921    +
118chr2    109730  109812  HAL1    264     -
119chr2    110514  110571  MER5B   225     +
120chr2    111186  111304  MER94   459     +
121chr2    111642  111836  MIR     654     -
122chr2    111936  112346  L2      309     -
123chr2    112452  112477  (TGAA)n 225     +
124chr2    112938  113010  MIRb    180     +
125chr2    115295  115402  MIR     343     +
126chr2    115424  115551  MIR     412     -
127chr2    116167  117645  SVA     11488   +
128chr2    117805  118013  MIRb    306     -
129chr2    118824  119831  L1PB    5354    -
130chr2    120000  120038  (TAAA)n 197     +
131chr2    120670  120807  MER5B   553     +
132chr2    120921  121233  AluJo   1929    -
133chr2    122648  122930  AluSp   2141    +
134chr2    123099  123410  AluJb   1619    +
135chr2    123519  123681  L1ME3A  325     +
136chr2    123710  123775  LTR43   242     -
137chr2    123841  124183  LTR43B  1146    -
138chr2    124264  124603  L1ME3A  939     +
139chr2    125097  125705  L1MC1   3512    +
140chr2    125706  126048  MSTA    2544    +
141chr2    126048  126347  AluSx   1849    +
142chr2    126347  126409  MSTA    2544    +
143chr2    127755  128321  L1MA9   2460    -
144chr2    128314  128822  L1MA9   1912    +
145chr2    128822  128844  AT_rich 22      +
146chr2    128906  129305  MLT1A1  1893    +
147chr2    131614  132043  MSTA    2057    -
148chr2    132398  132645  AluY    1947    +
149chr2    133039  133106  AT_rich 32      +
150chr2    133111  133341  PABL_A  1802    -
151chr2    133341  134756  PABL_A-int      10971   -
152chr2    135007  135054  L2      184     -
153chr2    135074  135147  L2      249     +
154chr2    135270  135471  L1MEb   333     -
155chr2    135510  135690  Tigger1 669     +
156chr2    135672  135884  Tigger1 1251    +
157chr2    135884  135947  L1M2    8741    -
158chr2    135947  136253  AluSp   2298    -
159chr2    136253  136888  L1M2    8741    -
160chr2    136888  136922  (TTTA)n 224     +
161chr2    136922  137816  L1M2    8741    -
162chr2    137816  138169  THE1B   2055    -
163chr2    138169  138639  L1M2    8741    -
164chr2    138641  139121  MER44C  2479    +
165chr2    139144  139808  MER4A   2394    +
166chr2    139810  140042  MER44C  1272    +
167chr2    140046  140215  L1M2    664     -
168chr2    140215  140675  MER4A1  3468    +
169chr2    140675  140763  L1M2    664     -
170chr2    141552  142024  L1MEb   591     -
171chr2    142058  142213  MER51A  538     +
172chr2    142215  142519  MER51B  1633    +
173chr2    142638  142787  HAL1b   319     -
174chr2    143395  143564  LTR17   1225    -
175chr2    143580  143698  AluY    902     +
176chr2    143698  144298  LTR17   4934    -
177chr2    144298  144589  HERV17  2415    -
178chr2    144579  144620  HERV17  305     -
179chr2    144612  148188  HERV17  30373   -
180chr2    148187  150021  HERV17  13802   -
181chr2    150021  150782  LTR17   6037    -
182chr2    151296  151390  L2      190     -
183chr2    152021  152314  AluJb   1532    +
184chr2    153860  154064  L3      484     +
185chr2    154147  155500  L1PA7   7363    +
186chr2    155550  155627  L4      184     +
187chr2    156586  156729  MIRb    240     +
188chr2    157888  159232  L1MC2   4364    +
189chr2    159933  160007  MIR3    196     +
190chr2    160097  160129  AT_rich 32      +
191chr2    160901  160950  (CA)n   378     +
192chr2    161462  161773  AluY    2636    +
193chr2    161926  162002  Kanga1  233     -
194chr2    164118  164211  HAL1    264     +
195chr2    164330  164435  (CATATA)n       450     +
196chr2    164435  164679  AluSx   1559    -
197chr2    164780  164802  AT_rich 22      +
198chr2    164931  165118  MIRb    183     -
199chr2    167243  167542  AluSx   1867    +
200chr2    168414  168510  L1PB1   3181    +
201chr2    168510  168537  (TA)n   182     +
202chr2    168537  168572  (CA)n   324     +
203chr2    168572  168923  L1PB1   3181    +
204chr2    169914  170344  LTR35-int       677     +
205chr2    170349  170763  LTR35-int       1559    +
206chr2    170771  170917  L1PA4   1004    +
207chr2    170998  172290  LTR57-int       5968    +
208chr2    171342  173675  LOR1-int        6255    +
209chr2    173750  173972  LOR1-int        625     +
210chr2    174098  174198  LTR49-int       367     +
211chr2    174202  174392  LOR1-int        1108    +
212chr2    174395  174681  MER49   4056    +
213chr2    174681  175052  THE1C   2588    +
214chr2    175052  175497  MER49   4056    +
215chr2    175684  176055  LOR1-int        351     +
216chr2    176246  176698  LTR35   736     +
217chr2    176818  176841  AT_rich 23      +
218chr2    176990  177493  MLT1F2  1583    +
219chr2    177497  177522  (CAAAAA)n       225     +
220chr2    177538  177765  L1MC4   481     +
221chr2    177880  178397  LTR22C  2762    -
222chr2    178522  178630  AluJb   728     +
223chr2    178895  178998  L1M5    261     +
224chr2    179170  179198  AT_rich 21      +
225chr2    179978  180161  MER20   331     +
226chr2    180330  180509  L1MB2   1075    +
227chr2    180509  181898  LTR12C  8168    -
228chr2    181898  181924  L1MB2   1075    +
229chr2    181903  182185  L1MB2   1132    +
230chr2    182394  182433  (T)n    246     +
231chr2    182441  182653  AluSg   1644    -
232chr2    185331  185446  L1M4    246     -
233chr2    185937  186497  MER92B  900     -
234chr2    189807  189920  L2      242     +
235chr2    190069  190208  L2      229     -
236chr2    190610  190778  MIR     271     -
237chr2    190936  191064  MIRb    241     +
238chr2    192383  192531  L1MC4a  279     -
239chr2    192614  192967  MSTA    1342    +
240chr2    193615  193737  L1M4    416     -
241chr2    194139  194517  MSTA    2196    +
242chr2    195051  195659  MER4B   3688    +
243chr2    196994  197082  (GGAA)n 1047    +
244chr2    197082  197262  (GGGA)n 1431    +
245chr2    197262  197302  (GGAA)n 1047    +
246chr2    197302  197482  (GGGA)n 1347    +
247chr2    197482  197502  (GGAA)n 1047    +
248chr2    197502  197682  (GGGA)n 1368    +
249chr2    197682  197714  (GGAA)n 1047    +
250chr2    197714  197752  polypurine      219     +
251chr2    198076  198423  MLT1A0  1472    +
252chr2    199454  199677  L2      323     +
253chr2    199741  199990  L2      449     +
254chr2    201304  201337  AT_rich 26      +
255chr2    201543  201737  MIRb    344     -
256chr2    202374  203301  Tigger1 6366    -
257chr2    203546  203694  L1MC2   594     -
258chr2    204844  204905  Alu     426     +
259chr2    204907  205020  L1MD    245     -
260chr2    205310  205354  (CA)n   248     +
261chr2    205572  205611  AT_rich 25      +
262chr2    205757  206463  L1ME1   2227    -
263chr2    206478  206741  L1MA4   1087    -
264chr2    207057  207228  L1M3de  232     -
265chr2    207784  208051  L2      525     -
266chr2    208713  208734  AT_rich 21      +
267chr2    209284  209645  MLT1A0  1607    +
268chr2    210181  210214  (TAA)n  236     +
269chr2    211053  211149  MIR     223     -
270chr2    212441  212529  MER20   473     +
271chr2    213153  213232  MIRb    221     -
272chr2    215176  215279  Charlie2        435     -
273chr2    215309  215572  Charlie2        466     -
274chr2    215762  215892  L1MC4a  248     +
275chr2    216077  216489  L1MC4a  421     +
276chr2    217210  217559  L1MC4a  326     +
277chr2    217567  217588  AT_rich 21      +
278chr2    217889  217910  (TG)n   189     +
279chr2    219447  219753  AluYa5  2878    +
280chr2    220529  220769  AluSx   1445    -
281chr2    221199  221228  AT_rich 22      +
282chr2    221477  221524  (CATATA)n       240     +
283chr2    222442  222742  L1PA6   2387    -
284chr2    222746  222958  L1ME4a  234     +
285chr2    224460  224564  MIRb    253     -
286chr2    224875  225175  AluSq   2314    -
287chr2    226239  226463  MIR     272     +
288chr2    226463  226678  MIR     378     +
289chr2    227578  227831  L1MA4   1053    +
290chr2    228067  228259  LTR52   326     +
291chr2    228259  228303  (TG)n   396     +
292chr2    228303  228355  LTR52   326     +
293chr2    229207  229376  MER105  586     +
294chr2    229713  232723  L1M4b   6457    +
295chr2    232723  232751  (CAA)n  231     +
296chr2    232751  233606  L1M4    3745    +
297chr2    233633  233769  LTR16A1 309     +
298chr2    233780  233825  MIRb    246     +
299chr2    234214  234524  AluY    2373    +
300chr2    234527  234584  (GAAA)n 326     +
301chr2    234597  234715  MIR     217     -
302chr2    235457  235691  MIR     371     -
303chr2    235866  235892  (TAAAAA)n       201     +
304chr2    235913  236224  AluSq   2400    +
305chr2    236591  236642  GA-rich 202     +
306chr2    237758  237789  AT_rich 24      +
307chr2    241682  241737  MER5A   222     -
308chr2    242099  242222  MER5A   250     -
309chr2    243203  243830  MER41B  4374    +
310chr2    244057  244136  AT_rich 44      +
311chr2    244592  245160  MER4A   1940    +
312chr2    245335  245610  AluJo   1518    +
313chr2    246060  246409  L1ME2   2049    -
314chr2    246409  246714  AluSq   2369    +
315chr2    246714  247040  L1ME2   2049    -
316chr2    247032  247373  L1PREC2 1625    -
317chr2    247373  247786  MER57B  2701    +
318chr2    247790  248410  L1PREC2 3920    -
319chr2    248438  249129  L1MEc   575     -
320chr2    249353  249388  AT_rich 28      +
321chr2    249505  249889  L1MC    354     +
322chr2    253987  254010  GC_rich 23      +
323chr2    256504  257206  MER44C  3540    -
324chr2    257237  257619  L2      869     -
325chr2    257626  257758  MER105  414     -
326chr2    257758  258055  MER58B  701     -
327chr2    258065  258208  L2      435     -
328chr2    259635  259758  MER39   618     +
329chr2    259816  260040  MER39   688     +
330chr2    260145  260244  L2      235     +
331chr2    260590  260618  AT_rich 28      +
332chr2    260619  260678  MER21C  340     +
333chr2    260678  260979  MER77   442     +
334chr2    261078  261136  L2      193     +
335chr2    261228  261475  MER8    820     +
336chr2    261491  261567  Charlie9        244     -
337chr2    263033  263317  MSTD    409     -
338chr2    263469  263560  MER58A  287     +
339chr2    263885  264181  AluJo   1552    +
340chr2    265538  265751  MIR     405     -
341chr2    265969  265990  AT_rich 21      +
342chr2    266132  266443  L2      310     +
343chr2    268083  268107  AT_rich 24      +
344chr2    272348  272439  L2      215     +
345chr2    274262  274365  MER5A1  525     -
346chr2    274737  274812  MIR3    296     +
347chr2    275187  275231  MIR     229     +
348chr2    277448  277470  (A)n    198     +
349chr2    277738  277788  GC_rich 36      +
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。