root/galaxy-central/test-data/emboss_compseq_out.compseq

リビジョン 2, 0.9 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central
行番号 
1#
2# Output from 'compseq'
3#
4# The Expected frequencies are calculated on the (false) assumption that every
5# word has equal frequency.
6#
7# The input sequences are:
8#       Sequence
9
10
11Word size       2
12Total count     560
13
14#
15# Word  Obs Count       Obs Frequency   Exp Frequency   Obs/Exp Frequency
16#
17AA      40              0.0714286       0.0625000       1.1428571
18AC      27              0.0482143       0.0625000       0.7714286
19AG      26              0.0464286       0.0625000       0.7428571
20AT      41              0.0732143       0.0625000       1.1714286
21CA      26              0.0464286       0.0625000       0.7428571
22CC      24              0.0428571       0.0625000       0.6857143
23CG      15              0.0267857       0.0625000       0.4285714
24CT      41              0.0732143       0.0625000       1.1714286
25GA      19              0.0339286       0.0625000       0.5428571
26GC      17              0.0303571       0.0625000       0.4857143
27GG      19              0.0339286       0.0625000       0.5428571
28GT      43              0.0767857       0.0625000       1.2285714
29TA      50              0.0892857       0.0625000       1.4285714
30TC      38              0.0678571       0.0625000       1.0857143
31TG      37              0.0660714       0.0625000       1.0571429
32TT      97              0.1732143       0.0625000       2.7714286
33
34Other   0               0.0000000       0.0000000       10000000000.0000000
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。