root/galaxy-central/test-data/emboss_epestfind_out.epestfind

リビジョン 2, 1.6 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central
行番号 
1PEST-find: Finds PEST motifs as potential proteolytic cleavage sites.
2
3    No PEST motif was identified in Sequence from 1 to 561.
4
5
6       ---------+---------+---------+---------+---------+---------+
7
8     1 GTTCGATGCCTAAAATACCTTCTTTTGTCCCTACACAGACCACAGTTTTCCTAATGGCTT 60
9                                                                   
10
11    61 TACACCGACTAGAAATTCTTGTGCAAGCACTAATTGAAAGCGGTTGGCCTAGAGTGTTAC 120
12                                                                   
13
14   121 CGGTTTGTATAGCTGAGCGCGTCTCTTGCCCTGATCAAAGGTTCATTTTCTCTACTTTGG 180
15                                                                   
16
17   181 AAGACGTTGTGGAAGAATACAACAAGTACGAGTCTCTCCCCCCTGGTTTGCTGATTACTG 240
18                                                                   
19
20   241 GATACAGTTGTAATACCCTTCGCAACACCGCGTAACTATCTATATGAATTATTTTCCCTT 300
21                                                                   
22
23   301 TATTATATGTAGTAGGTTCGTCTTTAATCTTCCTTTAGCAAGTCTTTTACTGTTTTCGAC 360
24                                                                   
25
26   361 CTCAATGTTCATGTTCTTAGGTTGTTTTGGATAATATGCGGTCAGTTTAATCTTCGTTGT 420
27                                                                   
28
29   421 TTCTTCTTAAAATATTTATTCATGGTTTAATTTTTGGTTTGTACTTGTTCAGGGGCCAGT 480
30                                                                   
31
32   481 TCATTATTTACTCTGTTTGTATACAGCAGTTCTTTTATTTTTAGTATGATTTTAATTTAA 540
33                                                                   
34
35   541 AACAATTCTAATGGTCAAAAA 561
36                           
37
38       Symbols   PEST motifs
39       +++++++   potential
40       OOOOOOO   poor     
41
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。