root/galaxy-central/test-data/emboss_fuzztran_out.tabular

リビジョン 2, 6.1 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central

行番号 
1SeqName Start   End     Score   Strand  Pattern_name    Mismatch        Frame   PStart  PEnd    Translation
2hg17    3958    3963    2       +       pattern1        .       1       1320    1321    AA
3hg17    3961    3966    2       +       pattern1        .       1       1321    1322    AA
4hg17    4099    4104    2       +       pattern1        .       1       1367    1368    AA
5hg17    4315    4320    2       +       pattern1        .       1       1439    1440    AA
6hg17    5194    5199    2       +       pattern1        .       1       1732    1733    AA
7hg17    8584    8589    2       +       pattern1        .       1       2862    2863    AA
8hg17    9232    9237    2       +       pattern1        .       1       3078    3079    AA
9hg17    9343    9348    2       +       pattern1        .       1       3115    3116    AA
10hg17    9715    9720    2       +       pattern1        .       1       3239    3240    AA
11hg17    9769    9774    2       +       pattern1        .       1       3257    3258    AA
12hg17    9841    9846    2       +       pattern1        .       1       3281    3282    AA
13hg17    9994    9999    2       +       pattern1        .       1       3332    3333    AA
14hg17    10045   10050   2       +       pattern1        .       1       3349    3350    AA
15hg17    10048   10053   2       +       pattern1        .       1       3350    3351    AA
16hg17    12157   12162   2       +       pattern1        .       1       4053    4054    AA
17hg17    12487   12492   2       +       pattern1        .       1       4163    4164    AA
18hg17    12688   12693   2       +       pattern1        .       1       4230    4231    AA
19hg17    12691   12696   2       +       pattern1        .       1       4231    4232    AA
20hg17    15010   15015   2       +       pattern1        .       1       5004    5005    AA
21hg17    17521   17526   2       +       pattern1        .       1       5841    5842    AA
22hg17    17551   17556   2       +       pattern1        .       1       5851    5852    AA
23hg17    1148    1153    2       +       pattern1        .       2       383     384     AA
24hg17    2078    2083    2       +       pattern1        .       2       693     694     AA
25hg17    2432    2437    2       +       pattern1        .       2       811     812     AA
26hg17    3080    3085    2       +       pattern1        .       2       1027    1028    AA
27hg17    3593    3598    2       +       pattern1        .       2       1198    1199    AA
28hg17    3692    3697    2       +       pattern1        .       2       1231    1232    AA
29hg17    4055    4060    2       +       pattern1        .       2       1352    1353    AA
30hg17    5018    5023    2       +       pattern1        .       2       1673    1674    AA
31hg17    5147    5152    2       +       pattern1        .       2       1716    1717    AA
32hg17    8276    8281    2       +       pattern1        .       2       2759    2760    AA
33hg17    9587    9592    2       +       pattern1        .       2       3196    3197    AA
34hg17    9668    9673    2       +       pattern1        .       2       3223    3224    AA
35hg17    9920    9925    2       +       pattern1        .       2       3307    3308    AA
36hg17    9971    9976    2       +       pattern1        .       2       3324    3325    AA
37hg17    10112   10117   2       +       pattern1        .       2       3371    3372    AA
38hg17    10115   10120   2       +       pattern1        .       2       3372    3373    AA
39hg17    11837   11842   2       +       pattern1        .       2       3946    3947    AA
40hg17    12026   12031   2       +       pattern1        .       2       4009    4010    AA
41hg17    12944   12949   2       +       pattern1        .       2       4315    4316    AA
42hg17    12953   12958   2       +       pattern1        .       2       4318    4319    AA
43hg17    13229   13234   2       +       pattern1        .       2       4410    4411    AA
44hg17    13232   13237   2       +       pattern1        .       2       4411    4412    AA
45hg17    15356   15361   2       +       pattern1        .       2       5119    5120    AA
46hg17    15482   15487   2       +       pattern1        .       2       5161    5162    AA
47hg17    16061   16066   2       +       pattern1        .       2       5354    5355    AA
48hg17    17822   17827   2       +       pattern1        .       2       5941    5942    AA
49hg17    15      20      2       +       pattern1        .       3       5       6       AA
50hg17    33      38      2       +       pattern1        .       3       11      12      AA
51hg17    3669    3674    2       +       pattern1        .       3       1223    1224    AA
52hg17    3759    3764    2       +       pattern1        .       3       1253    1254    AA
53hg17    5646    5651    2       +       pattern1        .       3       1882    1883    AA
54hg17    5847    5852    2       +       pattern1        .       3       1949    1950    AA
55hg17    5850    5855    2       +       pattern1        .       3       1950    1951    AA
56hg17    5853    5858    2       +       pattern1        .       3       1951    1952    AA
57hg17    7674    7679    2       +       pattern1        .       3       2558    2559    AA
58hg17    9699    9704    2       +       pattern1        .       3       3233    3234    AA
59hg17    9891    9896    2       +       pattern1        .       3       3297    3298    AA
60hg17    10074   10079   2       +       pattern1        .       3       3358    3359    AA
61hg17    10407   10412   2       +       pattern1        .       3       3469    3470    AA
62hg17    12675   12680   2       +       pattern1        .       3       4225    4226    AA
63hg17    13746   13751   2       +       pattern1        .       3       4582    4583    AA
64hg17    17115   17120   2       +       pattern1        .       3       5705    5706    AA
65hg17    17421   17426   2       +       pattern1        .       3       5807    5808    AA
66hg17    19122   19127   2       +       pattern1        .       3       6374    6375    AA
67hg17    19353   19358   2       +       pattern1        .       3       6451    6452    AA
68hg17    -2312   -2317   2       -       pattern1        .       1       772     773     AA
69hg17    -4073   -4078   2       -       pattern1        .       1       1359    1360    AA
70hg17    -4652   -4657   2       -       pattern1        .       1       1552    1553    AA
71hg17    -4778   -4783   2       -       pattern1        .       1       1594    1595    AA
72hg17    -6902   -6907   2       -       pattern1        .       1       2302    2303    AA
73hg17    -6905   -6910   2       -       pattern1        .       1       2303    2304    AA
74hg17    -7181   -7186   2       -       pattern1        .       1       2395    2396    AA
75hg17    -7190   -7195   2       -       pattern1        .       1       2398    2399    AA
76hg17    -8108   -8113   2       -       pattern1        .       1       2704    2705    AA
77hg17    -8297   -8302   2       -       pattern1        .       1       2767    2768    AA
78hg17    -10019  -10024  2       -       pattern1        .       1       3341    3342    AA
79hg17    -10022  -10027  2       -       pattern1        .       1       3342    3343    AA
80hg17    -10163  -10168  2       -       pattern1        .       1       3389    3390    AA
81hg17    -10214  -10219  2       -       pattern1        .       1       3406    3407    AA
82hg17    -10466  -10471  2       -       pattern1        .       1       3490    3491    AA
83hg17    -10547  -10552  2       -       pattern1        .       1       3517    3518    AA
84hg17    -11858  -11863  2       -       pattern1        .       1       3954    3955    AA
85hg17    -14987  -14992  2       -       pattern1        .       1       4997    4998    AA
86hg17    -15116  -15121  2       -       pattern1        .       1       5040    5041    AA
87hg17    -16079  -16084  2       -       pattern1        .       1       5361    5362    AA
88hg17    -16442  -16447  2       -       pattern1        .       1       5482    5483    AA
89hg17    -16541  -16546  2       -       pattern1        .       1       5515    5516    AA
90hg17    -17054  -17059  2       -       pattern1        .       1       5686    5687    AA
91hg17    -17702  -17707  2       -       pattern1        .       1       5902    5903    AA
92hg17    -18056  -18061  2       -       pattern1        .       1       6020    6021    AA
93hg17    -18986  -18991  2       -       pattern1        .       1       6330    6331    AA
94hg17    -783    -788    2       -       pattern1        .       2       262     263     AA
95hg17    -1014   -1019   2       -       pattern1        .       2       339     340     AA
96hg17    -2715   -2720   2       -       pattern1        .       2       906     907     AA
97hg17    -3021   -3026   2       -       pattern1        .       2       1008    1009    AA
98hg17    -6390   -6395   2       -       pattern1        .       2       2131    2132    AA
99hg17    -7461   -7466   2       -       pattern1        .       2       2488    2489    AA
100hg17    -9729   -9734   2       -       pattern1        .       2       3244    3245    AA
101hg17    -10062  -10067  2       -       pattern1        .       2       3355    3356    AA
102hg17    -10245  -10250  2       -       pattern1        .       2       3416    3417    AA
103hg17    -10437  -10442  2       -       pattern1        .       2       3480    3481    AA
104hg17    -12462  -12467  2       -       pattern1        .       2       4155    4156    AA
105hg17    -14283  -14288  2       -       pattern1        .       2       4762    4763    AA
106hg17    -14286  -14291  2       -       pattern1        .       2       4763    4764    AA
107hg17    -14289  -14294  2       -       pattern1        .       2       4764    4765    AA
108hg17    -14490  -14495  2       -       pattern1        .       2       4831    4832    AA
109hg17    -16377  -16382  2       -       pattern1        .       2       5460    5461    AA
110hg17    -16467  -16472  2       -       pattern1        .       2       5490    5491    AA
111hg17    -20103  -20108  2       -       pattern1        .       2       6702    6703    AA
112hg17    -20121  -20126  2       -       pattern1        .       2       6708    6709    AA
113hg17    17553   17548   2       -       pattern1        .       3       863     864     AA
114hg17    17523   17518   2       -       pattern1        .       3       873     874     AA
115hg17    15012   15007   2       -       pattern1        .       3       1710    1711    AA
116hg17    12693   12688   2       -       pattern1        .       3       2483    2484    AA
117hg17    12690   12685   2       -       pattern1        .       3       2484    2485    AA
118hg17    12489   12484   2       -       pattern1        .       3       2551    2552    AA
119hg17    12159   12154   2       -       pattern1        .       3       2661    2662    AA
120hg17    10050   10045   2       -       pattern1        .       3       3364    3365    AA
121hg17    10047   10042   2       -       pattern1        .       3       3365    3366    AA
122hg17    9996    9991    2       -       pattern1        .       3       3382    3383    AA
123hg17    9843    9838    2       -       pattern1        .       3       3433    3434    AA
124hg17    9771    9766    2       -       pattern1        .       3       3457    3458    AA
125hg17    9717    9712    2       -       pattern1        .       3       3475    3476    AA
126hg17    9345    9340    2       -       pattern1        .       3       3599    3600    AA
127hg17    9234    9229    2       -       pattern1        .       3       3636    3637    AA
128hg17    8586    8581    2       -       pattern1        .       3       3852    3853    AA
129hg17    5196    5191    2       -       pattern1        .       3       4982    4983    AA
130hg17    4317    4312    2       -       pattern1        .       3       5275    5276    AA
131hg17    4101    4096    2       -       pattern1        .       3       5347    5348    AA
132hg17    3963    3958    2       -       pattern1        .       3       5393    5394    AA
133hg17    3960    3955    2       -       pattern1        .       3       5394    5395    AA
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。