root/galaxy-central/test-data/emboss_pepstats_out.pepstats

リビジョン 2, 1.5 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central

行番号 
1PEPSTATS of Sequence from 1 to 561
2
3Molecular weight = 48582.66             Residues = 561   
4Average Residue Weight  = 86.600        Charge   = 0.0   
5Isoelectric Point = 5.0278
6A280 Molar Extinction Coefficient  = 0       
7A280 Extinction Coefficient 1mg/ml = 0.00     
8Improbability of expression in inclusion bodies = 0.520
9
10Residue         Number          Mole%           DayhoffStat
11A = Ala         135             24.064          2.798   
12B = Asx         0               0.000           0.000   
13C = Cys         106             18.895          6.515   
14D = Asp         0               0.000           0.000   
15E = Glu         0               0.000           0.000   
16F = Phe         0               0.000           0.000   
17G = Gly         98              17.469          2.080   
18H = His         0               0.000           0.000   
19I = Ile         0               0.000           0.000   
20J = ---         0               0.000           0.000   
21K = Lys         0               0.000           0.000   
22L = Leu         0               0.000           0.000   
23M = Met         0               0.000           0.000   
24N = Asn         0               0.000           0.000   
25O = ---         0               0.000           0.000   
26P = Pro         0               0.000           0.000   
27Q = Gln         0               0.000           0.000   
28R = Arg         0               0.000           0.000   
29S = Ser         0               0.000           0.000   
30T = Thr         222             39.572          6.487   
31U = ---         0               0.000           0.000   
32V = Val         0               0.000           0.000   
33W = Trp         0               0.000           0.000   
34X = Xaa         0               0.000           0.000   
35Y = Tyr         0               0.000           0.000   
36Z = Glx         0               0.000           0.000   
37
38Property        Residues                Number          Mole%
39Tiny            (A+C+G+S+T)             561             100.000
40Small           (A+B+C+D+G+N+P+S+T+V)   561             100.000
41Aliphatic       (A+I+L+V)               135             24.064
42Aromatic        (F+H+W+Y)               0                0.000
43Non-polar       (A+C+F+G+I+L+M+P+V+W+Y) 339             60.428
44Polar           (D+E+H+K+N+Q+R+S+T+Z)   222             39.572
45Charged         (B+D+E+H+K+R+Z)         0                0.000
46Basic           (H+K+R)                 0                0.000
47Acidic          (B+D+E+Z)               0                0.000
48
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。