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リビジョン 2, 7.5 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central
行番号 
1
2
3          V  R  C  L  K  Y  L  L  L  S  L  H  R  P  Q  F  S  *  W  L     F1
4           F  D  A  *  N  T  F  F  C  P  Y  T  D  H  S  F  P  N  G  F    F2
5            S  M  P  K  I  P  S  F  V  P  T  Q  T  T  V  F  L  M  A  L   F3
6          gttcgatgcctaaaataccttcttttgtccctacacagaccacagttttcctaatggctt
7                   10        20        30        40        50        60       
8          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
9          caagctacggattttatggaagaaaacagggatgtgtctggtgtcaaaaggattaccgaa
10           T  R  H  R  F  Y  R  R  K  D  R  C  L  G  C  N  E  *  H  S    F6
11          X  E  I  G  L  I  G  E  K  T  G  V  C  V  V  T  K  R  I  A     F5
12            N  S  A  *  F  V  K  K  Q  G  *  V  S  W  L  K  G  L  P  K   F4
13
14
15          Y  T  D  *  K  F  L  C  K  H  *  L  K  A  V  G  L  E  C  Y     F1
16           T  P  T  R  N  S  C  A  S  T  N  *  K  R  L  A  *  S  V  T    F2
17            H  R  L  E  I  L  V  Q  A  L  I  E  S  G  W  P  R  V  L  P   F3
18          tacaccgactagaaattcttgtgcaagcactaattgaaagcggttggcctagagtgttac
19                   70        80        90        100       110       120       
20          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
21          atgtggctgatctttaagaacacgttcgtgattaactttcgccaaccggatctcacaatg
22           *  V  S  *  F  N  K  H  L  C  *  N  F  A  T  P  R  S  H  *    F6
23          K  C  R  S  S  I  R  T  C  A  S  I  S  L  P  Q  G  L  T  N     F5
24            V  G  V  L  F  E  Q  A  L  V  L  Q  F  R  N  A  *  L  T  V   F4
25
26
27          R  F  V  *  L  S  A  S  L  A  L  I  K  G  S  F  S  L  L  W     F1
28           G  L  Y  S  *  A  R  L  L  P  *  S  K  V  H  F  L  Y  F  G    F2
29            V  C  I  A  E  R  V  S  C  P  D  Q  R  F  I  F  S  T  L  E   F3
30          cggtttgtatagctgagcgcgtctcttgccctgatcaaaggttcattttctctactttgg
31                   130       140       150       160       170       180       
32          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
33          gccaaacatatcgactcgcgcagagaacgggactagtttccaagtaaaagagatgaaacc
34           R  N  T  Y  S  L  A  D  R  A  R  I  L  P  E  N  E  R  S  Q    F6
35          G  T  Q  I  A  S  R  T  E  Q  G  S  *  L  N  M  K  E  V  K     F5
36            P  K  Y  L  Q  A  R  R  K  G  Q  D  F  T  *  K  R  *  K  P   F4
37
38
39          K  T  L  W  K  N  T  T  S  T  S  L  S  P  L  V  C  *  L  L     F1
40           R  R  C  G  R  I  Q  Q  V  R  V  S  P  P  W  F  A  D  Y  W    F2
41            D  V  V  E  E  Y  N  K  Y  E  S  L  P  P  G  L  L  I  T  G   F3
42          aagacgttgtggaagaatacaacaagtacgagtctctcccccctggtttgctgattactg
43                   190       200       210       220       230       240       
44          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
45          ttctgcaacaccttcttatgttgttcatgctcagagaggggggaccaaacgactaatgac
46           F  V  N  H  F  F  V  V  L  V  L  R  E  G  R  T  Q  Q  N  S    F6
47          S  S  T  T  S  S  Y  L  L  Y  S  D  R  G  G  P  K  S  I  V     F5
48            L  R  Q  P  L  I  C  C  T  R  T  E  G  G  Q  N  A  S  *  Q   F4
49
50
51          D  T  V  V  I  P  F  A  T  P  R  N  Y  L  Y  E  L  F  S  L     F1
52           I  Q  L  *  Y  P  S  Q  H  R  V  T  I  Y  M  N  Y  F  P  F    F2
53            Y  S  C  N  T  L  R  N  T  A  *  L  S  I  *  I  I  F  P  L   F3
54          gatacagttgtaatacccttcgcaacaccgcgtaactatctatatgaattattttccctt
55                   250       260       270       280       290       300       
56          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
57          ctatgtcaacattatgggaagcgttgtggcgcattgatagatatacttaataaaagggaa
58           S  V  T  T  I  G  K  A  V  G  R  L  *  R  Y  S  N  N  E  R    F6
59          P  Y  L  Q  L  V  R  R  L  V  A  Y  S  D  I  H  I  I  K  G     F5
60            I  C  N  Y  Y  G  E  C  C  R  T  V  I  *  I  F  *  K  G  K   F4
61
62
63          Y  Y  M  *  *  V  R  L  *  S  S  F  S  K  S  F  T  V  F  D     F1
64           I  I  C  S  R  F  V  F  N  L  P  L  A  S  L  L  L  F  S  T    F2
65            L  Y  V  V  G  S  S  L  I  F  L  *  Q  V  F  Y  C  F  R  P   F3
66          tattatatgtagtaggttcgtctttaatcttcctttagcaagtcttttactgttttcgac
67                   310       320       330       340       350       360       
68          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
69          ataatatacatcatccaagcagaaattagaaggaaatcgttcagaaaatgacaaaagctg
70           *  *  I  Y  Y  T  R  R  *  D  E  K  L  L  D  K  V  T  K  S    F6
71          K  N  Y  T  T  P  E  D  K  I  K  R  *  C  T  K  *  Q  K  R     F5
72            I  I  H  L  L  N  T  K  L  R  G  K  A  L  R  K  S  N  E  V   F4
73
74
75          L  N  V  H  V  L  R  L  F  W  I  I  C  G  Q  F  N  L  R  C     F1
76           S  M  F  M  F  L  G  C  F  G  *  Y  A  V  S  L  I  F  V  V    F2
77            Q  C  S  C  S  *  V  V  L  D  N  M  R  S  V  *  S  S  L  F   F3
78          ctcaatgttcatgttcttaggttgttttggataatatgcggtcagtttaatcttcgttgt
79                   370       380       390       400       410       420       
80          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
81          gagttacaagtacaagaatccaacaaaacctattatacgccagtcaaattagaagcaaca
82           R  L  T  *  T  R  L  N  N  Q  I  I  H  P  *  N  L  R  R  Q    F6
83          G  *  H  E  H  E  *  T  T  K  S  L  I  R  D  T  *  D  E  N     F5
84            E  I  N  M  N  K  P  Q  K  P  Y  Y  A  T  L  K  I  K  T  T   F4
85
86
87          F  F  L  K  Y  L  F  M  V  *  F  L  V  C  T  C  S  G  A  S     F1
88           S  S  *  N  I  Y  S  W  F  N  F  W  F  V  L  V  Q  G  P  V    F2
89            L  L  K  I  F  I  H  G  L  I  F  G  L  Y  L  F  R  G  Q  F   F3
90          ttcttcttaaaatatttattcatggtttaatttttggtttgtacttgttcaggggccagt
91                   430       440       450       460       470       480       
92          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
93          aagaagaattttataaataagtaccaaattaaaaaccaaacatgaacaagtccccggtca
94           K  K  K  F  Y  K  N  M  T  *  N  K  T  Q  V  Q  E  P  A  L    F6
95          N  R  R  L  I  N  I  *  P  K  I  K  P  K  Y  K  N  L  P  W     F5
96            E  E  *  F  I  *  E  H  N  L  K  Q  N  T  S  T  *  P  G  T   F4
97
98
99          S  L  F  T  L  F  V  Y  S  S  S  F  I  F  S  M  I  L  I  *     F1
100           H  Y  L  L  C  L  Y  T  A  V  L  L  F  L  V  *  F  *  F  K    F2
101            I  I  Y  S  V  C  I  Q  Q  F  F  Y  F  *  Y  D  F  N  L  K   F3
102          tcattatttactctgtttgtatacagcagttcttttatttttagtatgattttaatttaa
103                   490       500       510       520       530       540       
104          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
105          agtaataaatgagacaaacatatgtcgtcaagaaaataaaaatcatactaaaattaaatt
106           E  N  N  V  R  N  T  Y  L  L  E  K  I  K  L  I  I  K  I  *    F6
107          N  M  I  *  E  T  Q  I  C  C  N  K  *  K  *  Y  S  K  L  K     F5
108            *  *  K  S  Q  K  Y  V  A  T  R  K  N  K  T  H  N  *  N  L   F4
109
110
111          N  N  S  N  G  Q  K                                            F1
112           T  I  L  M  V  K  X                                           F2
113            Q  F  *  W  S  K  X                                          F3
114          aacaattctaatggtcaaaaa
115                   550       560       
116          ----:----|----:----|-
117          ttgttaagattaccagttttt
118           F  L  E  L  P  *  F                                           F6
119          F  C  N  *  H  D  F                                            F5
120            V  I  R  I  T  L  F                                          F4
121
122##############################
123Minimum size of ORFs : 1
124
125Total ORFs in frame 1 :    10
126Total ORFs in frame 2 :    11
127Total ORFs in frame 3 :     8
128Total ORFs in frame 4 :    14
129Total ORFs in frame 5 :    12
130Total ORFs in frame 6 :    14
131
132Total ORFs :    69
133##############################
134
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。