root/galaxy-central/test-data/fs-joiner.dat

リビジョン 2, 5.7 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central

行番号 
1108299600       chr6    108299744       CCDS5061.1_cds_0_0_chr6_108299601_r     0       -       chr6    108299744       NM_007214_cds_0_0_chr6_108299601_r      0       -
2108594662       chr6    108594687       CCDS5063.1_cds_0_0_chr6_108594663_f     0       +       chr6    108594687       NM_003269_cds_0_0_chr6_108594663_f      0       +
3108640045       chr6    108640151       CCDS5064.1_cds_0_0_chr6_108640046_r     0       -       chr6    108640151       NM_003795_cds_0_0_chr6_108640046_r      0       -
4108722976       chr6    108723115       CCDS5067.1_cds_0_0_chr6_108722977_f     0       +       chr6    108723115       NM_145315_cds_0_0_chr6_108722977_f      0       +
5112381694       chr13   112381953       CCDS9526.1_cds_0_0_chr13_112381695_f    0       +       chr13   112381953       NM_207440_cds_1_0_chr13_112381695_f     0       +
6113660517       chr7    113660685       CCDS5760.1_cds_0_0_chr7_113660518_f     0       +       chr7    113660685       AF467257_cds_1_0_chr7_113660518_f       0       +
7116124407       chr11   116124501       CCDS8374.1_cds_0_0_chr11_116124408_r    0       -       chr11   116124501       AK057832_cds_0_0_chr11_116124408_r      0       -
8116206508       chr11   116206563       CCDS8377.1_cds_0_0_chr11_116206509_f    0       +       chr11   116206563       NM_000040_cds_1_0_chr11_116206509_f     0       +
9116211733       chr11   116212337       CCDS8378.1_cds_0_0_chr11_116211734_r    0       -       chr11   116212337       BC005380_cds_0_0_chr11_116211734_r      0       -
10116512159       chr7    116512389       CCDS5771.1_cds_0_0_chr7_116512160_r     0       -       chr7    116512389       NM_003391_cds_0_0_chr7_116512160_r      0       -
11116714099       chr7    116714152       CCDS5773.1_cds_0_0_chr7_116714100_f     0       +       chr7    116714152       NM_000492_cds_0_0_chr7_116714100_f      0       +
12116945541       chr7    116945787       CCDS5774.1_cds_0_0_chr7_116945542_r     0       -       chr7    116945787       AF377960_cds_0_0_chr7_116945542_r       0       -
13118288583       chr2    118288668       CCDS2120.1_cds_0_0_chr2_118288584_f     0       +       chr2    118288668       NM_006773_cds_0_0_chr2_118288584_f      0       +
14118881131       chr8    118881317       CCDS6324.1_cds_0_0_chr8_118881132_r     0       -       chr8    118881317       NM_000127_cds_0_0_chr8_118881132_r      0       -
15122745047       chrX    122745924       CCDS14606.1_cds_0_0_chrX_122745048_f    0       +       chrX    122745924       NM_001167_cds_1_0_chrX_122745048_f      0       +
16128764156       chr9    128764189       CCDS6914.1_cds_0_0_chr9_128764157_f     0       +       chr9    128764189       BC051300_cds_0_0_chr9_128764157_f       0       +
17128787519       chr9    128789136       CCDS6915.1_cds_0_0_chr9_128787520_r     0       -       chr9    128789136       NM_014908_cds_0_0_chr9_128787520_r      0       -
18131424298       chr5    131424460       CCDS4149.1_cds_0_0_chr5_131424299_f     0       +       chr5    131424460       NM_000588_cds_0_0_chr5_131424299_f      0       +
19131556601       chr5    131556672       CCDS4151.1_cds_0_0_chr5_131556602_r     0       -       chr5    131556672       BC035813_cds_0_0_chr5_131556602_r       0       -
20131621326       chr5    131621419       CCDS4152.1_cds_0_0_chr5_131621327_f     0       +       chr5    131621419       BC003096_cds_0_0_chr5_131621327_f       0       +
21142908  chr16   143003  CCDS10397.1_cds_0_0_chr16_142909_f      0       +       chr16   143003  NM_005332_cds_0_0_chr16_142909_f        0       +
22147962192       chr1    147962580       CCDS989.1_cds_0_0_chr1_147962193_r      0       -       chr1    147962580       NM_005997_cds_0_0_chr1_147962193_r      0       -
23147984545       chr1    147984630       CCDS990.1_cds_0_0_chr1_147984546_f      0       +       chr1    147984630       BC007833_cds_0_0_chr1_147984546_f       0       +
24148078400       chr1    148078582       CCDS993.1_cds_0_0_chr1_148078401_r      0       -       chr1    148078582       AJ011123_cds_0_0_chr1_148078401_r       0       -
25148185136       chr1    148185276       CCDS996.1_cds_0_0_chr1_148185137_f      0       +       chr1    148185276       NM_002796_cds_0_0_chr1_148185137_f      0       +
26152648964       chrX    152649196       CCDS14733.1_cds_0_0_chrX_152648965_r    0       -       chrX    152649196       NM_000425_cds_0_0_chrX_152648965_r      0       -
27152691446       chrX    152691471       CCDS14735.1_cds_0_0_chrX_152691447_f    0       +       chrX    152691471       AF101728_cds_0_0_chrX_152691447_f       0       +
28152694029       chrX    152694263       CCDS14736.1_cds_0_0_chrX_152694030_r    0       -       chrX    152694263       BC052303_cds_0_0_chrX_152694030_r       0       -
29220229609       chr2    220230869       CCDS2443.1_cds_0_0_chr2_220229610_r     0       -       chr2    220230869       NM_024536_cds_0_0_chr2_220229610_r      0       -
3023786114        chr18   23786321        CCDS11891.1_cds_0_0_chr18_23786115_r    0       -       chr18   23786321        NM_001792_cds_0_0_chr18_23786115_r      0       -
31244413  chr16   244681  CCDS10402.1_cds_0_0_chr16_244414_f      0       +       chr16   244681  AK057165_cds_2_0_chr16_244414_f 0       +
32259268  chr16   259383  CCDS10403.1_cds_0_0_chr16_259269_r      0       -       chr16   259383  AB016929_cds_0_0_chr16_259269_r 0       -
3330120223        chr22   30120265        CCDS13897.1_cds_0_0_chr22_30120224_f    0       +       chr22   30120265        NM_004147_cds_0_0_chr22_30120224_f      0       +
3430160419        chr22   30160661        CCDS13898.1_cds_0_0_chr22_30160420_r    0       -       chr22   30160661        BC032941_cds_0_0_chr22_30160420_r       0       -
3532869641        chr21   32870022        CCDS13615.1_cds_0_0_chr21_32869642_r    0       -       chr21   32870022        NM_018277_cds_3_0_chr21_32869642_r      0       -
3633321040        chr21   33322012        CCDS13620.1_cds_0_0_chr21_33321041_f    0       +       chr21   33322012        NM_005806_cds_1_0_chr21_33321041_f      0       +
3733330413        chr20   33330423        CCDS13249.1_cds_0_0_chr20_33330414_r    0       -       chr20   33330423        NM_181466_cds_0_0_chr20_33330414_r      0       -
3833513606        chr20   33513792        CCDS13255.1_cds_0_0_chr20_33513607_f    0       +       chr20   33513792        AF022655_cds_1_0_chr20_33513607_f       0       +
3938440094        chr12   38440321        CCDS8736.1_cds_0_0_chr12_38440095_r     0       -       chr12   38440321        NM_052885_cds_0_0_chr12_38440095_r      0       -
4041486872        chr15   41487060        CCDS10096.1_cds_0_0_chr15_41486873_r    0       -       chr15   41487060        BX537418_cds_0_0_chr15_41486873_r       0       -
4141673708        chr15   41673857        CCDS10097.1_cds_0_0_chr15_41673709_f    0       +       chr15   41673857        AK223365_cds_0_0_chr15_41673709_f       0       +
4241679161        chr15   41679250        CCDS10098.1_cds_0_0_chr15_41679162_r    0       -       chr15   41679250        NM_153700_cds_0_0_chr15_41679162_r      0       -
4355251623        chr10   55253124        CCDS7248.1_cds_0_0_chr10_55251624_r     0       -       chr10   55253124        AY029205_cds_0_0_chr10_55251624_r       0       -
4459068595        chr19   59069564        CCDS12866.1_cds_0_0_chr19_59068596_f    0       +       chr19   59069564        BC013995_cds_1_0_chr19_59068596_f       0       +
4559236026        chr19   59236146        CCDS12872.1_cds_0_0_chr19_59236027_r    0       -       chr19   59236146        NM_198481_cds_0_0_chr19_59236027_r      0       -
4659297998        chr19   59298008        CCDS12877.1_cds_0_0_chr19_59297999_f    0       +       chr19   59298008        NM_004542_cds_0_0_chr19_59297999_f      0       +
4759406881        chr18   59407046        CCDS11985.1_cds_0_0_chr18_59406882_f    0       +       chr18   59407046        NM_012397_cds_1_0_chr18_59406882_f      0       +
4859455932        chr18   59456337        CCDS11986.1_cds_0_0_chr18_59455933_r    0       -       chr18   59456337        AB046400_cds_0_0_chr18_59455933_r       0       -
4998710240        chr14   98712285        CCDS9949.1_cds_0_0_chr14_98710241_r     0       -       chr14   98712285        NM_022898_cds_0_0_chr14_98710241_r      0       -
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。