root/galaxy-central/test-data/joiner_out1.bed

リビジョン 2, 6.1 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central
行番号 
1chr1    147962192       147962580       CCDS989.1_cds_0_0_chr1_147962193_r      0       -       chr1    147962192       147962580       NM_005997_cds_0_0_chr1_147962193_r      0       -
2chr1    147984545       147984630       CCDS990.1_cds_0_0_chr1_147984546_f      0       +       chr1    147984545       147984630       BC007833_cds_0_0_chr1_147984546_f       0       +
3chr1    148078400       148078582       CCDS993.1_cds_0_0_chr1_148078401_r      0       -       chr1    148078400       148078582       AJ011123_cds_0_0_chr1_148078401_r       0       -
4chr1    148185136       148185276       CCDS996.1_cds_0_0_chr1_148185137_f      0       +       chr1    148185136       148185276       NM_002796_cds_0_0_chr1_148185137_f      0       +
5chr10   55251623        55253124        CCDS7248.1_cds_0_0_chr10_55251624_r     0       -       chr10   55251623        55253124        AY029205_cds_0_0_chr10_55251624_r       0       -
6chr11   116124407       116124501       CCDS8374.1_cds_0_0_chr11_116124408_r    0       -       chr11   116124407       116124501       AK057832_cds_0_0_chr11_116124408_r      0       -
7chr11   116206508       116206563       CCDS8377.1_cds_0_0_chr11_116206509_f    0       +       chr11   116206508       116206563       NM_000040_cds_1_0_chr11_116206509_f     0       +
8chr11   116211733       116212337       CCDS8378.1_cds_0_0_chr11_116211734_r    0       -       chr11   116211733       116212337       BC005380_cds_0_0_chr11_116211734_r      0       -
9chr12   38440094        38440321        CCDS8736.1_cds_0_0_chr12_38440095_r     0       -       chr12   38440094        38440321        NM_052885_cds_0_0_chr12_38440095_r      0       -
10chr13   112381694       112381953       CCDS9526.1_cds_0_0_chr13_112381695_f    0       +       chr13   112381694       112381953       NM_207440_cds_1_0_chr13_112381695_f     0       +
11chr14   98710240        98712285        CCDS9949.1_cds_0_0_chr14_98710241_r     0       -       chr14   98710240        98712285        NM_022898_cds_0_0_chr14_98710241_r      0       -
12chr15   41486872        41487060        CCDS10096.1_cds_0_0_chr15_41486873_r    0       -       chr15   41486872        41487060        BX537418_cds_0_0_chr15_41486873_r       0       -
13chr15   41673708        41673857        CCDS10097.1_cds_0_0_chr15_41673709_f    0       +       chr15   41673708        41673857        AK223365_cds_0_0_chr15_41673709_f       0       +
14chr15   41679161        41679250        CCDS10098.1_cds_0_0_chr15_41679162_r    0       -       chr15   41679161        41679250        NM_153700_cds_0_0_chr15_41679162_r      0       -
15chr16   142908  143003  CCDS10397.1_cds_0_0_chr16_142909_f      0       +       chr16   142908  143003  NM_005332_cds_0_0_chr16_142909_f        0       +
16chr16   244413  244681  CCDS10402.1_cds_0_0_chr16_244414_f      0       +       chr16   244413  244681  AK057165_cds_2_0_chr16_244414_f 0       +
17chr16   259268  259383  CCDS10403.1_cds_0_0_chr16_259269_r      0       -       chr16   259268  259383  AB016929_cds_0_0_chr16_259269_r 0       -
18chr18   23786114        23786321        CCDS11891.1_cds_0_0_chr18_23786115_r    0       -       chr18   23786114        23786321        NM_001792_cds_0_0_chr18_23786115_r      0       -
19chr18   59406881        59407046        CCDS11985.1_cds_0_0_chr18_59406882_f    0       +       chr18   59406881        59407046        NM_012397_cds_1_0_chr18_59406882_f      0       +
20chr18   59455932        59456337        CCDS11986.1_cds_0_0_chr18_59455933_r    0       -       chr18   59455932        59456337        AB046400_cds_0_0_chr18_59455933_r       0       -
21chr19   59068595        59069564        CCDS12866.1_cds_0_0_chr19_59068596_f    0       +       chr19   59068595        59069564        BC013995_cds_1_0_chr19_59068596_f       0       +
22chr19   59236026        59236146        CCDS12872.1_cds_0_0_chr19_59236027_r    0       -       chr19   59236026        59236146        NM_198481_cds_0_0_chr19_59236027_r      0       -
23chr19   59297998        59298008        CCDS12877.1_cds_0_0_chr19_59297999_f    0       +       chr19   59297998        59298008        NM_004542_cds_0_0_chr19_59297999_f      0       +
24chr2    118288583       118288668       CCDS2120.1_cds_0_0_chr2_118288584_f     0       +       chr2    118288583       118288668       NM_006773_cds_0_0_chr2_118288584_f      0       +
25chr2    220229609       220230869       CCDS2443.1_cds_0_0_chr2_220229610_r     0       -       chr2    220229609       220230869       NM_024536_cds_0_0_chr2_220229610_r      0       -
26chr20   33330413        33330423        CCDS13249.1_cds_0_0_chr20_33330414_r    0       -       chr20   33330413        33330423        NM_181466_cds_0_0_chr20_33330414_r      0       -
27chr20   33513606        33513792        CCDS13255.1_cds_0_0_chr20_33513607_f    0       +       chr20   33513606        33513792        AF022655_cds_1_0_chr20_33513607_f       0       +
28chr21   32869641        32870022        CCDS13615.1_cds_0_0_chr21_32869642_r    0       -       chr21   32869641        32870022        NM_018277_cds_3_0_chr21_32869642_r      0       -
29chr21   33321040        33322012        CCDS13620.1_cds_0_0_chr21_33321041_f    0       +       chr21   33321040        33322012        NM_005806_cds_1_0_chr21_33321041_f      0       +
30chr22   30120223        30120265        CCDS13897.1_cds_0_0_chr22_30120224_f    0       +       chr22   30120223        30120265        NM_004147_cds_0_0_chr22_30120224_f      0       +
31chr22   30160419        30160661        CCDS13898.1_cds_0_0_chr22_30160420_r    0       -       chr22   30160419        30160661        BC032941_cds_0_0_chr22_30160420_r       0       -
32chr5    131424298       131424460       CCDS4149.1_cds_0_0_chr5_131424299_f     0       +       chr5    131424298       131424460       NM_000588_cds_0_0_chr5_131424299_f      0       +
33chr5    131556601       131556672       CCDS4151.1_cds_0_0_chr5_131556602_r     0       -       chr5    131556601       131556672       BC035813_cds_0_0_chr5_131556602_r       0       -
34chr5    131621326       131621419       CCDS4152.1_cds_0_0_chr5_131621327_f     0       +       chr5    131621326       131621419       BC003096_cds_0_0_chr5_131621327_f       0       +
35chr6    108299600       108299744       CCDS5061.1_cds_0_0_chr6_108299601_r     0       -       chr6    108299600       108299744       NM_007214_cds_0_0_chr6_108299601_r      0       -
36chr6    108594662       108594687       CCDS5063.1_cds_0_0_chr6_108594663_f     0       +       chr6    108594662       108594687       NM_003269_cds_0_0_chr6_108594663_f      0       +
37chr6    108640045       108640151       CCDS5064.1_cds_0_0_chr6_108640046_r     0       -       chr6    108640045       108640151       NM_003795_cds_0_0_chr6_108640046_r      0       -
38chr6    108722976       108723115       CCDS5067.1_cds_0_0_chr6_108722977_f     0       +       chr6    108722976       108723115       NM_145315_cds_0_0_chr6_108722977_f      0       +
39chr7    113660517       113660685       CCDS5760.1_cds_0_0_chr7_113660518_f     0       +       chr7    113660517       113660685       AF467257_cds_1_0_chr7_113660518_f       0       +
40chr7    116512159       116512389       CCDS5771.1_cds_0_0_chr7_116512160_r     0       -       chr7    116512159       116512389       NM_003391_cds_0_0_chr7_116512160_r      0       -
41chr7    116714099       116714152       CCDS5773.1_cds_0_0_chr7_116714100_f     0       +       chr7    116714099       116714152       NM_000492_cds_0_0_chr7_116714100_f      0       +
42chr7    116945541       116945787       CCDS5774.1_cds_0_0_chr7_116945542_r     0       -       chr7    116945541       116945787       AF377960_cds_0_0_chr7_116945542_r       0       -
43chr8    118881131       118881317       CCDS6324.1_cds_0_0_chr8_118881132_r     0       -       chr8    118881131       118881317       NM_000127_cds_0_0_chr8_118881132_r      0       -
44chr9    128764156       128764189       CCDS6914.1_cds_0_0_chr9_128764157_f     0       +       chr9    128764156       128764189       BC051300_cds_0_0_chr9_128764157_f       0       +
45chr9    128787519       128789136       CCDS6915.1_cds_0_0_chr9_128787520_r     0       -       chr9    128787519       128789136       NM_014908_cds_0_0_chr9_128787520_r      0       -
46chrX    122745047       122745924       CCDS14606.1_cds_0_0_chrX_122745048_f    0       +       chrX    122745047       122745924       NM_001167_cds_1_0_chrX_122745048_f      0       +
47chrX    152648964       152649196       CCDS14733.1_cds_0_0_chrX_152648965_r    0       -       chrX    152648964       152649196       NM_000425_cds_0_0_chrX_152648965_r      0       -
48chrX    152691446       152691471       CCDS14735.1_cds_0_0_chrX_152691447_f    0       +       chrX    152691446       152691471       AF101728_cds_0_0_chrX_152691447_f       0       +
49chrX    152694029       152694263       CCDS14736.1_cds_0_0_chrX_152694030_r    0       -       chrX    152694029       152694263       BC052303_cds_0_0_chrX_152694030_r       0       -
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。