root/galaxy-central/test-data/lastz_diffs.txt @ 2

リビジョン 2, 2.6 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central
行番号 
1phiX    2490    2491    +       5386    HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:486:822       10      11      -       36      C       A       ACCTGTTTTACAGACACCTAAAGCTACATCGTCAAC    ACCTGTTTTAAAGACACCTAAAGCTACATCGTCAAC
2phiX    2173    2174    +       5386    HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:259:1389      26      27      +       36      G       T       GCGTACTTATTCGCCACCATGATTATGACCAGTGTT    GCGTACTTATTCGCCACCATGATTATTACCAGTGTT
3phiX    578     579     +       5386    HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:317:1411      8       9       +       36      G       T       GTACGCTGGACTTTGTGGGATACCCTCGCTTTCCT     GTACGCTGTACTTTGTGGGATACCCTCGCTTTCCT
4phiX    2992    2993    +       5386    HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:458:1629      23      24      +       36      G       T       GCTGGTGGCGCCATGTCTAAATTGTTTGGAGGCGGT    GCTGGTGGCGCCATGTCTAAATTTTTTGGAGGCGGT
5phiX    4783    4784    +       5386    HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:646:59        18      19      -       36      C       T       CATTTCCATGCGGTGCACTTTATGCGGACACTTCC     CATTTCCATGCGGTGCATTTTATGCGGACACTTCC
6phiX    1649    1650    +       5386    HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:295:694       24      25      +       36      A       G       GTGATTACTTCATGCAGCGTTACCATGATGTTATTT    GTGATTACTTCATGCAGCGTTACCGTGATGTTATTT
7phiX    1995    1996    +       5386    HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:590:331       14      15      +       36      G       T       GAAATTTCTATGAAGGATGTTTTCCGTTCTGGTGAT    GAAATTTCTATGAATGATGTTTTCCGTTCTGGTGAT
8phiX    3261    3262    +       5386    HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:221:1238      17      18      -       36      C       A       AAGTCTGCCGCTGATAAAGGAAAGGATAC   AAGTCTGCCGATGATAAAGGAAAGGATAC
9phiX    4109    4110    +       5386    HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:478:252       12      13      -       36      C       A       ATGCTTGGCTTCCATAAGCAGATGGATAACCGCATC    ATGCTTGGCTTCAATAAGCAGATGGATAACCGCATC
10phiX    2972    2973    +       5386    HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:836:1204      17      18      +       36      G       T       TTGCTTCTGCTCTTGCTGGTGGCGCCATGTCTAAAT    TTGCTTCTGCTCTTGCTTGTGGCGCCATGTCTAAAT
11phiX    2234    2235    +       5386    HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:172:1412      13      14      -       36      C       A       AAATTTAATGTGACCGTTTATCGCAATCTGCCGACC    AAATTTAATGTGAACGTTTATCGCAATCTGCCGACC
12phiX    2902    2903    +       5386    HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:540:1415      18      19      +       36      G       T       TTATTAAAGAGATTATTTGTCTCCAGCCACTTA       TTATTAAAGAGATTATTTTTCTCCAGCCACTTA
13phiX    2837    2838    +       5386    HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:253:1162      14      15      -       36      T       A       ATGGTTTGGTCTAACTTTACCGCTACTAAATGC       ATGGTTTGGTCAAACTTTACCGCTACTAAATGC
14phiX    4662    4663    +       5386    HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:828:754       26      27      +       36      G       T       TTTGCGTGACTATTTTCGTGATATTGGTCGTATGGT    TTTGCGTGACTATTTTCGTGATATTGTTCGTATGGT
15phiX    4783    4784    +       5386    HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:1566:499      9       10      +       36      C       T       TGCGGTGCACTTTATGCGGACACTTCCTACAGGTAG    TGCGGTGCATTTTATGCGGACACTTCCTACAGGTAG
16phiX    2857    2858    +       5386    HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:578:971       15      16      +       36      G       T       CGCTACTAAATGCCGCGGATTGGTTTCG    CGCTACTAAATTCCGCGGATTGGTTTCG
17phiX    3112    3113    +       5386    HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:1721:1800     27      28      -       36      T       C       TCAAGGCTCTAATGTTCCTAACCC        TCAAGGCTCTAATGTCCCTAACCC
18phiX    4825    4826    +       5386    HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:815:1640      9       10      -       36      T       G       CCCTAATTTTGGTCGTCGGGTACGCAATCGCCGCCA    CCCTAATTTGGGTCGTCGGGTACGCAATCGCCGCCA
19phiX    4517    4518    +       5386    HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:1485:741      19      20      -       36      G       A       GAAATCGCGTAGAGGCTTTGCTATTCAGCGTTTGAT    GAAATCGCGTAGAGGCTTTACTATTCAGCGTTTGAT
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。