Context Navigation

nj_tree_newick_out.tabular

リビジョン 2, 4.0 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年前)
import galaxy-central

行番号
1	0 (hg17,panTro1,(rheMac2,(rn3,mm7))) (hg17.chr7(+):127471195-127471526\|hg17_0:0.00283776,panTro1.chr6(+):129885076-129885407\|panTro1_0:0.00323907,(rheMac2.chr3(+):165787989-165788319\|rheMac2_0:0.0324438,(rn3.chr4(+):56178191-56178473\|rn3_0:0.0264183,mm7.chr6(+):28984529-28984886\|mm7_0:0.148227):0.457076):0.00849339)
2	1 ((hg17,panTro1),mm7,rheMac2) ((hg17.chr7(+):127471526-127471584\|hg17_1:0.00446699,panTro1.chr6(+):129885407-129885465\|panTro1_1:0.013401):0.00483543,mm7.chr6(+):28984886-28984940\|mm7_1:999.986,rheMac2.chr3(+):165788319-165788377\|rheMac2_1:0.0137694)
3	2 ((((hg17,panTro1),rheMac2),(canFam2,dasNov1)),bosTau2,rn3) ((((hg17.chr7(+):127471584-127471688\|hg17_2:0.00103752,panTro1.chr6(+):129885465-129885569\|panTro1_2:0.018681):0.00493709,rheMac2.chr3(+):165788377-165788482\|rheMac2_2:0.0691856):0.106183,(canFam2.chr14(-):11090703-11090811\|canFam2_2:0.213381,dasNov1.scaffold_256527(+):298-392\|dasNov1_2:0.123834):0.0305914):0.028679,bosTau2.chr4(-):50243931-50244034\|bosTau2_2:0.170682,rn3.chr4(+):56182200-56182295\|rn3_2:0.285956)
4	3 ((hg17,panTro1),rheMac2,(rn3,(bosTau2,(canFam2,dasNov1)))) ((hg17.chr7(+):127471688-127471871\|hg17_3:0.0225878,panTro1.chr6(+):129885569-129885752\|panTro1_3:0):0.0221216,rheMac2.chr3(+):165788482-165788684\|rheMac2_3:0.0429855,(rn3.chr4(+):56182295-56182489\|rn3_3:0.286513,(bosTau2.chr4(-):50243792-50243930\|bosTau2_3:0.135108,(canFam2.chr14(-):11090345-11090505\|canFam2_3:0.0418005,dasNov1.scaffold_256527(+):393-625\|dasNov1_3:0.198071):0.0128256):0.0852898):0.0472209)
5	4 ((hg17,rheMac2),panTro1,((bosTau2,canFam2),dasNov1)) ((hg17.chr7(+):127471871-127471910\|hg17_4:0,rheMac2.chr3(+):165788684-165788723\|rheMac2_4:0.0586327):0,panTro1.chr6(+):129885752-129885791\|panTro1_4:0,((bosTau2.chr4(-):50243734-50243773\|bosTau2_4:0.462377,canFam2.chr14(-):11090081-11090120\|canFam2_4:0.199446):0.119837,dasNov1.scaffold_256527(+):625-665\|dasNov1_4:0.17977):0.172715)
6	5 ((hg17,panTro1),rheMac2,((mm7,rn3),((bosTau2,dasNov1),canFam2))) ((hg17.chr7(+):127471910-127472074\|hg17_5:0.000139728,panTro1.chr6(+):129885791-129885955\|panTro1_5:0.0184104):0.05206,rheMac2.chr3(+):165788723-165788885\|rheMac2_5:0.0285966,((mm7.chr6(+):28990714-28990875\|mm7_5:0.123289,rn3.chr4(+):56183448-56183705\|rn3_5:0.0718529):0.38361,((bosTau2.chr4(-):50243566-50243734\|bosTau2_5:0.181878,dasNov1.scaffold_256527(+):665-786\|dasNov1_5:0.429124):0.0618692,canFam2.chr14(-):11089913-11090081\|canFam2_5:0.133548):0.11305):0.0250925)
7	6 ((hg17,panTro1),rheMac2,((mm7,rn3),(canFam2,dasNov1))) ((hg17.chr7(+):127472074-127472258\|hg17_6:0.00549431,panTro1.chr6(+):129885955-129886139\|panTro1_6:0):0.0241181,rheMac2.chr3(+):165788885-165789069\|rheMac2_6:0.0447415,((mm7.chr6(+):28990875-28991025\|mm7_6:0.0851965,rn3.chr4(+):56183705-56183879\|rn3_6:0.109546):0.319094,(canFam2.chr14(-):11089743-11089913\|canFam2_6:0.186816,dasNov1.scaffold_256527(+):786-964\|dasNov1_6:0.219003):0.0699235):0.0966238)
8	7 (((hg17,(canFam2,dasNov1)),panTro1),rheMac2,(mm7,rn3)) (((hg17.chr7(+):127472258-127472280\|hg17_7:0,(canFam2.chr14(-):11089526-11089548\|canFam2_7:0.572157,dasNov1.scaffold_256527(+):964-987\|dasNov1_7:0.212507):0.327632):0,panTro1.chr6(+):129886139-129886161\|panTro1_7:0):0,rheMac2.chr3(+):165789069-165789091\|rheMac2_7:0,(mm7.chr6(+):28991025-28991048\|mm7_7:0.0708909,rn3.chr4(+):56183879-56183902\|rn3_7:0.0230732):125.221)
9	8 (((hg17,panTro1),rheMac2),(rn3,canFam2),dasNov1) (((hg17.chr7(+):127472280-127472681\|hg17_8:0.00753956,panTro1.chr6(+):129886161-129886562\|panTro1_8:0):0.0353922,rheMac2.chr3(+):165789091-165789492\|rheMac2_8:0.0278572):0.0967916,(rn3.chr4(+):56183902-56184219\|rn3_8:0.379264,canFam2.chr14(-):11089143-11089523\|canFam2_8:0.207268):0.0346594,dasNov1.scaffold_256527(+):987-1401\|dasNov1_8:0.268281)
10	9 (hg17,((rheMac2,dasNov1),canFam2),panTro1) (hg17.chr7(+):127472681-127472715\|hg17_9:0.0183718,((rheMac2.chr3(+):165789492-165789526\|rheMac2_9:0,dasNov1.scaffold_256527(+):1401-1433\|dasNov1_9:0.160078):0.0595979,canFam2.chr14(-):11089108-11089143\|canFam2_9:0.237132):0.0383088,panTro1.chr6(+):129886562-129886596\|panTro1_9:0.0152865)

Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。

異なるフォーマットでダウンロード:

元の形式

行番号
1	0 (hg17,panTro1,(rheMac2,(rn3,mm7))) (hg17.chr7(+):127471195-127471526\|hg17_0:0.00283776,panTro1.chr6(+):129885076-129885407\|panTro1_0:0.00323907,(rheMac2.chr3(+):165787989-165788319\|rheMac2_0:0.0324438,(rn3.chr4(+):56178191-56178473\|rn3_0:0.0264183,mm7.chr6(+):28984529-28984886\|mm7_0:0.148227):0.457076):0.00849339)
2	1 ((hg17,panTro1),mm7,rheMac2) ((hg17.chr7(+):127471526-127471584\|hg17_1:0.00446699,panTro1.chr6(+):129885407-129885465\|panTro1_1:0.013401):0.00483543,mm7.chr6(+):28984886-28984940\|mm7_1:999.986,rheMac2.chr3(+):165788319-165788377\|rheMac2_1:0.0137694)
3	2 ((((hg17,panTro1),rheMac2),(canFam2,dasNov1)),bosTau2,rn3) ((((hg17.chr7(+):127471584-127471688\|hg17_2:0.00103752,panTro1.chr6(+):129885465-129885569\|panTro1_2:0.018681):0.00493709,rheMac2.chr3(+):165788377-165788482\|rheMac2_2:0.0691856):0.106183,(canFam2.chr14(-):11090703-11090811\|canFam2_2:0.213381,dasNov1.scaffold_256527(+):298-392\|dasNov1_2:0.123834):0.0305914):0.028679,bosTau2.chr4(-):50243931-50244034\|bosTau2_2:0.170682,rn3.chr4(+):56182200-56182295\|rn3_2:0.285956)
4	3 ((hg17,panTro1),rheMac2,(rn3,(bosTau2,(canFam2,dasNov1)))) ((hg17.chr7(+):127471688-127471871\|hg17_3:0.0225878,panTro1.chr6(+):129885569-129885752\|panTro1_3:0):0.0221216,rheMac2.chr3(+):165788482-165788684\|rheMac2_3:0.0429855,(rn3.chr4(+):56182295-56182489\|rn3_3:0.286513,(bosTau2.chr4(-):50243792-50243930\|bosTau2_3:0.135108,(canFam2.chr14(-):11090345-11090505\|canFam2_3:0.0418005,dasNov1.scaffold_256527(+):393-625\|dasNov1_3:0.198071):0.0128256):0.0852898):0.0472209)
5	4 ((hg17,rheMac2),panTro1,((bosTau2,canFam2),dasNov1)) ((hg17.chr7(+):127471871-127471910\|hg17_4:0,rheMac2.chr3(+):165788684-165788723\|rheMac2_4:0.0586327):0,panTro1.chr6(+):129885752-129885791\|panTro1_4:0,((bosTau2.chr4(-):50243734-50243773\|bosTau2_4:0.462377,canFam2.chr14(-):11090081-11090120\|canFam2_4:0.199446):0.119837,dasNov1.scaffold_256527(+):625-665\|dasNov1_4:0.17977):0.172715)
6	5 ((hg17,panTro1),rheMac2,((mm7,rn3),((bosTau2,dasNov1),canFam2))) ((hg17.chr7(+):127471910-127472074\|hg17_5:0.000139728,panTro1.chr6(+):129885791-129885955\|panTro1_5:0.0184104):0.05206,rheMac2.chr3(+):165788723-165788885\|rheMac2_5:0.0285966,((mm7.chr6(+):28990714-28990875\|mm7_5:0.123289,rn3.chr4(+):56183448-56183705\|rn3_5:0.0718529):0.38361,((bosTau2.chr4(-):50243566-50243734\|bosTau2_5:0.181878,dasNov1.scaffold_256527(+):665-786\|dasNov1_5:0.429124):0.0618692,canFam2.chr14(-):11089913-11090081\|canFam2_5:0.133548):0.11305):0.0250925)
7	6 ((hg17,panTro1),rheMac2,((mm7,rn3),(canFam2,dasNov1))) ((hg17.chr7(+):127472074-127472258\|hg17_6:0.00549431,panTro1.chr6(+):129885955-129886139\|panTro1_6:0):0.0241181,rheMac2.chr3(+):165788885-165789069\|rheMac2_6:0.0447415,((mm7.chr6(+):28990875-28991025\|mm7_6:0.0851965,rn3.chr4(+):56183705-56183879\|rn3_6:0.109546):0.319094,(canFam2.chr14(-):11089743-11089913\|canFam2_6:0.186816,dasNov1.scaffold_256527(+):786-964\|dasNov1_6:0.219003):0.0699235):0.0966238)
8	7 (((hg17,(canFam2,dasNov1)),panTro1),rheMac2,(mm7,rn3)) (((hg17.chr7(+):127472258-127472280\|hg17_7:0,(canFam2.chr14(-):11089526-11089548\|canFam2_7:0.572157,dasNov1.scaffold_256527(+):964-987\|dasNov1_7:0.212507):0.327632):0,panTro1.chr6(+):129886139-129886161\|panTro1_7:0):0,rheMac2.chr3(+):165789069-165789091\|rheMac2_7:0,(mm7.chr6(+):28991025-28991048\|mm7_7:0.0708909,rn3.chr4(+):56183879-56183902\|rn3_7:0.0230732):125.221)
9	8 (((hg17,panTro1),rheMac2),(rn3,canFam2),dasNov1) (((hg17.chr7(+):127472280-127472681\|hg17_8:0.00753956,panTro1.chr6(+):129886161-129886562\|panTro1_8:0):0.0353922,rheMac2.chr3(+):165789091-165789492\|rheMac2_8:0.0278572):0.0967916,(rn3.chr4(+):56183902-56184219\|rn3_8:0.379264,canFam2.chr14(-):11089143-11089523\|canFam2_8:0.207268):0.0346594,dasNov1.scaffold_256527(+):987-1401\|dasNov1_8:0.268281)
10	9 (hg17,((rheMac2,dasNov1),canFam2),panTro1) (hg17.chr7(+):127472681-127472715\|hg17_9:0.0183718,((rheMac2.chr3(+):165789492-165789526\|rheMac2_9:0,dasNov1.scaffold_256527(+):1401-1433\|dasNov1_9:0.160078):0.0595979,canFam2.chr14(-):11089108-11089143\|canFam2_9:0.237132):0.0383088,panTro1.chr6(+):129886562-129886596\|panTro1_9:0.0152865)