root/galaxy-central/test-data/sam_indel_filter_in1.sam

リビジョン 2, 2.8 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central
行番号 
11378_28_770     89      chr11.nib:1-134452384   72131356        37      16M1I5M =       72131356        0       CACACTGTGACAGACAGCGCAGC 00/02!!0//1200210AA44/1 XT:A:U  CM:i:2  SM:i:37  AM:i:0  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:22
21378_28_770     181     chr11.nib:1-134452384   72131356        0       13M2I6M1D5M     =       72131356        0       TTGGTGCGCGCGGTTGAGGGTTGG        $$(#%%#$%#%####$%%##$###
31378_33_1945    113     chr2.nib:1-242951149    181247988       0       23M     chr12.nib:1-132349534   41710908        0       GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG PQRVUMNXYRPUXYXWXSOSZ]M XT:A:R  CM:i:0  SM:i:0  AM:i:0  X0:i:163148  XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
41378_33_1945    177     chr12.nib:1-132349534   41710908        0       23M     chr2.nib:1-242951149    181247988       0       AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA SQQWZYURVYWX]]YXTSY]]ZM XT:A:R  CM:i:0  SM:i:0  AM:i:0  X0:i:163148  XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
51378_35_263     115     chr16.nib:1-88827254    19671878        0       23M     =       19671877        -1      AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTCT 77543:<55#"4!&=964518A> XT:A:R  CM:i:2  SM:i:0  AM:i:0  X0:i:4  X1:i:137  XM:i:2  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
61378_35_263     179     chr16.nib:1-88827254    19671877        0       13M1I4M1I5M     =       19671878        1       GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTC LE7402DD34FL:27AKE>;432 XT:A:R  CM:i:0  SM:i:0  AM:i:0  X0:i:265  XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
71378_35_469     4       *       0       0       *       *       0       0       TTAAGGGGAACGTGTGGGCTATTTAGGCTTTATG      BBB=?BBA?>;?=B=AA=;A@B>=;;>:A=?:?9
81378_51_1671    117     chr2.nib:1-242951149    190342418       0       24M     =       190342418       0       CTGGCGTTCTCGGCGTGGATGGGT        #####$$##$#%#%%###%$#$##
91378_51_1671    153     chr2.nib:1-242951149    190342418       37      15M1I6M =       190342418       0       TCTAACTTAGCCTCATAATAGCT /<<!"0///////00/!!0121/ XT:A:U  CM:i:2  SM:i:37  AM:i:0  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:22
101378_56_324     117     chr2.nib:1-242951149    80324999        0       24M     =       80324999        0       TCCAGTCGCGTTGTTAGGTTCGGA        #$#$$$#####%##%%###**#+/
111378_56_324     153     chr2.nib:1-242951149    80324999        37      7M1I14M =       80324999        0       TTTAGCCCGAAATGCCTAGAGCA 4;?AA@@IE@GGI0110////00 XT:A:U  CM:i:2  SM:i:37  AM:i:0  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1 MD:Z:22
121378_67_1795    81      chr16.nib:1-88827254    26739130        0       23M     chrY.nib:1-57772954     57401793        0       TGGCATTCCTGTAGGCAGAGAGG AZWWZS]!"QNXZ]VQ]]]/2]] XT:A:R  CM:i:2  SM:i:0  AM:i:0  X0:i:3  X1:i:0  XM:i:2  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
131378_67_1795    161     chrY.nib:1-57772954     57401793        37      23M     chr16.nib:1-88827254    26739130        0       GATCACCCAGGTGATGTAACTCC ]WV]]]]WW]]]]]]]]]]PU]] XT:A:U  CM:i:0  SM:i:37  AM:i:0  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
141378_68_1186    4       *       0       0       *       *       0       0       GTTAATAGGGTGATAGA       AB/BC==CC%ACBC/CB
151378_69_800     16      chr11.nib:1-125234658   241     255     14M1D8M *       0       0       CGTGGCCGGCGGGCCGAAGGCAT IIIIIIIIIICCCCIII?!IIII
161378_69_1777    170     chrX.nib:1-59090954     59090793        37      23M     chr16.nib:1-88827254    26739130        0       TATCAATAAGGTGATGTAACTCG ]WV]ABAWW]]]]]P]P//GU]] XT:A:U  CM:i:0  SM:i:37  AM:i:0  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:23
171378_72_1612    151     chrY.nib:1-124295114    190342418       37      18M1I3M =       190342418       0       TCTAACTTAGCCTCATAATAGCT /<<!"0/4//7//@@?BCIIIII XT:A:U  CM:i:2  SM:i:37  AM:i:0  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:22
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。