root/galaxy-central/test-data/sam_indel_filter_in2.sam

リビジョン 2, 2.9 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central
行番号 
1081017-and-081020:1:6:774:1836  0       PHIX174 4973    37      26M1I9M *       0       0       GCTTAAAGCTACCAGTTATATGGCTGTTTGGTTTTT    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII@IIIDIE;%II;I=    XT:A:U  NM:i:2  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:33C1
2081017-and-081020:1:6:1193:793  0       PHIX174 4971    37      27M1I8M *       0       0       CCGCTTAAAGCTACCAGTTATATGGCTGGTTGTTTT    IIIIIIIIIIIIIII7IIIDIIIIIIII&=(>%II?    XT:A:U  NM:i:2  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:31G3
3081017-and-081020:1:8:753:970   0       PHIX174 2974    37      29M1I6M *       0       0       GTGGCGCCATGTCTAAATTGTTTGGAGGCGGGTCAA    IIIIIIIIIIIIIIII4IIIIII3I&IIIII*%%&'    XT:A:U  NM:i:1  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:0  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:35
4081017-and-081020:1:11:761:901  4       *       0       0       *       *       0       0       GACCTGTGATCCATCGTGATGT  CBBAB/$3BB<AB/,CBCABCA
5081017-and-081020:1:17:361:871  0       PHIX174 4739    37      30M1I5M *       0       0       TGAGTATGGTACAGCTAATGGCCGTCTTTATTTTCC    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIGIIIII%II&I'II%/#    XT:A:U  NM:i:2  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:28C6
6081017-and-081020:1:18:1164:1678        0       PHIX174 4971    37      27M1I8M *       0       0       CCGCTTAAAGCTACCAGTTATATGGCTGGTTGTTTT    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIII;IIII1#I)II.I-I    XT:A:U  NM:i:2  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:31G3
7081017-and-081020:1:20:754:1256 16      PHIX174 4772    37      4M1I31M *       0       0       CCCTGGCGGTGCATTTTATGCGGACACTTCCTACAG    &IIII(III3IIIII7II,IIIIIIIIIIIIIIIII    XT:A:U  NM:i:2  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:2A32
8081017-and-081020:1:24:1326:917 0       PHIX174 188     37      25M1D11M        *       0       0       TTCGCCATCAACTAACGATTCTGTCAAACCTGACGC    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIA/&II>'IEI    XT:A:U  NM:i:2  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:25^A3A7
9081017-and-081020:1:24:1567:1780        0       PHIX174 3716    37      28M1D8M *       0       0       TCATCAGCAAACGCAGAATCAGCGGTATGCTCTTCT    IIIIIIIIIIIIIIIII;IIIIIII87IFII%I(@I.   XT:A:U  NM:i:1  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:0  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:28^G8
10081017-and-081020:1:25:1466:511 16      PHIX174 1179    37      21M1D15M        *       0       0       CTATTGACTCTACTGTAGACATTTTACTTTTTATGT    :I<=IIIIII5IIGI5IIIIAIIIIIIIIIIIIIII    XT:A:U  NM:i:1  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:0  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:21^T15
11081017-and-081020:1:27:1267:1275        0       PHIX174 3716    37      28M1D8M *       0       0       TCATCAGCAAACGCAGAATCAGCGGTATGCTCTTCT    IIIIIIIIIIIIIIIII;IIIIIII87!II%I(@I.    XT:A:U  NM:i:1  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:0  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:28^G8
12081017-and-081020:1:56:7924:8122        4       *       0       0       *       *       0       0       GACCTGTGATCCATCGTGATGT  CBBAB/$3BB<AB/,CBCABCA
13081017-and-081020:1:94:1649:147 16      PHIX174 2755    37      15M2D21M        *       0       0       TATACCGTCAAGGACTGTGACTATTGACGTCCTTCC    4IIIIII@I7IIIIDEIIIIIIIIIIIIIIIIIIII    XT:A:U  NM:i:2  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:0  XO:i:1  XG:i:2  MD:Z:15^TG21
14081017-and-081020:1:95:74:43    0       PHIX174 4038    37      29M3I4M *       0       0       ATCGAGGCTCTTAAACCTGCTATTGAGGCCCTTTTT    IIIIIIIIIIIIIIIIICI;8I,I>II#####I1I%    XT:A:U  NM:i:2  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:31G3
15081017-and-081020:1:95:182:353  4       *       0       0       *       *       0       0       GACCTGTGATCCATCGTGATGT  CBBAB/$3BB<AB/,CBCABCA
16081017-and-081020:1:95:58:307   16      PHIX174 3859    37      2M1I33M *       0       0       ACAAATGTCTGGAAAGACGGTAAAGCTGATGGTATT    I&*IIIIIIII;IIIBIII>IICIIIIIIFII:III    XT:A:U  NM:i:2  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:5T29
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。