root/galaxy-central/test-data/sam_indel_filter_out3.sam

081017-and-081020:1:6:774:1836  0       PHIX174 4973    37      26M1I9M *       0       0       GCTTAAAGCTACCAGTTATATGGCTGTTTGGTTTTT    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII@IIIDIE;%II;I=    XT:A:U  NM:i:2  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:33C1
081017-and-081020:1:8:753:970   0       PHIX174 2974    37      29M1I6M *       0       0       GTGGCGCCATGTCTAAATTGTTTGGAGGCGGGTCAA    IIIIIIIIIIIIIIII4IIIIII3I&IIIII*%%&'    XT:A:U  NM:i:1  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:0  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:35
081017-and-081020:1:20:754:1256 16      PHIX174 4772    37      4M1I31M *       0       0       CCCTGGCGGTGCATTTTATGCGGACACTTCCTACAG    &IIII(III3IIIII7II,IIIIIIIIIIIIIIIII    XT:A:U  NM:i:2  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:2A32
081017-and-081020:1:24:1326:917 0       PHIX174 188     37      25M1D11M        *       0       0       TTCGCCATCAACTAACGATTCTGTCAAACCTGACGC    IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIA/&II>'IEI    XT:A:U  NM:i:2  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:25^A3A7
081017-and-081020:1:24:1567:1780        0       PHIX174 3716    37      28M1D8M *       0       0       TCATCAGCAAACGCAGAATCAGCGGTATGCTCTTCT    IIIIIIIIIIIIIIIII;IIIIIII87IFII%I(@I.   XT:A:U  NM:i:1  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:0  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:28^G8
081017-and-081020:1:25:1466:511 16      PHIX174 1179    37      21M1D15M        *       0       0       CTATTGACTCTACTGTAGACATTTTACTTTTTATGT    :I<=IIIIII5IIGI5IIIIAIIIIIIIIIIIIIII    XT:A:U  NM:i:1  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:0  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:21^T15
081017-and-081020:1:94:1649:147 16      PHIX174 2755    37      15M2D21M        *       0       0       TATACCGTCAAGGACTGTGACTATTGACGTCCTTCC    4IIIIII@I7IIIIDEIIIIIIIIIIIIIIIIIIII    XT:A:U  NM:i:2  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:0  XO:i:1  XG:i:2  MD:Z:15^TG21