root/galaxy-central/tools/data_source/genbank.xml

リビジョン 2, 0.8 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central

行番号 
1<tool id="genbank" name="Connect to Genbank">
2<!--  <description>queries genbank</description> -->
3  <command interpreter="python">genbank.py $mode "$text" $output</command>
4  <inputs>
5    <param name="mode" type="select">
6      <option value="nucleotide">nucleotide database</option>
7      <option value="protein">proteins database</option>
8      <label>Get sequences from the</label>
9    </param>
10    <param name="text" size="40" type="text" value="6273291">
11      <label>with accession ID</label>
12    </param>   
13  </inputs>
14  <outputs>
15    <data format="fasta" name="output" />
16  </outputs>
17  <help>
18At the moment this tool allows the following simple searches:
19
20- by GI: **51594135**
21- by accession: **CF622840**
22- using text: **human hbb1** (this feature is experimental)
23  </help>
24
25</tool>
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。