root/galaxy-central/tools/data_source/wormbase.xml

リビジョン 2, 1.3 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central
行番号 
1<?xml version="1.0"?>
2<tool name="Wormbase" id="wormbase" tool_type="data_source">
3    <description>server</description>
4    <command interpreter="python">data_source.py $output $__app__.config.output_size_limit</command>
5    <inputs action="http://www.wormbase.org/db/seq/gbgff/c_elegans/" check_values="false" target="_top">
6        <display>go to Wormbase server $GALAXY_URL</display>
7        <param name="GALAXY_URL" type="baseurl" value="/tool_runner?tool_id=wormbase" />
8    </inputs>
9    <request_param_translation>
10        <request_param galaxy_name="URL" remote_name="URL" missing="">
11            <append_param separator="&amp;" first_separator="?" join="=">
12                <value name="d" missing="" />
13                <value name="dbkey" missing="" />
14                <value name="q" missing="" />
15                <value name="s" missing="" />
16                <value name="t" missing="" />
17            </append_param>
18        </request_param>
19        <request_param galaxy_name="URL_method" remote_name="URL_method" missing="post" />
20        <request_param galaxy_name="data_type" remote_name="data_type" missing="txt" />
21    </request_param_translation>
22    <uihints minwidth="800"/>
23    <outputs>
24        <data name="output" format="txt" />
25    </outputs>
26    <options sanitize="False" refresh="True"/>
27</tool>
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。