root/galaxy-central/tools/emboss_5/emboss_banana.pl

リビジョン 2, 444 bytes (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central

行番号 
1#! /usr/bin/perl -w
2use strict;
3
4my $cmd_string = join (" ",@ARGV);
5#my $cmd_string = "/home/djb396/temp/emboss/bin/banana -sequence /home/djb396/universe-prototype/test.fasta -outfile result.txt -graph png -goutfile results -auto";
6my $results = `$cmd_string`;
7my @files = split("\n",$results);
8foreach my $thisLine (@files)
9{
10        if ($thisLine =~ /Created /i)
11        {
12                $thisLine =~ /[\w|\.]+$/;
13                $thisLine =$&;
14                print "outfile: $thisLine\n";
15        }
16}
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。