root/galaxy-central/tools/emboss_5/emboss_cai_custom.xml

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import galaxy-central

行番号 
1<tool id="EMBOSS: cai_custom6" name="cai custom" version="5.0.0">
2  <description>CAI codon adaptation index using custom codon usage file</description>
3  <requirements><requirement type="package" version="5.0.0">emboss</requirement></requirements>
4  <command>cai -seqall $input1 -outfile $out_file1 -cfile $input2 -auto</command>
5  <inputs>
6    <param format="fasta" name="input1" type="data">
7      <label>On query</label>
8    </param>
9    <param format="txt" name="input2" type="data">
10      <label>Codon Usage File</label>
11    </param>
12  </inputs>
13  <outputs>
14    <data format="txt" name="out_file1" />
15  </outputs>
16  <help>
17.. class:: warningmark
18
19The input dataset needs to be sequences.
20
21-----
22
23    You can view the original documentation here_.
24   
25    .. _here: http://emboss.sourceforge.net/apps/release/5.0/emboss/apps/cai_custom.html
26  </help>
27</tool>
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。