root/galaxy-central/tools/emboss_5/emboss_hmoment.xml

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import galaxy-central

行番号 
1<tool id="EMBOSS: hmoment44" name="hmoment" version="5.0.0">
2  <description>Hydrophobic moment calculation</description>
3  <requirements><requirement type="package" version="5.0.0">emboss</requirement></requirements>
4  <command>hmoment -seqall $input1 -outfile $out_file1 -window $window -aangle $aangle -graph png -auto</command>
5  <inputs>
6    <param format="data" name="input1" type="data">
7      <label>Sequences</label>
8    </param>
9    <param name="window" size="5" type="text" value="10">
10      <label>Window</label>
11    </param>
12    <param name="aangle" size="5" type="text" value="100">
13      <label>Alpha helix angle (degrees)</label>
14    </param>
15  </inputs>
16  <outputs>
17    <data format="hmoment" name="out_file1" />
18  </outputs>
19    <tests>
20    <test>
21      <param name="input1" value="2.fasta"/>
22      <param name="window" value="10"/>
23      <param name="aangle" value="100"/>
24      <output name="out_file1" file="emboss_hmoment_out.hmoment"/>
25    </test>
26  </tests>
27  <help>
28    You can view the original documentation here_.
29   
30    .. _here: http://emboss.sourceforge.net/apps/release/5.0/emboss/apps/hmoment.html
31  </help>
32</tool>
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。