root/galaxy-central/tools/emboss_5/emboss_preg.xml @ 2

リビジョン 2, 0.8 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central

行番号 
1<tool id="EMBOSS: preg78" name="preg" version="5.0.0">
2  <description>Regular expression search of a protein sequence</description>
3  <requirements><requirement type="package" version="5.0.0">emboss</requirement></requirements>
4  <command>preg -sequence $input1 -outfile $out_file1 -pattern "$pattern" -auto</command>
5  <inputs>
6    <param format="data" name="input1" type="data">
7      <label>Sequence 1</label>
8    </param>
9    <param name="pattern" size="50" type="text" value="(ACD)">
10      <label>Regular expression pattern</label>
11    </param>
12  </inputs>
13  <outputs>
14    <data format="preg" name="out_file1" />
15  </outputs>
16  <help>
17    You can view the original documentation here_.
18   
19    .. _here: http://emboss.sourceforge.net/apps/release/5.0/emboss/apps/preg.html
20  </help>
21</tool>
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。