root/galaxy-central/tools/filters/joiner2.xml

リビジョン 2, 0.8 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central

行番号 
1<tool id="joiner2" name="Relational join 2">
2  <description>two Queries A specific column of which has the same value</description>
3  <command>sort -k $col1 $input1 > $input1.tmp; sort -k $col2 $input2 > $input2.tmp; join -1 $col1 -2 $col2 $input1.tmp $input2.tmp | tr " " "\t" > $out_file1; rm -rf $input1.tmp $input2.tmp </command>
4  <inputs>
5    <param name="input1" label="Combine query" format="tabular" type="data" />
6    <param name="col1" label="using column" type="data_column" data_ref="input1" />
7    <param name="input2" label="with query"     format="tabular" type="data"/>
8    <param name="col2" label="and column" type="data_column" data_ref="input2" />
9  </inputs>
10  <outputs>
11    <data format="input" name="out_file1" metadata_source="input1" />
12  </outputs>
13</tool>
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。