root/galaxy-central/tools/maf/maf_limit_size.xml

リビジョン 2, 1.0 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central

行番号 
1<tool id="maf_limit_size1" name="Filter MAF blocks" version="1.0.1">
2  <description>by Size</description>
3  <command interpreter="python">maf_limit_size.py $input1 $out_file1 $min_size $max_size</command>
4  <inputs>
5    <page>
6        <param format="maf" name="input1" label="MAF File" type="data"/>
7        <param name="min_size" label="Minimum Size" value="0" type="integer"/>
8        <param name="max_size" label="Maximum Size" value="0" type="integer" help="A maximum size less than 1 indicates no limit"/>
9    </page>
10   </inputs>
11  <outputs>
12    <data format="maf" name="out_file1" />
13  </outputs>
14  <tests>
15    <test>
16      <param name="input1" value="3.maf" ftype="maf" />
17      <param name="min_size" value="0"/>
18      <param name="max_size" value="0"/>
19      <output name="out_file1" file="maf_limit_size1_out.maf" />
20    </test>
21  </tests>
22  <help>
23
24**What it does**
25
26This tool takes a MAF file and a size range and extracts the MAF blocks which fall within the specified range.
27  </help>
28</tool>
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。