root/galaxy-central/tools/rgenetics/rgGTOOL_code.py

リビジョン 2, 0.6 KB (コミッタ: hatakeyama, 14 年 前)

import galaxy-central

行番号 
1# for GTOOL linkage ped to marchini snptest format
2from galaxy import datatypes
3
4
5def exec_before_job(app, inp_data, out_data, param_dict, tool=None):
6    """Sets the name of the data"""
7    job_name = param_dict.get( 'o', 'Marchini' )
8    log = ['txt','%s_rgGTOOL_report.log' % job_name,'txt']
9    lookup={}
10    lookup['logf'] = log
11    for name in lookup.keys():
12        data = out_data[name]
13        data_type,newname,ext = lookup[name]
14        data = app.datatypes_registry.change_datatype(data, data_type)
15        data.name = newname
16        out_data[name] = data
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Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。