CSV <-> 改行区切り変換ツールの組込み

[h-morita]

Galaxy において、データのフォーマットはカンマ区切りが適切 であったり、改行区切りが適切であったりと、ツールの入力フォ ーマットに合わせて入力データの区切り方を変える必要がある。 それら相互変換をサポートするツールをGalaxy ツールとして組み 込むことで、変換にかかる手間を軽減させる。 仕様書 (1) - 3 に対応。

「Fieldwise Transpose」というツール名で作成し、対象ファイルの他に、転置するカラム名、エスケープの有無、区切り文字をしていして変換を行う。

また、どのどちらの形式に変換するかは、指定カラム内の区切り文字有無などで、基本的に自動で認識を行う。ただし、ツール利用者の意図を完全に再現することはできないので、自動以外にも形式指定の変換も行えるようにする。

実装後確認をしていただいたので、closedとさせていただきます。