チケット #370 (closed 不具合: fixed)
[エラー] ワークフローまわりでエラーが発生している
報告者: | mn | 担当者: | t-hatakeyama |
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優先度: | 現マイルストーンで作業の停滞を招く | マイルストーン: | Problems |
コンポーネント: | Galaxy | バージョン: | |
キーワード: | 関係者: | t-hatakeyama, fujiwara, mn, atsuko | |
GanttChart表示: | OFF | 依存TaskNo: | |
開始予定日: | YYYY/MM/DD | 終了予定日: | YYYY/MM/DD |
説明
http://galaxy.dbcls.jp でのエラー発生を報告します。
(1)公開されたワークフローの一部を表示するとエラーになる。
公開ワークフロー http://galaxy.dbcls.jp/workflow/list_published の thata さんの http://galaxy.dbcls.jp/u/thata/w/thatas-galaxy-workflow は表示されるけど、atsuko さんの http://galaxy.dbcls.jp/u/atsuko/w/snpsexonchr22 ではエラーになる。
Error Traceback: View as: Interactive | Text | XML (full) ⇝ KeyError: u'Grouping1' URL: http://galaxy.dbcls.jp/u/atsuko/w/snpsexonchr22 Module weberror.evalexception.middleware:364 in respond view >> app_iter = self.application(environ, detect_start_response) Module paste.debug.prints:98 in __call__ view >> environ, self.app) Module paste.wsgilib:539 in intercept_output view >> app_iter = application(environ, replacement_start_response) Module paste.recursive:80 in __call__ view >> return self.application(environ, start_response) Module galaxy.web.framework.middleware.remoteuser:107 in __call__ view >> return self.app( environ, start_response ) Module paste.httpexceptions:632 in __call__ view >> return self.application(environ, start_response) Module galaxy.web.framework.base:145 in __call__ view >> body = method( trans, **kwargs ) Module galaxy.web.controllers.workflow:205 in display_by_username_and_slug view >> self.get_stored_workflow_steps( trans, stored_workflow ) Module galaxy.web.base.controller:213 in get_stored_workflow_steps view >> module = module_factory.from_workflow_step( trans, step ) Module galaxy.workflow.modules:333 in from_workflow_step view >> return self.module_types[type].from_workflow_step( trans, step ) Module galaxy.workflow.modules:192 in from_workflow_step view >> module = Class( trans, tool_id ) Module galaxy.workflow.modules:166 in __init__ view >> self.tool = trans.app.toolbox.tools_by_id[ tool_id ] KeyError: u'Grouping1'
(2)ユーザ自身のワークフローを編集するとエラーが表示される。
http://galaxy.dbcls.jp/workflow/editor?id=75cfda0e4b8063b8
Server error URL: http://galaxy.dbcls.jp/workflow/load_workflow?_=1297826075869&id=75cfda0e4b8063b8&_=true Module weberror.evalexception.middleware:364 in respond >> app_iter = self.application(environ, detect_start_response) Module paste.debug.prints:98 in __call__ >> environ, self.app) Module paste.wsgilib:539 in intercept_output >> app_iter = application(environ, replacement_start_response) Module paste.recursive:80 in __call__ >> return self.application(environ, start_response) Module galaxy.web.framework.middleware.remoteuser:107 in __call__ >> return self.app( environ, start_response ) Module paste.httpexceptions:632 in __call__ >> return self.application(environ, start_response) Module galaxy.web.framework.base:145 in __call__ >> body = method( trans, **kwargs ) Module galaxy.web.framework:65 in decorator >> return simplejson.dumps( func( self, trans, *args, **kwargs ) ) Module galaxy.web.controllers.workflow:756 in load_workflow >> module = module_factory.from_workflow_step( trans, step ) Module galaxy.workflow.modules:333 in from_workflow_step >> return self.module_types[type].from_workflow_step( trans, step ) Module galaxy.workflow.modules:192 in from_workflow_step >> module = Class( trans, tool_id ) Module galaxy.workflow.modules:166 in __init__ >> self.tool = trans.app.toolbox.tools_by_id[ tool_id ] KeyError: u'Cut1' []
チケットの履歴
Note: チケットについてのヘルプは
TracTickets を参照
して下さい。