root/BH13SPARQLBuilder/src/org/biohackathon/SPARQLBuilder/OWL/OWLQueryBuilderImpl.java @ 30

リビジョン 30, 25.6 KB (コミッタ: atsuko, 11 年 前)

getPath の引数変更
  • 属性 svn:mime-type の設定値 text/plain
行番号 
1package org.biohackathon.SPARQLBuilder.OWL;
2
3import java.util.ArrayList;
4import java.util.Collection;
5import java.util.HashMap;
6import java.util.HashSet;
7import java.util.Set;
8
9import com.hp.hpl.jena.query.Query;
10import com.hp.hpl.jena.query.QueryExecution;
11import com.hp.hpl.jena.query.QueryExecutionFactory;
12import com.hp.hpl.jena.query.QueryFactory;
13import com.hp.hpl.jena.query.QuerySolution;
14import com.hp.hpl.jena.query.ResultSet;
15import com.hp.hpl.jena.rdf.model.Literal;
16import com.hp.hpl.jena.rdf.model.Resource;
17
18/**
19 * 繧ｯ繧ｨ繝ｪ繧堤函謌舌☆繧九◆繧√�讖溯�繧呈署萓帙☆繧区ｸ繧ｯ繝ｩ繧ｹ
20 *
21 * @author Norio KOBAYASHI
22 * @since 28.01.2014
23 * @version 29.01.2014
24 */
25public class OWLQueryBuilderImpl implements OWLQueryBuilder {
26
27        // private Model model = null;
28        private String endpointURI = null;
29
30        /**
31         * 繧｢繧ｯ繧ｻ繧ｹ縺吶ｋSPARQL endpoint縺ｮURI繧呈欠螳壹☆繧区ｧ区�蟄�
32         *
33         * @param endpointURI
34         *            縲€繧｢繧ｯ繧ｻ繧ｹ縺吶ｋSPARQL endpoint縺ｮURI
35         * @throws Exception
36         * @since 28.01.2014
37         */
38        public OWLQueryBuilderImpl(String endpointURI) {
39                this.endpointURI = endpointURI;
40        }
41
42        /**
43         * 繝�せ繝医↓菴ｿ逕ｨ縺吶ｋmain繝｡繧ｽ繝�ラ
44         * <p>
45         * 繧ｯ繧ｨ繝ｪ繝薙Ν繝€繝ｼ縺ｮ譛ｬ逡ｪ繝励Ο繧ｰ繝ｩ繝縺ｧ縺ｯ縺薙�繝｡繧ｽ繝�ラ縺ｯ菴ｿ逕ｨ縺励↑縺�
46         * </p>
47         *
48         * @param args
49         *            菴ｿ逕ｨ縺励↑縺�
50         * @throws Exception
51         * @since 28.01.2014
52         */
53        public static void main(String[] args) throws Exception {
54                String sparqlEndpoint = "http://dbpedia.org/sparql";
55                // String sparqlEndpoint = "http://lsd.dbcls.jp/sparql";
56                String keyword = "artiste";
57                // String keyword = "Agent";
58                String[] graphURIs = new String[0];
59
60                OWLQueryBuilder builder = new OWLQueryBuilderImpl(sparqlEndpoint);
61                SClass[] clz = builder.getOWLClasses(graphURIs, keyword, false);
62                for (SClass cls : clz) {
63                        System.out.println(cls);
64                }
65
66                System.out.println("CLS");
67                ClassLink[] cls = builder.getNextClass(null, clz[1].getClassURI(), 100,
68                                false);
69                if (cls != null) {
70                        for (ClassLink cl : cls) {
71                                System.out.println(cl.toString());
72                        }
73                        cls = builder.countLinks(null, clz[1].getClassURI(), cls);
74                        for (ClassLink cl : cls) {
75                                System.out.println(cl.toString());
76                        }
77                }
78
79                /*
80                 * System.out.println("CLS-INS"); cls =
81                 * builder.getNextClassViaInstanceLink(null, clz[0].getClassURI(), 100);
82                 * if( cls != null ){ for( ClassLink cl: cls){
83                 * System.out.println(cl.toString()); } }
84                 *
85                 * System.out.println("Instances"); Instance[] ins =
86                 * builder.getInstances(null, "\"A.C. Reed\"@en"); if( ins != null ){
87                 * for( Instance in: ins){ System.out.println(in.toString()); } }
88                 *
89                 *
90                 * System.out.println("INS-INS"); ins = builder.getInstances(null,
91                 * "\"A.C. Reed\"@en"); InstanceLink[] iLinks =
92                 * builder.getNextInstancesViaInstanceLink(null,
93                 * ins[0].getInstanceURI(), 100);
94                 *
95                 *
96                 *
97                 * if( iLinks != null ){ for( InstanceLink in: iLinks){
98                 * System.out.println(in.toString()); } }
99                 */
100        }
101
102        /**
103         * 譏守､ｺ逧�↓RDF縺ｧ譖ｸ縺九ｌ縺ｦ縺�ｋ繧ｯ繝ｩ繧ｹ繧貞叙蠕励☆繧�
104         * <p>
105         * 謖�ｮ壹＆繧後◆graphURIs縺ｮ荳ｭ縺九ｉ縲√く繝ｼ繝ｯ繝ｼ繝峨↓繝偵ャ繝医☆繧九Λ繝吶Ν繧呈戟縺､繧ｯ繝ｩ繧ｹ��dfs:Class�峨ｒ縺吶∋縺ｦ霑斐☆ <br>
106         * </p>
107         *
108         * @param graphURIs
109         *            縲€讀懃ｴ｢蟇ｾ雎｡縺ｮgraph縺ｮURI驟榊� (null繧�聞縺�縺ｮ驟榊�繧ょ庄)
110         * @param keyword
111         *            ��ull繧�ｩｺ譁�ｭ励�荳榊庄��
112         * @return 繧ｯ繝ｩ繧ｹURI縺ｮ驟榊�
113         * @throws Exception
114         * @since 28.01.2014
115         */
116        public SClass[] getOWLClasses(String[] graphURIs, String keyword,
117                        boolean countInstances) throws Exception {
118                StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
119                queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
120                queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
121                queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
122                if (countInstances) {
123                        queryStr.append("SELECT DISTINCT ?c ?pLabel (COUNT(?i) AS ?numOfInstances)\n");
124                } else {
125                        queryStr.append("SELECT DISTINCT ?c ?pLabel \n");
126                }
127                if (graphURIs != null) {
128                        for (String graphURI : graphURIs) {
129                                queryStr.append("FROM <");
130                                queryStr.append(graphURI);
131                                queryStr.append(">\n");
132                        }
133                }
134                queryStr.append("WHERE{\n");
135
136                queryStr.append(" {?c rdf:type rdfs:Class} UNION {?c rdf:type owl:Class}\n");
137
138                queryStr.append("      ?c rdfs:label ?label.\n");
139                queryStr.append("      ?c rdfs:label ?pLabel.\n");
140                if (countInstances) {
141                        queryStr.append("      ?i rdf:type ?c.\n");
142                }
143                // queryStr.append("      ?c rdfs:label ");
144                // queryStr.append(keyword);
145                // queryStr.append(".");
146                if (keyword != null && keyword.length() != 0) {
147                        queryStr.append("  FILTER (\n");
148                        queryStr.append("    REGEX( ?label , \"");
149                        queryStr.append(keyword);
150                        queryStr.append("\" , \"i\" )\n");
151                        queryStr.append("  )");
152                }
153                if (countInstances) {
154                        queryStr.append("\n}  GROUP BY ?c ?pLabel");
155                } else {
156                        queryStr.append("\n}");
157                }
158                System.out.println(queryStr.toString());
159
160                Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
161                QueryExecution qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(endpointURI,
162                                query);
163
164                ResultSet results = qexec.execSelect();
165                HashMap<String, SClass> classMap = new HashMap<String, SClass>();
166                for (; results.hasNext();) {
167                        QuerySolution sol = results.next();
168                        Resource res = sol.getResource("c");
169                        if (res != null) {
170                                String uri = res.getURI();
171                                int numOfInstances = sol.getLiteral("numOfInstances").getInt();
172                                // System.out.println(numOfInstances);
173                                Literal labelLiteral = sol.getLiteral("pLabel");
174                                SClass sClass = null;
175                                if (classMap.containsKey(uri)) {
176                                        sClass = classMap.get(uri);
177                                } else {
178                                        sClass = new SClass(uri, null, numOfInstances);
179                                        classMap.put(uri, sClass);
180                                }
181                                if (labelLiteral != null) {
182                                        String label = labelLiteral.getString();
183                                        String lang = labelLiteral.getLanguage();
184                                        sClass.addLabel(new Label(label, lang));
185                                }
186                        }
187                }
188                qexec.close();
189                return classMap.values().toArray(new SClass[0]);
190        }
191
192        /**
193         * 縲€繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ繧貞叙蠕励☆繧�
194         * <p>
195         * 謖�ｮ壹＆繧後◆graphURIs縺ｮ荳ｭ縺九ｉ縲√く繝ｼ繝ｯ繝ｼ繝峨↓繝偵ャ繝医☆繧九Λ繝吶Ν繧呈戟縺､繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ繧偵☆縺ｹ縺ｦ霑斐☆ <br>
196         * 縺薙％縺ｧ繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｨ縺ｯ縲〉df:type縺ｮ荳ｻ隱槭→縺励※險倩ｿｰ縺輔ｌ縺ｦ縺�ｋ繧ゅ�繧偵＞縺�<br>
197         * </p>
198         *
199         * @param graphURIs
200         *            縲€讀懃ｴ｢蟇ｾ雎｡縺ｮgraph縺ｮURI驟榊� (null繧�聞縺�縺ｮ驟榊�繧ょ庄)
201         * @param keyword
202         *            ��ull繧�ｩｺ譁�ｭ励�荳榊庄��
203         * @return 繧ｯ繝ｩ繧ｹURI縺ｮ驟榊�
204         * @throws Exception
205         * @since 28.01.2014
206         */
207        public Instance[] getInstances(String[] graphURIs, String keyword)
208                        throws Exception {
209                StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
210                queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
211                queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
212                queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
213                queryStr.append("SELECT DISTINCT ?ins ?c \n");
214                if (graphURIs != null) {
215                        for (String graphURI : graphURIs) {
216                                queryStr.append("FROM <");
217                                queryStr.append(graphURI);
218                                queryStr.append(">\n");
219                        }
220                }
221                queryStr.append("WHERE{\n");
222                // queryStr.append(" {?c rdf:type rdfs:Class} UNION {?c rdf:type owl:Class}\n");
223
224                queryStr.append("      ?ins rdf:type ?c.\n");
225                queryStr.append("      ?ins rdfs:label ");
226                queryStr.append(keyword);
227                queryStr.append(".\n");
228                queryStr.append(" FILTER (?c != rdf:Property)");
229                queryStr.append("}");
230
231                // System.out.println(queryStr.toString());
232
233                Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
234                QueryExecution qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(endpointURI,
235                                query);
236
237                ResultSet results = qexec.execSelect();
238                HashMap<String, HashSet<String>> instanceMap = new HashMap<String, HashSet<String>>();
239                for (; results.hasNext();) {
240                        QuerySolution sol = results.next();
241                        Resource cls = sol.getResource("c");
242                        Resource ins = sol.getResource("ins");
243                        String clsURI = cls.getURI();
244                        String insURI = ins.getURI();
245                        if (instanceMap.containsKey(insURI)) {
246                                HashSet<String> classes = instanceMap.get(insURI);
247                                classes.add(clsURI);
248                        } else {
249                                HashSet<String> classes = new HashSet<String>();
250                                instanceMap.put(insURI, classes);
251                                classes.add(clsURI);
252                        }
253                }
254                qexec.close();
255                Set<String> keySet = instanceMap.keySet();
256                ArrayList<Instance> instanceList = new ArrayList<Instance>();
257                for (String key : keySet) {
258                        Instance ins = new Instance(key, instanceMap.get(key).toArray(
259                                        new String[0]));
260                        instanceList.add(ins);
261                }
262                return instanceList.toArray(new Instance[0]);
263        }
264
265        /**
266         * 縲€謖�ｮ壹＆繧後◆繧ｯ繝ｩ繧ｹ繧定ｵｷ轤ｹ縺ｨ縺励€∵�遉ｺ逧�↓險倩ｿｰ縺輔ｌ縺ｦ縺�ｋOWL縺ｮproperty蛻ｶ邏�ｒ隱ｿ縺ｹ縲√◎縺ｮproperty蛻ｶ邏�〒
267         * 髢｢騾｣縺･縺代ｉ繧後※縺�ｋ繧ｯ繝ｩ繧ｹ繧堤ｶｲ鄒�噪縺ｫ蜿門ｾ励☆繧�
268         * <p>
269         * 蜃ｦ逅�ｯｾ雎｡繝��繧ｿ繧暖raphURIs縺ｧ謖�ｮ壹☆繧九％縺ｨ縺後〒縺阪ｋ <br>
270         * <br>
271         * </p>
272         *
273         * @param graphURIs
274         *            縲€讀懃ｴ｢蟇ｾ雎｡縺ｮgraph縺ｮURI驟榊� 縲€(null繧�聞縺�縺ｮ驟榊�繧ょ庄)
275         * @param originClass
276         *            襍ｷ轤ｹ縺ｨ縺ｪ繧九け繝ｩ繧ｹ縺ｮURI縲€��ull荳榊庄��
277         * @param limit
278         *            隗｣縺ｨ縺励※霑斐＆繧後ｋClassLink驟榊�縺ｮ髟ｷ縺輔�荳企剞蛟､繧呈欠螳壹☆繧九€�荳企剞蛟､繧定ｨｭ螳壹＠縺ｪ縺�ｴ蜷医�0莉･荳九�蛟､繧呈欠螳壹☆繧�
279         * @return ClassLink縺ｮ驟榊�縲ゅ％縺薙↓縺ｯ縲∝叙蠕励＆繧後◆繧ｯ繝ｩ繧ｹ縺ｨ髢｢菫ゅ▼縺代ｉ繧後※縺�ｋ繝励Ο繝代ユ繧｣縲�未菫ゅ�蜷代″縺悟性縺ｾ繧後ｋ縲�
280         * @throws Exception
281         * @since 28.01.2014
282         */
283        public ClassLink[] getNextClass(String[] graphURIs, String originClass,
284                        int limit, boolean countLinks) throws Exception {
285                StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
286                queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
287                queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
288                queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
289
290                // SELECT
291                if (countLinks) {
292                        queryStr.append("SELECT DISTINCT ?p ?pDirection ?c (COUNT(?s) AS ?numOfLinks) \n");
293                } else {
294                        queryStr.append("SELECT DISTINCT ?p ?pDirection ?c \n");
295                }
296
297                if (graphURIs != null) {
298                        for (String graphURI : graphURIs) {
299                                queryStr.append("FROM <");
300                                queryStr.append(graphURI);
301                                queryStr.append(">\n");
302                        }
303                }
304                queryStr.append("WHERE{\n");
305                // queryStr.append("  { ?c rdf:type rdfs:Class. }\n  UNION\n  { ?c rdf:type owl:Class. }\n");
306                queryStr.append("  { ?p rdfs:domain <");
307                queryStr.append(originClass);
308                queryStr.append(">.\n    ?p rdfs:range ?c.\n");
309
310                if (countLinks) {
311                        queryStr.append("    ?o ?p ?s.");
312                } else {
313                        queryStr.append("filter(exists{\n");
314                        queryStr.append("  ?o rdf:type ?c.\n");
315                        queryStr.append(" ?s rdf:type <");
316                        queryStr.append(originClass);
317                        queryStr.append(">.\n");
318                        queryStr.append("       ?s ?p ?o.})\n");
319                }
320
321                queryStr.append("}\n  UNION\n");
322                queryStr.append("  { ?p rdfs:range <");
323                queryStr.append(originClass);
324                queryStr.append(">.\n");
325                queryStr.append("    ?p rdfs:domain ?c.\n");
326
327                if (countLinks) {
328                        queryStr.append("    ?s ?p ?o.");
329                } else {
330                        queryStr.append("filter(exists{\n");
331                        queryStr.append("  ?s rdf:type ?c.\n");
332                        queryStr.append(" ?o rdf:type <");
333                        queryStr.append(originClass);
334                        queryStr.append(">.\n");
335                        queryStr.append("       ?s ?p ?o.})\n");
336                }
337
338                queryStr.append("}\n");
339
340                queryStr.append("    ?p ?pDirection ?c.\n");
341
342                queryStr.append("  ?s rdf:type ?c.\n");
343
344                if (countLinks) {
345                        queryStr.append("}\nGROUP BY ?p ?pDirection ?c\n");
346                } else {
347                        queryStr.append("}\n");
348                }
349                if (limit > 0) {
350                        queryStr.append("limit ");
351                        queryStr.append(limit);
352                        queryStr.append("\n");
353                }
354
355                System.out.println(queryStr.toString());
356
357                Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
358                QueryExecution qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(endpointURI,
359                                query);
360
361                ResultSet results = qexec.execSelect();
362                ArrayList<ClassLink> solCLs = new ArrayList<ClassLink>();
363                for (; results.hasNext();) {
364                        QuerySolution sol = results.next();
365                        Resource pro = sol.getResource("p");
366                        if (pro != null) {
367                                Resource cls = sol.getResource("c");
368                                Resource dir = sol.getResource("pDirection");
369                                String proURI = pro.getURI();
370                                String clsURI = cls.getURI();
371                                String dirURI = dir.getURI();
372
373                                // System.out.println(pro.getURI() + " " + cls.getURI() + " " +
374                                // dir.getURI());
375
376                                Direction direction = null;
377                                if (dirURI
378                                                .equals("http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#domain")
379                                                || dirURI.equals("rdfs:domain")) {
380                                        direction = Direction.reverse;
381                                }
382                                if (dirURI.equals("http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#range")
383                                                || dirURI.equals("rdfs:range")) {
384                                        if (direction != null) {
385                                                direction = Direction.both;
386                                        } else {
387                                                direction = Direction.forward;
388                                        }
389                                }
390                                // System.out.println(direction);
391                                int numOfLinks = 0;
392                                if (countLinks) {
393                                        numOfLinks = sol.getLiteral("numOfLinks").getInt();
394                                }
395                                ClassLink cl = new ClassLink(proURI, clsURI, direction,
396                                                numOfLinks);
397                                solCLs.add(cl);
398                        }
399                }
400                qexec.close();
401                return solCLs.toArray(new ClassLink[0]);
402        }
403
404        /**
405         * 縲€謖�ｮ壹＆繧後◆繧ｯ繝ｩ繧ｹ繧定ｵｷ轤ｹ縺ｨ縺励€√◎縺ｮ繧ｯ繝ｩ繧ｹ縺ｫ螻槭＠縺ｦ縺�ｋ繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｨ繝ｪ繝ｳ繧ｯ縺悟ｼｵ繧峨ｌ縺ｦ縺�ｋ繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｮ髮�粋繧貞叙蠕励＠縲�
406         * 蜿門ｾ励＠縺溘う繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｮ繧ｯ繝ｩ繧ｹ繧堤ｶｲ鄒�噪縺ｫ蜿門ｾ励☆繧�
407         * <p>
408         * 縺薙％縺ｧ繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｨ縺ｯ縲〉df:type縺ｮ荳ｻ隱槭→縺励※險倩ｿｰ縺輔ｌ縺ｦ縺�ｋ繧ゅ�繧偵＞縺�<br>
409         * 蜃ｦ逅�ｯｾ雎｡繝��繧ｿ繧暖raphURIs縺ｧ謖�ｮ壹☆繧九％縺ｨ縺後〒縺阪ｋ <br>
410         * </p>
411         *
412         * @param graphURIs
413         *            縲€讀懃ｴ｢蟇ｾ雎｡縺ｮgraph縺ｮURI驟榊� 縲€(null繧�聞縺�縺ｮ驟榊�繧ょ庄)
414         * @param originClass
415         *            襍ｷ轤ｹ縺ｨ縺ｪ繧九け繝ｩ繧ｹ縺ｮURI縲€��ull荳榊庄��
416         * @param limit
417         *            隗｣縺ｨ縺励※霑斐＆繧後ｋClassLink驟榊�縺ｮ髟ｷ縺輔�荳企剞蛟､繧呈欠螳壹☆繧九€�荳企剞蛟､繧定ｨｭ螳壹＠縺ｪ縺�ｴ蜷医�0莉･荳九�蛟､繧呈欠螳壹☆繧�
418         * @return ClassLink縺ｮ驟榊�縲ゅ％縺薙↓縺ｯ縲∝叙蠕励＆繧後◆繧ｯ繝ｩ繧ｹ縺ｨ髢｢菫ゅ▼縺代ｉ繧後※縺�ｋ繝励Ο繝代ユ繧｣縲�未菫ゅ�蜷代″縺悟性縺ｾ繧後ｋ縲�
419         * @throws Exception
420         * @since 28.01.2014
421         */
422        public ClassLink[] getNextClassViaInstanceLink(String[] graphURIs,
423                        String originClass, int limit) throws Exception {
424                StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
425                queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
426                queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
427                queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
428                queryStr.append("SELECT DISTINCT ?pf ?pr ?c \n");
429                if (graphURIs != null) {
430                        for (String graphURI : graphURIs) {
431                                queryStr.append("FROM <");
432                                queryStr.append(graphURI);
433                                queryStr.append(">\n");
434                        }
435                }
436                queryStr.append("WHERE{\n");
437                queryStr.append("  ?ins rdf:type ?c.\n");
438                queryStr.append("  ?insOrg rdf:type <");
439                queryStr.append(originClass);
440                queryStr.append(">.\n");
441                queryStr.append("  { ?ins ?pr ?insOrg. }\n  UNION { ?insOrg ?pf ?ins. }\n");
442                queryStr.append("}\n");
443                if (limit > 0) {
444                        queryStr.append("limit ");
445                        queryStr.append(limit);
446                        queryStr.append("\n");
447                }
448
449                // System.out.println(queryStr.toString());
450
451                Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
452                QueryExecution qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(endpointURI,
453                                query);
454
455                ResultSet results = qexec.execSelect();
456                ArrayList<ClassLink> solCLs = new ArrayList<ClassLink>();
457                for (; results.hasNext();) {
458                        QuerySolution sol = results.next();
459                        Resource proForward = sol.getResource("pf");
460                        Resource proReverse = sol.getResource("pr");
461                        Resource cls = sol.getResource("c");
462                        Direction direction = null;
463                        String propURI = null;
464                        if (proForward != null) {
465                                if (proReverse != null) {
466                                        direction = Direction.both;
467                                } else {
468                                        direction = Direction.forward;
469                                }
470                                propURI = proForward.getURI();
471                        } else {
472                                direction = Direction.reverse;
473                                propURI = proReverse.getURI();
474                        }
475                        String clsURI = cls.getURI();
476                        // System.out.println(propURI + " " + clsURI + " " + direction);
477
478                        ClassLink cl = new ClassLink(propURI, clsURI, direction, 0);
479                        solCLs.add(cl);
480                }
481                qexec.close();
482                return solCLs.toArray(new ClassLink[0]);
483        }
484
485        public Path[] getPaths(String startClass, String endClass, int mode, boolean countLink) throws Exception {
486                OWLClassGraph graph = new OWLClassGraph(startClass, endClass);
487                return graph.getPaths(this, mode, countLink);
488        }
489
490        public String createSPARQL(Path path) throws Exception {
491                return null;
492        }
493
494        /*
495         * private String executeSelect(String sparqlQuery) throws Exception {
496         * HttpClient client = HttpClientBuilder.create().build(); HttpPost httppost
497         * = new HttpPost(endpointURI); httppost.setHeader("Content-Type",
498         * "application/x-www-form-urlencoded"); httppost.setHeader("Accept",
499         * "application/sparql-results+xml"); List<NameValuePair> nvpList = new
500         * ArrayList<NameValuePair>(); nvpList.add(new BasicNameValuePair("query",
501         * sparqlQuery)); // nvpList.add(new BasicNameValuePair("format", //
502         * outputFormat.getMime())); httppost.setEntity(new
503         * UrlEncodedFormEntity(nvpList, Charset .forName("UTF-8"))); HttpResponse
504         * response = client.execute(httppost); //
505         * System.out.println("[StatusLine] " + response.getStatusLine());
506         * HttpEntity entity = response.getEntity(); String entityString =
507         * EntityUtils.toString(entity, "UTF-8"); return entityString; }
508         */
509
510        /**
511         * 縲€謖�ｮ壹＆繧後◆繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ繧定ｵｷ轤ｹ縺ｨ縺励€√◎縺ｮ繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｫ繝ｪ繝ｳ繧ｯ縺悟ｼｵ繧峨ｌ縺ｦ縺�ｋ繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｮ髮�粋繧貞叙蠕励☆繧九€�
512         * 縲€蜿門ｾ励＆繧後◆蜷�う繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｮ繧ｯ繝ｩ繧ｹ繧らｶｲ鄒�噪縺ｫ蜿門ｾ励☆繧�
513         * <p>
514         * 縺薙％縺ｧ繧､繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｨ縺ｯ縲〉df:type縺ｮ荳ｻ隱槭→縺励※險倩ｿｰ縺輔ｌ縺ｦ縺�ｋ繧ゅ�繧偵＞縺�<br>
515         * 蜃ｦ逅�ｯｾ雎｡繝��繧ｿ繧暖raphURIs縺ｧ謖�ｮ壹☆繧九％縺ｨ縺後〒縺阪ｋ <br>
516         * </p>
517         *
518         * @param graphURIs
519         *            縲€讀懃ｴ｢蟇ｾ雎｡縺ｮgraph縺ｮURI驟榊� 縲€(null繧�聞縺�縺ｮ驟榊�繧ょ庄)
520         * @param originInstance
521         *            襍ｷ轤ｹ縺ｨ縺ｪ繧九う繝ｳ繧ｹ繧ｿ繝ｳ繧ｹ縺ｮURI縲€��ull荳榊庄��
522         * @param limit
523         *            隗｣縺ｨ縺励※霑斐＆繧後ｋInstanceLink驟榊�縺ｮ髟ｷ縺輔�荳企剞蛟､繧呈欠螳壹☆繧九€�荳企剞蛟､繧定ｨｭ螳壹＠縺ｪ縺�ｴ蜷医�0莉･荳九�蛟､繧呈欠螳壹☆繧�
524         * @return InstanceLink縺ｮ驟榊�縲ゅ％縺薙↓縺ｯ縲∝叙蠕励＆繧後◆繧ｯ繝ｩ繧ｹ縺ｨ髢｢菫ゅ▼縺代ｉ繧後※縺�ｋ繝励Ο繝代ユ繧｣縲�未菫ゅ�蜷代″縺悟性縺ｾ繧後ｋ縲�
525         * @throws Exception
526         * @since 28.01.2014
527         */
528        public InstanceLink[] getNextInstancesViaInstanceLink(String[] graphURIs,
529                        String originInstance, int limit) throws Exception {
530                StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
531                queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
532                queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
533                queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
534                queryStr.append("SELECT DISTINCT ?pf ?pr ?ins ?c \n");
535                if (graphURIs != null) {
536                        for (String graphURI : graphURIs) {
537                                queryStr.append("FROM <");
538                                queryStr.append(graphURI);
539                                queryStr.append(">\n");
540                        }
541                }
542                queryStr.append("WHERE{\n");
543                // queryStr.append("  { ?c rdf:type rdfs:Class. }\n  UNION\n  { ?c rdf:type owl:Class. }\n");
544                queryStr.append("  ?ins rdf:type ?c.\n");
545                queryStr.append("  { ?ins ?pr <");
546                queryStr.append(originInstance);
547                queryStr.append(">. }\n  UNION { <");
548                queryStr.append(originInstance);
549                queryStr.append("> ?pf ?ins. }\n");
550
551                queryStr.append(" FILTER (?c != rdf:Property)");
552
553                queryStr.append("}\n");
554                if (limit > 0) {
555                        queryStr.append("limit ");
556                        queryStr.append(limit);
557                        queryStr.append("\n");
558                }
559
560                // System.out.println(queryStr.toString());
561
562                Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
563                QueryExecution qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(endpointURI,
564                                query);
565
566                ResultSet results = qexec.execSelect();
567                HashMap<String, InstanceLink> insLinkMap = new HashMap<String, InstanceLink>();
568                for (; results.hasNext();) {
569                        QuerySolution sol = results.next();
570                        Resource proForward = sol.getResource("pf");
571                        Resource proReverse = sol.getResource("pr");
572                        Resource ins = sol.getResource("ins");
573                        Resource cls = sol.getResource("c");
574                        Direction direction = null;
575                        String propURI = null;
576                        if (proForward != null) {
577                                if (proReverse != null) {
578                                        direction = Direction.both;
579                                } else {
580                                        direction = Direction.forward;
581                                }
582                                propURI = proForward.getURI();
583                        } else {
584                                direction = Direction.reverse;
585                                propURI = proReverse.getURI();
586                        }
587                        String clsURI = cls.getURI();
588                        String insURI = ins.getURI();
589                        String key = propURI + "\t" + insURI + "\t" + direction;
590                        if (insLinkMap.containsKey(key)) {
591                                InstanceLink insLink = insLinkMap.get(key);
592                                insLink.addLinkedClassURI(clsURI);
593                        } else {
594                                InstanceLink insLink = new InstanceLink(propURI, insURI,
595                                                new String[] { clsURI }, direction);
596                                insLinkMap.put(key, insLink);
597                        }
598                }
599                qexec.close();
600                Collection<InstanceLink> values = insLinkMap.values();
601                return values.toArray(new InstanceLink[0]);
602        }
603
604        public LabelMap[] getLabels(String[] graphURIs, String[] resourceURIs,
605                        String language) throws Exception {
606                if (resourceURIs == null || resourceURIs.length == 0) {
607                        return new LabelMap[0];
608                }
609                StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
610                queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
611                queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
612                queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
613                queryStr.append("SELECT DISTINCT ?res ?label \n");
614                if (graphURIs != null) {
615                        for (String graphURI : graphURIs) {
616                                queryStr.append("FROM <");
617                                queryStr.append(graphURI);
618                                queryStr.append(">\n");
619                        }
620                }
621                queryStr.append("WHERE{\n");
622                queryStr.append("  ?res rdfs:label ?label.\n");
623                queryStr.append("  FILTER(?res IN (");
624                boolean f = false;
625                for (String resourceURI : resourceURIs) {
626                        if (f) {
627                                queryStr.append(", ");
628                        }
629                        f = true;
630                        queryStr.append("<");
631                        queryStr.append(resourceURI);
632                        queryStr.append(">");
633                }
634                queryStr.append("))\n");
635                queryStr.append("}");
636
637                System.out.println(queryStr.toString());
638
639                Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
640                QueryExecution qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(endpointURI,
641                                query);
642
643                ResultSet results = qexec.execSelect();
644                HashMap<String, LabelMap> lMap = new HashMap<String, LabelMap>();
645                for (; results.hasNext();) {
646                        QuerySolution sol = results.next();
647                        String uri = sol.getResource("res").getURI();
648                        Literal literal = sol.getLiteral("label");
649                        if (literal != null) {
650                                String label = literal.getString();
651                                String lang = literal.getLanguage();
652                                if (language != null && language.equals(lang)) {
653                                        Label lbl = new Label(label, lang);
654                                        if (lMap.containsKey(uri)) {
655                                                LabelMap lm = lMap.get(uri);
656                                                lm.addLabel(lbl);
657                                        } else {
658                                                LabelMap lm = new LabelMap(uri, new Label[] { lbl });
659                                                lMap.put(uri, lm);
660                                        }
661                                }
662                        }
663                }
664                return lMap.values().toArray(new LabelMap[0]);
665        }
666
667        public ClassLink[] countLinks(String[] graphURIs, String startClassURI,
668                        ClassLink[] classLinks) throws Exception {
669                if (classLinks == null || classLinks.length == 0) {
670                        return new ClassLink[0];
671                }
672                for (ClassLink classLink : classLinks) {
673                        StringBuffer queryStr = new StringBuffer();
674                        queryStr.append("PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>\n");
675                        queryStr.append("PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>\n");
676                        queryStr.append("PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>\n");
677
678                        queryStr.append("SELECT (COUNT(?os) AS ?numOfLinks) \n");
679                        if (graphURIs != null) {
680                                for (String graphURI : graphURIs) {
681                                        queryStr.append("FROM <");
682                                        queryStr.append(graphURI);
683                                        queryStr.append(">\n");
684                                }
685                        }
686
687                        queryStr.append("WHERE{\n");
688                        if (classLink.getDirection() == Direction.forward) {
689                                queryStr.append("?is rdf:type  <");
690                                queryStr.append(startClassURI);
691                                queryStr.append(">.\n");
692                                queryStr.append("?os rdf:type  <");
693                                queryStr.append(classLink.getLinkedClassURI());
694                                queryStr.append(">.\n");
695                                queryStr.append("?is ?p ?os.\n");
696                                queryStr.append("}");
697                        } else {
698                                if (classLink.getDirection() == Direction.forward) {
699                                        queryStr.append("?os rdf:type  <");
700                                        queryStr.append(startClassURI);
701                                        queryStr.append(">.\n");
702                                        queryStr.append("?is rdf:type  <");
703                                        queryStr.append(classLink.getLinkedClassURI());
704                                        queryStr.append(">.\n");
705                                        queryStr.append("?is ?p ?os.\n");
706                                        queryStr.append("}");
707                                } else {
708                                        queryStr.append("?os rdf:type  <");
709                                        queryStr.append(startClassURI);
710                                        queryStr.append(">.\n");
711                                        queryStr.append("?is rdf:type  <");
712                                        queryStr.append(classLink.getLinkedClassURI());
713                                        queryStr.append(">.\n");
714                                        queryStr.append("{?is ?p ?os.}\n");
715                                        queryStr.append("UNION\n");
716                                        queryStr.append("{?os ?p ?is.}\n");
717                                        queryStr.append("}");
718                                }
719                        }
720                        System.out.println(queryStr.toString());
721
722                        Query query = QueryFactory.create(queryStr.toString());
723                        QueryExecution qexec = QueryExecutionFactory.sparqlService(
724                                        endpointURI, query);
725
726                        ResultSet results = qexec.execSelect();
727                        if (results.hasNext()) {
728                                QuerySolution sol = results.next();
729                                Literal lit = sol.getLiteral("numOfLinks");
730                                if (lit != null) {
731                                        int numOfLinks = lit.getInt();
732                                        classLink.setNumOfLinks(numOfLinks);
733                                }
734                        }
735                        qexec.close();
736                }
737                return classLinks;
738        }
739
740}
Note: リポジトリブラウザについてのヘルプは TracBrowser を参照してください。